Les Tumorothèques, aspects gestion de données et mutualisation
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- Serge St-Georges
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1 Les Tumorothèques, aspects gestion de données et mutualisation Tumorothèque Caen Basse-Normandie Nathalie Rousseau, Ingénieur Tumorothèque Rencontres annuelles des Data Managers Académiques 12 et 13 Juin 2012
2 TUMOROTHEQUE - DEFINITION Collections d échantillons biologiques d origine humaine Tissus tumoraux et tissus sains Cellules Sérums, liquides Différents organes : Broncho-pulmonaire Tube digestif Neuropathologie Hématologie Glande mammaire Echantillons cryopréservés Prélèvements Pièce opératoire, Biopsie Prélèvement sanguin, Cytoponction
3 TUMOROTHEQUE - DEFINITION Structure organisée pour gérer : La prise en charge des prélèvements à l origine des échantillons (qualité, traçabilité) Le stockage des échantillons à très basses températures La mise à disposition d annotations cliniques, biologiques et anatomo-pathologiques La cession des échantillons et de leurs annotations Applications sanitaires et recherche
4 TUMOROTHEQUE - OBJECTIF Contribuer aux innovations diagnostiques, pronostiques et thérapeutiques. Contribuer au développement de la recherche clinique en Cancérologie pour valider des informations diagnostiques, pronostiques et prédictives de la réponse thérapeutique. Contribuer au développement de la recherche fondamentale.
5 TUMOROTHEQUE CAEN BASSE-NORMANDIE (TCBN) Un groupement de coopération sanitaire du Centre Hospitalier Universitaire de Caen et du Centre de Lutte contre le Cancer François Baclesse Inauguration de la TCBN : Mai 2006 Responsable : Pr. Galateau-Sallé CGCT : Comité de Gestion et de Coordination Technique Comité scientifique Financement MIGAC (Mission d Intérêt Général et d Aide à la Contractualisation) annuel versé par l ARS Indications et Recommandations de l INCA sur la conservation et l utilisation des échantillons tumoraux en Cancérologie (Actualisation en Novembre 2011)
6 Service Anatomo-pathologique + CRB Mésothéliome Tumorothèque de proximité Visée sanitaire et recherche Service Anatomo-pathologique Tumorothèque de proximité Service Hématologie + CRB LLC Tumorothèque de proximité Laboratoire Biologie Clinique et Oncologique STOCKAGE Tumorothèque Caen Basse-Normandie GESTION DONNEES Cliniques, biologiques et anatomo-pathologiques Réseau Sanitaire Autres établissements de la Basse Normandie
7 ACTIVITE DE LA TCBN patients prélèvements échantillons
8 ACTIVITE PAR SERVICE
9 ACTIVITE DES PRINCIPALES COLLECTIONS
10 ACTIVITE PAR CATEGORIE 1.5% des échantillons stockés à visée sanitaire (A) sont sortis pour diagnostic. 24 % des échantillons stockés pour des projets (B) sont sortis pour ces projets.
11 STOCKAGE - CONGELATION 2 Congélateurs à -80 C Contrôle de T Reliés à la centrale d alarme Capacité : échantillons
12 100 cryotubes/cryoboite
13 STOCKAGE - CRYOCONSERVATION 2 Cryoconservateurs alimentés en azote liquide à -196 C Sonde de T Sonde de niveau
14 Rencontres annuelles des Data Managers Académiques Capacité : échantillons Combinaison spécifique Contrôle taux d O 2
15 TRANSFERT DANS L AZOTE LIQUIDE Transfert d échantillons entre les tumorothèques de proximité (CFB et CHU) à la TCBN.
16 GESTION DES DONNEES CLINIQUES Logiciel: Databiotec BD : ORACLE Saisie des prélèvements et des échantillons Saisie des annotations cliniques, anatomopathologiques et biologiques Requêtes SQL
17 STRUCTURE ARBORESCENTE Rencontres annuelles des Data Managers Académiques
18 GESTION DU STOCKAGE Rencontres annuelles des Data Managers Académiques
19 IMPRESSION DES ETIQUETTES Rencontres annuelles des Data Managers Académiques
20 Actualisation des indications et recommandations sur la conservation et l utilisation des échantillons tumoraux en cancérologie (Novembre 2011) Fiche Projet RECOMMANDATIONS INCA MTA Accord de Transfert de Matériel Contrôle Qualité des échantillons Procédure de certification : NF S Rapport d activités Consentement éclairé signé Calcul coûts des échantillons
21 GRILLE TARIFAIRE DE LA TCBN Coûts Fragment de tissu congelé (50 mg) après contrôle histologique Copeaux en paraffine (50 mg) après contrôle histologique ADN à partir de tissu congelé (2 µg) ADN à partir de paraffine (2µg) ARN à partir de tissu congelé (2µg) 95 euros 85 euros euros 165 euros
22 CONCLUSION Stockage d échantillons avec mise à disposition des annotations cliniques, biologiques et anatomopathologiques A visée sanitaire et de Recherche Coût de l activité : Nécessité de valoriser les ressources biologiques Remerciements
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