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12 EXAMEN DE BIOCHIMIE- Les molécules de la vie (BI102) - Juin 2013 Durée : 2 heures - Calculatrices, téléphones et documents interdits. Important : Indiquer votre numéro de groupe sur votre copie I. Vous avez une Solution 1, HCl 1 mol. L -1. Vous souhaitez préparer 100 ml de Solution 2, HCl 10 mmol. L -1. a. Quels volumes d eau et de Solution 1 devez-vous mélanger? Détaillez votre calcul. (1 point) b. Quel est le ph de la solution 2? Détaillez votre explication. (Vous pouvez résoudre la question b indépendamment de la question a) (2 points) II. Vous êtes à la montagne, dans le chalet familial. C est la fin de l été et, avant de partir, votre père vous demande de purger les tuyaux, afin qu il ne reste pas d eau dans les tuyaux pendant l hiver qui va être très froid. Quelle mauvaise surprise pourriez-vous avoir l été prochain si votre père oubliait de vous demander ce service? Donnez une explication scientifique. (2 points) III. Parmi les groupements suivants, lesquels sont susceptibles de former une ou plusieurs liaisons hydrogène avec l eau? (1 point) -CH3 -OH -NH 2 >C=O IV. L extrémité N-terminale d une protéine membranaire a la séquence suivante : NH 2 - Met- Asp-Arg-Leu-Ser-Arg-Arg-Arg-Leu-Phe-Met-Tyr-Val-Ile-Met-Val-Gly-Gly-Ser-Val-Leu- Ile-Leu-Phe-Trp-Val-Arg-Lys-Arg Cette extrémité contient un segment transmembranaire. Les segments transmembranaires sont en général approximativement composés d une vingtaine d acides aminés. a. Définissez «un segment transmembranaire» (0,5 point) b. Repérez la séquence correspondant au segment transmembranaire et notez la sur votre copie. Expliquez votre choix. (2 points) V. Le goût sucré du maïs fraîchement récolté est dû à la haute teneur en sucres des grains. Le maïs stocké quelques jours na plus ce goût sucré car 50% du sucre libre est converti en amidon dans la journée suivant la récolte. Pour conserver le goût sucré du maïs frais, les grains sont immergés dans leau bouillante pendant quelques minutes (blanchis) puis refroidis. Après ce traitement, le maïs stocké conserve sa douceur sucrée. a. Quelle est la base moléculaire de ce phénomène? (1 point) b. Rappelez ce qu est l amidon. (1 point)

13 VI. L octapeptide Ala-Val-Gly-Trp-Arg-Val-Lys-Ser a été digéré par la trypsine qui clive après les résidus Arg et Lys. Vous avez la possibilité de réaliser une chromatographie par échange d ions ou une chromatographie par filtration sur gel pour séparer les produits. a. Expliquez le principe d une chromatographie par échange d ions et le principe d une chromatographie par filtration sur gel. (3 points) b. Quelle technique choisirez-vous pour séparer les produits de la digestion trypsique. Justifiez votre choix. (2 points) VII. Vous êtes en stage au laboratoire et vous digérez le fragment d ADN indiqué plus bas par l enzyme de restriction SmaI. SmaI reconnaît la séquence palindromique 5 -CCCGGG-3 et la coupe en son milieu, générant des extrémités franches. Vous devez ensuite séparer les fragments d ADN sur un gel d électrophorèse. Malheureusement, vous ne vous rappelez plus ce que votre maître de stage vous a dit quant au branchement des électrodes. Fragment ADN : 5 - TCTAAAGCCGCCTACGGACGCCGCCCGGGAAAAACTCTCCAGCGAAGGGCAA AGATTTCGGCGGATGCCTGCGGCGGGCCCTTTTTGAGAGGTCGCTTCCCGTT-5 a. A votre avis, l électrode reliée au pôle négatif du générateur doit-elle être branchée du côté où vous avez déposé l ADN où à l autre extrémité? Expliquez votre choix. (2 points) b. Expliquez comment vous allez ensuite visualiser les fragments d ADN sur le gel d électrophorèse. (1 point) c. Alors que vous avez coupé le fragment d ADN en deux vous ne voyez qu une seule bande sur le gel. Quelle est votre explication? (1,5 points)