Les plateformes de génétique

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1 Thérapies ciblées : de l anatomopathologie th l à la biothérapie i Les plateformes de génétique moléculaire PO Schischmanoff UF Génétique moléculaire et oncogénétique CHU Avicenne ACP FHF 29 mars 2012

2 Tests moléculaires prédictifs de la réponse aux biothérapies Avant Administration de médicaments anti-cancéreux Quels patients bénéficient du traitement? Dorénavant Analyse préalable du profil moléculaire tumoral Critères biologiques ou moléculaires Sélection des médicaments les plus appropriés Thérapie ciblé Yap TA et al. Nat Rev Cancer 2010;10,

3 Tests moléculaires prédictifs de la réponse aux biothérapies Avant Administration de médicaments anti-cancéreux Quels patients bénéficient du traitement? Dorénavant Analyse préalable du profil moléculaire tumoral Critères biologiques ou moléculaires Sélection des médicaments les plus appropriés Thérapie ciblé Yap TA et al. Nat Rev Cancer 2010;10,

4 Plan cancer et plateformes G ti é l è t it t Garantir un égal accès aux traitements et aux innovations

5 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, )

6 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, ) Maillage permet l accès aux tests moléculaires pour l ensemble des patients d une région Peuvent regrouper différents laboratoires CRLCC, CHU, CHG Relation avec les laboratoires de recherche

7 28 plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers subventionnées Appels à projets nationaux 2006 Crédits d'équipement (INCa/Cancéropole- Région ) 2007 Financement emplois de Techniciens (INCa) 2006 Financements tests moléculaires innovants (KRAS EGFR BRAF, ) Maillage permet l accès aux tests moléculaires pour l ensemble des patients d une région Peuvent regrouper différents laboratoires CRLCC, CHU, CHG Relation avec les laboratoires de recherche Activité en pleine expansion tests différents (44 en 2009) analyses (+ 75 %) patients (+ 44 %)

8 Missions des plateformes hospitalières de génétique éti moléculaire l Réaliser dans des conditions qualifiées des tests t moléculaires l sanitaires en cancérologie et hématologie qui : déterminent l accès à une thérapie ciblée (EGFR, KRAS, BRAF) orientent le processus diagnostique (phénotypage MSI) permettent le suivi d une maladie résiduelle (BCR-Abl) Assurer la qualification et l évaluation médico-économique des tests effectués ectués (STIC) Développer l assurance qualité (CQ, guide de bonnes pratiques) Anticiper les futurs tests, assurer leur insertion dans les projets de recherche Favoriser l accès à l information de tous les utilisateurs potentiels

9 Assurance qualité Contrôle de qualité inter-laboratoires européen mutations activatrices du gène KRAS (UKLeuven) Session 2010 Organisation : Institut Curie (Dr E. Rouleau ) 12 Participants Rouen, H Mondor, A Paré, Brest, Marseille, Lille, Bordeaux, Clermont- Ferrand, HEGP, Curie, Nantes, Nice. 100% de succès F

10 Accès à l information Organisation Coordinateurs: Pr M. Marty; Pr T. Molina; Pr P. Laurent-Puig; Dr N. Rheims Regroupe des laboratoires répartis sur 12 hôpitaux de l AP-HP laphp 2010 : intégration des laboratoires d ACP : ONCOMOLPATH Règles de fonctionnement t Réalisation des tests moléculaires prédictifs : avec des techniques validées dans des délais permettant la prescription gratuitement t t (les laboratoires d ACP et d Hématologie sont remboursés de 30 pour l envoi de matériel tumoral) Remise à l INCa de rapports d activités (trimestriels, annuels)

11 Accès à l information Site internet de la plate forme ONCOMOLPATH Permet : Mise à disposition d outils validés d information et de prescription

12 Recherche h des analyses Liste des sites Outils téléchargeables pour chaque analyse : Fiches médicales communes à l AP HP Fiches d information pratique (par site) Bon de demande d analyse (par site) Analyses moléculaires l validées : KRAS, MSI, BRAF cancer du colon EGFR cancer du poumon HER2 cancer du sein Clonalité IgH/TCR lymphome HER2 cancer de estomac KIT et PDGFRA GIST IDH1/IDH2 gliomes BRAF et c KIT mélanome JAK2 et SMP (

13 Evolution de l activité des plateformes de génétique moléculaire? Mutations somatiques fréquentes de l oncogène KRAS (CRCm) Evolution qualitative des tests moléculaires dans le cancer bronchique

14 Mutations de KRAS dans le cancer colorectal Biothérapie CETUXIMAB PANITUMUMAB EGF EGF Récepteur à l EGF Shc STAT Grb-2 P13K SOS Ras PTEN Akt Raf mtor FKHR GSK-3 BAD MEK 1/2 MAPK PROLIFERATION

15 Mutations de KRAS dans le cancer colorectal Biothérapie CETUXIMAB PANITUMUMAB EGF EGF Récepteur à l EGF STAT Shc Grb-2 Mutation activatrice de KRAS chez ~40 % des patients P13K SOS Ras PTEN Akt Raf mtor FKHR GSK-3 BAD MEK 1/2 MAPK PROLIFERATION

16 Évolution du nombre de tests KRAS dans les cancers colorectaux métastatiques (données nationales) Nombre de patients mutations de KRAS depuis 3 ans Incidence des cancers colorectaux en France ( nouveaux cas en 2011) Proportion des formes métastatiques (40 à 60 %) La plus grande partie des patients susceptibles de bénéficier d un traitement (cetuximab ou panitumumab) a bénéficié du test

17 Origine des prescriptions pour la recherche des mutations KRAS Autres plateformes (données nationales) Établissements privés 42 % 3% 30% CH de la plateforme 25 % CH hors plateforme Stabilité > 2011

18 Etapes de la caractérisation moléculaire du cancer bronchique TOTAL ~ testst en 2011 (~ 30 %) Les altérations moléculaires constituent des biomarqueurs qui peuvent être - des cibles moléculaires pour des thérapies ciblées - des marqueurs prédictifs de la réponse ou de la résistance aux traitements

19 Avenir = multiplication des tests Tendance au développement de tests théranostiques «compagnons» J Natl Cancer Inst (2009) (19):

20 Conséquences pour les plateformes Multiplication des tests pourrait => accroître la charge de travail => allonger les délais de rendu des résultats (perte de chance) Quantité limitante d ADN (cancer pulmonaire, entre 13 et 20 % des cas : bloc tumoral épuisé ) Accréditation ISO 15189

21 Comment faire face? Mise en œuvre de nouvelles technologies : - basées sur le multiplexage (recherche simultanée de plusieurs mutations) - séquençage à moyen débit (µconducteurs, fluorescence, spectrométrie de masse) Détection rapide de centaines es de mutations à partir de faibles quantités d ADN)

22 Conclusions La médecine personnalisée en oncologie/hématologie se développe Pour le bénéfice des patients INCa a joué un rôle structurant dans ce processus La multiplication prévue des tests nécessite une adaptation nouvelles technologies plus rapides, moins consommatrices d ADN collaboration accrue : pathologistes biologistes - cliniciens

23 Plateforme de génétique moléculaire Service d anatomopathologie Service clinique i

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26 Evolution de l activité «KRAS» 2010/2011 dans le cancer colorectal l par plateforme Médiane du nombre de tests par plate forme : 2009 : 520 [ ] 2010 : 475 [ ] 2011 : 457 [ ]

27 DELAIS MOYEN DE RENDU DES RESULTATS AVICENNE KRAS jours jours jours EGFR jours jours MSI jusqu en mois mois

28 Des pistes pour faire face Nouvelles organisations : collaboration accrue avec les pathologistes blocs => lames blanches => copeaux ou punchs > ADN? Stockage ADN par ACP serait plus logique Accueil de personnel des hôpitaux généraux sur la PF? nouvelles méthodes : approches multiplex, séquençage massif, etc + de tests avec autant d ADN