Groupe «Bactérioses» Bactérioses des arbres fruitiers provoquées par Pseudomonas syringae

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1 Groupe «Bactérioses» Bactérioses des arbres fruitiers provoquées par Pseudomonas syringae Objectif du groupe : - Partager un Etat des lieux - Maladies - Expérimentation & Recherche - Identifier les espaces à enjeux - Co-construire des projets et/ou des démarches destinées à répondre à ces enjeux Animation : C. Morris B. Loquet

2 Cadre de lecture Analyse des documents et présentations Recherche des convergences et divergences Cadre de lecture - Recherche de mots clés Maladie et métadonnées associées Agent pathogène Matériel végétal Agronomie et Pratiques culturales

3 Etat des lieux Kiwi versus Prunus? Des questions convergentes Des approches biotechniques et méthodologiques parallèles Les actions priorisées Lutte protection du verger Diagnostic de la maladie Des informations plus fragmentaires Matériel végétal Agronomie générale Pas ou peu d informations intégrées à l échelle de l écosystème du verger à l échelle de la région de production en lien avec la durabilité de l exploitation

4 Maladie(s) et métadonnées associées Présentations Espèce Economie Impact Géographie Symptômes Enquêtes Lutte CB Kiwi JM Fournier Kiwi Casdar Kiwi ML Brachet Kiwi x x CB Kiwi diag A. Cunty Kiwi x Bactérioses B. Loquet Prunus x GT CB Abricotier B. Loquet Abricotier (x) x x Expé SEFRA B. Labeyrie Abricotier x CB Prunier CEFEL E. Koké P. Japonais x ( criblure) x ARDU C. Lamine Prunus x x x Ingénérie écologique C. Morris Prédiction CB Casdar JM. Audergon Prunus (x) x EPIDEC C. Morris x

5 Maladie(s) et métadonnées associées Expression des Maladies ( 2 grandes catégories) Mortalité des plants Chancre sur rameaux et charpentières Mort des bourgeons Criblures foliaires (prunier abricotier) Interaction forte entre la maladie et les conditions agroenvironnementales Régions septentrionales Humidité et températures hivernales Sols squelettiques => remarques émergentes Impact économique (un point faible ) Répartition territoriale un sujet intéressant à objectiver une méthodologie à développer de manière transversale Problème majeur : la vascularisation de la bactérie

6 Agent(s) pathogène(s) Agent pathogène Présentations Espèce Détection diagnostic Diversité génétique Pourvoir pathogène Dynamique des populations Epidémiologie CB Kiwi JM Fournier Kiwi Casdar Kiwi ML Brachet Kiwi x x x x CB Kiwi diag A. Cunty Kiwi x x x Bactérioses B. Loquet Prunus GT CB Abricotier B. Loquet Abricotier x x x x Expé SEFRA B. Labeyrie Abricotier CB Prunier CEFEL E. Koké P. Japonais ARDU C. Lamine Prunus Ingénérie écologique C. Morris x x Prédiction CB Casdar JM. Audergon Prunus x x x EPIDEC C. Morris x x x x

7 Agent(s) pathogène(s) Pseudomonas (une diversité large en cours d analyse) Une espèce centrale : Pseudomonas syringae Une erreur de jeunesse Ps. Viridiflava Des sous-espèces spécialisées : Ps. pv. actinidiae (Kiwi) Ps. pv. persicae (pêcher) Ps. pv. syringae (pêcher abricotier cerisier pruniers amandier - kiwi ) Ps. pv. mors-prunorum (cerisier abricotier) => Des mécanismes en cours d étude Pouvoir glaçogènes Pouvoir pathogène Des portes d entrées Identifiées : plaies pétiolaires : cerisier pêcher Plaies de taille : cerisier - pêcher Suspectées : Bourgeons : abricotier

8 Agent(s) pathogène(s) => Remarques émergentes - La maladie est associée à différents biovars - présents dans l environnement - à des biovars émergents? Comment anticiper les risques d émergence de nouveaux biovars? - Connaissances limitées - des mécanismes liés à la pathogénicité - des interactions entre pouvoir pathogène et biovars - des interactions attendues avec des gènes présents dans la bactérie (vascularisation ) - des interactions entre populations bactériennes et épidémiologie Des travaux de recherche à innovants et intégrateurs développer? Une diversité génétique à mieux appréhender de manière intégrée

9 Matériel Végétal Matériel végétal Présentations Espèce Variété Porte-greffe Var x PG Test sensibilité Diversité génétique Résistance/ Sensibilité CB Kiwi JM Fournier Kiwi Casdar Kiwi ML Brachet Kiwi x x x CB Kiwi diag A. Cunty Kiwi Bactérioses B. Loquet Prunus x x GT CB Abricotier B. Loquet Abricotier x x Expé SEFRA B. Labeyrie Abricotier x x CB Prunier CEFEL E. Koké P. Japonais ARDU C. Lamine Prunus x Ingénérie écologique C. Morris Prédiction CB Casdar JM. Audergon Prunus x x x x x x EPIDEC C. Morris

10 Matériel Végétal Une variabilité génétique (Kiwi Prunus) => Des questions communes => Une diversité de comportement génétique à explorer Des enjeux : Développement de méthodes d évaluation ciblées sur les mécanismes de résistance et conformes au comportement en verger Approcher les mécanismes de résistance Intrinsèques & induits Anticiper les interactions plantes x pathogènes Co-construire et valider une démarche d élaboration d idéotype

11 Agronomie et Pratiques culturales Agronomie & pratiques culturales Présentations Espèce Sol Irrigation/hu midité Fertilisation Hauteur greffage Taille Couvres sols CB Kiwi JM Fournier Kiwi Casdar Kiwi ML Brachet Kiwi CB Kiwi diag A. Cunty Kiwi Bactérioses B. Loquet Prunus x x GT CB Abricotier B. Loquet Abricotier x Expé SEFRA B. Labeyrie Abricotier x x (N) x x CB Prunier CEFEL E. Koké P. Japonais x ARDU C. Lamine Prunus x Ingénérie écologique C. Morris x Prédiction CB Casdar JM. Audergon Prunus EPIDEC C. Morris

12 Agronomie et Pratiques culturales Des facteurs dont le rôle est aujourd hui clair => remarques & questions - Une validation et une pondération de l effet des facteurs à étudier -? Dispositifs & m&thodes - Une généralisation qui ne pourra se faire qu avec une régionalisation de la notion de risque

13 Intégration une approche nouvelle en émergence Présentations Espèce Hiérarchisation des facteurs G x E x P G (plante x pathogène) Changement d'échelles arbre/verger/région CB Kiwi JM Fournier Kiwi Casdar Kiwi ML Brachet Kiwi CB Kiwi diag A. Cunty Kiwi Bactérioses B. Loquet Prunus GT CB Abricotier B. Loquet Abricotier Expé SEFRA B. Labeyrie Abricotier CB Prunier CEFEL E. Koké P. Japonais ARDU C. Lamine Prunus x x x Ingénérie écologique C. Morris x x Prédiction CB Casdar JM. Audergon Prunus x x EPIDEC C. Morris x x x

14 Intégration une approche nouvelle en émergence Des approches jusqu alors essentiellement du domaine biotechnique et ciblées La preuve d interactions a été apportée? => Importance de les quantifier objectivement / analyse de risque L écosystème du verger Un ensemble complexe avec des compartiments qui ont peu été abordés conjointement Des enjeux nouveaux

15 Points de vigilance Les projets hormis ARDU et EPIDEC sont espèce centrés! Une vision principalement présent centrée? Les agents pathogènes de demain seront-ils ceux d aujourd hui? Impact des changements climatiques et des pratiques? Les pratiques culturales se diversifient Des analyses de risques à développer Géographiques Génétique Socio-économique ( viabilité économique et sociale)