Rapport annuel d'activité, année Laboratoire National de Référence. Brucelloses animales (y compris pour le contrôle officiel des brucellines)

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1 Rapport annuel d'activité, année 2014 Laboratoire National de Référence Brucelloses animales (y compris pour le contrôle officiel des brucellines) Nom du responsable du LNR Claire Ponsart Nom de l'unité où l'activité du LNR est mise en œuvre Unité Zoonoses Bactériennes Nom du laboratoire où l'activité du LNR est mise en œuvre Laboratoire de Santé Animale Nombre de laboratoires agréés et/ou reconnus dans le réseau 90 Précisez la catégorisation du danger (en SA) sinon la justification de l'existence du mandat de LNR Infection à Brucella toutes espèces sauf B. suis biovar 2 et B. ovis= cat 1 Brucellose porcine à B. suis biovar 2 = cat. 2 Epididymite contagieuse ovine à B. ovis non catégorisée 1

2 Introduction Les faits marquants de l'année - Evaluation d un test sérologique rapide pour le dépistage de la brucellose chez les bouquetins (massif du Bargy) - Appui scientifique et technique à la DGAl à la gestion de foyers de brucellose porcine - Appui scientifique et technique à la DGAl à la gestion d infection atypique à Brucella suis bv. 2 chez des ruminants - Appui scientifique et technique à la DGAl à gestion de fort taux de réactions faussement positives dans deux cheptels de ruminants (suivi cinétique) - Essai pilote sur un prototype de kit ielisa (ELISA indirect) porcs (LPS-R/S) - Participation au groupe de travail DGAL/plateforme ESA sur la révision de la réglementation «surveillance programmée/ événementielle brucellose ovine et caprine» - Participation au groupe plateforme ESA Surveillance des avortements (bovins) Révision de la réglementation concernant la surveillance événementielle de la brucellose chez les bovins - Organisation d un EILA Brucellose sérum (EAT, FC, SAW, ielisa) 1. Méthodes développées ou révisées Nombre de méthodes développées ou révisées proposées à l autorité compétente 1 Donner le nom et une brève description de chacune de ces méthodes Validation d un test sérologique rapide, pour la surveillance de la brucellose chez le bouquetin (validation sur sérum et sur sang total) Nombre de méthodes développées ou révisées qui sont susceptibles d être prêtes pour être proposées à l autorité compétente au cours de l année N+1 2 2

3 Donner le nom et une brève description de chacune de ces méthodes Méthode de PCR en temps réel pour la détection du genre Brucella sur prélèvements biologiques (validation diagnostique en cours). Initialement prévu pour 2014, mais validation décalée en Test ELISA permettant d'améliorer la différenciation entre réactions sérologiques spécifiques et non spécifiques en brucellose porcine (publication soumise). A plus long terme (n+2, n+3): Développement d'approches NGS : - l'identification de marqueurs moléculaires permettant l'identification des souches de Brucella - l'identification de marqueurs moléculaires impliqués dans la virulence - la caractérisation de souches présentant des caractéristiques phénotypiques atypiques Développement d'un prototype d'elisa indirect sur lait de mélange de petits ruminants 2. Matériels biologiques ou chimiques, matériaux de référence et échantillons et souches d'intérêt Décrire ici les collections d'échantillons biologiques ou d'autre nature (environnement, aliment...) conservés par le LNR; indiquer les méthodes de conservation, la température, le nombre de "repositories", le nombre d'échantillons par souche, l'enregistrement associé...). Le laboratoire dispose : - d une collection de plus de souches d origine animale isolées des principales espèces domestiques sensibles (bovins, ovins, caprins, porc, chien, chat, camélidés) et de plusieurs espèces sauvages (chamois, bouquetin, sanglier, lièvre, dauphins, marsouins, etc.), d origine principalement française, mais aussi du reste de l Europe, d Afrique, du Proche et Moyen-Orient, d Amérique Latine et du Pacifique sud - d une collection de plus de 200 souches humaines d origines géographiques variées. - d une collection de plusieurs milliers de sérums d espèces animales variées, en volumes variables et issus d animaux/humains à statut connu ou inconnu au regard de la brucellose. - d une collection de souches apparentées aux Brucella au plan génomique (Ochrobactrum, Agrobacterium, etc.) ou antigénique (Yersinia enterocolitica O:9, Francisella tularensis, E. coli O:157H7), ainsi qu une importante collection de souches potentiellement présentes dans l environnement de l élevage ou dans les prélèvements animaux pour l étude de la spécificité des outils de détection moléculaire développés au laboratoire. - de la souche d épreuve 544 de B. abortus biovar 1 nécessaire au contrôle des lots de semence de vaccins vétérinaires dans le modèle souris INRA - des souches de référence ATCC/NCTC et des souches types (pour B. ceti et B. pinnipedialis et B. microti récemment approuvées) de l ensemble des espèces et biovars de Brucella actuellement reconnus - des souches de référence permettant la fabrication des antigènes et kits ELISA de 3

4 diagnostic (B. abortus biovar 1 S99) et des vaccins vétérinaires classiques (S19 USDA et Rev.1 EDQM) ainsi qu un exemplaire de la souche vaccinale RB51 (sous licence). Autres matériaux de référence L ensemble des souches identifiées par le laboratoire tant chez l homme que chez l animal fait l objet d un bilan annuel à l InVS communiqué dans le rapport annuel du CNR et à l ANSM dans le cadre de l application de l Arrêté du 30 juillet 2004 relatif à la mise en œuvre, l importation, l exportation, la détention, la cession à titre gratuit ou onéreux, l acquisition et le transport de certains agents responsables de maladies infectieuses, microorganismes pathogènes et toxines. Le LNR dispose, pour ce qui concerne le domaine vétérinaire, des sérums nationaux, européens et internationaux de référence et de la brucelline nationale et européenne de référence. Le LNR produit et standardise également les sérums monospécifiques de lapin anti-a, -M, -R et les bactériophages (Wb, Tb, Iz1, R/C) nécessaires au typage phénotypique des souches de Brucella. Le LNR produit et commercialise le seul antigène et les seuls sérums de contrôle positif et négatif disponibles pour la FC (Fixation du Complément) B.ovis sur le marché national et européen. Souches bactériennes et sérums : Toutes les souches sont conservées à une température de -20 C en bouillon glycérolé (conservation supérieure à 30 ans) ou lyophilisées et à 4 C. Toutes les souches de référence sensu stricto (ATCC), les souches témoins et celles utiles aux productions industrielles font l objet de banques primaires et, si nécessaire, de banques secondaires. La collection des souches de référence et la quasi-totalité des souches de terrain est ouverte (à l exception de quelques souches de grande valeur, du fait de l espèce d origine ou de leur rareté par exemple) et disponible pour l ensemble des laboratoires nationaux et internationaux de référence (vétérinaires/médicaux), moyennant la prise en charge par le destinataire du coût lié à la maintenance de la collection (réévalué annuellement au tarif officiel de l Anses) et du coût du transport. La collection peut être ouverte à d autres organismes, mais exclusivement sur la base d une convention formelle. Nombre de souches/échantillons reçu(e)s et mis(es) en collection dans l'année 1578 Nombre de souches/échantillons maintenu(e)s au total (souches uniquement)

5 3. Activités d'analyse 3.1 Analyses officielles de première intention Nombre d'analyses de première intention réalisées dans l'année (de biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...) 529 Détaillez ici par type d'analyse de première intention Total : 529 (349 en sérologie et 180 en bactériologie) Sérologie : EAT : 42 C-ELISA (faune sauvage) : 202 (augmentation -> faune sauvage Bargy / Tourné I-ELISA lait mélange petits ruminants expérimental : 8 Sérologie B. canis : 69 (61 LFIA, 6 SAT et 2 RSAT) Sérologie B. ovis (export) : 28 Bactériologie: Recherche de Brucella par culture (échantillons d origine animale venant de France) : 180 échantillons ; Augmentation significative en 2014 liée à plusieurs investigations de suspicions de brucellose porcine et du cas d infection à Brucella suis bv. 2 chez un bovin Analyses officielles de confirmation Nombre d'analyses de seconde intention réalisées dans l'année (de biotypie, sérotypie, caractérisation moléculaire...) 2550 Détaillez ici par type d'analyse de confirmation Confirmations sérologiques : - Confirmation sur lait de mélange bovin : 115 ELISA lait (85 pos, 15 douteux, 15 neg), 100 RT (8 pos, 91 neg, 1 ininterprétable); taux de confirmation : ELISA : 87%; Ring-Test: 8% - Investigation sérologique chez les ruminants : 365 EAT, 308 FC, 59 ELISA bovin, 53 ELISA petits ruminants : Augmentation liée à des investigations dans des cheptels corses (dépistage en parallèle du laboratoire départemental dans le cadre d'investigation de cas humains groupés, 2013) et au suivi cinétique de cheptels de ruminants avec fort taux de faux positifs (Ardèche, Corrèze) - Investigation sérologique chez les porcins : EAT porcin : 475, FC porcin : 468, ielisa 5

6 porcin : 525; Augmentation liée aux investigations de suspicions de brucellose porcine Identification et typage de Brucella : 27 (souches reçues au LNR pour typage) et 13 (souches isolées au LNR puis typées) 27 souches reçues au LNR pour typage (Confirmation Brucella: 23/27 reçues): - Suspicions traitées dans le cadre de la surveillance de la brucellose des ruminants (prophylaxie ou avortements) : 3 souches (dont une confirmée B. suis bv. 2 chez un bovin) - Analyses SAGIR : 2 souches de lièvre - Pour 2 foyers porcins à Brucella suis bv. 2 (sur les 6 confirmés en France en 2014) : 22 souches Identification des souches isolées par les laboratoires agréés ; plusieurs souches ont été envoyées par foyer, la confirmation d une seule souche suffit pour la police sanitaire (les autres souches sont conservés en souchothèque pour R&D) - Typage moléculaire de Brucella : 2 (B. suis 2 bovin) 13 souches isolées au LNR puis typées: 2 souches isolées à partir de prélèvements de sangliers (sous-traitance LVD37) 3 souches isolées sur un bovin infecté à B. suis bv. 2 (à partir de différents prélèvements) 6 souches isolées à partir de prélèvements d un foyer porcin (64) 2 souches isolées à partir de prélèvements d un foyer porcin (65) Au total sur les 6 foyers de brucellose porcine confirmés en 2014, 4 cheptels ont été confirmés par isolement : 2 isolements+typages réalisés au LNR à partir de prélèvements et 2 typages de souches réalisées au LNR (isolées par labos agréés) 2 cheptels en lien ont été confirmés uniquement en sérologie. Taux de confirmations par type d'analyse (= nombre de résultats confirmés / nombre d'analyses officielles de seconde intention réalisées) Souches 23/27 reçues 3.3. Autres analyses Nombre estimé d'autres analyses (non officielles) réalisées dans l'année en lien avec le mandat de LNR 908 Détaillez ici par type d'autres analyses Essais de validation d un prototype de kit ielisa porcs LPS-R : 525 sérums Typage moléculaire de Brucella : MLVA : 82 souches de Brucella suis bv. 2 (France) RFLP 301 souches de Brucella suis bv. 2 (France) 6

7 4. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence et de réactifs biologiques Le LNR produit-il et fournit-il des réactifs? Oui Cette activité est-elle une obligation découlant de textes réglementaires, normatifs ou infra-réglementaires (notes de service). Si oui, lesquels? Directive 64/432 et 91/68 Normes AFNOR immunosérologie LAB GTA 27 (U47-003, U47-004, U47-005, U47-008, U47-019, U47-021, U47-304, U47-307, U47-308, et bactériologie programme 116 (U47-105, U47-109) brucellose Quels sont les types de réactifs produits et fournis (vaccins, kits, autres)? Antigène pour la fixation du complément (FC) B. ovis Sérum positif contrôle B. ovis Sérum négatif contrôle B. ovis Sérum polyclonal anti-brucella S, sérum anti-brucella R et sérum négatif Quels est le nombre de lots produits et fournis par an? (moyenne sur les 5 dernières années) 1 Quelles sont les quantités produites/fournies par lot? (moyenne sur les 5 dernières années) 1 Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années Quantités produites : - Antigène FC B. ovis : Production (2011) : 1er lot : une centaine d aliquots (utilisation interne) ; second lot : 1130 aliquots - Sérum positif contrôle B. ovis produits par ANSES Sophia - Sérum négatif contrôle B. ovis produits par ANSES Sophia - Sérum polyclonal anti-brucella S, sérum anti-brucella R et sérum négatif : 7

8 Production : 40 ml environ pour le sérum polyclonal (2012), 94 ml de sérum négatif produit en 2010, 146 ml de sérum anti-r produit en 2008 Quantité fournies (stables sur les 5 dernières années) : - Antigène FC B. ovis : 150 vials de 0.5mL (moyenne de 116 vials/an sur 5 ans) - Sérum positif contrôle B. ovis : 30 vials en 2014 (moyenne de 21 vials/ an sur 5 ans) - Sérum négatif contrôle B. ovis : 1 vial en 2014 (moyenne de 2 vials/ an sur 5 ans) - Sérum polyclonal anti-brucella S, sérum anti-brucella R et sérum négatif : 2 tubes de chaque sérum pour chacun des 13 laboratoires agréés du réseau français en 2012 (pas de fourniture en 2014) ; fourniture à certains laboratoires de référence européens ex : Pologne, Suède, (lié aux activités de LRUE) Le LNR fournit-il des matériaux de référence? Oui Cette activité est-elle une obligation découlant de textes réglementaires, normatifs ou infra-réglementaires (notes de service). Si oui, lesquels? Annexe C directive 64/432 Quels sont les types de matériaux de référence (MRE, MRI, contrôles positifs ou négatifs, autre) produits et fournis? Panels de sérums de référence (MRE) Sérums étalons nationaux Souches/ADN de référence Quel est le format (sérum, souche, produit chimique, autre) de ces matériaux de référence? Sérum, souche, ADN Quel est le nombre de lots produits et fournis par an? (moyenne sur les 5 dernières années) 1 Quelles sont les quantités produites/fournies par lot? (moyenne sur les 5 dernières années) 1 8

9 Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années Quantités produites : Panels de sérums de référence (MRE) : production 1 lot années 90 Sérums étalons nationaux (MRE) : production plusieurs lots années 80 Quantités fournies : 2-10 flacons de sérums de référence équivalents nationaux pour l EAT, 2-10 flacons de sérums de référence équivalents nationaux pour l ELISA, 2-10 flacons de sérums de référence équivalents nationaux pour la FC, 2-10 panels de référence En 2012, 2 souches de référence fournies à chaque laboratoire agréé pour la bactériologie des Brucella (pas de fourniture de souches de référence au niveau national en 2014) Le LNR réalise-t-il des contrôles de réactifs commerciaux? Oui Cette activité est-elle une obligation découlant de textes réglementaires, normatifs ou infra-réglementaires (notes de service). Si oui, lesquels? Réactifs de diagnostic in vivo (Brucelline : Manuel OIE) et in vitro (antigènes et kits ELISA) : Annexe C Directive UE 64/432 et Normes AFNOR Quelles sont les modalités de contrôle (initiaux, répétitifs, lot par lot)? contrôles initiaux et contrôles lot par lot Quel est le nombre de contrôles - ou de lots contrôlés - par an? (moyenne sur les 5 dernières années) 35 Analyse de l'évolution (augmentation, diminution) des tendances en termes d'activité sur les 5 dernières années maintien du niveau d'activité 9

10 5. Activités d'expertise scientifique et technique 5.1. Demandes d expertise scientifique et technique du ministère (chargé de l agriculture, santé, etc ) ou d instances communautaires et internationales qui concernent votre domaine de compétence Nombre de rapports d'est rendus dans l'année 4 Détaillez ici les demandes d'est et les noms des mandataires Hars J, Vaniscotte A, Gauthier D, Garin-Bastuji B, Gibert P, Le Horgne JM, Toigo C, 2013 Eléments d'analyse complémentaires à la demande d'avis au CNPN relatif à une autorisation d'abattage des bouquetins du massif du Bargy (74), préalable à une réintroduction de l espèce, dans l'intérêt de la santé et de la sécurité publiques pour prévenir des dommages importants à l'élevage, pour des raisons économiques majeures et pour assainir l'enzootie de brucellose au sein de cette population. Rapport, 32 pp. Mandataires : Ministère de l'agriculture et de l'environnement Hars J, Vaniscotte A, Jaÿ M, Game Y, Gauthier D, Gibert P, Herbaux JP, Le Horgne JM, Maucci E, Pasquier JJ, Mick V, Rautureau S, Toigo C, Garin-Bastuji B, Surveillance épidémiologique de la brucellose et suivi populationnel des ongulés sauvages du massif du Bargy et des massifs voisins - Rapport d étape des études , 33 pp, 05/2014. Mandataires : Ministère de l'agriculture et de l'environnement Collective, Report of the Bovine, sheep and goats Brucellosis Task Force Sub- Group Meeting held in Villa Real, Portugal, May 2014, SANCO/11482/2014, 54 pp, 09/14. df Appui scientifique et technique de l Anses, Demande n 2014-SA-0241, NOTE d appui scientifique et technique de l Agence nationale de sécurité sanitaire de l alimentation, de l environnement et du travail relatif au «dépistage des bouquetins infectés de brucellose sur le terrain» Mandataires : DG SANCO Appui scientifique et technique de l Anses, Demande n 2014-SA-0241, NOTE d appui scientifique et technique de l Agence nationale de sécurité sanitaire de l alimentation, de l environnement et du travail relatif au «dépistage des bouquetins infectés de brucellose sur le terrain» Mandataires : Ministère de l'agriculture 10

11 5.2. Autres expertises Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise (internes: CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de commissions de normalisation (Afnor...). Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré. Commission AFNOR Santé Animale (Claire Ponsart) GT EILA ANSES inscription/ transport (Gabriela Vacchio, Gilles Le Carrou, Maryne Jaÿ) 5.3. Dossiers de demande d'agrément Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année 0 Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré. AFNOR (Commission Santé animale) : 1 jour UE : 10 jours ANSES (GT, AST,...) : 20 jours 5.4. Activités de conseil aux professionnels Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré Echanges mails réguliers (plusieurs échanges de mails et téléphoniques DGAl/LVD/DDDP/GDS chaque semaine) temps consacré impossible à déterminer 6. Animation du réseau de laboratoires officiels 6.1. Organisation d'eila Précisez ici le nombre d'eila organisés par le LNR au cours de l année N 1 Nom de l'eila EILA Brucellose analyses sérologiques sur sérum bovin

12 L'EILA est-il réalisé sous accréditation "17043"? Non Nombre de laboratoires participants 84 Nombre de laboratoires agréés participants (Na) 78 Le LNR a-t-il participé à l'eila? Oui Nombre de laboratoires participants en cours de demande d'agrément 0 Nombre d'autres laboratoires participants 47 Détail des autres laboratoires participants: français/étrangers 36 laboratoires européens (Etats membres et non Membres), 5 laboratoires du réseau OIE et 6 fournisseurs de réactifs Nombre de laboratoires ayant obtenu des résultats défavorables 14 Nombre de laboratoires agréés non conformes (Nc) 0 Taux de non conformités Nc/Na 0 12

13 Nature des non conformités (limiter aux laboratoires agréés) 14 laboratoires avec des écarts, soldés suite au renseignement fiche d écart (7) et à la réalisation d un essai complémentaire (7) Gestion des non conformités (limiter aux laboratoires agréés) : actions mises en œuvre pour l'identification des causes et des mesures correctives Envoi d une fiche d écart, prise de contact avec les laboratoires, guide pour l'investigation et l'identification de l origine des problèmes observés Si les échanges ne permettent pas d'identifier de façon univoque l'origine du problème et que l'écart le nécessite : réalisation d'un essai complémentaire Suivi de décisions sur l'agrément NA Evolution du réseau dans le temps Maintien des performances Nom (s) et nombre(s) d'eila que vous prévoyez d'organiser au cours de l année N+1 EILA Brucellose analyses sérologiques sur lait bovin (1) Précisez le nombre d'eil (hors EILA - dont EILV en lien avec méthodes en cours de validation telles que précisées dans le paragraphe 1) organisés par le LNR au cours de l année N 0 Précisez le nombre d'eil (hors EILA) que vous prévoyez d'organiser au cours de l année N Formation, organisation d'ateliers, accueil de stagiaires Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires agréés du réseau, organisées dans l'année 0 13

14 Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux méthodes utilisées pour les contrôles officiels, organisées dans l'année EILA auxquels le LNR a participé dans l'année Détaillez les EILA auxquels le LNR a participé dans l'année, dans le cadre : National; UE (EILA organisé par le LRUE); International - National : 1 - UE (EILA organisé par le LRUE) : 2 (le LNR est également LRUE) + 1 EILA organisé par le CODA-CERVA (Belgique) - International : 0 7. Participation aux activités de surveillance 7.1 PS/PC Existe-t-il un ou plusieurs PS/PC élaboré(s) par l'autorité sanitaire dans le champ du LNR? Oui plusieurs Réseau de surveillance des avortements + réseau de surveillance national des brucelloses bovine, ovine, caprine, et porcine / réseau des laboratoires d analyses agréés en brucellose 7.2 Activités de surveillance hors PS/PC Dispositif(s) hors PS/PC Indiquer si le LNR est intégré à un (ou des) dispositif(s) de surveillance (hors PS/PC)? Non 8. Activités de recherche en lien avec l activité de référence 8.1. Recherches méthodologiques pour la référence Détaillez ici les recherches méthodologiques que vous avez réalisées dans l'année : objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre d'appels à projets... - Activités réalisées dans le cadre du LRUE (mais à conséquences directes pour le LNR) : - Evaluation de l ELISA de compétition et du FPA en comparaison des tests officiels dans l UE (EAT, FC, ielisa) de dépistage de la brucellose ovine et caprine (Mandat LRUE). - Validation (en cours) d une méthode de PCR en temps réel pour la détection du genre Brucella sur prélèvements biologiques (validation diagnostique). Méthode déjà validée au plan analytique. 14

15 Projet Bru-EPIDIA (ANIHWA France/Espagne/Italie) : Brucellosis in wildlife and domestic animals: development of a direct diagnostic method and assessment of genetic diversity of Brucella melitensis and B. suis biovar 2 strains in the EU Recherches associées pour la référence Détaillez ici les recherches associées auxquelles vous avez participé dans l'année (participations à des études cliniques, études d'incidences, modèles d'infections expérimentales, études toxicologiques, essais vaccinaux...): objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre d'appels à projets... NA 9. Relations avec le CNR Existence d'un CNR Oui Intitulé du CNR CNR des Brucella Organisme porteur du CNR ANSES- LSAn - UZB + CHU Nîmes (Laboratoire associé) Collaboration dans le cadre de la surveillance, détailler: collaboration pour la prévention du risque santé publique lors de foyers de brucellose dans la faune domestique et sauvage Collaboration dans le cadre de projets de recherche, détailler: Etude Maldi-TOF Un partenariat a été signé entre le CHU Nîmes et la société biomérieux. Les objectifs de ce partenariat étaient multiples : - 1/ mettre au point un protocole d inactivation des souches de Brucella permettant d éviter la contamination du technicien manipulant une souche de Brucella lors de l identification par spectrométrie de masse ; 15

16 - 2/ évaluer l impact de ce protocole d inactivation sur la qualité des spectres obtenus par spectrométrie de masse - 3/ constituer, à partir d environ 80 isolats divers (qui seront fournis par le CNR et le CNR- LA), une banque de données pour la détection du genre Brucella par spectrométrie de masse. - Les deux premiers objectifs ont été accomplis et ont permis d établir un protocole utilisant deux inactivations successives à l éthanol et par la matrice pour efficacement inactiver Brucella. Ce protocole est efficace sur l ensemble des espèces de Brucella. De plus tous les spectres obtenus ont permis la reconnaissance par le logiciel Saramis des souches testées avec un pourcentage d identification et un nombre de pics protéiques observés similaires. - Le troisième objectif a été débuté en 2014 et sera poursuivi en Ce projet est essentiel car plusieurs cas de brucelloses non diagnostiquées par cette nouvelle technologie (ayant pris la place des méthodes classiques d identification bactérienne dans les laboratoires de bactériologie) ont été rapportés ayant occasionné une exposition du personnel à cette bactérie. Autres collaborations, détailler: NA 10. Autres mandats Le LNR détient-il d'autres mandats de référence dans le même domaine de compétences Oui Si oui, précisez : Mandats LRUE, laboratoire de référence OIE, FAO et CNR Annexes Listes des publications et communications: Publications destinées aux professionnels Hars J, Jaÿ M, Game Y, Gauthier D, Herbaux JP, Le Horgne JM, Maucci E, Pasquier JJ, Rautureau S, Vaniscotte A, Garin-Bastuji B (2014) Un foyer de brucellose chez les ongulés sauvages du massif du Bargy en Haute-Savoie. Lettre d Information du Réseau national Ongulés Sauvages ONCFS/FNC N 18,

17 Maris P, Allix S, Etienne S, Garin Bastuji B, Gassilloud B, Lecarrou G, Madani N, Marianneau P, Monchâtre-Leroy E, Rizzo F, Rousset E, Sidi-Boumedine K, Zini S (2014) Methodological guide to the implementation of a process for airborne surface disinfection applied to containment areas/ Guide méthodologique pour la mise en oeuvre d un procédé de désinfection des surfaces par voie aérienne appliqué aux zones confinées. Euroreference 12, Focus, Perrin JB, Rautureau S, Bronner A, Dufour B, Jaÿ M, Garin-Bastuji B (2014) Aucun cas de brucellose bovine identifié en Bull. Epidémiol. Santé Anim. Alim., Spécial Maladies Réglementées et Emergentes (MRE) 64: Perrin JB, Rautureau S, Garin-Bastuji B, Jaÿ M, Bronner A, Dufour B (2014) Brucellose des petits ruminants en 2013: situation épidémiologique et évolution des modalités de surveillance. Bull. Epidémiol. Santé Anim. Alim., Spécial Maladies Réglementées et Emergentes (MRE) 64:16-19 Marcé C, Garin-Bastuji B, Jaÿ M, Pozzi N, (2014) Brucellose porcine en France en 2013 : trois foyers en race locale. Bull. Epidémiol. Santé Anim. Alim., Spécial Maladies Réglementées et Emergentes (MRE) 64: Publications scientifiques internationales Brown C, Garin-Bastuji B, Ziay G, Hayajneh W, Al-Fuqaha S, Hemida H, Otify Y, Hailat I, Alkhlouf S, Hailat N (2014) Improving the diagnostic capacities of brucellosis, enhancing the vaccination and control strategies in the Middle East and North Africa. Pak Vet J 34(2): Garin-Bastuji B, Hars J, Drapeau A, Cherfa MA, Game Y, Le Horgne JM, Rautureau S, Maucci E, Pasquier JJ, Jaÿ M, Mick V (2014) Re-emergence of Brucella melitensis in wildlife, France. Emerg Infect Dis 20: Garin-Bastuji B, Mick V, Le Carrou G, Allix S, Perrett LL, Dawson CE, Groussaud P, Stubberfield EJ, Koylass M, Whatmore AM (2014) Examination of taxonomic uncertainties surrounding Brucella abortus biovar 7 using phenotypic and molecular approaches. Appl Environ Microbiol 80: Lounes N, Cherfa MA, Le Carrou G, Bouyoucef A, Jay M, Garin-Bastuji B, Mick V (2014) Human brucellosis in Maghreb: Existence of a lineage related to socio-historical connections with Europe. PLoS ONE 9(12): e Mick V, Le Carrou G, Corde Y, Game Y, Jaÿ M, Garin-Bastuji B (2014) Brucella melitensis in France: persistence in wildlife and probable spill over from Alpine ibex to domestic animals. PLos ONE 9(4):e Souza Lopes E, Silveira Luiz Machado V, Tonial Simões C, Garin-Bastuji B, Da Costa M (2014) Identification of Brucella sp. isolated in Brazil between 1976 and 2013 by Bruce-Ladder PCR. Acta Scientiae Veterinariae 42:1242. Communications nationales Corde Y, Cherfa MA, Drapeau A, Le Carrou G, Jaÿ M, Garin-Bastuji B, Mick V (2014) MLVA-16 chez Brucella: quelles limites pour les enquêtes épidémiologiques? 10ème Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Paris, France, 31/03-01/04/2014 (Poster, abstract published). Le Carrou G, Allix S, Whatmore A, Garin-Bastuji B, Mick V (2014) Biovar 7 de Brucella abortus, le 17

18 retour!. 10 ème Congrès National de la Société Française de Microbiologie, Paris, France, 31/03-01/04/2014 (Poster, abstract published). Lounes N, Bouyoucef A, Lazri M, Benamrouche N, Rahal K, Le Carrou G, Garin-Bastuji B (2014). Caractérisation phénotypique des Brucella chez les bovins de la région centre d Algérie. 21èmes journées 3R (Rencontres Recherches Ruminants), Paris, France, 03-04/12/2014 (Comm, abstract published). Communications internationales Ekgatat M, Garin-Bastuji B, ANSES and NIAH teams (2014) Brucellosis OIE Twinning Laboratory Programme France-Thailand. The 4th FAO-APHCA/OIE/DLD Regional Workshop on Brucellosis Diagnosis and Control in Asia-Pacific Region Proficiency Test and Ways Forward, Chiang Mai, Thailand, 19-21/03/2014 (Comm). Ekgatat M, Jaÿ M, ANSES and NIAH teams (2014) 1st Asia-Pacific Brucellosis Proficiency test management and result analysis. The 4th FAO-APHCA/OIE/DLD Regional Workshop on Brucellosis Diagnosis and Control in Asia-Pacific Region Proficiency Test and Ways Forward, Chiang Mai, Thailand, 19-21/03/2014 (Comm). Jaÿ M, Cherfa MA, Le Carrou G, Nicollet P, Giraud P, Rambaud T, Mick V, Garin-Bastuji B (2014) Infection à Brucella suis biovar 2 chez les ruminants, exceptionnelle ou sous-estimée? 6ème Colloque International Francophone de Microbiologie animale, Toulouse, France, 15-16/05/2014 (Poster). Hars J, Vaniscotte A, Da Silva E, Game Y, Gauthier D, Gibert P, Herbaux J-P, Jay M, Le Horgne J-M, Mick V, Pasquier J-J, Rautureau S, Toigo C, Garin-Bastuji B (2014) Surveillance et gestion d un foyer de brucellose à Brucella melitensis chez le bouquetin (Capra ibex) dans le massif du Bargy (Haute-Savoie/France). 32èmes Rencontres du Groupe d'étude de l'écopathologie de la faune sauvage de montagne (GEEFSM), Olivone, Switzerland, 06-08/06/2014 (Comm). Hars J, Vaniscotte A, Jaÿ M, Herbaux JP, Toigo C, Gibert P, Rautureau S, Lehorgne JM, Pasquier JJ, Game Y, Maucci E, Gauthier D, Mick V, Garin-Bastuji B (2014) Unexpected outbreak of brucellosis due to Brucella melitensis in the alpine Ibex in the French Alps. 11th European Wildlife Disease Association (EWDA) Conference, Edinburgh, Scotland, 24-29/08/2014 (Comm). Drapeau A, Corde Y, Jaÿ M, Garin-Bastuji B (2014) Comparison of barbital Veronal Buffer and non-toxic MgCa buffer in the complement fixation test for the diagnosis of brucellosis in animals. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Jaÿ M, Cherfa MA, Le Carrou G, Drapeau A, Corde Y, Mick V, Garin-Bastuji B (2014) Brucella suis biovar 2 infection in atypical hosts in France. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Hars J, Vaniscotte A, Jaÿ M, Herbaux JP, Toïgo C, Gibert P, Rautureau S, Le Horgne JM, Pasquier JJ, Game Y, Maucci E, Gauthier D, Mick V, Garin-Bastuji B (2014) Unexpected outbreak of brucellosis due to Brucella melitensis in the Alpine Ibex (Capra ibex) in the French Alps. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). 18

19 Jaÿ M, Le Carrou G, Cherfa MA, Mick V, Garin-Bastuji B (2014) First Brucella bacteriology and molecular biology interlaboratory-proficiency trial organized in the EU. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Lounes N, Cherfa MA, Le Carrou G, Jaÿ M, Benamrouche N, Garin-Bastuji B, Mick V (2014) Human brucellosis in Maghreb: Existence of a pre-independence lineage related to politico-historical connections between Algeria and France. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Corde Y, Drapeau A, Game Y, Maucci E, Hars J, Jaÿ M, Garin-Bastuji B (2014) A rapid test for identifying B. melitensis infection in an Alpine ibex (Capra ibex) reservoir in the French Alps. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Cherfa MA, Le Carrou G, Jaÿ M, Garin-Bastuji B, Mick V (2014) MLVA-16 in Brucella spp.: Data interpretation considerations and limitations for epidemiological investigations. Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Ekgatat M, Kanitpun R, Corde Y, Drapeau A, Kunchit P, Jay M, Vecchio G, Wongkasemjit S, Wongwicharn P, Songkitti V, Ishibashi T, Garin-Bastuji B (2014) 1st bovine brucellosis proficiency test in Asia-Pacific in Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Garin-Bastuji B, Ekgatat M, Kanitpun R, Jaÿ M, Drapeau A, Corde Y, Kunchit P, Le Carrou G, Cherfa MA, Vecchio G, Wongkasemjit S, Wongwicharn P, Jirathanawat V (2014) Brucellosis OIE Laboratory Twinning Programme France/Thailand ( ). Brucellosis 2014 International Research Conference, including the 67th Annual Brucellosis Research Meeting, Berlin, Germany, 09-12/09/2014 (Poster, abstract published). Ponsart C, Jaÿ M, Mick V (2014) Introduction of brucellosis control strategies in France and Europe. International Conference on Brucellosis, Qingdao, China (People Rep), 30-31/10/14 (Comm.) Ponsart C, Jaÿ M, Mick V (2014) Diagnosis and vaccines of brucellosis. International Conference on Brucellosis, Qingdao, China (People Rep), 30-31/10/14 (Comm.) Garin-Bastuji B (2014) Bovine, ovine and caprine brucellosis The EU experience in control/eradication. Update on OIE standards, Brucellosis-Tuberculosis Diagnostic Summit, Montpellier, France, 18-20/11/2014 (Comm). c) Conférences sur invitation Garin-Bastuji B (2014). Brucellosis in cattle, sheep and goats - Fundamentals of diagnosis and control Korean Society of Veterinary Science (KSVS) International Symposium on International Cooperation for the Development of Veterinary Technology, Jeju Island, Korea (Rep.), 16-17/10/2014 (Invited lecture). 19

20 Garin-Bastuji B (2014). Brucellosis an emerging disease with public health implications? Symposium Exotic livestock diseases a Swedish issue? Why conduct research on infectious diseases we don t have? Is the money not better spent by focusing on the endemic diseases affecting livestock, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU)/Centre for global Animal Diseases (CGD), Uppsala, Sweden, 12/11/2014 (Invited lecture). Garin-Bastuji B (2014) Workshop Improving the Diagnostic Capacities of Brucellosis, Enhancing the Vaccination and Control Strategies. Jordan University of Science and Technology, Irbid, Jordan, 5-7/01/2014 (Invited lecture). Garin-Bastuji B (2014) Brucellosis: Preventing Animal & Human infections. OIE National Focal Points on Animal Production Food Safety Seminar for Middle East, Abu Dhabi, UAE, 14-16/01/2014 (Invited lecture). Garin-Bastuji B, Mick V, Jaÿ M (2014) Review and update on brucellosis in Asia and Pacific Region. The 4th FAOAPHCA/OIE/DLD Regional Workshop on Brucellosis Diagnosis and Control in Asia-Pacific Region Proficiency Test and Ways Forward, Chiang Mai, Thailand, 19-21/03/2014 (Invited lecture). Jaÿ M, Garin-Bastuji B (2014) Quality management in veterinary testing laboratories. The 4th FAO-APHCA/OIE/DLD Regional Workshop on Brucellosis Diagnosis and Control in Asia-Pacific Region Proficiency Test and Ways Forward, Chiang Mai, Thailand, 19-21/03/2014 (Invited lecture). Garin-Bastuji B, Jaÿ M, Vecchio G (2014) International shipment of biological and potentially infectious substances - Main requirements. The 4th FAO-APHCA/OIE/DLD Regional Workshop on Brucellosis Diagnosis and Control in Asia-Pacific Region Proficiency Test and Ways Forward, Chiang Mai, Thailand, 19-21/03/2014 (Invited lecture). 20