Ecologie des maladies infectieuses

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1 Séminaire à l'attention des points focaux nationaux de l'oie pour la faune sauvage Ecologie des maladies infectieuses Centre canadien coopératif de la santé de la faune Centre collaborateur de l OIE pour la surveillance, le suivi, l é épidémiologie et la gestion des maladies des animaux sauvages

2 Ecologie des maladies Ecologie : Etude des interactions entres d organismes et avec leur environnement. Ecologie des maladies Ecologie des maladies : Etude des interactions entre les agents pathogènes, leurs hôtes et l environnement qu ils partagent. Mortalité Morbidité Asymptomatique Déterminants des maladies Climat, structure et complexité de l écosystème Déterminants des maladies Climat, structure et complexité de l écosystème Contacts rapprochés Contact peau-peau Aérosol Sécrétions / excrétions Sexuel Carcasses Contamination environnementale Air Eau Nourriture Objets Hôtes de transport Hôtes intermédiaires Obligatoires Parateniques Vecteurs Contacts rapprochés Contact peau-peau Aérosol Sécrétions / excrétions Sexuel Carcasses Tularémie

3 Contacts rapprochés Contact peau-peau Aérosol Sécrétions / excrétions Sexuel Carcasses Tuberculose Contamination environnementale Air Eau Nourriture Objets Hôtes de transport Contacts rapprochés Contact peau-peau Aérosol Sécrétions / excrétions Sexuel Carcasses Contamination environnementale Air Eau Nourriture Objets Hôtes de transport Choléra aviaire / Influenza aviaire Trichine chez les ours Contamination environnementale Air Eau Nourriture Objets Hôtes de transport Variole aviaire et moustiques Contamination environnementale Air Eau Nourriture Objets Hôtes de transport Echinococcus multilocularis Hôte définitif Hôtes intermédiaires Obligatoires Parateniques Vecteurs Echinococcus multilocularis Hôte définitif Hôte intermédiaire Hôte accidentel

4 Virus du Nil occidental Hôtes intermédiaires Obligatoires Parateniques Vecteurs Virus du Nil occidental Hôtes intermédiaires Obligatoires Parateniques Vecteurs Culex quinquefasciatus Culex quinquefasciatus Culex pipiens Vecteur «pont» Vecteur Cycle Moustiques primaire ornithophilique Oiseaux sauvages Vecteur Cycle Moustiques primaire ornithophilique Oiseaux sauvages Cycle secondaire Hôtes Accidentels Fièvre jaune Déterminants des maladies Hôtes intermédiaires Obligatoires Parateniques Vecteurs Climat, structure et complexité de l écosystème Primates (Amplificateurs) Aedes sp. (s) de l espl espèce hôte Dispersion Sarcelle d hiver (Anas crecca) Amplification du cycle primaire du Virus du Nil occidental Régions où des sarcelles baguées en Camargue ont été recapturées

5 Dispersion Potentiel pour : - Transmission intercontinentale (virus de l Influenza et du Nil occidental) Déterminants des maladies Climat, structure et complexité de l écosystème - Transmission entre espèces Jourdain et al Pathogen Reservoirs d agents pathogènes Une ou plusieurs populations ou environnements reliés épidémiologiquement dans lesquels un agent pathogène peut être maintenu en permanence et à partir de lesquels la maladie peut être transmise à la population d intérêt Défini selon la population d intérêt La faune sauvage : d agents pathogènes ~ 60% des pathogènes humains sont des zoonoses; ~ 77% des pathogènes du bétails infectent plus d une espèce; ~ 91% des pathogènes des carnivores domestiques infectent plus d une espèce; Presque tous les pathogènes qui menacent des espèces en difficulté infectent plus d une espèce. Haydon et al EID 8(12): 1468 Transmission et transformation d agents pathogènes de la faune sauvage () Systèmes réservoir population d intérêt Faune d intérêt avec maintient sans maintient Communauté avec maintient Animaux domestiques Animaux domestiques Homme Evolution de l agent Evolution de l agent Homme Homme Homme Homme Brucellose Virus Nipah Leptospirose Tuberculose bovine Peste Influenza VIH Adapté de Haydon et al EID 8(12): 1468

6 Systèmes réservoir population d intérêt d agents pathogène et gestion de la maladie d intérêt avec maintient sans maintient Communauté avec maintient cible Pathogène zoonotique ou émergent du pathogène Fièvre aphteuse - Afrique Wikipedia Wikipedia Contrôler la maladie dans la population cible: -Vaccination -Traitement peut être ignoré Bloquer la transmission du réservoir à la population cible : -Education -Modification habitat -Traitement de l eau -Hygiène des viandes -Pratiques agricoles Contrôler le pathogène dans la population réservoir : -Amélioration de l écosystème -Vaccination -Traitement -Contrôler la population Adapté de Haydon et al EID 8(12): 1468 doit être connu et «compris» Fièvre jaune Fièvre aphteuse - Afrique cible cible Pathogène zoonotique ou émergeant du pathogène Contrôler la maladie dans la population cible: -Vaccination peut être ignoré Bloquer la transmission du réservoir à la population cible : -Modification habitat? doit être connu et «compris» Rage du raton laveur Rage du raton laveur cible Pathogène zoonotique ou émergeant du pathogène cible Pathogène zoonotique ou émergeant du pathogène Contrôler le pathogène dans la population réservoir : -Vaccination -Contrôler la population Humain Chien Chat Raton Moufette Autres carnivores sauvages d intérêt avec maintient sans maintient doit être connu et «compris» doit être connu et «compris»

7 Déterminants des maladies Virus Nipah Malaisie 1998 Climat, structure et complexité de l écosystème Eclosions d épidémies de virus Nipah Facteurs de risque possibles Climat: El Niňo et Feu de forêt Eclosions d épidémies de Virus Nipah Facteurs de risque possibles Fermes porcines à grande échelle Déforestation Perte d habitat pour les chauves-souris frugivores Plantations de palmiers à huile Arbres à fruits à proximité des fermes PC Bali Déterminants des maladies Climat, structure et complexité de l écosystème La biodiversité Virus du Nil occidental Virus du Nil occidental Culex quinquefasciatus Culex pipiens Vecteur «pont» Vecteur Cycle Moustiques primaire ornithophilique Oiseaux sauvages Cycle secondaire Hôtes Accidentels

8 Effet de dilution de la biodiversité sur la transmission d agents pathogènes Biodiversité et Virus du Nil occidental Biodiversité élevée espèces nombreuses Biodiversité basse espèces peu nombreuses Super amplificateurs Espèces réservoirs Transmission réduite Prévalence basse Log cas VNO / habitants Transmission favorisée Prévalence élevée Nb d espèces de passereaux Système complexe : Biodiversité élevée Système simplifié : perte de biodiversité Villages et fermes Prairies Forêt -Etalement urbain : - Perte de la prairies - Déforestation - Réduction de la biodiversité Rats, souris Arvicola sp. (campagnols) Lapins Apodemus sp. (mulot) Clethrionomys (campagnols) - Diminution du nombre d espèces - Diminution de la compétition - Augmentation de l espèce réservoir - Perte de l effet de dilution Séminaire à l'attention des points focaux nationaux de l'oie pour la faune sauvage Evaluation d une maladie dans une population animale Centre canadien coopératif de la santé de la faune Centre collaborateur de l OIE pour la surveillance, le suivi, l é épidémiologie et la gestion des maladies des animaux sauvages

9 Evaluer la transmission d une maladie dans une population Taux de reproduction de base R 0 «Basic reproductive number» R 0 : Le nombre moyen d infections (cas) générés par l introduction d un individu infecté dans une population d individus susceptibles R et la transmission d agents pathogènes R > 1 : R = 1 : R < 1 : Prévalence de l infection augmente Prévalence stable ; agent pathogène maintenu Prévalence de l infection diminue ; agent pathogène n est pas maintenu R ou R eff : Taux de reproduction de base stabilisé (population non-naïve) R 0 R=1 R=1 R=1

10 R 0 =2 R=2 R=2 R=2 R=2 R=2

11 R=0 R varie en fonction de différents facteurs Taux d infection Taux de contact Niveau de susceptibilité de l hôte Pouvoir de transmission de l agent pathogène Durée de la maladie de l agent pathogène Statut immunitaire Résistants (immuns) R n a pas une valeur fixe pour un agent infectieux donné Cholera aviaire R pour un agent pathogène donné peut changer en fonction de : La structure d âge de la population Les taux de naissances, d immigration et d émigration La densité de la population L espèce animale affectée Le comportement La proportion d animaux susceptibles et d animaux immuns Taille de la colonie R 1 R > 1 Proportion des femelles au nid mortes Adapté de Buttler, E.I., et al. en préparation Morbillivirus chez les phoques Morbillivirus chez les phoques R > 1 R > 1 Nb d échouages de phoques (par semaine) Juin Juillet Août Sep. Oct. Nov. Adultes Subadultes Juvéniles Adapté de : Adapté de : Juin Juillet Août Sep. Oct. Nov.

12 Objectif de la vaccination dans une population : Avoir un R < 1 Pourcentage de la population ciblée qui doit être vacciné en fonction du R R : % à vacciner 50% 75% 83% 88% 90% Proportion minimale qui doit être vaccinée e = 1-1/ R Objectif de la vaccination dans une population : Maladies Avoir un R < 1 ~ R % de la population vaccinée Variole Afrique % Variole Inde % Rougeole 18 94% Conclusion : écologie des maladies de la faune Climat, structure et complexité de l écosystème, modifications anthropogéniques Mortalités isolées Bruit de fond <1 R =1 >1 Maladies endémiques Maladies émergentes Epidémies R >1 GREMM Merci de votre attention