Module 1 «Compréhension et contrôle des zoonoses» Module 2 «Emergence et développement des zoonoses»

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1 Module 1 «Compréhension et contrôle des zoonoses» Module 2 «Emergence et développement des zoonoses»

2 COURS ZOONOSES (Du 6 au 30 avril 2010) Ce cours est organisé conjointement par l'institut Pasteur, l'agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments et l'ecole Nationale Vétérinaire d'alfort, avec la contribution de l'institut National de Veille Sanitaire Co-directeurs du cours Dr Henri-Jean BOULOUIS Ecole Nationale Vétérinaire d'alfort Maisons-Alfort Dr Marc SAVEY Agence Française de Sécurité Sanitaire des Aliments Maisons-Alfort Dr Noël TORDO Institut Pasteur Paris Directeur du Pôle Epidémiologie et Santé Publique de l Institut Pasteur Co-directeur de l Ecole Pasteur-Cnam de Santé Publique Dr Arnaud FONTANET Unité d Epidémiologie des Maladies Emergentes Institut Pasteur - Paris

3 Organisation générale et objectifs L objectif général de la formation est de rassembler et de transmettre de façon cohérente les principaux acquis issus des recherches et des activités opérationnelles les plus récentes autour des différents aspects des zoonoses, sans frontière entre médecine de l homme et médecine des animaux, dans une perspective de compréhension globale pour la connaissance et l action. L objectif de chacun des modules est de fournir des concepts, des méthodes et un langage commun à l ensemble des auditeurs autour d une part, de la problématique «compréhension et contrôle des zoonoses, évaluation des risques associés» (module 1) et d autre part de la problématique «émergence et développement des zoonoses» (module 2). L enseignement dispensé s efforcera (i) de définir et discuter les principaux concepts nécessaires à la compréhension des zoonoses, à l évaluation des risques associés et aux différentes méthodes de contrôle, (ii) de démontrer la synergie entre les différentes disciplines mobilisables en matière de maladies transmissibles (bactériologie, virologie, parasitologie, biologie moléculaire, génétique, épidémiologie, écologie, sciences humaines, ) appliquées aux problématiques propres aux zoonoses. La formation permettra aux différents acteurs de la santé publique humaine et vétérinaire, au plan régional, national ou international, qu ils soient intervenants opérationnels (surveillance, évaluation, contrôle) ou acteurs de la recherche, de disposer d une vision synthétique combinée à la connaissance des principaux points critiques concernant les zoonoses. Dates et lieux de cours Module 1 : Module 2 : «Compréhension et contrôle de zoonoses, évaluation des risques associés» du 6 au 16 avril 2010 (attention 9 jours du fait du lundi de Pâques) une semaine à l ENVA, Maisons-Alfort ; une semaine à l Institut Pasteur, Paris «Emergence et développement des zoonoses» du 19 au 30 avril 2010 les deux semaines à l Institut Pasteur, Paris Organisation de l enseignement Il s agit, en combinant cours magistraux, études de cas, tables rondes interactives et ateliers, d illustrer la diversité des agents zoonotiques et des systèmes de transmission correspondants ainsi que l apport des différentes disciplines concourant à la compréhension des maladies transmissibles aussi bien en termes conceptuel qu opérationnel, dans une perspective réellement multidisciplinaire et multimétier. Chaque module de deux semaines consécutives, soit 10 journées de formation à temps plein, comportera des cours magistraux, des études de cas, des tables rondes et des ateliers interactifs.

4 Typologie des interventions Pour chaque type d enseignement et chaque sujet, les objectifs et les modalités de présentation sont précisés ci-dessous. Cours magistral Cours le plus souvent thématiquement articulé avec les études de cas, table ronde ou atelier l aprèsmidi (un seul intervenant en général). Étude de cas Étude rétrospective focalisée sur un sujet, conduite par des binômes d élèves à partir de documents conduisant à un exposé et une discussion, avec deux ou trois intervenants qui viendront faire partager leur expérience (prévoir une présentation Powerpoint de 15 à 20 mn par intervenant). Table ronde La table ronde a pour but de faire présenter, à l ensemble de la classe, par deux ou trois élèves, l ensemble des aspects d une problématique. Trois à quatre intervenants auront préalablement exposé chacun un aspect du sujet (prévoir une présentation Powerpoint de 20 à 30 mn par intervenant) afin de permettre une discussion structurée et ouverte pouvant nourrir des réponses ou justifier leur absence dans le cadre de la problématique. Réflexion méthodologique sur l utilisation des outils d investigation propre à l épidémiologie, la microbiologie, biologie moléculaire, l immunologie et la biologie intégrative pour répondre aux questionnements propres aux zoonoses. Trois à quatre élèves seront chargés (i) de recenser les questions de l ensemble de leurs collègues sur le thème, en introduction (15 mn) ; (ii) d animer au décours des présentations des intervenants une discussion générale de type indications et limites méthodologiques, ouverture prospective du thème. Les intervenants présenteront les principales contributions méthodologiques au sujet ainsi que les enjeux associés en termes de santé publique et santé animale (présentation Powerpoint de 30 à 40 mn par intervenant).

5 MODULE 1 COMPREHENSION ET CONTROLE DES ZOONOSES EVALUATION DES RISQUES ASSOCIES Semaine 1 (Ecole Nationale Vétérinaire d'alfort) Mardi 6 avril h00-10h00 Présentation du cours H.-J. BOULOUIS (ENVA), M. SAVEY (AFSSA) et N. TORDO (Inst. Pasteur) 10h30-12h30 Agents zoonotiques et zoonoses : cadre M. SAVEY général et définitions (AFSSA, Maisons Alfort)) 14h00-15h30 Histoire naturelle des zoonoses au travers F. MOUTOU de la relation homme/animal : de la "révolution néolithique" (AFSSA, Maisons-Alfort) aux différentes formes modernes de cohabitation 16h00-17h30 Diversité et évolution de la circulation des agents A. THERON infectieux et parasitaires chez les animaux (Université de Perpignan) vertébrés (faune domestique et sauvage) : de l'avènement de la microbiologie à la globalisation - 1) Aspects parasitaires Mercredi 7 avril h00-10h30 Diversité et évolution de la circulation des agents C. CHASTEL infectieux et parasitaires chez les animaux (Université de Rennes) vertébrés (faune domestique et sauvage) : de l'avènement de la microbiologie à la globalisation - 2) Aspects viraux 11h00-12h30 Diversité et évolution de la circulation des agents S. BRISSE infectieux et parasitaires chez les animaux vertébrés (faune domestique et sauvage) : de l'avènement de la microbiologie à la globalisation - 3) Aspects bactériens Maladie de Chagas : histoire et actualité d une zoonose J.-F. PAYS complexe, modalité de traitement et possibilité de (CHU Necker, Paris) développement hors du sous-continent latino-américain Jeudi 8 avril h00-10h30 Evolution des facteurs de risque associés au J.-J. BENET développement et au contrôle de maladies (ENVA, Maisons-Alfort) zoonotiques chez l'homme et l'animal. et N HADDAD Exemple de la tuberculose (ENVA, Maisons-Alfort) 11h00-12h30 Evolution des facteurs de risque associés au B. GARIN-BASTUJI développement et au contrôle de maladies (AFSSA, Maisons-Alfort) zoonotiques chez l'homme et l'animal. Exemple de la brucellose

6 Apports croisés de la biologie phénotypique et moléculaire ainsi que de l'épidémiologie descriptive pour caractériser l'origine de l'exposition dans deux zoonoses majeures de l'homme : la brucellose et la tuberculose à M. bovis M.-L. BOSCHIROLI (AFSSA, Maisons-Alfort) B. GARIN-BASTUJI (AFSSA, Maisons-Alfort) et S. GODREUIL (CHRU, Montpellier) Vendredi 9 avril h00-10h30 Réduction de la listériose humaine en France : un V. GOULET exemple d adaptation du système de surveillance (InVS, Saint-Maurice) de la maladie et du contrôle des denrées alimentaires 11h00 12h30 Epidémiologie descriptive et surveillance : problématiques R. LANCELOT originales des zoonoses en santé publique vétérinaire (CIRAD, Montpellier) dans les pays du Sud Table ronde Toxoplasmose : le bébé, le mouton et le chat. Le progrès S. BRETAGNE de la compréhension du cycle biologique et du diagnostic (Univ. Paris XII, Créteil) chez l'homme permet-il de justifier l'hétérogénéité des R. CHERMETTE politiques de santé publique en Europe (dépistage, contrôle)? (ENV d'alfort) et V. GOULET (InVS, Saint-Maurice)

7 MODULE 1 COMPREHENSION ET CONTROLE DES ZOONOSES EVALUATION DES RISQUES ASSOCIES Semaine 2 Lundi 12 avril h00-10h30 Evaluation des risques : 1 - Evaluation qualitative des risques en matière B. DUFOUR de zoonoses d'origine non alimentaire (ENVA, Maisons-Alfort) 10h30-11h30 Formalités administratives à l Institut Pasteur S. MALOT 11h30-13h00 Evaluation des risques : 2 - Evaluation quantitative des risques en matière J.-C. AUGUSTIN de zoonoses d'origine alimentaire (ENVA, Maisons-Alfort) 14h30-17h00 Table ronde Risque lié à la Fièvre Q en santé humaine : situations en France, en Hollande et en Australie - Des modalités de transmission à la stratégie de contrôle H. DE VALK (InVS, Saint-Maurice) et E. ROUSSET (AFSSA, Sophia-Antipolis) Mardi 13 avril h00-10h30 La rage : une zoonose à contrôle vaccinal toujours évolutive : N. TORDO 1) diversité des virus et des cycles épidémiologiques 11h00-12h30 La rage : une zoonose à contrôle vaccinal toujours évolutive : J. BARRAT 2) rôle des faunes sauvages et domestiques (AFSSA, Nancy) 14h00-15h30 Circulation d'agents zoonotiques en système d'élevage G. SALVAT avicole : les salmonelles (AFSSA, Ploufragan) 15h45-17h45 Etude de cas Apport des outils de la bactériologie classique et moléculaire G. SALVAT pour caractériser les salmonelles zoonotiques, identifier leur et S. GRANIER origine et monitorer leur antibiorésistance : les cas de (AFSSA, Maisons-Alfort) Salmonella.e. Typhimurium DT 104 et S.e. Enteritidis S. LE HELLO et Y. MILLEMANN(ENVA, Maisons-Alfort) Mercredi 14 avril h00-10h30 Les agents zoonotiques vectorisés : histoire naturelle F. RODHAIN des vecteurs 11h00-12h30 Les vecteurs : génétique des populations et évolution A.-B. FAILLOUX des facteurs de risque

8 Table ronde Transmission par les tiques des virus de la Fièvre de A. IZRI Crimée-Congo et de la TBE : comment comprendre (Hôp. Avicennes, Bobigny) la diversité des situations épidémiologiques et tenter H. ZELLER de prévoir l'évolution du risque correspondant? (ECDC, Stockholm) F. RODHAIN et Ph. DESPRES Jeudi 15 avril h00-10h30 Bases de la diversité, de la réceptivité et de la A.-J. DESSEIN sensibilité de l'homme à l'infection (Faculté Médecine Timone, Marseille) 11h00-12h30 Pourquoi un agent transmissible est-il caractérisé J.-P. HUGOT comme agent zoonotique (infections partagées et (Hôp. Robert Debré, Paris) principe de causalité) et pourquoi ne peut-il l'être : et J. VIALARD exemple des mycobactéries non tuberculeuses et (ENVL, Lyon) de Mycobacterium avium subsp paratuberculosis Méthodes et systèmes de surveillance dans le règne D. CALAVAS animal : principes généraux et problématique particulière et P. HENDRIKX dans le cadre des zoonoses (AFSSA, Lyon) B. DUFOUR (ENVA, Maisons-Alfort) Vendredi 16 avril h00-10h30 Systèmes de surveillance des zoonoses aux Etats-Unis B. CHOMEL le cas particulier de la faune sauvage et des «nouveaux (Univ. Californie, USA) animaux de compagnie» 11h00-12h30 Biologie intégrative et zoonoses : un apport spécifique J. ZINSSTAG indispensable, de la caractérisation moléculaire à la (Swiss Trop. Institute, Bâle) transmission dans les populations (espace/temps) : exemples de la tuberculose et de la rage Evaluation des connaissances

9 Lundi 19 avril 2010 MODULE 2 EMERGENCE ET DEVELOPPEMENT DES ZOONOSES Semaine 1 9h00-10h00 Présentation du cours H.-J. BOULOUIS (ENVA), M. SAVEY (AFSSA) et N. TORDO (Inst. Pasteur) 10h00-12h30 Emergence et zoonoses, cadre nosologique général et M. SAVEY problèmes originaux (AFSSA, Maisons Alfort) 14h00-16h00 De la barrière d'espèce à la barrière de transmission, J.-C. MANUGUERRA des aspects moléculaires aux échanges interspécifiques : et A. FONTANET 1) le virus du SRAS 16h15-17h30 De la barrière d'espèce à la barrière de transmission, A. ANDREMONT des aspects moléculaires aux échanges interspécifiques : (Hôpital Bichat, Paris) 2) l'exemple des bactéries résistantes aux antibiotiques Mardi 20 avril h00-10h30 Arthropodes vecteurs et émergences des maladies P. REITER virales. Comportement des agents zoonotiques et des agents strictement inféodés à l'homme 11h00-12h30 Quand et comment un agent transmissible devient-il S. VAN DER WERF un agent zoonotique? Apport de l'épidémiologie et de la biologie expérimentale : le cas des IAHP 14h00-17h30 Etude de cas Emergence de l'esb et évaluation du potentiel zoonotique en Grande-Bretagne : , D. CALAVAS et T. BARON (AFSSA, Lyon) et M. SAVEY (AFSSA, Maisons Alfort) Mercredi 21 avril h00-10h30 Rôle des faunes sauvages et domestiques dans le J.-P. DEDET développement des zoonoses : l'exemple des (Faculté Médecine, Montpellier) leishmanioses, conséquence pour la surveillance de l'émergence dans différents contextes 11h00-12h30 Influence du changement climatique sur l'émergence S. MORAND de maladies zoonotiques (CNRS et Université de Montpellier) Epidémie de Kala Azar et génétique humaine : de A.J. DESSEIN l'investigation opérationnelle à l épidémiologie (Faculté Médecine, Marseille) moléculaire et la recherche génétique J.-P. DEDET (Faculté Médecine, Montpellier) et G. MILON

10 Jeudi 22 avril h30-11h30 Pluralité des fonctions d'hôtes chez l'animal et l'homme : J. GUILLOT évolution dans le temps et l'espace. (ENVA, Maisons-Alfort) 1) Cestodoses imaginale et larvaire 13h30-14h30 Pluralité des fonctions d'hôtes chez l'animal et l'homme : évolution dans le temps et l espace. 2) Les poxvirus, évolution et développement des zoonoses associées aux cowpox et aux monkeypox 2) Poxvirus, evolution and development of zoonoses H. HENTTONEN associated to cowpox and monkeypox (FFRI, Finland) 14h30-17h30 Table ronde - Round-table New cycles for Poxvirus: rats, humans and cowpox Nouveau cycle des Poxvirus : rats, hommes et cowpox J.-C. DESENCLOS (InVS, Saint-Maurice) H. HENTTONEN (FFRI, Finland) et J.-P. HUGOT (MNHN, Paris) Vendredi 23 avril h00-11h00 Influence des déplacements de populations (humaines Ph. MARIANNEAU et/ou animales) et des transformations des écosystèmes anthropisés dans l'émergence des zoonoses. 1) Le cas des Hantavirus et des Arenavirus 11h00-12h30 Influence des déplacements de populations (humaines N. BOULANGER et/ou animales) et des transformations des écosystèmes (Fac. Pharmacie, Illkirch) anthropisés dans l'émergence des zoonoses. 2) Le cas de la maladie de Lyme Diversité virale : des maladies strictement animales aux Ph. MARIANNEAU zoonoses extensives à transmissions interhumaines, le cas des virus influenza et des filovirus V. JESTIN (AFSSA, Ploufragan) et J.-C. MANUGUERRA (Institut Pasteur)

11 MODULE 2 EMERGENCE ET DEVELOPPEMENT DES ZOONOSES Semaine 2 Lundi 26 avril h00-10h30 Les batraciens, les reptiles et les poissons sont-ils des N. CHAI sources futures significatives de zoonoses? (MNHN, Paris) 11h00-12h30 Risques zoonotiques émergents et prise de décision B WOLFER publique (INRA, Ivry/Seine) 14h00-15h00 Chauves-souris, vecteurs de virus émergents N. TORDO 15h30-17h30 Table ronde Nouveaux animaux de compagnie (NAC) et commerce N. CHAI (MNHN) international. Quels risques, dans quelles circonstances? P. ARNE (ENVA, Maisons-Alfort) et F. MOUTOU (AFSSA, Maisons-Alfort) Mardi 27 avril h00-10h30 Surveillance et détection des émergences : indicateurs P. HENDRIKX globaux ou surveillance spécifique? (AFSSA, Lyon) 1) L'apport de la surveillance des maladies animales 11h00-12h30 Surveillance et détection des émergences : indicateurs N. CAILLERE globaux ou surveillance spécifique? (InVS, Saint Maurice) 2) L'apport de la surveillance des maladies humaines 14h00-17h30 Etude de cas Fièvre de la vallée du Rift : un paradoxe de la D. FONTENILLE surveillance? (IRD, Montpellier) R. LANCELOT (CIRAD, Montpellier) M. BOULOY et M. GRANDADAM Mercredi 28 avril h00-10h30 Réémergences de zoonoses parasitaires d'origine P. BOIREAU alimentaire : causes et conséquences pour les systèmes (AFSSA, Maisons-Alfort) de veille et de surveillance chez les animaux et chez l'homme (exemple de la trichinellose) 11h00-12h30 Une zoonose à réservoir tellurique, le charbon : émergence, N. MADANI réémergence ou menace? (AFSSA, Maisons-Alfort) Les primates : réservoir permanent d'agents zoonotiques? A. AYOUBA Du VIH aux fièvres hémorragiques (IRD, Montpellier) H. CONTAMIN (Cynbiose, Lyon) et A. BLANCHER (CHU, Toulouse)

12 Jeudi 29 avril h00-10h30 West-Nile : conditions et conséquences de l'émergence, S. ZIENTARA comparaison Ancien et Nouveau Monde (AFSSA, Maisons-Alfort) 11h00-12h30 Peste : émergence et ré-émergence d une zoonose E. CARNIEL Fausse ou vraie émergence : découverte ou (re)connaissance M. CORNET à propos de la maladie de Lyme, de la listériose et des chlamydioses aviaires K. LAROUCAU et P. MARTIN (AFSSA, Maisons-Alfort) Vendredi 30 avril h00-10h30 Une zoonose extensive : la fièvre jaune. Emergence A. SALL historique et développement des cycles (Institut Pasteur, Dakar) épidémiologiques sylvestre et urbain 11h00-12h30 Les risques : du principe de prévention au O. GODARD principe de précaution (Ecole Polytechnique, Palaiseau) Evaluation des connaissances