UNIVERSITE MONTPELLIER 2 Poste n 212

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1 UNIVERSITE MONTPELLIER 2 Poste n 212 Corps : Article : Chaire : Section 1 : Section 2 : Section 3 : Profil : Localisation : Code postal de la localisation : Etat du poste : Adresse d'envoi du dossier : Maître de conférences 26-I-1 Non 67-Biologie des populations et écologie 26-Mathématiques appliquées et applications des mathématiques Biostatistiques et genetique quantitative UM Vacant envoi internet Contact administratif : N de téléphone : N de Fax : Date de prise de fonction : 01/09/2010 Mots-clés : Profil enseignement : Composante ou UFR : Référence UFR : Profil recherche : Laboratoire1 : MONTPELLIER AMBROISE HOUDART RESPONSABLE SERVICE PERSONNEL ENSEIGNANT marie-louise.seidel@univ-montp2.fr FDS FDS UMR CENTRE D'ECOLOGIE FONCTIONNELLE ET EVOLUTIVE (CEFE) Laboratoire2 : UMR INSTITUT DES SCIENCES DE L'EVOLUTION (MONTPELLIER) Laboratoire3 : Laboratoire4 : Laboratoire5 : Dossier papier : Dossier numérique physique (CD, DVD, clé USB) : Pièces jointes par courrier électronique : Application spécifique : NON NON NON gestionnaire : OUI URL application : Le profil détaillé se trouve en page 2 et suivantes

2 CAMPAGNE D'EMPLOIS ENSEIGNANTS 2010 ETABLISSEMENT : UNIVERSITE MONTPELLIER II COMPOSANTE : Faculté des Sciences SITE :UM2 IDENTIFICATION DU POSTE : N : MCF 0212 Corps : Enseignant Section CNU : 67 Nature demandée : MCF Article de référence : - axe prioritaire "modélisation du vivant" et "pluridisciplinaire informatique-biologie" Section(s) CNU demandée(s) : 67/26 (mots clefs) Profil pour publication : Biostatistiques et génétique quantitative ENSEIGNEMENT : Profil enseignement : Le Maître de conférences devra assurer des enseignements de biostatistiques à tous les niveaux de L et M (statistique descriptive à une et deux dimensions, probabilité mathématique et distributions théoriques, principes de l inférence statistique : échantillonnage, estimation de paramètres, théorie des tests, comparaison de populations, liaison entre deux variables, analyses de variance et de covariance ; séries temporelles; régression linéaire et non linéaire, régression logistique, analyse de pistes, bootstrap et Jackknife, statistiques spatiales, statistiques bayésiennes, méta-analyses, analyses multivariées, sélection de modèles ). Il devra aussi mettre en place des enseignements dans le domaine de la génétique quantitative (modèle de base, estimations de paramètres génétiques ; réponse à la sélection, interactions génétique x milieu, modèle mixte, cartographie de locus à effet quantitatif, ), en L3 et M1, et participer aux enseignements existants en M2. Pour ces derniers enseignements, un minimum de connaissances en génétique moléculaire et bioinformatique est nécessaire. Il pourra également contribuer à renforcer, en L et en M, des enseignements dans le domaine de l écologie théorique (dynamique des populations et des communautés, théorie neutraliste de la biodiversité, dynamique spatiale, ), en liaison étroite avec les enseignements de génétique des populations. Département d'enseignement ou équipe pédagogique : Biologie-Ecologie Lieu(x) d'exercice : Bât 22, 1er étage Nom du directeur département : Sylvie HURTREZ-BOUSSES Tél. directeur département : directeur département : Sykvie.Hurtrez@mpl.ird.fr URL département : RECHERCHE : Profil recherche : La personne recrutée mènera des recherches dans le domaine de la génétique quantitative, discipline fondamentale pour comprendre la base génétique des phénotypes et leur plasticité. Appuyées sur les outils, en particulier statistiques et génétiques, les plus modernes de la discipline, les recherches pourront porter sur des organismes de laboratoire ou sur des populations naturelles. Elles se placeront aussi dans un cadre fermement évolutif. De solides connaissances en génétique quantitative, en particulier dans les méthodes d analyse de données et de construction de protocoles, sont requises. Adéquation éventuelle avec une chaire associée à un organisme : Equipes d'accueil potentielles: ================================================================== 1

3 CEFE UMR 5175 Les problématiques du Centre d Ecologie Fonctionnelle et Evolutive se situent dans les grands axes internationaux de recherche en écologie : dynamique de la biodiversité, changements globaux et développement durable. Ces axes sont en accord avec les priorités du département EDD du CNRS, et plus généralement du CNRS. Les recherches se situent plus particulièrement dans les champs de la biologie des populations, de l écologie évolutive et de l écologie fonctionnelle (flux de matières et d'énergie au sein des écosystèmes). L emphase est placée sur la compréhension du rôle des variations environnementales, en particulier des changements globaux sur le fonctionnement de ces organismes et de leur diversité, dans une perspective résolument spatiale et temporelle. La pluridisciplinarité des approches est une réalité concrète. Les problématiques écologiques et de biologie des populations sont aussi analysées via des approches SHS (par ex., ethnologie, sociologie, géographie) avec des intégrations récentes au CEFE de chercheurs de ces champs disciplinaires. La liaison avec les Sciences de l Univers est ancienne, et a été renforcée par la participation à des programmes sur la dynamique des écosystèmes. Le CEFE est déjà de fait un "Laboratoire d Interface" entre les Sciences de la Vie, les Sciences de l Homme et de la Société et les Sciences de l Univers. En aval de questionnements fondamentaux, une fraction significative des recherches portent sur, ou sont appliquées à, des problématiques d écologie de la conservation, du niveau populationnel ou niveau écosystème Equipe d'accueil : Intitulé de l'équipe : CEFE, UMR 5175 Nom du chef d'équipe : Jean-Dominique LEBRETON Composition de l'équipe (nombre de PU, PUPH, DR, MCF, CR, ITA/IATOS, postdocs, doctorants) : permanents (hors CDD) PU (1) PUPH DR (2) MCF(1) CR (3) ITA/IATOS Post-docs Doctorants (1) UM1 + UM2+UM3+EPHE+SUPAGRO (2) Dont 1 cadre CIRAD chef d équipe (3) Dont 2 cadres CIRAD chercheurs L emploi vient-il en soutien à une activité établie ou à l émergence d une nouvelle thématique? Renforcement Biostatistique et émergence Génétique quantitative Contexte scientifique local, national et international : Forte demande avec peu de forces organisées en équipes, d où un besoin fort de consolidation Collaborations locales, nationales et internationales : Les équipes potentielles d accueil ( Biométrie, R. Pradel, Ecologie évolutive, T. Lenormand, etc..) sont des leaders mondiaux dans leur domaine Utilisation de plates-formes : outils calcul du CEFE Lieu(x) d'exercice : CEFE, campus CNRS Nom directeur labo : Jean-Dominique LEBRETON Tél. directeur labo: directeur labo : direction@cefe.cnrs.fr URL labo : ================================================================== ISEM UMR 5554 Intitulé de l'umr : Institut des Sciences de l Evolution de Montpellier (ISEM) Nom du directeur d unité : Jean-Christophe AUFFRAY Composition de l'équipe (nombre de PU, PUPH, DR, MCF, CR, ITA/IATOS, postdocs, doctorants) : 8 PU ; 15 DR ; 19 MC ; 21 CR ; 42 ITA/IATOS (19 pour les services communs ISEM) ; 15 post-doc ; 37Doc 2 Contexte scientifique local, national et international : L ISEM est un laboratoire de l Université Montpellier 2, de l Institut Ecologie et Environnement (INEE) du CNRS et de l IRD. De part sa production scientifique (environ 200 publications par an) et sa participation aux programmes nationaux et internationaux de

4 recherche sur l évolution, l ISEM dispose d une excellente visibilité nationale et internationale. Collaborations locales, nationales et internationales : - Pour l international, nombreuses collaborations sont entretenues avec de nombreuses régions du monde au travers de projets financés ou de dispositifs de coopération : deux PICS Algérie et Afrique du Sud, GDRI avec l Afrique du Sud, GDRE avec l Espagne. D autres coopérations internationales se développent sous forme de programme ANR. - A un niveau National l ISEM est impliqué dans cinq GDRs, GDR Morphométrie et Evolution des Formes, GDR Génomique des populations, GDR Ecologie Chimique, GDR Bioinformatique Moléculaire, GDR Cytogénomique structurale et évolutive. - A un niveau local, l ISEM est présent et actif dans nombre de dispositifs fédératifs. Depuis la création de l IFR 119 MEB, Montpellier Environnement Biodiversité, l ISEM est l une des unités constitutives, et s y montre très proactif. Depuis 2008, l ISEM est l un des 6 membres constitutifs de l OSU OREME, Observatoire de Recherche Méditerranéen de l Environnement. Utilisation de plates-formes : L ISEM dispose ou héberge de nombreuses plateformes techniques, ou services mutualisées entre équipes de l ISEM, voire au-delà, vers les laboratoires de l IFR 119 ou le site de Montpellier au travers de la plateforme IbiSa Imagerie. - Plateforme de Morphométrie. Service commun de l ISEM ouvert aux autres unités de l IFR 119. Fonctionne avec un AI dédié - Conservatoire Génétique de la Souris Sauvage (CGSS) - Plateforme de séquençage génotypage de l IFR Plateforme qpcr Haut Débit des IFRs 119 et Plateforme de Cytogénomique de l IFR Cluster de Calcul. - Plateforme de Microtomographie 3D in vivo («CT scan») - Accès aux plateformes de l IFR 119 hors ISEM (écologie chimique, terrains d expériences, etc.) Lieu(x) d'exercice : Université Montpellier 2 Nom directeur labo : Jean-Christophe AUFFRAY Tél. directeur labo: directeur labo : jean-christophe.auffray@univ-montp2.fr URL labo : Descriptif labo : Depuis trois décennies, l ISE-M développe des recherches de haut niveau en biologie évolutive et en paléontologie. Avec la prise de conscience des effets possibles du changement global, les recherches fondamentales que nous menons sur les mécanismes d évolution et d adaptation des organismes et des communautés rencontrent de véritables enjeux de sociétés. S il est manifeste que les enjeux du changement global sur la biodiversité inspirent des pans entiers de nos recherches sur l évolution, le décryptage des mécanismes évolutifs reste au coeur de nos préoccupations. Nous nous situons ici sur le front de la connaissance, et rappelons que le CNRS, dans son plan stratégique 2020 place l évolution du monde vivant parmi les questions les plus stimulantes de la recherche fondamentale. Les sciences de l évolution sont, par définition, pluridisciplinaires. Elles impliquent toutes les sciences du vivant (génétique et génomique, écologie, biologie du développement, etc.) et s interfacent avec tout un ensemble de champs disciplinaires tels que les sciences de l univers (paléontologie, paléo-environnements et paléoclimats), l informatique (bioinformatique), les mathématiques (modélisation) ou les sciences humaines (biologie évolutive humaine). Fiche AERES labo : / DESCRIPTION ACTIVITES COMPLEMENTAIRES : 3

5 Moyens du laboratoire mis à disposition de l'équipe d'accueil : Moyens matériels : Plateformes techniques de l ISEM, de l IFR 119 (Montpellier Environnement Biodiversité) et de l équipe concernée Moyens humains : cf nombre ITA-IATOS plus haut Moyens financiers : Budgets récurrents Autres moyens : Projets financés selon les départements (15 ANR et 2 ERC en cours au 01/01/2010) 4

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