Actualités sur les arbovirus: émergence et diagnostic

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1 Actualités sur les arbovirus: émergence et diagnostic Isabelle Leparc-Goffart IRBA Institut de Recherche Biomédicale des Armées UMR 190 Virus Emergents CNR arbovirus SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 1

2 Généralités arbovirus (arthropod-borne viruses) Définition: Virus transmis par les arthropodes suceurs de sang moustiques, tiques, phlébotomes, culicoïdes Moustiques: Aedes albopictus (2-10mm) Culex pipiens (5-7mm) Chikungunya, alphavirus West Nile, flavivirus Dengue, flavivirus Tiques, CCHF Nairovirus Culicoïdes, 1-3mm, Oropouche, orthobunyavirus Phlebotome, 2mm, Toscana, phebovirus > 100 pathogènes pour l homme 7 virus de fièvres hémorragiques SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 2

3 Arbovirus et France métropolitaine 1. Arbovirus pouvant émerger: Dengue/Chikungunya 2. Arbovirus ayant circulé et pouvant ré-émerger: West-Nile 3. Arbovirus endémique: Toscana SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 3

5 La dengue 1 ère arbovirose humaine Vecteurs: Aedes aegypti, Aedes albopictus 2, 5 milliards d individus exposés 50 à 100 millions cas / an, (1 % de DH) décès / an (enfants ++) Flaviviridae, genre flavivirus 4 sérotypes de virus de la dengue: D1 à D4 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 5

6 La dengue dans le monde SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 6

7 La dengue en Afrique depuis 2010 Madère, 2012, D1 Mali, 2013 D1 Sénégal, 2013 D1 Cap Vert, 2009, D3 Burkina Faso, 2012 D2, 2013 D1 et D3 Togo 2013 D3 Cameroun 2010 D1 Gabon, 1998, 2007 D2, 2010 D1 D2 D3, 2013 D1 et D3 Angola, 2013 D1 D3, 2014 D4 Benin 2011 D1 Djibouti, 2011 D1, D3, 2014 D2 Somalie, 2012 D1 Comores 2010, 2013 Kenya, 2011, 2013 Tanzanie, 2013 D1 Mayotte, D2 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 7

8 Augmentation X30 du nombre de cas Malaisie Singapoure SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 8

9 Infection par le virus de la dengue Infection par le virus de la dengue Asymptomatique (50-85%) Symptomatique (15-50%) fièvre élevée céphalées intenses myalgies douleur rétro-orbitaire rash Biologie non spécifique: leucopénie thrombopénie Fièvre indifférenciée (syndrome viral) Syndrome de la dengue Dengue hémorragique (fuite plasmatique) Sans hémorragie Avec hémorragie anormale Pas de choc Dengue avec syndrome de choc Dengue Dengue hémorragique Maladie à déclaration obligatoire SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 9

10 Cinétique de l infection Symptômes IgM IgG Symptômes IgG Virémie Virémie IgM? J-7 J-2 J0 J7 3-6 mois J-7 J-2 J0 J7 Primo-infection dengue Dengue secondaire 7 jours : Détection par RT PCR (+Isolement viral) 5 jours Sérologie : IgM et IgG Sérologie nécessite 2 prélèvements dont 1 tardif ( 15 jours) Remarques: kit NS1 (dengue secondaire, sérotype); Sérocroisement flavivirus SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 10

11 Chikungunya virus Vector: genus Aedes; Togaviridae, genus Alphavirus 1952, Tanzania Symptoms IgM IgG Viraemia D-7 D-2 D0 D7 3-6 months Clinical manifestations: - Sudden onset with high grade fever (> 38,5 C) - severe arthralgias - myalgias, skin rash, headache - chronic arthritis for several months in some patients S.-D. Thiberville et al. / Antiviral Research 99 (2013) SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 11

12 S.-D. Thiberville et al. / Antiviral Research 99 (2013) SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 12

13 Novembre / Décembre 2013 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 13

14 Emergence du Chikungunya aux Amériques 18th November 2013: 5 patients without any travel history presenting severe arthralgia after a «dengue-like» fever episode SFM 25 mars 2015 Saint Martin I. Leparc-Goffart N 14

15 Alert 18/11/2013: Alert by clinician to public health services 5 suspected cases 22/11/2013: Epidemiological and entomological investigation 8 suspected cases 26/11/2013: French National Reference Center (NRC) alert. Sending of samples 05/12/2013: 1 st positive CHIKV RT- PCR. CHIKV emergence is confirmed 02/12/2013: Analysis at the French NRC: serology and RT-PCR Detection of recent alphavirus infection by serology 10/12/2013: NGS sequencing: the virus belongs to the Asian genotype, and not ECSA. SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 15

16 Phylogeny of CHIKV Saint Martin Leparc-Goffart et al, 2014 The Lancet SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 16

17 Epidemic curve of the first cases in St Martin Cassadou et al, 2014 Eurosurveillance SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 17

18 Aujourd hui Plus d 1.2 million cas suspect Figueiredo ML et al. Emerging alphaviruses in the Americas: Chikungunya and Mayaro. Rev Soc Bras Med Trop SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 18

19 Chikungunya aux Antilles Plus de cas de novembre 2013 à février 2015 Martinique et Guadeloupe, Cas sporadique Mar$nique, fin épidémie novembre 2014 St Martin et St Barthélémy, Transmission virale modérée Saint Mar$n Guadeloupe, fin épidémie janvier 2015 Saint Barthélémy SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 19

20 Guyane cas depuis février 2014, épidémie en cours SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 20

21 Dengue, chikungunya, Pourquoi? SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 21

22 Situation fin 2014 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 22

23 Dengue et chikungunya Surveillance en France Surveillance des cas importés (tout le territoire): maladies à déclaration obligatoire Surveillance renforcée depuis 2006 Mai-novembre Département où Aedes albopicus est présent Réseau de laboratoire et Centre National de Référence des arbovirus Définition cas suspect de dengue: fièvre supérieure à 38,5 C d apparition brutale au moins un signe algique (céphalées, arthralgies, myalgies, lombalgies ou douleur rétro-orbitaire) absence de tout point d appel infectieux Définition cas suspect de chikungunya: fièvre supérieure à 38,5 C d apparition brutale arthralgies Lutte anti-vectorielle SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 23

24 Cas importés Dengue/Chik, dpt 1, mai-novembre à 188 cas importés de dengue 0 à 443 cas importés de chikungunya Épidémie majeure dengue Antilles, cas 6 départements niv1 Epidémie dengue Antilles 17 départements niv 1 Epidémie chikungunya Antilles 18 départements niv 1 2 cas autochtones, Dengue 1 (origine Antilles), Nice cas autochtones de Dengue 1 1 cas autochtone de Dengue 2 2 cas autochtones, Chikungunya (origine Inde), Fréjus cas autochtones de Chikungunya 1 cas autochtone, Dengue 2, Bouches du Rhône 2013 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 24

25 Propagation de l épidémie à partir des Caraibes? Aux iles alentour où Ae aegypti est present: Oui Amérique Centrale et Amérique du Sud où Ae aegypti est present : Oui Aux lies du Pacifique où Ae aegypti est present : Oui Europe où Ae albopictus est present:??? SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 25

26 Emergences en 2014 Épidémie majeure dengue Antilles, cas 6 départements niv1 Epidémie dengue Antilles 17 départements niv 1 Epidémie chikungunya Antilles 18 départements niv 1 2 cas autochtones de Dengue 1 2 cas autochtones de Chikungunya 1 cas autochtone de Dengue 2 3 émergences du virus de la Dengue: - Dengue 1 génotype V, Toulon (1 cas) - Dengue 2, Toulon (1 cas) - Dengue 2, Aubagne (2 cas) 1 émergence du virus chikungunya, Montpellier, 11 cas SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 26

27 Propagation de l épidémie à partir des Caraibes? 432 cas importés dans les régions de France métropolitaine où Ae. albopictus est present, pendant la période d activité des mousitques Pas de transmission autochthone détectée 10 cas importés à partir d autres régions du monde (Afrique et Asie) Transmission autochthone détectée CHIKV génotype ECSA Suggère une compétence faible du vecteur Ae. albopictus présent en France métropolitaine pour CHIKV génotype Asie SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 27

28 CHIKV emergence in France, 2014 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 28

29 Cas autochtones en cas liés de dengue à Aubagne Foyer de 11 cas de chikungunya dans un quartier de Montpellier 2 cas isolés de dengue à Toulon Hyères SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 29

30 Risque pour l Europe Aedes Albopictus en Europe From European Center for Disease Control 2014 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 30

32 Un cycle complexe Oiseaux migrateurs Introduction Oiseaux sauvages ou domestiques Transmission directe (orofécale) Oiseaux sauvages ou domestiques Amplification Cycle enzootique : Moustiques ornithophiles Culex sp. Emergence de cas cliniques Chevaux Moustiques non strictement ornithophiles (Culex sp.) ou «bridge vectors» (Aedes sp.)? Prédateurs ou charognards Transmission orale Infection chronique (oiseaux ou autres) Pradier S et al., 2012 Oiseaux sauvages ou domestiques Persistance Transmission continue Amplification secondaire potentielle Transmission verticale Moustiques Hommes Autres hôtes (écureuils, lapins, alligators SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 32

33 Transmission par moustiques du genre Culex Flaviviridae, genre flavivirus Virus West Nile: Arbovirus, Répartition mondiale SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 33

34 West Nile en Europe, 2014 Lignée 1 Lignée 2 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N

35 Infection par le virus West Nile Incubation : 3-15j Formes asymptomatiques : 70-79% Infections bénignes < 20% Syndrome grippal Formes neuro-invasives: 1% encéphalites> méningites> paralysie flasque aiguë, SGB Mortalité: 5 à 10 % SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 35

36 Formes neuro-invasives de West-Nile chez l homme Données similaires sur l épidémie de Grèce; Différence sur la mortalité: 8% Israel,17% Grèce Kopel et al., Eurosurveillance 2011 Papa et al., Eurosurveillance 2010 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 36 2

37 WN en France 1960: détection en Camargue 2000: cas équins en Camargue 2003: cas humains et équins dans le Var 2004: cas équins en Camargue 2006: cas équins dans les Pyrénées-Orientales SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 37

38 Cinétique d infection Fièvre Symptômes neurologiques Problèmes: Diagnostic sérologique; sérocroisement flavivirus Persistance des IgM IgM IgG Virémie Virurie J-7 J0 3-6 à 12 mois SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 38 7

39 Stratégie diagnostic Jusqu à 2013: syndrome neuromeningé: détection des IgM et des IgG LCR + Sérum Pour 2014: syndrome neuromeningé: détection des IgM et des IgG Sérum +/- LCR Si positif: recherche de virus dans les urines SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N

40 Surveillance Détecter au plus tôt la circulation virale Plan de surveillance West Nile - Syndrome neuro-méningé (sérologie sur sérum ±LCR) chez l homme - Cas equins - Oiseaux morts Importance: dons de sang et don d organes Lecollinet et al., Livre Le virus du Nil occidental, Editions QUAE SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N

42 Maladie : Fièvres à Phlébotome Toscana (Tos), Sandfly fever Naples (SFN), Sandfly fever Sicilian (SFS) Bunyaviridae/phlébovirus RVF TOS SFN SFS syndrome grippal, souvent limité, évolution favorable («fièvre de 3 jours») MAIS : malaise, céphalées, fièvre encéphalite/méningo encéphalite (TOS) des virus peu étudiés mais bien présents Sud France Développement des outils de diagnostic Surveillance West Nile / surveillance chik dengue renforcée 1943 Italie troupes US SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 42

43 Toscana, 2015 SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 43

44 Toscana et diversité génétique Bichaud et al 2013 Clin Microbiol Infect SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 44

45 Infection humaine par le Virus Toscana 12 Nombre de cas SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 45

46 Infection humaine par le Virus Toscana Localisation: Vecteur? Réservoir? SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 46

47 Etude Priam Séroprévalence donneur de sang 0.75% 0.8% 0.37% 1.7% 0.0% 0.7% 5.5% 7.3% 3% 1.7% 2.5% 1.2% 0.0% 3.7% 4.3% 1.8% 7.9% 6.3% 9.7% 10.2% 2.5% 0.8% 2.5% 2.8% SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 47

48 Octobre 2013: émergence du virus Zika en Polynésie Français Novembre 2013: émergence CHIKV dans les Caraïbes Aout/Septembre 2014: émergences Dengue/CHIKV en France métropolitaine 2015???? SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 48

49 Centre National de Référence des Arbovirus(IRBA): Dr Olivier Flusin, Dr Christine Prat Riyadh Omarjee, Dr Raafat Fares Patrick Gravier, Laetitia Boubis, Bernard Tenebray, Olivier Merle UMR D190 «Virus Emergents» X. de Lamballerie, Rémi Charrel, and co. EFS: Pierre Gallian, and co. Réseau de laboratoires, Entomologistes, InVS, CIRE, ARS SFM 25 mars 2015 I. Leparc-Goffart N 49