Biochimie moléculaire et cellulaire des maladies métaboliques (BMC2M)

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1 Biochimie moléculaire et cellulaire des maladies métaboliques (BMC2M) Responsable : Pr B. Hainque (bernard.hainque@parisdescartes.fr) Présentation des voies métaboliques et de leurs relations avec les pathologies dans un contexte intégré (notamment avec les voies de signalisation). Sont abordés à la fois les aspects physiopathologiques et thérapeutiques. Un travail par binôme d analyse critique d un article scientifique et sa présentation lors d un séminaire sont à réaliser. La présence aux cours est requise. Les 6 modules développés sont les suivants : 1) Mécanismes d action des enzymes et de leurs modes de régulations o Quelques cours permettent de découvrir les concepts de l enzymologie moderne de façon à comprendre les stratégies actuelles de développement d inhibiteurs et d activateurs d enzymes. 2) Mises au point sur les méthodes d exploration et de diagnostic o Présentation de la diversité des approches du métabolisme (analyse métabolomique et protéomique par spectrométrie de masse, étude des flux métaboliques, imagerie métabolique, épreuves fonctionnelles). 3) Métabolisme intermédiaire et pathologies o Acides aminés, vitamines et aminoacidopathies (hyperammoniémies, aciduries organiques). o Métabolisme des purines et des pyrimidines. o Métabolisme des monosaccharides et des disaccharides (fructosémie et galactosémie congénitales). o Voies métaboliques mitochondriales et peroxysomales. o Oncométabolisme et reprogrammation métabolique. 4) Métabolisme de molécules complexes et pathologies o Métabolisme de l hème et porphyries. o Métabolisme du glycogène et glycogénoses. o Catabolisme des glycosaminoglycanes et mucopolysaccharidoses. o Anomalies de la glycosylation et de la glypiation des protéines. o Catabolisme des glycoprotéines et oligosaccharidoses. o Métabolisme des acides biliaires et cholestase. o Troubles de biosynthèse, de dégradation et de remodelage des lipides complexes (glycosphingolipides, phospholipides). 5) Biochimie métabolique intégrée et pathologies o Pathologies neurodégénératives et cardiovasculaires et métabolisme des espèces réactives de l oxygène et de l azote. o Pathologies conformationnelles et stress du réticulum endoplasmique. o Pathologie vasculaire et fonction endothéliale. o Pathologies osseuses et remodelage de la matrice extracellulaire. o Fibroses tissulaires (hépatique, rénale, cardiaque) et anomalies de la matrice extracellulaire et des tissus conjonctifs. 6) Séminaires d analyses d articles o Trois ou quatre séances de présentations d articles sur différents thèmes abordés en cours.

2 Université Paris Descartes - Parcours d Initiation à la Recherche - Biologie Cellulaire - Physiologie - Pathologies Unité Master Recherche 5 - Biochimie Moléculaire et Cellulaire des Maladies Métaboliques : aspects physiopathologiques & thérapeutiques PLANNING UMR5 BMC2M - PIR BCPP Les cours ont lieu les mardis et jeudis de à 20h15 / 20h30 à la Faculté de Pharmacie Date 12/01 17/01 19/01 24/01 1 / M1 2h00 2 / M1 2h00 3 / M1 2h00 4 / M2 2h00 1 (Mécanismes d action des enzymes et de leurs modes de régulations) et 2 (Mises au point sur les méthodes d exploration et de diagnostic). Classification et familles d enzymes ; niveaux d organisation structurale des enzymes ; coenzymes et cosubstrats ; mécanismes réactionnels. Cinétiques Michaéliennes à plusieurs substrats ; coopérativité et allostérie ; types d inhibition enzymatique. Pourquoi les enzymes sont-elles des cibles thérapeutiques? Les caractéristiques fondamentales de leur action et de leur régulation. Enzymologie de la molécule unique. Protéomique et métabolisme. Mécanismes de régulation post-traductionnelle des enzymes : phosphorylation, acétylation, méthylation Dr Gilles Phan Dr Sylvie Gillet Pr Michèle Reboud-Ravaux Dr Sylvie Gillet 26/01 5 / M2 Epreuves fonctionnelles et explorations métaboliques. Dr Claude Jardel Applications cliniques de l imagerie métabolique. Dr Nicolas Tournier 1

3 31/01 6 / M1 2h00 Principes de catalyse enzymatique. Mécanismes d action typiques et relations structure-activité exemplifiés sur des enzymes d intérêt. Pr Michèle Reboud-Ravaux 02/02 7 / M2 2h00 Analyses par spectrométrie de masse pour la biochimie clinique. Apport de l'analyse métabolomique par spectrométrie de masse dans le domaine de la biologie médicale. Dr Christophe Junot 07/02 09/02 14/02 8 / M1 2h00 9 / M2 2h00 Inhibiteurs et activateurs d enzymes : outils de recherche et médicaments. Stratégies de découverte de molécules biologiquement actives. Recherche translationnelle. Méthodes d étude structurale des complexes enzymatiques macromoléculaires et supramoléculaires. Pr Michèle Reboud-Ravaux Dr Gilles Phan 10 / M2 2h00 Méthodes d étude des flux métaboliques. Pr Daniel Tomé 3 : Métabolisme intermédiaire et pathologies 16/02 11 / M3 2h00 Métabolisme des acides aminés et aminoacidopathies : aspects cliniques, biologiques et biochimiques. Dr Bernadette Chadefaux 21/02 12 / M3 1h00 Métabolisme des acides aminés et aminoacidopathies : traitements. Dr Bernadette Chadefaux 19h05 1h20 Métabolisme des purines et pyrimidines. Dr Irène Céballos-Picot 23/02 13 / M3 2h00 Voies métaboliques peroxysomales : β-oxydation des acides gras à très longue chaîne, α-oxydation des acides gras, métabolisme du glyoxylate. Dr Foudil Lamari 2

4 28/02 14 / M3 1h20 Voies métaboliques mitochondriales : carrefour du pyruvate et pyruvate deshydrogénase ; β-oxydation des acides gras et cétogenèse ; cycle de Krebs. Dr Audrey Boutron 19h25 1h00 Voies métaboliques mitochondriales : complexes de la chaîne respiratoire. Dr Claude Jardel 02/03 15 / M3 Métabolisme des glucides (mono et disaccharides) : fructosémie congénitale, galactosémie congénitale. Métabolisme des acides organiques et aciduries organiques : aspects diagnostiques et thérapeutiques. Dr Elise Lebigot Dr Odile Rigal 07/03 Pelletie 16 / M3 0h50 Introduction sur les besoins métaboliques de la prolifération cellulaire. Pr Bernard Hainque 18h55 1h30 Oncométabolisme et reprogrammation métabolique. Dr Chris Ottolenghi 4 : Métabolisme de molécules complexes et pathologies 09/03 17 / M4 2h00 Métabolisme de l hème et porphyries. Pr Hervé Puy 14/03 18 / M4 Catabolisme des glycoprotéines et oligosaccharidoses. Dr Jean-François Benoist Catabolisme des glycosaminoglycanes et mucopoly-saccharidoses. Dr Odile Rigal 16/03 19 / M4 2h00 Glycosylation et glypiation des protéines : Congenital Disorders of Glycosylation. Pr Nathalie Seta 21/03 20 / M4 2h00 Maladies héréditaires du métabolisme et troubles de biosynthèse, de dégradation et de remodelage des lipides complexes : * biosynthèse et catabolisme des glycosphingolipides ; * biosynthèse et remodelage des phospholipides. Dr Foudil Lamari 3

5 23/03 28/03 30/03 18/04 21 / M4 22 / M5 23 / M5 24 / M5 Métabolisme du glycogène et glycogénoses. Dr Anne Spraul Cholestase et métabolisme des acides biliaires : déficits en transporteurs hépatobiliaires (sels biliaires, phospholipides ). 5 : Biochimie métabolique intégrée et pathologies : La biologie RedOx Métabolisme des espèces réactives de l oxygène et de l azote : caractéristiques, principales sources cellulaires, cibles biologiques. Métabolisme des espèces réactives de l oxygène et de l azote : systèmes de défense. Métabolisme des espèces réactives de l oxygène et de l azote : implication dans les pathologies neurodégénératives et cardiovasculaires. Anomalies de la matrice extracellulaire et des tissus conjonctifs : remodelage de la matrice extracellulaire dans les pathologies osseuses. Dr Anne Spraul Pr Dominique Bonnefont- Rousselot Pr Didier Borderie Pr Dominique Bonnefont- Rousselot Pr Didier Borderie Pathologies conformationnelles. Pr Robert Barouki Anomalies de la matrice extracellulaire et des tissus conjonctifs : mécanismes de fibrose tissulaire (hépatique, rénale, cardiaque). 6 : Séminaires d analyses d articles Pr Bernard Hainque 20/04 25/04 27/04 25 / M6 2h00 Séminaire 1 26 / M6 2h00 Séminaire 2 27 / M6 2h00 Séminaire 3 4

6 02/05 Parmentier 28 / M6 2h00 Séminaire 4 Examen 18/05 15/06 2h00 Examen (1 ère session). 2h00 Examen (2 ème session). 5