Journée Sextant 16 juin Brest

Transcription

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2 Contenu du site Cartes de distribution par espèce des invertébrés benthiques, agrégées par façade Données des campagnes halieutiques, par chalutage Atlantique EVHOE, LANGOLF, NURSE, ORHAGO Manche / Mer du Nord IBTS, CGFS, NOURSEINE Méditerranée MEDITS

3 Contenu du site Habitats de fonds meubles infra et circalittoraux jusqu à la pente du plateau continental (-20 à -700m) Originalité des données de mégafaune : pas de données couvrant cet espace géographique pour les espèces décrites Demandes scientifiques ou expertises : DCSMM, CIEM

4 Quelles espèces? Invertébrés de la méga-épifaune capturables au chalut - formes errantes principalement (crabes, crevettes, échinodermes ) - quelques formes fixées (e.g. hydraire coloniaux, pennatules) - 9 embranchements, 463 taxa

5 Principaux objectifs du site Atlas BentHal Visualisation/Sélection de cartes de distribution des espèces de l épi-mégafaune benthique Fiche synthétique «écologique» par espèce Outils d extraction de données o Cartes, listes d espèces, indices o Critères géographiques o Critères bathymétriques

6 Visualisation de cartes de distribution par espèce de l épi-mégafaune benthique Pteroeides griseum Liocarcinus depurator

7 Génération des cartes par krigeage Meilleur modèle variographique Données brutes Evaluation des paramètres de voisinage Test de différentes mailles d agrégation x3 x1 x2 Carte optimisée de distribution par espèce Grille standard par façade

8 Sélection et visualisation des cartes de distribution, accès par espèce

9 Accès aux fiches synthétiques «écologiques» par espèce, via les métadonnées Atlas des invertébrés benthiques ( Pteroeides griseum (Linnaeus, 1767) Atlas des invertébrés benthiques ( Liocarcinus depurator (Linnaeus, 1758) Cnidaria Arthropoda Anthozoa Malacostraca Pennatulacea Decapoda Identifiants Ifremer : Aphia ID : Ifremer, Jocelyne Martin Identifiants Ifremer : Aphia ID : Ifremer, Jocelyne Martin DISTRIBUTION PROFONDEUR (m) HABITAT Épifaune DISTRIBUTION PROFONDEUR (m) HABITAT Épifaune Fond Fond 20 cm Endofaune ALIMENTATION EXPLOITATION TAILLE (cm) Prédateur Nécrophage OUI NON 10 cm cm Endofaune ALIMENTATION EXPLOITATION TAILLE (cm) Prédateur Nécrophage Profondeur maximale 795 m OUI NON 10 cm Bibliographie & Liens internet Martin J. (2011). Les invertébrés marins du golfe de Gascogne à la Manche orientale. Éditions Quae, Collection Guide pratique, ISBN WoRMS Editorial Board (2016). World Register of Marine Species, Flanders marine institute (VLIZ). (consulté le ) Bibliographie & Liens internet Martin J. (2011). Les invertébrés marins du golfe de Gascogne à la Manche orientale. Éditions Quae, Collection Guide pratique, ISBN WoRMS Editorial Board (2016). World Register of Marine Species, Flanders marine institute (VLIZ). (consulté le ) MarLIN (Marine Life Information Network), Marine Life Information Network. Plymouth: Marine Biological Association of the United Kingdom.h ttp:// (consulté le )

10 Sélection et visualisation des cartes de distribution, accès par façade

11 Journée Sextant 16 juin Brest Outil de sélection de données Affichage d une seule espèce par radio bouton Sélection d une espèce à afficher par filtre sur le nom

12 Outil d extraction de données Extraction de données selon des critères géographiques et/ou bathymétriques

13 Extraction de données Formulaires extraction en ligne Zone géo, bathy Script LISTE d ESPECES (tableau csv) / zone géographique ou bathy sélectionnée Indices pour chaque espèce Quelle importance de l espèce? Quelle image de la distribution?

14 Outil d extraction de données Espece Embranchement Code (Aphia ID) Fichier CSV en sortie Liste d espèces Indices d importance (I1 ) et de représentativité (R1, R2 ) par comparaison à leur distribution régionale I1: % occurrence R2: % quantité R3: représentativité Liocarcinus depurator Crustacea 80% 70% MAJEURE Pteroeides griseum 10% 20% FAIBLE Anseropoda placenta 40% 60% MOYENNE

15 Méthode automatisée de génération des Données source BENTHOS des CAMPAGNES Espece, lon, lat, abondance Référentiel Taxinomique standard (REFTAX, NumSys_CPerm) cartes & des métadonnées Script Méthode d agrégation et de génération des cartes FICHIER CSV LISTE ESPECES INDICES WPS Formulaires extraction en ligne Zone géo, bathy Script WMS CARTE DISTRIBUTION Raster + ncdf Projet QGIS METADONNEES xml, csv

16 Données & Coordination : EMH & IDM Financement : DCSMM Développement Site, Interface Web & Ergonomie : IDM Camp2Camp CONTACTS pascal.laffargue@ifremer.fr catherine.satra@ifremer.fr