Les Centres de Ressources Biologiques

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1 Les Centres de Ressources Biologiques Estelle SEILLES, DIU Immunologie et Biothérapies 19 novembre 2010, Paris Gilbert Montgaillard (EFS, Dijon) CRB Ferdinand Cabanne de Dijon Isabelle Desbois (EFS, Tours) CRB de Touraine

2 HISTORIQUE des CRB Détenir des ressources biologiques validées, avec des garanties d assurance qualité et de traçabilité est INDISPENSABLE pour la recherche scientifique et le développement des biotechnologies. Les Centres de Ressources Biologiques sont un des éléments essentiels de l infrastructure sur laquelle s appuient les sciences de la vie La France a été mandatée par l OCDE pour la mise en place du réseau international des CRB (Tokyo 1999). Définition des critères de constitution de telles entités (humain, animal, végétal, microorganismes) = CADRE TECHNIQUE

3 HISTORIQUE des CRB Mise en place février 2001 du Comité Consultatif, par le Ministère de la Recherche : reconnaissance par la France de l importance stratégique des CRB. Démarche d accréditation et de référentiel qualité des CRB en cours (AFNOR) Objectifs : structurer un réseau national Appels d offre Inserm Excellence scientifique Qualité de la cryoconservation Qualité du système d information Déclaration de l UNESCO du 8 Octobre 2003 sur les données génétiques humaine : Définition de collections, confidentialité, finalités, consentement, partage des bienfaits.

4 Définition - CRB Regroupement de collections biologiques, notamment d origine humaine (mais concerne également l animal et le végétal) collections : diversité des populations étudiées diversité des pathologies diversité des finalités (recherche, diagnostic, patrimonial,..) encadrement réglementaire limité

5 Définition Collection d éd échantillons biologiques «Désigne au sens du code SP la réunion, à des fins scientifiques, de prélèvements biologiques effectués sur un groupe de personnes, sélectionnées en fonction des caractéristiques cliniques ou biologiques d un ou plusieurs membres du groupe, ainsi que des dérivés de ces prélèvements». Une autorisation doit être délivrée par le Ministre de la Recherche après avis du Comité Consultatif sur le Traitement de l Information en matière de recherche dans le domaine de la santé.

6 Missions : Collecte, conserve, stocke et gèreg Expertise et évalue les échantillons, assure la préservation info clinique et bio Cède à titre gracieux ou onéreux Constitution et sauvegarde des collections d échantillons (patrimoine) assurer la qualité, traçabilité et la sécurité des collections et des données biomédicales associées garantir la transparence et l accès aux collections encourager les collaborations scientifiques promotion de la recherche. Réseaux et échanges de produits biologiques démarche assurance qualité outils incontournables en recherche biomédicale

7 Certification et référentielr rentiel INSERM / ANR Appel à projet «Collections d échantillons biologiques pour la santé» en centres retenus Référentiel dérivé de l ISO 9001 construit en partenariat avec AFAQ / AFNOR Financement 2007 / 2008 Audits fin 2008 / 2009

8 Objectifs de la Certification Améliorer le niveau de qualité Homogénéiser les pratiques Permettre des études à l échelle européenne La valorisation industrielle des échantillons

9 Certification 3 niveaux d auditd Le Référentiel NF S procédures organisationnelles Audit de qualité des échantillons Experts mandatés par l INSERM IBISA (Infrastructure en Biologie, Santé, Agronomie) Plateformes technologiques Audits possibles à tout moment

10 Harmonisation Européenne Harmoniser à l échelle européenne le fonctionnement des CRB Assurance qualité (promouvoir la norme Française) Aspects réglementaires et éthiques Modèles de financement Interopérabilité des bases de données

11 Harmonisation Européenne Objectifs Le soutien de la recherche académique et industrielle Études biomédicales groupant des cohortes de patients importantes Assurer la compétitivité de la recherche et de l industrie pharmaceutique et biotechnologique européenne Améliorer le niveau global de santé en Europe

12 BBMRI Biobanking and Biomolecular Resources Research Infrastructure L objectif de BBMRI Structurer le réseau européen des CRB Apporter la preuve de la faisabilité du concept Des groupes de travail sont en cours Création d un réseau européen des bio banques

13 Mission du comité de pilotage du CCRB Coordination de la politique nationale d accréditation Réflexion prospective sur les objectifs (besoins à 2020) Évaluation des besoins et coûts liés au fonctionnement des CRB Mise en œuvre de la politique de soutien aux CRB en lien avec le GIS IBiSA Coordination des actions visant à augmenter la visibilité du dispositif national - participation de la France dans les réseaux internationaux Coordination des comités sectoriels

14 Pilotage national du dispositif Comité de Pilotage du CCRB Ens. sup. recherche (DGRI) Santé (DGS, DHOS) Écologie, développement Affaires Étrangères/Europe Économie Finances Emploi Défense Agriculture pêche Bureau res. génétiques Inst. français biodiversité FHF GIS IBiSA (directeur) Comité Santé Comité agronomie Comité Microbiologie

15 Pilotage opérationnel Réseau des CRB français dans le domaine de la santé Réseau Français au 10 mars 2009 (J. H. Di Donato) Reconnaissance pour 4 ans Permettra la participation à BBMRI Permet d accéder au soutien : D organismes de recherche GIS IBiSA (gère financements des plateformes Pôles de compétitivité Projet de société savante

16 Règles de constitution de collections Le processus : de la collecte à l exploitation Evaluation Evaluation collecte conservation utilisation

17 Règles de constitution de collections = le processus : de la collecte à l exploitation 1 ÉVALUATION : définir le projet et le protocole pour les collections à visée de recherche : évaluer la pertinence scientifique d actes invasifs définir la population concernée type, quantité et qualité des échantillons biologiques et leurs transformations éventuelles les données cliniques associées

18 2 COLLECTE Acte de prélèvement : type d échantillons et obligations réglementaires : résidu opératoire ou de soins = INFORMATION et NON OPPOSITION de la personne prélevée prélèvement dans le cadre d un protocole de recherche = CPP et consentement écrit de la personne prélèvement à visée de recherche seule : INFORMATION (quid si changement de recherche?) qualité du recueil : pour permettre toute étude ultérieure Consentement doit être obtenu en cas de changement de finalité de la recherche (loi bioéthique août 2004) Recueil des données patient: données médicales, biologiques, personnelles confidentialité (loi 1978 : CNIL)

19 Les différentes ressources biologiques humaines / utilisation dans la recherche Nature des échantillons Types de collections Techniques utilisées Thématiques en recherche Collection Repères de l Inserm «Les collections des ressources biologiques humaines» février 2005

20 Nature des échantillons et types de collections Banque ADN : ADN extrait de cellules, sang séché, lignées Liquides biologiques : plasma, sérums, LCR, urine Lignées cellulaires établies : cellules cancéreuses, cultures primaires Organes : foie, poumons, ovaires, tissus fixés et lames

21 Nature des ressources biologiques (J.H. Di Donato, 2009) Protéines 2% Virus 0% Bactéries 1% ARN 11% parasite Protozoaires 1% 1% Champignon 0% Tissus 20% ADN 19% Fluides 19% Lignées 7% Cellules 19%

22 Techniques utilisées Exemples pour tissus et organes : Microscopie optique ou électronique Histologie Microdissection Extraction de molécules Techniques de génétique moléculaire

23 Thématiques en recherche (J.H. Di Donato, 2009) Santé Publique 11% Neur/Psy 7% Gent/Dvpmt 8% Cœur- Poumon/Immu 32% Cancer 20% Nutrition/ Méta 10% Mal Infectieuses 12%

24 3 CONSERVATION ET STOCKAGE : les étapes doivent se succéder pour aboutir au stockage définitif, dans les conditions permettant de garantir la qualité de l échantillon : conditions de prélèvement (température, anticoagulant,..) transport à une température adaptée réception : enregistrement de l échantillon et des données associées anonymisation transformation : centrifugation, extraction ADN, Ficoll,. Aliquotage et étiquetage sécurisé congélation +/- cryoprotecteurs entretien de cultures,. Stockage sécurisé (-196 C, - 80 C)

25 Réception des produits frais ou congelés

26 4 UTILISATION par le chercheur : «utilisation primaire» utilisation par d autres équipes = «secondaire» à la fin de la recherche les échantillons peuvent être détruits ou être utilisés à d autres fins (loi du 4 août 2004) retour au consentement comité scientifique +/- CPPRB (CPP) contrat définissant la propriété intellectuelle et les coûts

27 Exemple d organisation d : Le CRB Ferdinand Cabanne (Dijon) CRB multi-thématique de site UF du Pôle de recherche clinique du CHU Mutualisation des financements et centralisation du management Partenariat avec l EFS Bourgogne Franche-Comté Participation du DIM et de la DESIIR du CHU de Dijon Dimension inter-régionale avec le CHU de Besançon

28 Schéma général g d organisationd

29 Gouvernance organisée e par une charte Coordonnateur et coordonnateur adjoint Nommés par le coordonnateur du pôle de recherche clinique Comité technique Stratégie scientifique et politique qualité du CRB Recevabilité et pérennité des collections Cession des échantillons Réunion toutes les 5 semaines environ

30 Équipe pludisciplinaire Khalida Bentrari : responsable qualité Pôle Recherche Alain Bonnin : PU-PH biologie, coordonateur du CRB Frédéric Brun : chef de projet informatique DIM Caroline Chapusot : ingénieur recherche anatomopathologie Irène François : PU-PH Médecine légale éthique médicale Gilbert Mongaillard : responsable de la biothèque, EFS. Yves Mouillon : chargé de mission - Pôle Recherche Nathalie Portier : Chef de projet Pôle recherche Sylvia Rastoix : analyste informatique DIM Céline Schaeffer : ingénieur recherche lab. Hématologie Lorraine Suschetet : ingénieur DSIIR

31 Le CRB facilitateur de la recherche Tumeurs solides Hémopathies malignes Sérothèque hémopathies malignes Tumeurs mammaires AGARIC CIRCE BMSI Sérothèque mycoses invasives Banque de sang placentaire Cellules mononucléées/ allogreffes Collections micro-organismes F. Piard J. Faivre, CHU Dijon M. Maynadié, CHU Dijon O. Casasnovas, CHU Dijon L. Arnould, CLCC Dijon C. Bonithon-Kopp, CHU Dijon P. Hillon, CHU Dijon B. Bonnotte, CHU Dijon F. Dalle D. Caillot, CHU Dijon F. Pouthier, EFS BFC, Besançon P. Saas, EFS BFC, Besançon D. Talon, L. Millon CHU Besançon

32 Le CRB acteur de la recherche PHRC inter-régional 2006 «projet cellules sentinelles» Coordination CRB FC Plateforme protéomique CLIPP (Patrick Ducoroy) NVH Medicinal (David Vandroux) EFS BFC (Gilbert Mongaillard) Plateforme de cytométrie de l IFR santé-stic (Anabelle Legrand) Brevet déposé

33 Exemple du CRB de Touraine GIS université François Rabelais de TOURS CHU (CIC), EFS, INRA, Institut interrégional pour la Santé, INSERM fonctionnement avec: un conseil de groupement un conseil scientifique et éthique

34 Rôle du CSE Définition de règles de fonctionnement : CHARTE de FONCTIONNEMENT et de REGLEMENT INTERIEUR : o conditions d accès o conditions de cession,. Étude des dossiers proposés pour stockage (avis technique et éthique) Organisation centralisée (EFS) : plateau technique «cryo» norme ISO prestation : extraction ADN Mise en place de Procédures réception, stockage, enregistrement informatique

35 Programme scientifique du CRBT Cancérologie : Pharmacogénétique des biomédicaments Biothérapies, Cancérologie et Thérapie cellulaire Tumorothèque hospitalière Nutrition et métabolisme : nutrition et cancer cohorte DESIR (Données Epidémiologiques sur le Syndrome d Insulino Résistance) avec l IRSA Infectiologie hépatites (IRSA, INvS,..) autres agents pathogènes Pathologies Vasculaires PHRC 2001 et 2002 Gestion de la biodiversité semences de 3 lignées expérimentales de l INRA de coq Gallus gallus

36 Les choix technologiques : conditionnement, congélation, stockage Containers Azote liquide Congélateurs -80 C «Bioarchive»

37 Conclusion Véritable outil et plate forme à la disposition des chercheurs et des cliniciens vers une meilleure qualité des recherche, par l amélioration de la qualité des échantillons les objectifs : l intégration de la tumorothèque hospitalière la certification ISO

38 Annexes : Collection Repères Inserm, février f 2005 Les collections européennes Les collections dans le monde Textes et références Sites WEB