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1 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xv #15 Rapport Science et Technologie Composition du Comité RST Avant-propos Composition du groupe de travail Introduction iii v ix xi xxv PARTIE I La situation actuelle : un défi global pour les pays industrialisés et les pays en développement 1 CHAPITRE 1 L épidémiologie et la santé publique Veille sanitaire et politique de maîtrise 3 1. L épidémiologie : un outil de mesure au service du contrôle des maladies transmissibles La surveillance : un objectif prioritaire pour la gestion des risques et le contrôle des maladies infectieuses Les stratégies de la surveillance Les modèles de transmission La surveillance des infections chroniques Lesperspectivesnouvelles Mieux anticiper pour contrôler : l alerte précoce L évaluation des politiques de santé publique

2 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xvi #16 xvi LA MAÎTRISE DES MALADIES INFECTIEUSES CHAPITRE 2 Maladies infectieuses en médecine humaine et vétérinaire, passage des barrières d espèce État de l art Santé animale : importance économique et médicale des maladies infectieuses et parasitaires des animaux Maladies infectieuses humaines et vétérinaires : les zoonoses Le génie des maladies infectieuses Les maladies émergentes et réémergentes Barrièresd espècesetzoonoses Lesnouvellesdonnées La situation en France en matière de surveillance, de lutte et de recherche sur les maladies infectieuses Les forces Les faiblesses Lesgrandsdéfisetenjeuxpourlefutur Une frontière de plus en plus poreuse entre maladies animales etmaladieshumaines Une mondialisation de la surveillance et de la lutte Barrières d espèce et principe de précaution CHAPITRE 3 Virus émergents État de l art Introduction Facteurs contribuant à l émergence et à la réémergence SituationenFrance,forcesetfaiblesses Faiblesses Forces Grandsdéfisetenjeuxpourlefutur Introduction Veille des maladies émergentes Recherchesfondamentales Versunecommunicationclaireetnonalarmiste CHAPITRE 4 Pourquoi il y aura toujours des maladies infectieuses Lanaturedenotrerelationaveclespathogènes L avantage du temps de génération L avantage de la variation

3 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xvii #17 xvii 4. La réponse «génétique» des hôtes Laréponse«culturelle»deshôtes L imprédictibilité de l avenir CHAPITRE 5 Dynamiques et limites socio-anthropologiques des stratégies de prévention et de contrôle des risques infectieux dans les pays en développement Des maladies de la pauvreté? Les distances et les raisons des risques? Améliorer concrètement la prévention et la prise en charge des pathologies infectieuses Parler le même langage et instaurer des dialogues entrepopulationsetéquipessanitaires Analyser le risque et proposer des solutions concrètes et adaptées Proposer des solutions réalistes et intégrer les programmes Améliorer les interactions entre les soignants et les populations Aider à l émergence de systèmes de protection sociale Former les personnels de santé : articuler le social et le médical Conséquences : trois orientations opérationnelles CHAPITRE 6 Perception et gestion du risque Risque observé et risque perçu Constructions cognitive et sociale du risque Paradoxes révélés par l approche perceptive du risque Approches du risque perçu Perceptionetgestiondurisquedemaladieinfectieuse La recherche : état et besoins CHAPITRE 7 Succès et échecs dans le contrôle d une épidémie : l exemple du sida Une épidémie hors contrôle qui continue de croître et de s étendre L histoire «naturelle» de la maladie Les défis auxquels confronte l épidémie Le défi de la prévention Ledéfidutraitement...145

4 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xviii #18 xviii LA MAÎTRISE DES MALADIES INFECTIEUSES 3.3. Le défi de l accès aux soins dans le monde en développement Le défi de la recherche Le sida et la place de la santé dans le développement CHAPITRE 8 L homme en cause 153 SOUS-CHAPITRE 8.1 Les infections nosocomiales Les infections nosocomiales acquisesenmilieuhospitalier Forces et faiblesses du système de surveillance et de maîtrise des infections nosocomiales Forces Faiblesses SOUS-CHAPITRE 8.2 Les maladies infectieuses d origine alimentaire en France et dans les pays industrialisés État des lieux Les maladies infectieuses d origine alimentaire Les chaînes de causalité et leurs évolutions Lamaîtrisedesdangersmicrobiens Lesrisquessanitaires Les défis L appréciation (ou évaluation scientifique) des risques microbiologiques Lagestiondesrisques Ladiversitéetl évolutiondumondemicrobien La variabilité d un point à un autre de l environnement desmicro-organismes La non-équivalence des systèmes d épidémiosurveillance SOUS-CHAPITRE 8.3 Maladies infectieuses et bioterrorisme Perception du bioterrorisme Les agents de la menace terroriste La surveillance épidémiologique globale, une approche adaptée àlapréventiondubioterrorisme Les outils de la détection et du diagnostic précoce Les approches prophylactiques et thérapeutiques

5 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xix #19 xix SOUS-CHAPITRE 8.4 Les maladies à prions Généralités sur les prions Ladécouvertedesprions Lasituationdesmaladiesàprionschezl homme La situation des maladies à prions chez les animaux Conséquences sur la santé publique des maladies à prions et aspect économique Étatdel artenrecherche Caractérisation de l agent infectieux et de sa transmission Diagnostic et thérapeutique des maladies à prions Prions et protéinopathies Les phénomènes prions comme un nouveau type de contrôle épigénétique Situation de la recherche sur les prions en France Historique succinct de la recherche sur les prions en France Les politiques de recherche des différentes institutions face aux prions Programmes européens et recherche sur les prions en France Analyse critique et considérations stratégiques PARTIE II La réponse au défi : un effort sans précédent et coordonné de recherche, d enseignement et d actions en santé publique 227 CHAPITRE 9 La recherche fondamentale 229 SOUS-CHAPITRE 9.1 Les défis de la microbiologie fondamentale : connaissance du monde microbien, génomique, physiologie-métabolisme, parois 231 SOUS-CHAPITRE 9.2 Les mécanismes moléculaires et cellulaires des infections Mécanismesmoléculairesdesinfectionsbactériennes État de l art SituationenFrance:forcesetfaiblesses Lesgrandsdéfisetenjeuxpourlefutur...243

6 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xx #20 xx LA MAÎTRISE DES MALADIES INFECTIEUSES 2. Mécanismes moléculaires des infections virales Étatdel art Situation en France : forces et faiblesses Lesgrandsdéfisetenjeuxpourlefutur Mécanismes moléculaires des infections parasitaires Étatdel art Situation en France : forces et faiblesses Lesgrandsdéfisetenjeuxpourlefutur SOUS-CHAPITRE 9.3 Immunité anti-infectieuse innée et spécifique Immunogénétique État de l art Immunité innée et adaptative anti-infectieuse : généralités Immunité adaptative Dialogue entre effecteurs de l immunité innée et adaptative Efficacité du contrôle immunitaire des infections Paramètres requis pour l induction d une protection immune efficace Défaut de contrôle immunitaire des infections Recherches en immunité anti-infectieuse menées en France : forces et faiblesses Immunité innée : effecteurs cellulaires et récepteurs innés Cellules dendritiques dialogue entre immunité innée et adaptative Cellules lymphoïdes Cellules NK et lymphocytes T non conventionnels Lymphocytes T conventionnels Immunogénétique des maladies infectieuses Immunité anti-infectieuse vétérinaire SOUS-CHAPITRE 9.4 Infections, cancers et maladies de l immunité Infections et cancers État des connaissances Perspectives dans les domaines de la prévention et du traitement LescancersassociésàuneinfectionenFrance Infections et maladies de l immunité Auto-immunitéetinfections...292

7 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xxi #21 xxi 2.2. L effet protecteur paradoxal des infections sur les maladies de l immunité (allergies, maladies auto-immunes et lymphomes) La recherche française dans le domaine SOUS-CHAPITRE 9.5 Vers une meilleure connaissance des vecteurs et de leur contrôle Étatdel art Systématiqueetphylogénie Labiologiedespopulationsdevecteurs La lutte antivectorielle Situation en France : forces et faiblesses Lesgrandsenjeuxetdéfispourlefutur Comprendrecequ estunvecteur Évaluer et prédire les risques de transmission vectorielle Améliorer les méthodes de lutte actuelles et développer de nouvelles approches SOUS-CHAPITRE 9.6 Vers de nouveaux antibiotiques Détection Voies exploratoires pour la recherche de nouveaux antibiotiques Objectifsdecetterecherche La recherche de demain Les cibles bactériennes Méthodes de recherche Quellesmolécules Étatd avancementdelarecherche La paroi bactérienne Ribosomes ADN Métabolisme Virulence SOUS-CHAPITRE 9.7 Nouvelles approches vaccinales : quels défis? Introduction Vaccinationdujeuneenfant:prioritésderecherche Maladiescibles Périodenéonatale Période post-néonatale

8 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xxii #22 xxii LA MAÎTRISE DES MALADIES INFECTIEUSES 3. Vaccination de l adolescent et de l adulte : où en est-on? Les grandes cibles prioritaires Maladiesémergentes Préventiondecancersassociésàdesinfections Nécessité de vaccins mieux adaptés à l état immunologique de l individu vacciné Vaccinationdansletrèsjeuneâge Vaccination chez les personnes très âgées CHAPITRE 10 L enseignement 357 SOUS-CHAPITRE 10.1 L enseignement à l Université et à l Institut Pasteur Enseignement des maladies infectieuses Enseignement des maladies infectieuses aux étudiants enmédecine Enseignement des maladies infectieuses aux étudiants scientifiques Enseignement des maladies infectieuses à l Institut Pasteur Enseignementdel immunologie SOUS-CHAPITRE 10.2 L enseignement dans les écoles vétérinaires État de l art dans le domaine SituationenFrance:forcesetfaiblesses Les grands défis et enjeux pour le futur Recommandations Recommandations 371 Recommendations 375 Groupe de lecture critique 379 Composition du Groupe de lecture critique 381 Commentaires de l Agence française de sécurité sanitaire des aliments (Afssa) Commentaire du Cirad (Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le developpement)

9 maladies_infectieuses 2006/5/19 14:04 page xxiii #23 xxiii Contribution de la Direction de l hospitalisation etdel organisationdessoins Commentaire de l Institut de recherche pour le développement (IRD) 403 Contribution de l Inra, de l Inserm et de l Institut Pasteur Présentation à l Académie des sciences, par Bernard Malissen 425 Intervention de Maurice Tubiana, membredel AcadémiedesSciences