Jean-François Guégan. Centre IRD de Montpellier. Courriels : jean-francois.guegan@ird.fr jean-francois.guegan@ehesp.fr
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- Pauline Cousineau
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1 Réduction de la diversité biologique et vulnérabilité sanitaire des populations animales sauvages : intérêts et applications à l échelle de l atelier de production Jean-François Guégan Centre IRD de Montpellier Courriels : jean-francois.guegan@ird.fr jean-francois.guegan@ehesp.fr
2 Robert Barbault Jacques Weber
3 Les maladies infectieuses humaines sont toujours responsables de fortes incidences de mortalité/morbidité
4 M. Goldberg (2014), stage de master Université de Montpellier II
5 Maladies infectieuses émergentes (humaines) et importance de la biodiversité comme réservoir Influence de la biodiversité
6 Destruction des habitats et perte de diversité biologique Diversité biologique Dégradation des habitats
7 Quelle(s) incidence(s) sur la transmission infectieuse? Diversité biologique Augmentation du risque infectieux
8 Des travaux sur le thème biodiversité - infections en augmentation
9 Une synthèse (en français) publiée au Comptes Rendus Biologie Quel(s) rôle(s) exact(s) joue la diversité biologique sur la transmission infectieuse?
10 Une diversité spécifique riche en espèces (hôtes) diminue l incidence d infection dans les populations humaines
11 Effet de dilution joué par une forte diversité biologique et son action sur la transmission
12 Multiplication d une nombre d exemples où cela fonctionne bien!
13 Plusieurs autres exemples où cela ne fonctionne pas!
14 Pour les plantes, ici différentes variétés de riz, on observe le même phénomène
15 Différentes espèces de vecteurs et/ou de réservoirs hôtes présentent des compétences différentes dans la transmission Distribution théorique de compétences des espèces réservoirs Fréquence de distribution Compétence des espèces réservoirs/vecteurs
16 Différentes espèces de vecteurs et/ou de réservoirs hôtes présentent des compétences différentes dans la transmission Distribution théorique de compétences des espèces réservoirs Ce que l on observe réellement Grippes aviaires H x N y Fréquence de distribution Compétence des espèces réservoirs/vecteurs Fréquence de distribution Borréliose de Lyme Virus du nil occ. (moust.) Virus du Nil occ. (oiseaux) Compétence des espèces réservoirs/vecteurs
17 Dans les systèmes naturels, on observe des distributions variables de compétences Ce que l on observe réellement Ce que l on accepte être! Fréquence de distribution Virus du nil occ. (moust.) Compétence des espèces vecteurs Fréquence de distribution Compétence des espèces vecteurs
18 Une conséquence immédiate en est une variabilité importante des comportements épidémiologiques dans les communautés locales Compétence vectorielle locale Roche et al. (2013). The American Naturalist
19 Ne pas négliger le rôle des prédateurs Espèces de rongeurs granivores manquantes Espèces de prédateurs manquantes
20 Des espèces allouent de l énergie différentiellement entre trois fonctions principales. I - reproduction survie Réparation (syst. Imm.)
21 Des espèces allouent de l énergie différentiellement entre trois fonctions principales. II - reproduction survie Réparation (syst. Imm.)
22 Les espèces à fort taux de reproduction et à résilience importante investissent moins dans leur système immunitaire que les espèces plus spécialistes. III - Les systèmes anthropisés accumulent des espèces généralistes, investissant peu dans le système immunitaire, et donc très permissives aux agents pathogènes
23 Mieux exploiter et de manière plus optimale différentes formes de résistance (et de résilience) en agriculture/agronomie Différents niveaux d échelle et d intégration à appréhender pour mieux utiliser les relations diversité-transmission/infection du niveau de l individu (hôte) à celui de l écosystème : 1. Résistance et diversité biologique (i.e. génétique) à l échelle des individus et d une race/espèce (animale) 2. Résistance et diversité biologique à l échelle de communautés locales, inter-espèces 3. Résistance et diversité biologique à l échelle régionale
24 Races (hôtes), diversité génétique et production intensive. I - Densités très fortes, immuno-suppression, sélection de souches sur des critères de productivité = cocktail facilitant la transmission = ré-introduction de diversité génétique notamment visant la résistance engendre un coût de recherche, ré-introduction de gènes sauvages et perte de qualités (gustative, reproductive etc )
25 Races (hôtes), diversité génétique et production intensive. II - Densités très fortes, immuno-suppression, sélection de souches sur des critères de productivité = déconcentration et contre-sélection d agents pathogènes = cloisonnement en lots engendrant des barrières physiques à la engendre une perte de productivité, logistique difficile à organiser, remise en cause de pratiques installées, plus de recherches sur les coûts-bénéfices associés,
26 individus individus individus
27 Utilisation ou piégeage par des individus d espèces animales à compétence nulle dans la transmission infectieuse Zooprophylaxie maîtrisée mais n est pas sans créer des problèmes (introduction d espèce, nécessité d un vecteur généraliste, éthique,.)
28 Organisation du paysage (landscape ecology) et transmission infectieuse. I - Trois typologies de paysage Deux variétés d agents pathogènes (2 souches spécialistes et 1 généraliste) Modélisation de la transmission par modèle épidémiologique Ch. Lannou, INRA
29 Organisation du paysage (landscape ecology) et transmission infectieuse. II - Ch. Lannou, INRA
30 Organisation du paysage (landscape ecology) et transmission infectieuse. III - = une organisation du paysage en évitant les corridors et en maximisant le rôle des barrières naturelles enraye, ou diminue, une propagation épidémique = applicabilité très probable au monde animal Ch. Lannou, INRA
31
32 Messages à retenir 62% (MIE) à 72% (MI) humaines sont d origine animale Dans les systèmes naturels une forte diversité biologique tend à diluer la transmission (travail en cours : 72% des situations) L introduction de diversité biologique, et notamment en prédateurs, compétiteurs ou en hôtes-pièges peut diminuer la transmission de certaines infections mais peut poser des problèmes L introduction de diversité génétique en dehors de ses aspects patrimoniaux est à développer L utilisation de l espace et de sa typologie est à mieux être développée L uniformisation des paysage peut rendre des propagations épidémiques totalement imprédictibles et difficilement contrôlables Besoin de développer des approches systémiques et intégratives Nécessité d enseigner et de communiquer autour de ces aspects (formations, éducation, communication vers les décideurs,...)
33 Remerciements L IDDRI-Sciences Po et l ANSES Institut de Recherche pour le Développement Centre National de la Recherche Scientifique Ecole des Hautes Etudes en Santé Publique LabEx CEBA-ANR Le CESAB-FRB UMR 5090 MIVEGEC s research contribution
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