La connaissance et l utilisation des outils génétiques dans la filière équine

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1 Le magazine en ligne de l actualité technique et scientifique équine La connaissance et l utilisation des outils génétiques dans la filière équine Par : Alexandra COVIGLIO ; Maurine GRIVAZ ; Thibaud GUILARD ; Stessy LADEBESSE ; Chloé LE BRUN ; Nathalie MATHIEU Etudiants en deuxième année à l ENSAT (Ecole Nationale Supérieure Agronomique de Toulouse) les outils génétiques à disposition des éleveurs de chevaux Sous le terme «outil génétique», l ifce (Institut Français du Cheval et de l Equitation) regroupe, entre autre, deux notions : les indices de performance (ISO, ICC, IDR, ) et les indices génétiques -connus plus généralement sous le nom de BLUP (Best Linear Unbiased Predictor = Meilleur Prédicteur Linéaire non Biaisé) - (BSO, BCC, BDR, ). Les indices de performance sont associés à un coefficient de précision (CP) et les indices génétiques à un coefficient de détermination (CD). Ces coefficients sont compris entre 0 et 1 et ils permettent de mesurer la précision des indices qu ils accompagnent. Plus ils sont proches de 1, plus l indice est fiable. Les indices de performances permettent de rendre compte de la réussite d un cheval en compétition, sur une année donnée, en fonction de ses résultats, de la difficulté des épreuves réalisées et de la concurrence rencontrée. Ils sont sous format numérique, la moyenne de la population étant égale à 100. Un cheval au-dessus de 100 est donc un cheval plus performant que la moyenne, et inversement. Les indices génétiques estiment le potentiel héréditaire d un cheval en tenant également compte de celles de ses ascendants, de ses frères et sœurs, de ses descendants et même de ses cousins. Ils sont obtenus grâce au BLUP, méthode de calcul non biaisée grâce à laquelle l indice génétique du poulain à la naissance est établi en fonction de ceux de ses parents. Cet indice évolue ensuite tout au long de la vie du cheval en fonction de ses performances propres et de celles des produits et autres apparentés. L indice génétique est aussi une valeur mais la moyenne est égale à 0. Un cheval est considéré comme améliorateur sur un caractère donné s il possède un indice génétique supérieur à 0 pour ce critère. Matériels et méthodes L ifce souhaitait avoir des données statistiques sur l utilisation des indices génétiques par les acteurs de la filière. Un questionnaire en ligne a donc été soumis à un panel de personnes. Parmi elles, 267 personnes ont répondu dont 154 éleveurs, 68 professionnels du monde du cheval (cavaliers professionnels, moniteurs d équitation, vétérinaires, inséminateurs ) et 45 utilisateurs : cavaliers amateurs, de loisirs. Le questionnaire était essentiellement constitué de questions dites fermées. Pour les quelques questions qui étaient ouvertes, une étude de mots-clés a été effectuée dans le cadre de l analyse. Différentes méthodes d analyse ont été mises en place, notamment une quantification de la connaissance modélisée par un système de notation : une note de connaissance comprise entre 0 et 5 a été attribuée aux personnes ayant participé à l étude. Elle varie en fonction de la connaissance et de l utilisation des indices spécifiques à la discipline de chacun. 1

2 Résultats La connaissance des outils génétiques dans le monde du cheval Les résultats sont présentés dans le graphique ci-dessous. Comme le montre le graphique suivant, les éleveurs connaissent mieux les outils génétiques que le reste des acteurs de la filière. Toutefois, la proportion de personnes qui connaissent bien les indices reste très faible. En effet, 43% des personnes interrogées ont une note inférieure ou égale à 1 sur 5. Evaluation de la connaissance des personnes interrogées (n=267) Nombre de personnes interrogées (en %) 60% 50% 40% 30% 20% 10% Utilisateurs (46) Professionnels (69) Eleveurs (152) 0% 0 Mauvaise ]0;1] Faible ]1;2] Moyenne ]2;3] Bonne ]3;4] Très bonne ]4;5] Qualité de la connaissance 2

3 D autre part, une confusion entre certains termes a été mise en évidence. Aux questions qu estce qu un outil génétique pour vous? Avez-vous connaissance de ceux mis à votre disposition?, 61% des personnes interrogées ont prétendu connaître ces outils ou en avoir déjà entendu parler. Pourtant, parmi ceux qui ont dit les connaître, 30% n en ont pas donné une bonne définition. Pour les personnes ayant donné une réponse fausse, les outils génétiques regrouperaient les techniques de génomique, le génie génétique ou les moyens techniques et technologiques de reproduction comme les inséminations artificielles. Réponse correcte Réponse incorrecte Oui, je les connais J en ai déjà entendu parler Non, mais ça m intéresserait Non, ça ne m intéresse pas TOTAL 22% (58) 9% (26) 5% (14) 0% (0) 37% (98) 15% (39) 13% (36) 14% (37) 3% (9) 45% (121) Sans réponse 0,4% (1) 1%(3) 13% (35) 3% (9) 18% (48) TOTAL 37% (98) 24% (65) 32% (86) 7% (18) 100% (267) L utilisation des outils génétiques Il a été demandé aux éleveurs de classer les différents critères auxquels ils font attention lors du choix des étalons. Les résultats sont présentés dans la frise ci-dessous : Il apparaît que les indices (de performance et génétiques) ne sont pas pris en compte dans la plupart des cas (plus de 90 %). Ils ne sont donc pas utilisés et ce pour différentes raisons : une préférence pour l expérience personnelle, pour l intuition ou encore un accès difficile à l information. 3

4 L accès à l information De plus, il a été mis en évidence un problème de transmission de l information au moment de la publication des indices. Les éleveurs à qui ils sont destinés ne savent pas toujours qu ils ont un accès libre et gratuit à ces données. Les interfaces permettant d obtenir des informations sur les indices sont mal vues par la moitié de leurs utilisateurs. Ils les trouvent difficiles d accès, trop chargées, trop confuses, parfois même incomplètes et difficilement compréhensibles. Ceci s explique aisément par la diversité des catalogues et des sites internet qui présentent les indices sans aucune homogénéité. Le site des Haras Nationaux est d ailleurs le seul à présenter tous les indices de la même façon pour tous les chevaux. Conclusion Cette étude a donc permis de montrer qu un certain nombre d éleveurs, encore trop important, a bien une image biaisée des outils génétiques disponibles. Ils ne voient pas ce qu ils leur apportent concrètement en plus de leur ressenti personnel. Ils évitent et se méfient du sujet, favorisant leur expérience. En parallèle, un problème de terminologie a également été mis en évidence : confusion entre outils génétiques et outils pour la reproduction en général difficulté à différencier indices de performance et indices génétiques, terme outil qui renvoie à un outil matériel pour beaucoup, comme un logiciel ou l insémination artificielle. 4

5 Il est donc compréhensible qu un grand nombre de personnes soit réticent à l utilisation des outils génétiques et n y porte pas beaucoup d intérêt. Il existe également un problème de transmission de l information entre les scientifiques qui calculent les indices et ceux à qui ils sont destinés. Dans l idéal, les catalogues devraient jouer ce rôle d intermédiaire, mais ce n est pas toujours le cas et seule la mise en place d un cahier des charges pourrait y remédier. D après l étude, 22% des personnes interrogées souhaiteraient avoir accès à des formations sur ces outils. Il faut savoir que de telles formations existent déjà, elles ont lieu au mois de décembre et leur accès est gratuit. D autres améliorations ont été proposées : diffuser ces outils plus largement, envoyer des newsletters informatives, apprendre à lire des indices étrangers. De plus, comme nous l avons déjà évoqué, tous les indices ne sont pas encore disponibles pour toutes les disciplines de la filière équine. Il est donc difficile de mettre en commun les connaissances et les savoir-faire de tous les éleveurs. Ceci est d autant plus dommage que les éleveurs des disciplines en question sont ceux qui connaissent le mieux les outils génétiques et qui aimeraient pouvoir s en servir (notamment les éleveurs de poneys). Par ailleurs, d autres indices sont en cours d élaboration, comme les indices de tempérament et les indices morphologiques. Pour plus de renseignements, le rapport d enquête global, sera bientôt disponible sur le site de l ifce/haras nationaux. Consultez aussi les fiches Equipaedia : Le saviez-vous? Tous les indices génétiques commencent par la lettre B (BSO pour le saut d obstacle, BDR pour le dressage, etc...) et tous les indices de performance commencent par la lettre I (ICC pour le concours complet, IRE pour l endurance, etc ) En général, les significations des indices sont rappelées dans les premières pages des catalogues. Attention! Pour les courses plates et à l obstacle de chevaux et pour les poneys, il n existe pas encore d indice génétique. Pour les autres disciplines (sports équestres de chevaux et course au trot), il existe un indice génétique et un indice de performance. 5