Epidémiologie des maladies transmissibles

Transcription

1 Epidémiologie des maladies transmissibles Pr François Dabis Pr Anne-Marie Rogues Janvier 2015

2 ECN UE n 6 : Maladies transmissibles - Risque sanitaire Santé au travail Objectif ECN n Surveillance des maladies infectieuses transmissibles Inchangé à partir de 2016

3 Objectif ECN n 142 Plus précisément Modes de transmission des agents infectieux à l homme Indicateurs mesurant la fréquence de survenue des maladies transmissibles : prévalence, incidence, taux d attaque, sensibilité, spécificité, valeur prédictive positive, valeur prédictive négative Sources d information : liste des maladies à déclaration obligatoire, liste des maladies nécessitant des mesures d éviction Savoir déclarer une maladie transmissible Rôles de l Institut de Veille Sanitaire (InVS)

4 Plan du cours Introduction - définitions Les bases de l épidémiologie La surveillance épidémiologique Les maladies à déclaration obligatoire (MDO) et l Institut de Veille Sanitaire (InVS) Les maladies transmissibles : généralités La chaîne épidémiologique Exemple : Epidémiologie des infections associées aux soins

5 Définitions (1) Epidémiologie (Mac Mahon, 1970) Etude de la distribution des problèmes de santé et de leurs déterminants dans des populations humaines Approche scientifique ayant pour but de contribuer à la prévention et au contrôle des problèmes de santé

6 Définitions (2) Maladie transmissible Maladie due à un agent infectieux, conventionnel (bactérie, virus, champignons, parasites) ou non conventionnel (prion, ) et ayant la capacité à se transmettre, directement ou indirectement, d un individu à un autre, au sein d une même espèce ou d une espèce à une autre

7 Epidémiologie Objectifs (1) Trois objectifs principaux Décrire : étudier la distribution et l ampleur des phénomènes morbides dans une population pour orienter le développement des services de santé = Fréquence Comprendre : Déterminer les facteurs étiologiques des maladies (déterminants) dans le but de les modifier, de prévenir ou d enrayer la maladie = Causes Evaluer : Mesurer l efficacité ou l impact des actions mises en œuvre pour améliorer l état de santé d une population = Action

8 Epidémiologie Objectifs (2) L épidémiologie est un outil de décision Permettant de passer de la décision clinique à la prise de décision de santé publique : de l individu aux groupes (population ciblée, communauté)

9 Cycle de l'épidémiologie Contribution à la résolution des problèmes de santé publique Épidémiologie descriptive Décrire l état de santé d une population Analyser les déterminants des problèmes de santé Épidémiologie analytique ou étiologique Evaluer l impact des interventions Proposer les interventions les plus efficaces Épidémiologie évaluative

10 Epidémiologie descriptive Estimer la fréquence d un événement de santé : indicateurs

11 Estimer la fréquence d un événement de santé : indicateurs Prévalence Taux d incidence et taux d attaque Mortalité et létalité

12 Indicateurs = outils de mesure (1) (Taux de) prévalence Nombre de personnes atteintes d une maladie dans une population, à un moment donné ou pendant une période donnée (proportion) Taux d incidence Nombre de nouveaux cas d une maladie survenant dans une population pendant une période donnée (vitesse) Taux d attaque Nombre de nouveaux cas d une maladie survenant dans une population durant la phase épidémique (cas particulier du taux d incidence)

13 Indicateurs = outils de mesure (2) Taux de mortalité global ou spécifique Nombre de décès total ou dû à la maladie considérée rapporté à la population (vitesse) (taux) de létalité : nombre de décès dû à une maladie parmi les cas de cette même maladie (proportion ou taux)

14 Estimer la fréquence d un événement de santé dépend de la performance des test diagnostiques utilisés Sensibilité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui ont la maladie (aptitude à avoir peu de faux négatifs)

15 Estimer la fréquence d un événement de santé dépend de la performance des test diagnostiques utilisés Sensibilité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui ont la maladie (aptitude à avoir peu de faux négatifs) Spécificité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui n'ont pas la maladie (aptitude à avoir peu de faux positifs)

16 Estimer la fréquence d un événement de santé dépend de la performance des test diagnostiques utilisés Sensibilité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui ont la maladie (aptitude à avoir peu de faux négatifs) Spécificité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui n'ont pas la maladie (aptitude à avoir peu de faux positifs) Valeur prédictive positive: rapport du nombre de vrais positifs sur le nombre total de tests positifs

17 Estimer la fréquence d un événement de santé dépend de la performance des test diagnostiques utilisés Sensibilité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui ont la maladie (aptitude à avoir peu de faux négatifs) Spécificité d un test: capacité du test à correctement identifier les individus qui n'ont pas la maladie (aptitude à avoir peu de faux positifs) Valeur prédictive positive: rapport du nombre de vrais positifs sur le nombre total de tests positifs Valeur prédictive négative : rapport du nombre de vrais négatifs sur le nombre total de tests négatifs

18 Epidémiologie descriptive (2) Estimer la fréquence d un événement de santé : indicateurs Apprécier l importance d un événement de santé en termes de santé publique par ses 3 dimensions

19 Les trois dimensions de la description des données épidémiologiques Description dans le temps Description dans l espace Description des caractéristiques la population touchée

20 Epidémiologie descriptive Importance de santé publique (1 / 3) Description dans le temps = «courbe épidémique» Mesure d un phénomène évoluant rapidement (épisode épidémique) Évolution au long cours d un phénomène (tendances séculaires)

21 Caractéristiques temporelles d'une maladie à potentiel épidémique (Effectifs) Effectif [15-16[ [16-17[ [17-18[ [18-19[ [19-20[ [20-21[ [21-22[ [22-23[ [23-00[ [00-01[ [01-02[ [02-03[ [03-04[ [04-05[ [05-06[ [06-07[ [07-08[ [08-09[ [09-10[ [10-11[ 18 avril Heure 19 avril Cas de gastro-entérite par date et heure d'apparition des symptômes, Oswego, avril 1940.

22 Nombre hebdomadaire de cas confirmés de maladie à virus Ebola en Guinée,

23 Caractéristiques séculaires d'une maladie Nombre annuel de nouveaux cas (incidence) d infection à VIH en Afrique 23

24 Epidémiologie descriptive Importance de santé publique (2 / 3) Description dans le temps Description dans l espace : Mesure de l extension (mondiale, continentale, nationale, régionale, locale) d une maladie Évolution géographique du phénomène

25

26 Variations de l incidence de l infection à VIH entre 2005 et 2013 pour les 10 pays d Afrique les plus touchés

27 Epidémiologie descriptive Importance de santé publique (3 / 3) Description dans le temps Description dans l espace Description des caractéristiques la population touchée : âge, sexe, modes de vie, conditions sociales, exposition

28 28

29 Epidémiologie descriptive (3) Estimer la fréquence d un événement de santé Apprécier son importance en termes de santé publique Méthodologie : Surveillance épidémiologique +++ Enquêtes (à défaut de système de surveillance)

30 Définition Surveillance épidémiologique (1 / 3) Processus continu et systématique de collecte, de compilation, et d analyse de données épidémiologiques, et de leur diffusion à l ensemble de ceux qui ont besoin d être informés en santé publique

31 Surveillance épidémiologique (2 / 3) Typologie des systèmes de surveillance Surveillance active L organisateur recueille directement l information auprès des sources ad hoc Surveillance passive Les sources d informations informent la structure responsable de la surveillance Dispositif de déclaration obligatoire des maladies (DMO) Surveillance semi-active Surveillance passive avec relance Réseaux sentinelles

32 Surveillance épidémiologique (3 / 3) Quels objectifs? Estimer l importance d un problème de santé publique afin de planifier les besoins en ressources (ex : VHC) Suivre les tendances spatio-temporelles (ex : grippe) Détecter les modifications d agents infectieux (ex : BK) Détecter les épidémies ou phénomènes anormaux (ex : toxi-infections alimentaires collectives / TIAC, méningites) Evaluer les résultats d une action de prévention (ex : vaccination)

33 Institut national de la Veille Sanitaire (InVS) (a) Établissement public de l État créé par la loi n du 1 er juillet 1998 sur la sécurité sanitaire Mission générale : Surveiller en permanence l état de santé de la population française et son évolution surveillance épidémiologique observation évaluation des risques : veille et vigilance alerte sanitaire et contribution à la gestion des crises

34 Institut national de la Veille Sanitaire (InVS) (b) Maladies infectieuses, maladies chroniques, santé environnementale, santé au travail Organisation en région : Cellules interrégionales d épidémiologie Evoluera en 2015 de par la fusion avec l Institut National de Prévention et d Education pour la Santé (INPES) +++

35 Surveillance épidémiologique des maladies transmissibles en France (1 / 3) Centres Nationaux de Référence (CNR) laboratoires reconnus pour leur expertise microbiologique et épidémiologique - (arrêté du 26 décembre 2011 pour ) Missions : Identification des souches microbiennes circulantes Surveillance Alerte de la Direction Générale de la Santé et de l InVS Etablissements de santé RAISIN = Infections Nosocomiales

36 Surveillance épidémiologique des maladies transmissibles en France (2 / 3) Réseau de surveillance «Sentinelles» : 500 médecins généralistes Signalement électronique hebdomadaire semi-actif Syndrome grippal, varicelle, diarrhée aigüe,

37 Evolution des syndromes grippaux depuis le début de l année 2015

38 Surveillance épidémiologique des maladies transmissibles en France (3 / 3) Maladies à déclaration obligatoire (MDO) a) Définition Maladies faisant l objet d une transmission obligatoire de données individuelles à l autorité sanitaire Objectifs Des données permettant une analyse quasi-permanente de la situation et de l'évolution de ces maladies en France Pour mettre en place des actions préventives et/ou de contrôle Initier et conduire des programmes de lutte adaptés aux besoins de santé publique Limite Exhaustivité variable en fonction de la maladie concernée

39 Maladies à déclaration obligatoire b) Les acteurs Biologistes, médecins libéraux ou hospitaliers doivent signaler et déclarer aux Médecins Inspecteurs de Santé Publique (MISP) de la Délégation Territoriale de l Agence Régionale de Santé (ARS) dans le département du domicile du patient L InVS centralise le données départementales, les analyse et les transmets aux pouvoirs publics avec des recommandations sur des actions à mettre en place La Direction Générale de la Santé (DGS) du Ministère de la Santé est informée des alertes sanitaires et intervient dans les décisions en matière de risques

40 Maladies à déclaration obligatoire c) Inscription d'une maladie sur la liste des Maladies à déclaration obligatoire (MDO) se fait : Par décret ministériel, Après avis de la Commission Spécialisée des Maladies Transmissibles (CSMT), au sein du Haut Conseil de la Santé Publique (depuis mars 2007)

41 31 maladies à déclaration obligatoire d) (dernière révision le 16 janvier 2012) Botulisme Brucellose Charbon Chikungunya Choléra Dengue Diphtérie Fièvres hémorragiques africaines Fièvre jaune Fièvre typhoïde et fièvres paratyphoïdes Hépatite aigüe A Infection symptomatique par le VHB Infection par le VIH quel qu'en soit le stade Infection invasive à méningocoque Légionellose Listériose Mésothéliome Orthopoxviroses dont la variole Paludisme autochtone Paludisme d'importation dans les DOM Peste Poliomyélite Rage Rougeole Saturnisme de l'enfant mineur Suspicion de maladie de Creutzfeldt-Jakob Tétanos Toxi-infection alimentaire collective Tuberculose Tularémie Typhus exanthématique

42 31 maladies à déclaration obligatoire e) (dernière révision le 16 janvier 2012) Pour chaque MDO : aide-mémoire, données épidémiologiques, textes officiels, comment signaler et notifier, publications

43 Maladies à déclaration obligatoire f) Une MDO est une une maladie qui nécessite : Des mesures exceptionnelles sur le plan national ou international (peste, choléra, fièvre jaune, variole, rage) - Règlement Sanitaire International (RSI) 2005 de l Organisation Mondiale de la Santé (OMS)

44 Maladies à déclaration obligatoire g) Une MDO est une une maladie qui nécessite : Des mesures exceptionnelles sur le plan national ou international (peste, choléra, fièvre jaune, variole, rage) - RSI Une intervention urgente à l'échelon local, régional ou national : Mesures préventives (méningite, diphtérie, tuberculose) Mesures correctives pour agir sur la source de contamination (TIAC, légionellose)

45 Maladies à déclaration obligatoire h) Une MDO est une une maladie qui nécessite : Des mesures exceptionnelles sur le plan national ou international (peste, choléra, fièvre jaune, variole, rage) - RSI Une intervention urgente à l'échelon local, régional ou national : Mesures préventives (méningite, diphtérie, tuberculose) Mesures correctives pour agir sur la source de contamination (TIAC, légionellose) Des programmes de prévention à évaluer (Sida, tuberculose, tétanos) Un suivi de la létalité, de la morbidité et du risque de séquelles (Sida, légionellose) Un besoin de connaissances (maladie de Creutzfeldt-Jakob)

46 Maladies à déclaration obligatoire i) Maladies nécessitant une intervention urgente afin de limiter la diffusion : Le signalement se fait dans les meilleurs délais et inclut des éléments d identification du patient Ex : infection à méningocoque, poliomyélite, diphtérie, tuberculose-maladie, TIAC, légionellose, botulisme Infections nosocomiales : cas particulier!

47 Maladies à déclaration obligatoire j) Procédure de signalement Procédure d'urgence et d'alerte par les médecins ou biologistes au Médecin Inspecteur de Santé Publique (MISP) de l ARS Pas de support dédié au signalement Concerne toutes les MDO transmissibles sauf VIH, VHB et tétanos Permet la mise en place de mesures de prévention rapide, ou de déclencher des investigations Les données peuvent être nominatives, mais ne seront pas conservées au delà du temps nécessaire à l'investigation et à l'intervention

48 Maladies à déclaration obligatoire k) Maladies pour lesquelles une évaluation des programmes de prévention ou de lutte est nécessaire afin de mesurer l efficacité et les adapter aux besoins La notification concerne la transmission des informations épidémiologiques nécessaires au suivi des tendances Ex : infection par le VIH, infection aigüe symptomatique par le virus de l hépatite B, tétanos

49 Maladies à déclaration obligatoire l) Notification anonymisée Intervient après le signalement et la confirmation du diagnostic Procédure de transmission des données par les médecins ou biologistes au MISP de l ARS Au moyen d'une fiche spécifique à chaque maladie :

50 Maladies à déclaration obligatoire m) Notification anonymisée (fin) Contenu des données recueillies fixé par arrêté du Ministre de la Santé après avis de la Commission Nationale de l'informatique et des Libertés (CNIL) Modalités spécifiques de protection de l'anonymat Information individuelle, exercice du droit d'accès et de rectification