Gérer ses références bibliographiques avec Zotero

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1 Gérer ses références bibliographiques avec Zotero Elsa Poupardin / Strasbourg mai 2013 A partir du travail de Marie Laure Malingre Urfist Rennes

2 Quels besoins? Importer automatiquement des lots de références résultant de recherches documentaires (bases de données ou pages web) Exploiter facilement de gros corpus de références Récupérer ses références pour la rédaction d un travail scientifique (citations, bibliographie en fin d article) pour l élaboration rapide d une bibliographie, d un produit documentaire spécifique (liste des publications d un établissement, d un labo, listes d acquisition, etc.) Pouvoir appliquer à ses références un style de présentation conforme aux normes (thèse, revues scientifiques) Faire une saisie unique des données et adapter ensuite en fonction de la publication à éditer 2

3 Les outils de bibliographie Deux types d outils de gestion de bibliographie : Outils en «local» : Bibus (gratuit), biblioexpress (gratuit), Zotero (gratuit), Jabref (gratuit), OOo (gratuit), Endnote, Refmanager Outils en «ligne» : Basilic (gratuit) CiteULike (gratuit) Connotea (gratuit) refworks, Wikindx, WizFolio Web 2.0. EndNote Web, Zotero 4.0 3

4 Plan Présentation / Installation / Interface Récupérer des références, les organiser, créer une bibliographie, tri et recherche, Plugin d insertion pour traitement de texte Captures web export, marqueurs Compte Zotero en ligne : Fonctions collaboratives 4

5 Qu est-ce que Zotero? Un outil de gestion de références et de signets Site de référence : Une extension (plugin) de Firefox À partir de la version 2 de Firefox Open source : logiciel libre et gratuit Lancé en octobre 2006 par le Centre for History and New Media) de l Université George Mason (USA) Soutenu par divers organismes, dont la Andrew W. Mellon Foundation Téléchargement de la version 4.0 Depuis la version 2, synchronisation et accès aux références en ligne via un serveur Annonce du 22/09/2010 : «Zotero Everywhere» Zotero indépendant API / gestion web et mobiles de bibliothèques Zotero «ZoteroCommons» 5

6 Prérequis logiciels Zotero nécessite l installation du navigateur Firefox. Flock et Netscape sont aussi compatibles, pas Internet Explorer ni Opera Pour Windows, Mac, ou Linux Pour Chrome et Safari: Zotero Standalone

7 Quelques ressources sur Zotero Le site de Zotero, En particulier fr/quick start guide Le blog francophone de Zotero, Manuel Zotero (Hospices Civils de Lyon), uploads/media/manuel_zotero.pdf Fiche Zotero / ECLORE, FAQ Zotero / URFIST de Nice, ZOTERO_un_Logiciel_de_bibliographie_2.0 Supports pédagogiques (nombreux sur Slideshare) Perrine Helly, François Magnan,

8 Qu est-ce que Zotero?

9

10 Premières références Zotero Récupération de références Récupération d un lot de références : cliquer sur le dossier Ex : requête «téléphonie mobile» sur ScienceDirect ou sur le SUDOC, (http://www.sudoc. abes.fr/) 10

11 Premières références Zotero Récupération de références Sélectionner les références que l on souhaite récupérer 11

12 Premières références Zotero. Récupération de références Récupération du fichier PDF associé à la référence 12

13 Des problèmes pour récupérer les références? Problème : Pas d icône zotero dans la barre d adresse Échec de l enregistrement Ex : Dans ScienceDirect Une solution : Enregistrer les résultats sous forme d un fichier au format RIS ou BibTeX Importer ensuite le fichier dans Zotero Si dans les Préférences, on a coché «Utiliser Zotero pour les fichiers RIS/ Refer téléchargés», on aura un import automatique dans Zotero 13

14 L interface de travail de Zotero L interface de Zotero : en 3 panneaux La bibliothèque et ses collections La liste des références d une collection donnée Le détail de la référence sélectionnée + la barre d outils et le panneau des marqueurs 14

15 L interface de travail de Zotero Liste des signets / références Une référence Bibliothèque et ses collections Panneau des marqueurs 15 + Requêtes

16 L interface de travail de Zotero La barre d outils 16

17 L interface de travail de Zotero La barre d outils Créer une nouvelle collection (ou une sous-collection) Créer un nouveau groupe Actions : Importer, exporter une bibliothèque, créer une chronologie, gérer les préférences Nouvel élément : créer un type de document et faire le lien vers le fichier de texte intégral 17 Créer un nouvel élément à partir de la page courante = à partir de la page ouverte dans le navigateur en utilisant les métadonnées du site; une capture d écran est liée à la notice

18 L interface de travail de Zotero Créer une référence à partir de l identifiant du document (ISBN, DOI ou PMID) Créer une note Indépendante Liée à une référence Attacher Une capture de la page courante Le lien vers la page courante Une copie d un fichier Le lien vers le fichier Recherche dans la base Recherche avancée Boîte de recherche simple Synchronisation des données avec le serveur Zotero Passage en mode plein écran Fermeture de l interface Zotero 18

19 Importer des références Sites «Zotero compatibles» : voir ex : ScienceDirect, Google Scholar et Books, PubMed, Amazon, Revues.org, Citeseer, Bases Ebsco Host, SUDOC Plateformes de partage de références comme CiteUlike Icone dans la barre d adresse Sites partiellement compatibles (ex : HAL) Récupération sur les sites compatibles de références multiples (en cliquant sur le dossier jaune dans barre d adresse) référence par référence (en cliquant sur l icône de document) 19 Source des images : Maire - AgroParisTech-Engref, Montpellier

20 Importer des références Import d un ensemble de références Import de références individualisées 20 Alimenter la base en choisissant diverses sources Importer refs à partir d'un pdf Télécharger un fichier pdf. Créer une entrée dans Zotero. Clique droit de la souris sur l élément et choisir Retrieve Metadata from PDF. Cette fonctionnalité ne marchera que si le créateur du pdf a structuré son document

21 Importer des références Références de pages web Création d un élément à partir de la page web courante (métadonnées) Capture d écran État de la page à un moment donné Choisir la collection adéquate 21

22 Importer des références Références de pages web Attacher à une référence existante : Une capture de la page courante Un lien vers la page courante La copie d un fichier local Le lien vers un fichier 22

23 Exercices de capture de références Trouver et classer entre 20 et 50 références. Catalogue du Sudoc, rechercher des (références de ) articles de périodiques, livres, matériel audio-visuel, de thèses Capturer des références sur la librairie Amazon, ou autre catalogue de votre choix : Revue.org, Youtube, Flickr, etc... Comment faire sur BNU ou GIBERT? Veillez à vérifier les références finales... 23

24 Exercices de capture de documents Sur archivesic, tel thèses (ou autres sites compatibles) et sur des sites non compatibles : et récupérer des docs. pdf, (avec leurs références) en testant les différentes méthodes de récupération : avec document ouvert, ou en le téléchargeant sur l'ordinateur, puis le stocker dans zotero Faites de simples liens vers des pages web Au total, 5 documents récupérés avec leurs références et 5 liens 24

25 Importer des références Importer des fichiers de références depuis d autres logiciels Ex : formats RIS, bibtex Utiliser le menu Actions > Importer, après avoir fait une procédure d export de fichier sous l autre outil bibliographique 25

26 Créer et manipuler des références Une référence complète : onglet info 26

27 Créer et manipuler des références Créer une nouvelle référence 27

28 Créer et manipuler des références La référence Onglet Info = les différents éléments de la référence Localiser : résolveur de lien Afficher : la capture d écran, le fichier, la page Onglets Marqueurs = possibilité d apposer des tags (mots clés libres) sur une référence Onglet Connexe = possibilité de faire un lien entre deux éléments (référence, notes) 28

29 Créer et manipuler des références Les types de référence Menu déroulant 34 types de références 29

30 Créer et manipuler des références Ensemble de champs pour chaque type de référence 30

31 Créer et manipuler des références Entrée manuelle de nouveaux éléments et / ou modification des éléments importés Zone de modification des éléments 31

32 Créer et manipuler des références Modifier une référence Ajout de données supplémentaires Modification d un champ 32

33 Classer, organiser, gérer ses références Ma bibliothèque Contient toutes les références 33

34 Classer, organiser, gérer ses références Clic droit Gestion des collections de la bibliothèque Créer une collection / des sous-collections Nouvelle sous-collection Renommer la collection Supprimer la collection Exporter la collection Classer les références 34 C est la collection sélectionnée qui reçoit les références importées Déplacement d éléments par glisserdéposer dans une collection

35 Classer, organiser, gérer ses références Gestion de la base personnelle Modification de références Gestion du texte intégral Recherche dans la base Tri des notices Ajout de notes de lecture Ajout de tags (marqueurs) Export de la bibliothèque de références Lien de deux notices 35

36 Classer, organiser, gérer ses références Enrichir ses références : annoter ses collections de références Ajouter un tag Afficher les tags et rechercher par tag 36

37 Classer, organiser, gérer ses références Créer une note indépendante ou liée à une référence Zone de création de la note 37

38 Classer, organiser, gérer ses références Capturer la page courante : page figée Enregistrer le lien vers la page courante : l URL de la page Stocker une copie du fichier : lien plus pérenne (stockage dans un sous-répertoire du dossier système de zotero Lien vers un fichier : lien vers fichier stocké en local (Mes documents, bureau) 38

39 Classer, organiser, gérer ses références Glisser / Déposer du PDF sous la référence sélectionnée 39

40 Classer, organiser, gérer ses références Recherche dans la bibliothèque de références Fenêtre de recherche avancée, accessible par la barre d outils Possibilité d enregistrer la recherche 40

41 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 1er onglet : Préférences générales 41

42 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 2ème onglet : Sync, pour synchroniser les données de la bibliothèque sur le serveur Zotero et créer une bibliothèque en ligne 42

43 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 3ème onglet : Recherche, pour l indexation et la gestion des documents en texte intégral 43

44 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 4ème onglet : Exportation, pour paramétrer les options de copie rapide et l encodage des caractères 44

45 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 5ème onglet : Styles, pour choisir les styles à afficher par défaut dans le gestionnaire de bibliographie 45

46 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 6ème onglet : pour définir des proxies 46

47 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 7ème onglet : Raccourcis clavier 47

48 L interface de travail de Zotero Actions > Préférences dans la barre d outils 8ème onglet : Préférences avancées 48

49 Sauver vos données On peut faire une sauvegarde de la bibliothèque dans le format Zotero RDF mais cela ne donne pas une copie exacte de votre base. Il est préférable de localiser votre bibliothèque Zotero (Préférences / Avancées), de fermer Firefox et de copier les données de votre répertoire Zotero vers un emplacement de sauvegarde, de préférence sur un autre périphérique de stockage.

50 Styles bibliographiques et Zotero

51 Avertissement Il conviendra avant tout de bien cerner les besoins en terme de présentation de références bibliographiques... Il faudra trouver le style proposé par Zotero le plus proche de ces besoins 51

52 Deux genres de styles de citation gérés par Zotero a) Styles de citation au format auteur date. Sources citées dans le texte, généralement entre parenthèses, avec nom de l auteur et date de publication. par ex. En Afrique, le paludisme est responsable de la mort de plus d'un million de personnes à chaque année. Lutter contre ce fléau demande la concertation de plusieurs intervenants. (Organisation mondiale de la santé, 2000, p. 5-7) => Une bibliographie finale complète les références en fin du document (ordre alphabétique nom d'auteur) 52

53 1/Numéros dans le corps du texte 2/ Citations : références biblio. de la page ou de la section classés selon ordre d'apparition dans le texte 53 3/ Bibliographie complète et finale

54 b) Styles de citation avec numérotation proposés par Zotero Eléments 1 et 2 (cf diapo précédente) Chicago Manual of Style : note without bibliography Modern Humanities Research Association (Note without Bibliography) Eléments 1 et 2 et 3(cf diapo précédente) Modern Humanities Research Association (Note with Bibliography) Chicago Manual of Style : full note with bibliography Chicago Manual of Style : note with bibliography Eléments 1 et 3 (cf diapo précédente) American Medical Association IEEE National Library of medecine Nature Journal Biblio finale classée selon ordre alpha. auteurs 54 Biblio finale classée selon ordre apparition dans le texte

55 a) Styles au format (auteur date) proposés par Zotero American Political Association American Psychological Association American Sociological Association Chicago Manual of Style author date format Harvard reference format 1 (author date) Modern Langage Association 55 Quelques styles français : https://www.zotero.org/trac/ticket/1216 Ou sur

56 Générer automatiquement une bibliographie En utilisant le menu contextuel à partir de la collection souhaitée (clic droit) : «Créer une bibliographie» 56

57 Produire une bibliographie Formater sa bibliographie Utilisation des styles fournis par Zotero Enregistrement en format RTF ou HTML Voir dans les préférences le style par défaut 57

58 58 Produire une bibliographie

59 Produire une bibliographie Le Gestionnaire de styles Pour chercher d autres styles dans le Répertoire Zotero de Styles 59 Pour récupérer un style stocké en local

60 Produire une bibliographie Styles Zotero Choix de styles par défaut dans l interface (15 styles) Voir aussi Possibilité d installer d autres styles Aperçu du style en positionnant la souris sur le lien Pas d interface graphique de modification ou de création de style Création de style avec le langage CSL Le générateur CSL de Zotero : chrome://zotero/content/tools/csledit.xul Utilisation possible aussi de Simple Style Generator Projet de styles francophones de Zotero : https://www.zotero.org/trac/ ticket/

61 Produire un rapport Option du menu contextuel : «générer un rapport à partir de la collection 61

62 Styles supplémentaires site Zotero Des nouveaux styles sont proposés sur une page de dépôt : : ils s installent automatiquement (clic sur Install) Passer le curseur de la souris sur ces styles permet d'avoir un aperçu du style.. 62

63 Styles supplémentaires site Endnote Endnote propose de télécharger, à l'adresse des styles, légalement réservés aux utilisateurs d'endnote Techniquement, ces fichiers de style peuvent être utilisés par Zotero : Préférences, puis choisir 63

64 Créer un style personnalisé Réservé à un public averti. Pb de compatibilité des CSL Possible cependant : Pour cela Utiliser un langage XML : le CSL (Citation Style Language) voir dev.zotero.org/creating_citation_styles Puis enregistrer le code produit sous l extension CSL, ouvrir le fichier CSL (préférences/styles) : le nouveau style s intègrera 64

65 Zotero et Word ou Open-Office

66 Utiliser Zotero dans Word ou Open Office Citer dans un traitement de texte depuis Zotero Barre d outils Créer la bibliographie Zotero dans Word Modifier les préférences du document Insérer une référence Supprimer les codes Editer une référence Editer la bibliographie Rafraîchir l affichage des références 66

67

68

69

70 Exercice Chercher le bon style, comprenez-vous les différentes catégories de style de Zotero? Pour les exercices, choisir un style «avec bibliographie» Dans un document word, insérer plusieurs citations, les modifier, Constituer une bibliographie finale, puis la modifier Changez de style en cours de route Insertion de sources multiples Se servir de l éditeur de citation (Clic sur montrer l éditeur lors de l insertion d une citation) 70

71 Classer, organiser, gérer ses références Créer une chronologie Menu Actions 71

72 Exporter la bibliothèque Menu Actions > Exporter la bibliothèque Formats d export : Zotero RDF, MODS, RIS, Refer / BibiX, Unqualified Dublin Core RDF, Wikipedia Citation Templates, BibTeX 72

73 Utiliser Zotero en ligne Version 3.0 Création d un compte sur le serveur Zotero Accès à My Library Groupes Zotero People Possibilité de synchroniser ses références Partage des références 73

74 Utiliser Zotero en ligne Fonctions collaboratives : Zotero 3.0 La synchronisation : Synchronisation de la bibliothèque / serveur Zotero Sauvegarde et consultation en ligne via le site web et compte utilisateur zotero 74 Synchronisation des documents attachés avec un serveur WebDav / Zotero Ex Dropbox:

75 Utiliser Zotero en ligne Bouton de synchronisation 75

76 Utiliser Zotero en ligne Synchronisation des données Paramétrage de la synchronisation 76

77 Utiliser Zotero en ligne La bibliothèque en ligne Gratuit jusqu à 100mb Attention : problème des PDF partagés en public 77

78 Utiliser Zotero en ligne Création de groupes 78

79 Utiliser Zotero en ligne Paramétrage du groupe 79

80 80 Utiliser Zotero en ligne Définition du groupe : Nom Description Statut Disciplines concernées Logo, image Page web Commentaires Gestion des membres Options pour la gestion de la bibliothèque

81 Utiliser Zotero en ligne Un exemple : la bibliothèque du groupe Boîte à outils (pour les historiens) 81

82 Utiliser Zotero en ligne Groupes Zotero 82

83 Utiliser Zotero en ligne Création de groupes privés ou publics / interaction avec les bibliothèques propres à des groupes définis Réseaux de personnes Suivi de bibliothèques publiques par flux RSS 83

84 Edition et modification des styles Zotero Date 10 février 2011 Un des principal reproche que l on peut faire à Zotero, contrairement à un logiciel comme Bibus, concerne l édition et la modification des styles de publication existants afin de réaliser son propre style. Il existe un utilitaire qui permet de personnaliser une feuille de style déjà existante. Il faut pour cela utiliser un outil local dans Firefox en tapant chrome://zotero/content/ tools/csledit.xul dans la barre d adresse pour permettre l édition et la modification d un style pré-existant Vous trouverez plus de détails dans un tutoriel à l adresse suivante J en profite pour signaler également un autre outil très utile: chrome://zotero/content/ tools/cslpreview.xul, toujours à taper dans la barre d adresse de Zotero, qui permet de visualiser dans une même fenêtre une ou plusieurs références bibliographiques dans tous les styles disponibles dans son propre Zotero.

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