Picornaviridae. 5A Internat. Anne Goffard Université Lille 2 Droit et Santé Faculté des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques de Lille

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1 Picornaviridae 5A Internat Anne Goffard Université Lille 2 Droit et Santé Faculté des Sciences Pharmaceutiques et Biologiques de Lille Paternité - Pas d'utilisation Commerciale - Pas de Modification :

2 Table des matières Introduction 4 I - Poliomyélite et Poliovirus 5 1. La poliomyélite Éradication de la poliomyélite Physiopathologie Poliomyélite antérieure aiguë Évolution Vaccination Prévention de la poliomyélite en France Avant tout voyage dans un pays contaminé... 7 II - Infections à entérovirus 8 1. Méningites à Entérovirus Conjonctivite à entérovirus Diagnostic biologique Prise en charge Myocardite aiguë primitive Étiologies virales Diagnostic biologique Prise en charge Autres tableaux cliniques Diagnostic biologique III - Exercice 12 IV - Exercice 13 V - Exercice 14 VI - Exercice 15 VII - Exercice 16 VIII - Exercice 17 IX - Exercice 18 X - Exercice 19 XI - Exercice 20 XII - Exercice 21 XIII - Exercice 22

3 XIV - Exercice : QCM 23 XV - Exercice : QCM 24 Solutions des quiz 25

4 Introduction Ce cours s'intéresse à la famille des Picornaviridae. Nous allons d'abord caractériser cette famille puis nous aborderons les spécificités des infections par les poliovirus, les entérovirus et l'hépatite A. 4

5 Poliomyélite et Poliovirus Poliomyélite et Poliovirus I La poliomyélite 5 Vaccination 6 Epidémiologie de la poliomyélite aiguë antérieure Touche les enfants de moins de 5 ans Contamination selon le cycle fécal-oral principalement Pas de traitement Réservoir strictement humain Virus en voie d'éradication 1. La poliomyélite 1.1. Éradication de la poliomyélite 1988 : cas, 125 pays 2010 : 4 pays où l'infection n'a jamais disparu : Afghanistan, Inde, Nigeria, Pakistan. Pays réinfectés : Angola, Tchad, République Démaocratique du Congo et Soudan. Pays avec des cas importés : Kazakhstan, Tajikistan, Turkmenistan, Fédération de Russie Liberia, Mali, Mauritanie, Niger, Sénégal, Sierra Leone, Uganda Népal Sources : Incidence de la poliomyélite en 2008 (Bulletin Épidémiologique Hebdomadaire de l'oms du 21 novembre 2008, vol. 83, 47 (pp )) En rouge, entre 500 et 1000 cas déclarés En orangé, entre 100 et 499 cas déclarés En jaune, entre 10 et 99 cas déclarés En vert, moins de 10 cas déclarés En bleu clair, absence de virus sauvage En bleu foncé, virus officiellement éradiqué 5

6 Poliomyélite et Poliovirus 1.2. Physiopathologie Présence poliovirus dans des M o ë l l e épinière Ganglions mésentériques Matières fécales Poliomyélite antérieure aiguë Incubation longue : 2 semaines Syndrome infectieux : Fièvre, douleurs diffuses Paralysies brutales, périphériques Risque de paralysie des muscles respiratoires Atteinte des motoneurones de la ME Paralysies musculaires flasques Atteintes des muscles respiratoires Dans la majorité des cas, l infection à Poliovirus est inapparente Dans 5% des cas : syndrome infectieux seul Dans 1-2% des cas : forme neurologique 1.4. Évolution Régression des paralysies très lente Débute au bout de 2 semaines Dure jusqu'à 2 ans Souvent incomplète Syndrome post-poliomyélitique Survient 15 ans après la phase aiguë Apparition de signes de surmenage neurologiques Enfant présentant des séquelles de poliomyélite 2. Vaccination Prise en charge thérapeutique Aucun traitement Le seul traitement est préventif 2.1. Prévention de la poliomyélite en France Vaccination par vaccin inactivé 6

7 Poliomyélite et Poliovirus À 2, 3 et 4 mois, rappel à mois puis à 6 ans, ans, ans et tous les 10 ans. Enfants : Pentavac/Infanrixquinta: coqueluche, diphtérie, polio, tétanos, HIb Schéma de la vaccination contre la poliomyélite 2.2. Avant tout voyage dans un pays contaminé vérifier calendrier vaccinal faire un rappel si besoin. Enfant > 6 ans: Revaxis (tétanos, diphtérie, polio) Adulte : DT Polio (tétanos, diphtérie, polio) 7

8 Infections à entérovirus Infections à entérovirus II Méningites à Entérovirus 8 Conjonctivite à entérovirus 8 Myocardite aiguë primitive 9 Autres tableaux cliniques Méningites à Entérovirus Première cause de méningite virale chez l enfant et l adulte jeune Syndrome méningé fébrile Fièvre élevée : C Céphalées, photophobie Vomissements en jet Raideur de nuque Analyse du Liquide Céphalo-Rachidien en urgence Liquide clair, > 20 leucocytes/mm3, > 50% de lymphocytes Protéinorachie > 0,4 g/l Glycorachie/glycémie > 60% Chlorurorachie : normale (0,4 à 0,8 g/l) LCR lymphocytaire normoglycorachique= méningite virale Urgence virologique Analyse virologique du LCR Recherche de l'arn viral par RT-PCR dans le LCR Arrêt des traitements antibiotiques Traitement est symptomatique Hospitalisation pour surveillance Traitement antipyrétique Guérison spontanée en 3 à 5 jours 2. Conjonctivite à entérovirus Coxsackievirus A24, entérovirus 70 Épidémie estivale ou cas isolé Incubation : heures Conjonctivite hémorragique, souvent bilatérale 8

9 Infections à entérovirus Fièvre dans 20% des cas Possibilité de généralisation mais rare Inflammation pendant 4-6 jours, guérison en 1 à 2 semaines Diagnostic biologique Prélèvements : écouvillonnage conjonctival LCR en cas de méningite ou de complications neurologiques Diagnostic direct +++ isolement viral en culture cellulaire Isolement viral en culture cellulaire Sur cellules Hep2 ou Vero ECP : cellules arrondies et lyse cellulaire Réponse en 48h à 7j 2.2. Prise en charge Pas de traitement antiviral spécifique Antipyrétiques Paracétamol (Doliprane, Efferalgan) Surveillance neurologique et ophtalmologique 3. Myocardite aiguë primitive Concerne 5 nouveaux-nés/ naissances Enfants très jeunes SC apparaissant avant 2 j de vie = transmission tranplacentaire SC apparaissant après 7 j de vie = transmission horizontale 3.1. Étiologies virales ECHOvirus : 50 à 70 % Coxsackievirus A1- A24 : 20 à 30 % Coxsackievirus B1 à B6 Signes cliniques Fièvre fluctuante entre 38.5 et 40 C Signes généraux puis de défaillance cardiaque Évolution souvent mortelle en quelques jours Évolution Infections néonatales à entérovirus sans atteinte cardiaque : 90% de guérison En cas de myocardite : mortalité de 50 à 75% Séquelles cardiaques possibles 3.2. Diagnostic biologique Hospitalisation 9

10 Infections à entérovirus Prélèvements : LCR, prélèvements naso-pharyngés, selles pour diagnostic direct Bilan maternel Sérums pour sérologies Isolement viral en culture cellulaire Si necessaire, le typage peut être réalisé par le CNR 3.3. Prise en charge Pas de traitement antiviral spécifique Réanimation cardiaque Lutte contre la fièvre Paracétamol (Doliprane, Efferalgan) 4. Autres tableaux cliniques Herpangine Coxsackievirus A Enfant avant 3 ans, pendant l'été Incubation : 10 jours Éruption vésiculeuse dans la gorge Fièvre Guérison en 4-6 jours Syndrome main-pied-bouche Coxsackievirus A16, entérovirus 71 Épidémie estivale ou cas isolé Incubation : 10 jours Stomatite ulcéreuse, Lésion liées à une infection à ETV Eruption papulo-vésiculeuse indolore des mains et des pieds, Pas de fièvre Guérison en 3-6 jours Eruption liée au syndrome main-pied-bouche Myalgie épidémique (maladie de Bornhölm) Coxsackievirus B1 à B6 10

11 Infections à entérovirus Incubation : 3-5 jours Début brutal Douleurs abdominales et/ou thoraciques bloquant la respiration, continues ou paroxystiques Fièvre Guérison en 3-6 jours Exanthème de Boston ECHOvirus 16 Incubation 3-5 jours Début brutal : fièvre éruption maculeuse généralisée Guérison en 48 heures 4.1. Diagnostic biologique Prélèvements Sang total sur tube sec pour sérologies 11

12 Exercice III Quel est l'item qui caractérise les Picornaviridae? Ce sont des virus transmis par voie aérienne [Solution p 25] Ce sont de petits virus à ARN Ce sont des virus enveloppés très résistants Ce sont des virus à ARN segmenté Ce sont des virus à ADN double brin 12

13 Exercice IV Parmi les éléments suivants, lequel n'appartient pas à la particule d'un Picornaviridae? la protéine VP4 la protéine M ARN simple brin linéaire de polarité positive la protéine Vpg la protéine 3A [Solution p 25] 13

14 Exercice V Le diagnostic d'une méningite à entérovirus se fait par : Recherche des protéines virales par IF directement sur le LCR [Solution p 25] Isolement viral en culture cellulaire Recherche du génome viral par RT-PCR directement sur le LCR Recherche du génome viral par PCR directement sur le LCR Recherche d'igm par ELISA sur un échantillon de sang 14

15 Exercice VI Quels sont les virus appartenant à la famille des Picornaviridae? Entérovirus [Solution p 26] Aphtovirus Poliovirus Herpesvirus Kobuvirus 15

16 Exercice VII Quels sont les virus appartenant à l'espèce Enterovirus? Poliovirus Humains 1 à 3 [Solution p 26] Adénovirus Humains Poxvirus Humain Coxsackievirus B1 à B6 Rhinovirus Humains 16

17 Exercice VIII [Solution p 26] Parmi les propositions suivantes, laquelle/lesquelles s applique/nt au virus de la poliomyélite? Il appartient à la famille des Picornaviridae Il s agit d un virus enveloppé Le réservoir du virus est humain La transmission est fécale-orale 17

18 Exercice IX [Solution p 26] Parmi les items suivants, le/lesquel/s fait/font partie du cycle de réplication des Picornaviridae? La réplication est nucléaire et cytoplasmique La réplication est strictement cytoplasmique Le complexe de réplication est constitué uniquement de protéines virales Le complexe de réplication contient l'adn génomique La synthèse des protéines virales passe par des polyprotéines intermédiaires 18

19 Exercice X Les entéorvirus peuvent être responsables des tableaux cliniques suivants : Conjonctivites [Solution p 27] Méningites Adénite Myocardites Gastro-entérites 19

20 Exercice XI Quels sont les virus responsables du syndrome Main-Pied-Bouche? Coxsakievirus B1 à B6 [Solution p 27] Coxsakievirus A9 Entérovirus 69 Coxsakievirus A16 Entérovirus 71 20

21 Exercice XII [Solution p 27] Au cours d'une méningite à entérovirus, le liquide céphalo-rachidien est le plus souvent : Purulent Clair Hémorragique Normoglycorachique Hypoglycorachique 21

22 Exercice XIII La poliomyélite antérieure aiguë se traduit cliniquement par : Des diarrhées fébriles durant 3-4 jours [Solution p 27] Des paralysies flasques d apparition brutales Une éruption cutanée généralisée Un syndrome infectieux fébrile 22

23 QCM Exercice : QCM XIV [Solution p 28] Concernant le diagnostic de la méningite à entérovirus, quelle/s est/ sont la/les réponse/s vraie/s? il est uniquement clinique il est basé sur la recherche d'anticorps anti-entérovirus il est basé sur l'isolement viral en culture cellulaire il est basé sur la recherche du génome viral par RT-PCR il est basé sur l'analyse du LCR 23

24 QCM Exercice : QCM XV [Solution p 28] Concernant le diagnostic des conjonctivites à entérovirus, quelle/s est/ sont la/les réponse/s vraie/s? C'est une urgence vitale. la recherche d'anticorps anti-entérovirus dans le sang peut faire le diagnostic. la recherche d'anticorps anti-entérovirus dans l'humeur aqueuse peut faire le diagnostic. la recherche du génome viral dans le sang peut faire le diagnostic. la recherche du génome viral dans le liquide conjonctival peut faire le diagnostic. 24

25 Ressources annexes Solutions des quiz > Solution n 1 Exercice p. 12 Ce sont des virus transmis par voie aérienne Seuls quelques uns sont transmis par voie aérienne, le plus souvent, la transmission est oro-fécale. Ce sont de petits virus à ARN pico = petit (en grec), RNA = ARN, viridae = virus Ce sont des virus enveloppés très résistants enveloppés = fragile, l'item est contradictoire Ce sont des virus à ARN segmenté ARN simple brin linéaire + Ce sont des virus à ADN double brin ARN simple brin linéaire + > Solution n 2 Exercice p. 13 la protéine VP4 une des protéine de capside la protéine M protéine de matrice de la grippe ARN simple brin linéaire de polarité positive la protéine Vpg la protéine 3A > Solution n 3 Exercice p. 14 Recherche des protéines virales par IF directement sur le LCR technique pas assez sensible Isolement viral en culture cellulaire Délai de réponse trop long Recherche du génome viral par RT-PCR directement sur le LCR OUI, génome de type ARN et rapidité du rendu de résultats Recherche du génome viral par PCR directement sur le LCR 25

26 Solutions des quiz le génome est de type ARN, il faut donc une étape de rétro-transcription (RT) Recherche d'igm par ELISA sur un échantillon de sang Inutile > Solution n 4 Exercice p. 15 Entérovirus virus humains Aphtovirus virus animaux Poliovirus virus humains Herpesvirus famille des Herpesviridae Kobuvirus virus animaux > Solution n 5 Exercice p. 16 Poliovirus Humains 1 à 3 Adénovirus Humains Famille des Adenoviridae Poxvirus Humain c'est le virus de la variole, famille des Poxviridae Coxsackievirus B1 à B6 Rhinovirus Humains > Solution n 6 Exercice p. 17 Il appartient à la famille des Picornaviridae Il s agit d un virus enveloppé virus nu, très résistant Le réservoir du virus est humain La transmission est fécale-orale > Solution n 7 Exercice p. 18 La réplication est nucléaire et cytoplasmique La réplication est strictement cytoplasmique Le complexe de réplication est constitué uniquement de protéines virales protéines virales et cellulaires 26

27 Solutions des quiz Le complexe de réplication contient l'adn génomique le génome est de type ARN La synthèse des protéines virales passe par des polyprotéines intermédiaires nommées P1, P2 et P3. > Solution n 8 Exercice p. 19 Conjonctivites Méningites Adénite rarement virale... Myocardites Gastro-entérites JAMAIS > Solution n 9 Exercice p. 20 Coxsakievirus B1 à B6 Coxsakievirus A9 Entérovirus 69 Coxsakievirus A16 Entérovirus 71 > Solution n 10 Exercice p. 21 Purulent oriente plutôt vers une origine bactérienne Clair Hémorragique oriente plutôt vers une méningite herpétique Normoglycorachique une des caractéristiques des LCR au cours des méningites virales Hypoglycorachique oriente plutôt vers une origine bactérienne > Solution n 11 Exercice p. 22 Des diarrhées fébriles durant 3-4 jours Le virus est présent dans les intestins mais ne donne pas de diarrhée Des paralysies flasques d apparition brutales 27

28 Solutions des quiz Une éruption cutanée généralisée non Un syndrome infectieux fébrile > Solution n 12 Exercice p. 23 il est uniquement clinique il est basé sur la recherche d'anticorps anti-entérovirus il est basé sur l'isolement viral en culture cellulaire il est basé sur la recherche du génome viral par RT-PCR il est basé sur l'analyse du LCR > Solution n 13 Exercice p. 24 C'est une urgence vitale. la recherche d'anticorps anti-entérovirus dans le sang peut faire le diagnostic. la recherche d'anticorps anti-entérovirus dans l'humeur aqueuse peut faire le diagnostic. la recherche du génome viral dans le sang peut faire le diagnostic. la recherche du génome viral dans le liquide conjonctival peut faire le diagnostic. 28