Informatique médicale, e-santé. Fondements et applications

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1 Informatique médicale, e-santé Fondements et applications

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3 Informatique médicale, e-santé Fondements et applications Sous la direction de Alain Venot Avec la collaboration de Anita Burgun Catherine Quantin

4 Alain Venot UFR SMBH Léonard de Vinci Université Paris 13 74, rue Marcel Cachin Bobigny Anita Burgun Unité Inserm U 936, Laboratoire d Informatique Médicale Faculté de médecine 2, avenue du Professeur Léon Bernard Rennes Catherine Quantin CHU de Dijon, Service de Biostatistique et Informatique Médicale Département d Information Médicale 1, boulevard Jeanne d Arc, BP Dijon Cedex ISBN : Springer Paris Berlin Heidelberg New York Springer-Verlag France, 2013 Springer-Verlag est membre du groupe Springer Science + Business Media Cet ouvrage est soumis au copyright. Tous droits réservés, notamment la reproduction et la représentation, la traduction, la réimpression, l exposé, la reproduction des illustrations et des tableaux, la transmission par voie d enregistrement sonore ou visuel, la reproduction par microfilm ou tout autre moyen ainsi que la conservation des banques de données. La loi française sur le copyright du 9 septembre 1965 dans la version en vigueur n autorise une reproduction intégrale ou partielle que dans certains cas, et en principe moyennant le paiement des droits. Toute représentation, reproduction, contrefaçon ou conservation dans une banque de données par quelque procédé que ce soit est sanctionnée par la loi pénale sur le copyright. L utilisation dans cet ouvrage de désignations, dénominations commerciales, marques de fabrique, etc. même sans spécification ne signifie pas que ces termes soient libres de la législation sur les marques de fabrique et la protection des marques et qu ils puissent être utilisés par chacun. La maison d édition décline toute responsabilité quant à l exactitude des indications de dosage et des modes d emploi. Dans chaque cas il incombe à l usager de vérifier les informations données par comparaison à la littérature existante. Maquette de couverture : Jean-François Montmarché Mise en page : Arts Graphiques Drouais Dreux

5 Sommaire Avant-propos A. Venot, A. Burgun, C. Quantin et P. Roy... IX Préface A. Venot... XI Chapitre 1 L informatique médicale en tant que discipline scientifique A. Venot, A. Burgun, S. Després et P. Degoulet... 1 Chapitre 2 Le vocabulaire médical, les ressources terminologiques, le codage de l information en santé C. Duclos, A. Burgun, J.-B. Lamy, P. Landais, J.-M. Rodrigues, L. Soualmia, P. Zweigenbaum Chapitre 3 La gestion et la diffusion des connaissances en santé A. Venot, J. Charlet, S. Darmoni, C. Duclos, J.-C. Dufour et L. Soualmia Chapitre 4 La représentation des données des patients dans un système d information de santé et dans le Dossier Patient Informatisé M. Cuggia, P. Avillach et C. Daniel Chapitre 5 Le traitement d images médicales : principes, principales applications et perspectives L. Legrand Chapitre 6 Interventions médicales augmentées : surgétique et robotique A. Moreau-Gaudry et P. Cinquin Chapitre 7 L aide au diagnostic médical B. Séroussi, P. Le Beux et A. Venot Chapitre 8 L aide à la décision thérapeutique B. Séroussi, J. Bouaud, C. Duclos, J.-C. Dufour et A. Venot Chapitre 9 L aide à la décision médico-économique C. Le Bihan, C. Duclos et P. Landais

6 VI Informatique médicale, e-santé Chapitre 10 L aide à la décision en santé publique C. Jacquelinet, E. Sauleau, P. Lévy et H. Chaudet Chapitre 11 Sécurité, aspects juridiques et éthiques des données de santé informatisées C. Quantin, F.A. Allaert, B. Auverlot et V. Rialle Chapitre 12 Les systèmes d information hospitaliers P. Degoulet Chapitre 13 Les données de santé et les dossiers médicaux partagés P. Staccini, C. Daniel et P. Gillois Chapitre 14 L informatisation du cabinet médical M. Cuggia, P. Le Houerou et A. Venot Chapitre 15 L informatisation du cabinet dentaire V. Bertaud, B. Chaumeil, E. Ehrmann, M. Fages et J. Valcarcel Chapitre 16 L informatisation des officines pharmaceutiques G. Simon, H. Lepage, R. Moreau et J.-L. Rappa Chapitre 17 La e-santé R. Beuscart, E. Chazard, J. Duchêne, G. Ficheur, J.-M. Renard, V. Rialle et N. Souf Chapitre 18 Informatique biomédicale et recherche en santé Informatique translationnelle C. Daniel, E. Albuisson, P. Avillach, A. Burgun, G. Chêne, M. Cuggia, T. Dart et M. Goldberg Chapitre 19 Facteurs humains et ergonomie en informatique médicale H. Chaudet, F. Anceaux, M.C. Beuscart, S. Pelayo et L. Pellegrin Index

7 Ce livre est dédié à François Grémy successivement, professeur d Informatique Médicale à la Faculté de médecine Pitié-Salpêtrière puis à Montpellier. Il est considéré comme un des fondateurs de cette discipline au niveau international et est à l origine de son développement en France.

8 Avant-propos L informatique médicale est devenue au fil des années une vraie discipline scientifique avec ses congrès internationaux, ses journaux, ses salons, ses laboratoires de recherche, ses appels d offres nationaux et internationaux pour financer la recherche, ses masters pour former les étudiants. Ses bases et applications sont enseignées, non seulement dans tous les domaines de santé (médecine, odontologie, pharmacie, maïeutique, sciences sanitaires et sociales, École de Soins infirmiers et de kinésithérapie, École de santé publique ), mais également dans de nombreux autres cursus (Sciences de la vie, Écoles d ingénieur et d économie, etc.). Il s agit d une matière complexe et qui évolue rapidement. Les ouvrages relatifs à ce domaine sont peu nombreux et rapidement obsolètes. Ce livre d informatique médicale est le fruit du travail collectif de nombreux auteurs appartenant principalement au Collège français des enseignants chercheurs de cette discipline. Il est composé de 19 chapitres qui comportent tous des objectifs pédagogiques, des conseils pour approfondir les connaissances dans le domaine et des exercices. Le chapitre 1 montre comment l informatique médicale est devenue une discipline scientifique à part entière. Il en présente les grands domaines et les liens avec d autres matières comme l informatique générale, la biostatistique, le génie biomédical, la santé publique. Les principales sociétés savantes, revues, congrès et salons y sont listés. Le chapitre 2 est centré sur les grandes ressources terminologiques en santé. Celles-ci sont en effet un outil indispensable à la normalisation de l expression des concepts et au codage de l information en santé, ces deux opérations étant un préambule incontournable à l exploitation de l information (opération de recherche notamment). Le chapitre 3 présente les différentes sources de connaissances en santé, les principes de leur indexation, les moyens d y accéder et les critères de qualité de l information. Le chapitre 4 a trait à la représentation des données des patients dans un système d information de santé. Les problèmes posés par l informatisation du dossier patient y sont analysés. Les modalités de structuration et de normalisation des données y sont présentées.

9 X Informatique médicale, e-santé Dans les chapitres 5 et 6, le lecteur est initié aux principes du traitement et de l analyse des images médicales. Il peut ainsi comprendre comment ces méthodes et techniques peuvent venir «augmenter» le médecin et le chirurgien, lui offrir la possibilité d utiliser des robots et d arriver ainsi à une meilleure qualité des interventions. Les chapitres 7 à 10 concernent l aide à la décision individuelle puis collective. Le lecteur peut ainsi appréhender les bases théoriques sur lesquelles sont construites les méthodes d aide au diagnostic et à la décision thérapeutique, ainsi que les grandes applications qui en découlent. Puis, les aspects médico-économiques y sont présentés afin de pouvoir comprendre ce qu est le programme de médicalisation des systèmes d information qui a conduit à des modalités sophistiquées de tarification à l activité dans les hôpitaux. Enfin, les différentes méthodes et outils qui peuvent aider à la décision dans le domaine de la santé publique sont expliqués au lecteur. Le chapitre 11 traite du respect de l éthique, des textes de lois lors de la collecte, de l archivage, de la transmission de données de santé informatisées. Les processus de sécurisation des enregistrements et échanges d information y sont aussi présentés. Les chapitres 12 à 17 abordent successivement de grandes applications de l informatique médicale comme le développement des systèmes d information hospitaliers, celui des dossiers partagés, l informatisation des cabinets médicaux, dentaires et des officines pharmaceutiques. Le concept d e-santé est présenté ainsi que les deux volets de la télésanté qui regroupe télémédecine et téléservices pour la vie courante et le bien-être social. Le chapitre 18 explique comment l informatique médicale facilite les activités de recherche, qu il s agisse de recherche fondamentale ou clinique en épidémiologie comme en santé publique. Enfin, le chapitre 19 vient présenter la place très grande des facteurs humains et de l ergonomie dans les applications de l informatique médicale. Volontairement, cet ouvrage ne comporte pas de bibliographie classique. Certaines références sont données dans le corps du texte. À la fin de chaque chapitre, une section «Pour en savoir plus» donne au lecteur selon les domaines traités des mots clés pour faire lui-même une recherche bibliographique, des liens vers des sites à consulter et éventuellement quelques références d articles ou d ouvrages généraux sur le sujet. Professeur Alain Venot Université Paris 13 Professeur Anita Burgun Université Rennes 1 Professeur Catherine Quantin Université de Bourgogne Professeur Pascal Roy Université Lyon 1 Président du Collège des enseignants d Informatique Médicale, Méthodes en Épidémiologie, Statistique (CIMES)

10 Préface Les premières recherches effectuées dans le but d informatiser les processus métiers en médecine ont commencé il y a plus de cinquante ans. La tâche s est avérée laborieuse, plus difficile qu on ne le prévoyait et a nécessité des recherches spécifiques. Des systèmes informatisés se sont progressivement répandus dans divers domaines en Santé et sont maintenant largement présents dans nombre d hôpitaux, de cabinets médicaux et dentaires, d officines pharmaceutiques. Mais les logiciels en santé sont loin d être considérés comme optimaux. Leur utilisation semble souvent laborieuse. Ils communiquent difficilement entre eux. La recherche continue pour les améliorer, les rendre plus interopérables, plus faciles à utiliser et ainsi arriver à la mise en place de systèmes d information efficients en santé. Le domaine de l informatique médicale est complexe, rapidement évolutif et donc difficile à appréhender. Ses grands principes sont enseignés maintenant dans les cursus de beaucoup des professionnels. De ce fait, il est particulièrement important que soient écrits et diffusés des ouvrages pédagogiques qui en expliquent les fondements et décrivent des applications que les médecins, odontologistes, pharmaciens auront à utiliser au cours de leurs pratiques. L université doit pouvoir former aussi des spécialistes d informatique médicale, qui ont besoin au début de leur master d ouvrages basiques de référence. Ce livre vient répondre à ces besoins. Il a été rédigé à l initiative d un collectif français d enseignants d informatique médicale intervenant dans des cursus de santé, ainsi que dans des masters plus spécifiques. La réunion d un tel panel d auteurs de haut niveau qui ont tous écrit dans leur domaine de compétence confère une garantie de qualité et de fraîcheur aux informations présentées dans les 19 chapitres qui constituent cet ouvrage. Un effort pédagogique a été fait pour permettre au lecteur de tester sa compréhension de chaque chapitre grâce à l énoncé d objectifs pédagogiques et d exercices, et d approfondir ses connaissances en suivant les conseils de navigation et de lecture que l on peut trouver dans les sections «Pour en savoir plus». Des encadrés viennent rompre la monotonie des paragraphes et mettent en exergue des éléments qui ont semblé particulièrement importants aux rédacteurs. Cet ouvrage contient de nombreux liens vers des sites Web d organismes divers nationaux ou internationaux comme ceux d agences, de sociétés savantes, de

11 XII Informatique médicale, e-santé revues scientifiques. Le lecteur qui étudie avec ce livre découvrira les grands concepts, les méthodes de traitement des données et connaissances sur lesquels reposent les logiciels en santé. Il y trouvera nombre d informations qui lui faciliteront l appréhension du contexte qui fait le monde de l informatique médicale. Il en est ainsi de la structuration des sociétés savantes et de leurs interrelations, des grands congrès où aller continuer sa formation, des principaux journaux où publier, des agences nationales qui diffusent des informations liées à l informatique médicale. Alain Venot Professeur d Informatique Médicale à l Université Paris 13