12. Extraction des données

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1 12. Extraction des données L extraction des données a un double but : 1. la description des caractéristiques des essais : méthodologie, traitements et populations, 2. l obtention des données nécessaires à l estimation de l effet traitement cumulé Réalisation pratique L extraction des données doit s appuyer sur une fiche de recueil préétablie d après le protocole. Elle peut intégrer la liste de contrôle nécessaire à la phase précédente de sélection. De ce fait, la distinction théorique faite précédemment entre ces deux phases disparaît, et elles deviennent simultanées en pratique. Au moins deux lecteurs participeront à l extraction des données en appliquant la procédure décrite pour la phase de sélection. La constitution de la fiche de recueil est délicate. La tendance est de la faire trop détaillée, donc trop lourde à utiliser, surtout quand le nombre d essais est grand. Une étude pilote pour tester cette fiche et les critères de sélection est parfois nécessaire sur un petit échantillon d essais tiré au hasard. L étude pilote permet aussi de mettre en évidence des divergences d interprétation entre les lecteurs. Ces divergences seront supprimées par un travail de standardisation, avec la production d un document précisant le sens de chaque item de la fiche. Une fiche de recueil informatisée grâce à un gestionnaire de base de données sur micro ordinateur peut remplacer un support papier traditionnel. Cette solution présente l avantage de faciliter ensuite la manipulation des données pour la suite de la méta-analyse. Des logiciels standards de gestion de base de données sont utilisables pour cette application, ainsi que des développements spécifiques comme le logiciel RevMan de la Collaboration Cochrane.

2 114 Extraction des données Exemple de fiche d extraction A titre d exemple nous présentons à la fin de ce chapitre une fiche type d extraction de données. Les éléments recueillis dans ce type de fiche dépendent fortement du domaine de la méta-analyse et il n existe pas de fiche universelle.une difficulté rencontrée dans la mise au point de ces fiches est d éviter de recueillir trop de données qui ne seront pas exploitées par la suite. Cette inflation, même si elle part d une bonne intention, qui est de ne pas oublier de recueillir une information pertinente, entraîne une lourdeur d utilisation pouvant être parfois rédhibitoire Confirmation des données Les données extraites doivent être confirmées auprès des investigateurs des essais pour plusieurs raisons : Les erreurs typographiques sont plus fréquentes qu on peut l imaginer. Ces erreurs sont parfois évidentes quand une somme de pourcentages ne fait pas 100% ou lorsqu il existe des discordances entre plusieurs parties de la publication. Mais la plupart du temps, ces erreurs ne sont pas détéctables et ne seront corrigées que par les auteurs de la publication. Parfois, les auteurs font paraître un erratum. Ces errata sont signalés par MEDLINE et doivent être impérativement consultés. Des données complémentaires ne figurant pas dans la publication peuvent être spécifiquement demandées aux investigateurs (par exemple un critère de jugement ou un sous-groupe). Ceci est particulièrement utile lorsque l objectif de la méta-analyse diffère de celui des essais. De plus la correspondance directe avec les investigateurs permet d essayer d obtenir des données en intention de traiter si la publication ne les mentionne pas. Pour une étude de mortalité par exemple, le devenir de certains patients perdus de vue au moment de l analyse a pu être obtenu ultérieurement par les investigateurs et récupéré à cette occasion. Le contact direct avec les investigateurs débouche parfois sur la constitution d un groupe collaboratif autour de la méta-analyse, apportant des échanges d idées constructifs. Par exemple, certains investigateurs connaissent des travaux non publiés ou en cours. Une retombée possible est la constitution d un groupe de travail pour une méta-analyse sur données individuelles.

3 Confirmation des données 115 Fiche d extraction page 1

4 116 Extraction des données Fiche d extraction page 2

5 Confirmation des données 117 Fiche d extraction page 3

6 118 Extraction des données Fiche d extraction page 4