La recherche dans les bases de données bibliographiques

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1 La recherche dans les bases de données bibliographiques Sciences biomédicales MARIE-CLAUDE LAFERRIÈRE Conseillère à la documentation en sciences de la santé JANVIER 2015

2 Plan de la présentation Espace Web en sc. biomédicales Accès au ressources électroniques Google Scholar vs PubMed Deux méthodes de recherche et les outils à utiliser pour la recherche PubMed BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 2

3 Explorer par discipline Vous trouverez les ressources propres à votre discipline telle que: les bases de données spécialisées pour retrouver des articles en sciences biomédicales; les ensembles de livres électroniques en sciences de la santé; les dictionnaires et encyclopédies en sciences biomédicales; les nouveautés à la bibliothèque; et plus! BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 3

4 Accès aux ressources électroniques Réservé aux étudiants, aux professeurs et aux membres du personnel de l'université Laval. Lors de votre recherche documentaire, cliquez sur le lien de la ressource électronique désirée (livre, article, base de données) sur le site Web de la bibliothèque ou dans le catalogue Ariane. La page d'authentification suivante vous apparaîtra. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 4

5 Accès aux ressources électroniques BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 5

6 Accès aux ressources électroniques Modalités et conditions d'accès Une fois la session activée, vous pouvez consulter toutes les ressources électroniques désirées. La session expire à la fermeture du navigateur Web ou après une heure d'inactivité. Problème de connexion Vous pouvez éprouver des problèmes de connexion avec certaines ressources électroniques. Dans un tel cas, un message d'erreur s'affichera. Autres problèmes d'accès, remplissez le formulaire suivant: Formulaire Problème d'accès à une ressource électronique BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 6

7 Présentation Caractéristiques Sujet Toutes les disciplines Biomédical N bre de références? Plus de 24 millions Types de documents Articles, sites Web, livres, résumés de conférences, brevets, présentations Power Point, thèses Articles et Livres électroniques Recherche Texte intégral des articles (.pdf ou site Web) Notices bibliographiques Résultats Selon l algorithme de pertinence Selon la préparation du chercheur BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 7

8 Présentation Google Scholar signe des ententes avec certains partenaires afin d offrir du contenu. Toutefois, l intégralité du contenu n est pas indexée. Par rapport à PubMed, quelques références uniques peuvent être repérées. Certaines seront des articles scientifiques provenant d autres bases de données bibliographiques, mais la plupart seront des documents autres que des articles de périodiques scientifiques. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 8

9 Structurer sa recherche La recherche à l intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent: 1. Vocabulaire libre ou recherche à la Google 2. Vocabulaire contrôlé ou mots issus d un thésaurus BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9

10 Méthode de recherche 1 Vocabulaire libre ou recherche à la Utilisation du langage naturel ou de ses propres mots afin de repérer des documents sur le sujet d intérêt. Le choix et l orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche. Astuce : utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chaque concept afin de maximiser le repérage. Guide d utilisation de Google Scholar (disponible sur le site Web de la bibliothèque > Aide à la recherche > Tutoriels en ligne BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 10

11 Outils - Dictionnaires en ligne Repérer un maximum de synonymes et de variantes orthographiques Portail Terminologique de Santé Grand dictionnaire terminologique Portail linguistique du Canada (Termium Plus) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 11

12 Méthode de recherche 1 Exemple Je cherche des articles qui portent sur l obésité 1. Traduction Consultation de CisMeF Obésité > Obesity 2. Synonymes et variantes orthographiques Body weight, body weights, body-weight, body fat distribution, fat tissue distribution, overweight, over weight, over eat, over eating, obesities, obese, visceral obesity, morbid obesity, morbid obesities, abdominal obesity, body fat, waist, body fat, fat load, body mass index, quetelet index, BMI BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 12

13 Exercice Trouvez cinq synonymes anglophones pour la maladie Diabète de type 1. Autoimmune diabetes Brittle diabetes mellitus Insulin dependent diabetes mellitus Juvenile-onset diabetes / Juvenile onset diabetes Sudden-onset diabetes mellitus Utilisez le CiSMeF > Espace Web en sciences biomédicales - Onglet Atlas, dictionnaires et encyclopédie. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 13

14 Outils - Les symboles Pour gagner du temps et de la précision * Troncature : placée à la fin d un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme. arter* permet de repêcher artery, arteries, arterial, arteritis, arteriole, etc. " " Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d apparition. "Heart arrest" ou "Cardiac arrest" permet de repêcher ces mots tels qu ils apparaissent dans le texte. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 14

15 Outils - Les opérateurs booléens Pour lier différents concepts ET (AND) OU (OR) Limite la recherche à l intersection des concepts Unit les différents concepts SAUF (NOT) Exclut un ou plusieurs concepts non souhaités Précise la recherche, mais ATTENTION BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 15

16 Méthode de recherche 2 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d un thésaurus Validation des mots dans un dictionnaire appelé thésaurus avant de les utiliser pour la recherche. Une seule appellation possible et une seule orthographe à utiliser pour l ensemble des variantes orthographiques. L appellation à utiliser et la manière de l écrire sont imposées par la base de données. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 16

17 Outils - Thésaurus La plupart des bases de données publient un thésaurus. Souvent, il est intégré au logiciel de la base de données. Quelques thésaurus connus Medline / Pubmed = MeSH (Medical Subject Headings) Cochrane = MeSH (même que Medline) Embase = EMTREE CINAHL = Descripteurs CINAHL PsycINFO = Thesaurus (sous l onglet Term Finder) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 17

18 Accès au thésaurus BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 18

19 Méthode de recherche 2 Exemple Je cherche des articles qui parlent de l adhésion du patient à la prescription d un médicament. 1. Synonymes et variantes orthographiques: Patient cooperation, patient adherence, patient nonadherence, patient non adherence, patient non-adherence, patient compliance, patient noncompliance, patient non compliance, patient noncompliance 2. Choix du terme à utiliser Recherche dans le thésaurus de la base de données choisie BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 19

20 MeSH Définition Subdivisions (qualifier un MeSH) Transformation du MeSH en concept majeur Synonymes Explosion du MeSH par défaut Suggestions de MeSH BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 20

21 MeSH (suite) Structures arborescentes «explosées» Concepts plus généraux Concept plus spécifique Concepts plus généraux Concept plus spécifique BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 21

22 Exercices Quel est le terme utilisé pour le cancer du sein? Breast Neoplasms Quel est le terme utilisé pour le vaccin contre la grippe? Influenza Vaccines breast cancer Breast Neoplasms influenza vaccine / influenza vaccination Influenza Vaccine Utilisez le MeSH Database (PubMed), Emtree (Embase sous l onglet Browse) et Descripteurs CINAHL (CINAHL)> Espace Web en sciences biomédicales - Onglet articles BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 22

23 Bases de données bibliographiques Disciplinaires: utilisation du vocabulaire libre et/ou du vocabulaire contrôlé. Possèdent souvent leur propre thésaurus Ex: PubMed, Embase, CINAHL, etc. Multidisciplinaires: utilisation du vocabulaire libre. Thésaurus non disponibles. Ex: Web of science, Biosis Previews, Scopus, Google Scholar, etc. Recommandation: utiliser le vocabulaire contrôlé lorsque possible afin d augmenter la pertinence des résultats. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 23

24 Rechercher dans BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 24

25 PubMed vs Medline Contenu Medline Interface de recherche PubMed Ovid EBSCO Web of Knowledge PubMed Interface gratuite pour tous Contenu Medline (Références avec MeSH) + Articles en prépublication qui ne sont pas encore indexés ou publiés (PubMed in-process) Articles datant d avant l acceptation du périodique dans Medline (As supplied by publisher) Articles provenant de revues indexées sans toutefois couvrir un sujet en santé (ex. : astrophysique) Articles provenant de revues faisant partie de PubMedCentral, mais sans être inclus dans Medline BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 25

26 Recherche simple Boîte de recherche unique, offerte par défaut proposée sur la page d accueil Utilisation du vocabulaire libre Saisie de mots-clés à la Google Saisie par champ. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 26

27 Recherche simple Saisie de mots-clés à la Google Exemple Je cherche des articles qui portent sur l obésité chez les enfants. Recherche des mots effectuée dans tous les champs de la notice. Consulter la boîte Search Details Utilisation de limites (Filters) pour vos résultats. Recherche moins précise et résultats nombreux. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 27

28 Notice détaillée Informations bibliographiques (auteur, titre, périodique, année, etc. Résumé Numéro unique PubMed Type de publication Vocabulaire contrôlé BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 28

29 Recherche simple Saisie par champs Exemple Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants. La recherche est effectuée au sein du ou des champs spécifiés. Connaissance nécessaire des étiquettes de champs et de la syntaxe de recherche. La précision de la recherche est augmentée. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 29

30 Recherche simple Saisie par champs BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 30

31 Recherche avancée Plusieurs boîtes de recherche, accès disponible sur la page d accueil Là où il est possible de sélectionner ses champs pour la recherche quand l on ne connait pas la syntaxe. Connaissance de la syntaxe non nécessaire. Recherche plus visuelle. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 31

32 Recherche avancée Exemple Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants. Sélection du ou des champs voulus et ajout des termes dans les boîtes de recherche. Recherche plus précise et résultats moins nombreux. Utilisation de l historique de recherche pour combiner plusieurs recherches. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 32

33 Historique de recherche Utilisation de l historique de recherche pour combiner plusieurs recherches. (AND, OR, NOT)

34 Exercice Combien d articles écrits par Y. Nomura ont été publiés dans The Journal of biological chemistry? Nomura Y[Author] AND "The Journal of biological chemistry"[journal] > 13 résultats Utilisez la recherche Advanced. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 34

35 Recherche MeSH Recherche uniquement dans le champ MeSH. Utilise le vocabulaire contrôlé de la base de données. Recherche plus précise et les résultats plus pertinents. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 35

36 Recherche avec les MeSH Cocher les options voulues et cliquer sur Add to search builder OU utiliser les étiquettes de la recherche simple ou les champs de la recherche avancée BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 36

37 Recherche avec les MeSH Exemple Je cherche des articles dont le sujet principal est la toxicité des agents anti-obésité. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 37

38 Dans la notice les MeSH s affichent: Terme suivant une barre oblique après un MeSH -> subdivision MeSH suivi d un astérisque -> Concept majeur

39 Exercices Combien trouvez-vous d articles en français sur le métabolisme du cancer du cerveau? "Brain Neoplasms/ metabolism"[mesh] Filters: French > environ 171 résultats Combien trouvez-vous d articles dont le sujet principal est l effet des changements climatiques sur les maladies infectieuses? "Climate Change"[Majr] AND "Communicable Diseases"[Majr] > environ 102 résultats Utilisez la recherche MeSH. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 39

40 Obtenir le texte de l article Le bouton l Université Laval. permet de vérifier si un document est disponible à Ce dernier est visible avec le Display Settings: Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice. Si la Bibliothèque n est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l article est disponible gratuitement sur le Web. Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 40

41 Gestion des résultats Send to (sur la page de résultats) permet plusieurs options: File : enregistrer les notices sélectionnées envoyer les notices par courriel Clipboard : permet de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu à 500 notices. Les options File et sont aussi disponibles dans le Clipboard. ATTENTION: les notices mises sur le Clipboard seront effacées après 8 heures d inactivité. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 41

42 Sauvegarde vos stratégies de recherche Avec Search details : possibilité d enregistrer vos requêtes ou stratégies de recherche sous forme d URL permanente (adresse internet) et les mettre en bookmark (favoris) Avec un fil de votre recherche. Avec My NCBI : service de veille de PubMed Permet de sauvegarder des stratégies de recherche Permet d obtenir des alertes par courriel Service simple et gratuit, mais nécessité de s inscrire et de définir des codes d accès Créez votre compte My NCBI BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 42

43 Exercices Sauvegardez 2 ou 3 références dans une collection de votre compte NCBI. > Sélectionnez 2 ou 3 références > Cliquez sur Send to < Sélectionnez Collections > Sélectionnez Create a new collection Sauvegardez une recherche dans votre NCBI. > Dans Advanced, cliquez sur le numéro de la recherche à sauvegarder. > Cliquez sur Save in My NCBI. > Changez le nom de votre recherche et cliquez sur Save. > Alerte courriel ou non. Utilisez votre compte My NCBI. BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 43

44 Personnalisez My NCBI NCBI Site Preferences Surlignage des mots recherchés (Highlighting) Limiter votre recherche (Filters & icons) Articles francophones (French) Articles disponibles à ULaval (Universite Laval Library, Quebec, Canada) Articles disponibles gratuitement (Free Full Text) Changer l affichage des résultats (Result Display Settings > Abstact) BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 44

45 Nous sommes là pour vous aider! Conseillère à la documentation Marie-Claude Laferrière Bibliothèque scientifique, pavillon Alexandre-Vachon, bureau 1018-C Tél. : #7948 Courriel : marie-claude.laferriere@bibl.ulaval.ca Lundi au vendredi : 8 h 30 à 16 h 30 Il est préférable de prendre un rendez-vous pour vérifier ma disponibilité. Aide à la recherche Bibliothèque scientifique, Pavillon Alexandre-Vachon Tél.: Lundi au vendredi: 8 h 30 à 18 h 30 Samedi et dimanche: 10 h 00 à 17 h 30 BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 45

46 Prochaine formation Plan de la formation Présentation d EndNote Online Importer des références Organiser et partager vos références Utiliser vos références Date et endroit Le mardi 13 janvier > 8h30 à 10h00 Local 0022 Bibliothèque scientifique au Pavillon Alexandre-Vachon