Rapport du comité d'experts

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1 Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Physiopathologie des maladies génétiques d expression pédiatrique - UMRS 654 de l'université Paris 6 janvier 2008

2 Section des Unités de recherche Rapport du comité d'experts Unité de recherche : Physiopathologie des maladies génétiques d expression pédiatrique - UMRS 654 Université Paris 6 janvier 2008

3 Rapport du comité d'experts L'Unité de recherche : Nom de l'unité : Physiopathologie des maladies génétiques d expression pédiatrique Label demandé : UMR_S N si renouvellement : 654 Nom du directeur : Serge Amselem Université ou école principale : Université Paris 6 Autres établissements et organismes de rattachement : Assistance Publique - Hôpitaux de Paris Date(s) de la visite : 25 Janvier

4 Membres du comité d'évaluation Président : Madame Christine Petit Experts : Mme Mireille Claustres, Montpellier M. Roman Chrast, Lausanne Expert(s) représentant des comités d évaluation des personnels (CNU, CoNRS, CSS INSERM, représentant INRA, INRIA, IRD..) : M. Claude Ferec, Brest, expert représentant la CSS INSERM Mme Veronique Paquis, Nice, expert représentant la section du CNU Observateurs Délégué scientifique de l'aeres : M. Philippe Bouvet Représentant de l'université ou école, établissement principal : M. Bernard Dujon Représentant(s) des organismes tutelles de l'unité : Mme Chantal Lasserre, chargée de mission de l INSERM Mme N. Parez, correspondant recherche AP-HP 3

5 Rapport du comité d'experts 1 Présentation succincte de l'unité Nombre de chercheurs statutaires dans l'unité au 1er Janvier 2008 : 3 Nombre d'enseignants-chercheurs statutaires dans l'unité au 1er Janvier 2008 : 3 Nombre d'enseignants-chercheurs et de chercheurs bénéficiant d'une PEDR au 1er Janvier 2008 : 1 Nombre de chercheurs et d'enseignants-chercheurs titulaires d'une HDR : 5 (dont une en 2005 et 3 depuis le 1er janvier 2008) Nombre d'enseignants-chercheurs et chercheurs publiants selon les critères de l'aeres : 6 Nombre d'ita dans l'unité au 1er Janvier 2008 : 3 Nombre d'iatos dans l'unité au 1er Janvier 2008 : 1 Nombre de doctorants dans l'unité au 1er Janvier 2008 : 1 Nombre de doctorants ayant soutenu leur Thèse entre le 1er Janvier 2004 et le 1er Janvier 2008 : 3 Durée moyenne des thèses soutenues depuis 4 ans dans l unité : 4 ans 2 Déroulement de l'évaluation Le Comité d experts tout d abord réuni quelques instants a souhaité que les observateurs participent à l ensemble des étapes du processus d évaluation. Afin d apprécier au mieux les réalisations et les projets, la journée avait été organisée selon les suggestions de la présidente pour permettre un maximum d échanges scientifiques. Quatre heures ont ainsi été consacrées aux exposés scientifiques : présentation générale de l unité par son Directeur, suivie d exposés par ses collaborateurs sur les trois grands thèmes de recherche de l unité conclus par une synthèse des projets par son Directeur. Le Comité a ensuite visité les locaux de l unité et dialogué avec les ITA et les étudiants puis les chercheurs. A la fin de la journée, il a discuté à huis clos pendant près d une heure, puis s est entretenu avec le Directeur de l unité. A la suite, la Présidente a présenté les conclusions du Comité aux membres de l unité. Au total, échanges directs, approfondis, nourris des éclairages complémentaires apportés par les différents membres du Comité. Des appréciations très semblables quant à l évaluation et aux recommandations par les divers membres du Comité. Une qualité de discussion très largement due à la coopération de l équipe et tout particulièrement de son Directeur. Très bonne qualité des documents fournis, des exposés oraux et de l organisation de la journée. 4

6 3 Analyse globale de l unité, de son évolution et de son positionnement local, régional et européen Cette unité de recherche a été créée il y a moins de trois ans au CHU Mondor à Créteil. Son installation au sein de l hôpital Armand Trousseau était à peine achevée lors de la présente visite. L activité de recherche du laboratoire porte sur trois grands thèmes : 1- La pathologie moléculaire des retards de croissance 2- Les dyskinésies ciliaires primitives et maladies apparentées, 3- Les fièvres récurrentes héréditaires et les maladies autoinflammatoires. La démarche expérimentale dans chacun de ces thèmes est voisine. Elle repose sur l établissement de très larges collections de patients (les plus grandes cohortes européennes, voire mondiales) constituées grâce à un travail très organisé et soutenu auprès des cliniciens spécialistes des pathologies sus-mentionnées, dans le but d identifier les gènes impliqués. Après l identification d un gène causal, un déchiffrage de la physiopathologie moléculaire de la maladie est entrepris. Ainsi, cette unité a identifié quatre des six gènes aujourd hui connus comme responsables de dyskinésies ciliaires primitives, un des cinq pour ceux des fièvres récurrentes et quatre des dix gènes impliqués dans les retards de croissance en rapport avec des anomalies situées en amont du récepteur de la GH. Doit être soulignée la découverte d un gène modificateur majeur qui module la survenue d une amylose rénale chez les patients présentant une fièvre méditerranéenne familiale. Le diagnostic moléculaire aussitôt développé constitue même un élément essentiel du diagnostic de la maladie elle-même dans certains cas, celui des fièvres récurrentes par exemple. Au-delà de l identification de ces gènes, une étude des mécanismes moléculaires à l origine des évènements mutationnels observés et de la signification fonctionnelle des mutations décelées est systématiquement entreprise chaque fois que les résultats obtenus le demandent. Les approches mises en œuvre pour élucider la physiopathologie moléculaire des atteintes correspondantes font pour l essentiel appel à la biologie cellulaire. Y sont couplées, selon l activité présumée de la protéine défectueuse, analyse transcriptionnelle, étude des protéines axonémales mettant à profit le trypanosome (organisme modèle adapté à la mise en œuvre de tests fonctionnels rapides), et étude des voies de transduction. Dans cette phase aussi, les travaux sont bien menés, l ensemble des techniques requises bien maîtrisées. L innovation technologique a sa place dans les réalisations présentées, ainsi, l étude microscopique développée pour analyser le battement ciliaire à partir de l épithélium nasal de patients. Les thématiques développées par le laboratoire sont en totale adéquation avec son implantation dans l hôpital Armand Trousseau composé de services de spécialités pédiatriques et d une maternité dédiée aux grossesses à haut risque. L apport de ce laboratoire au site de Trousseau est indéniable. Les résultats de la recherche sont efficacement transférés aux services hospitaliers concernés. Pour chacune des trois pathologies étudiées, les mutations qui ont été identifiées rendent compte de moins de 20% des atteintes. En conséquence, la poursuite de la recherche des gènes impliqués que projette ce laboratoire est pleinement justifiée. Les démarches expérimentales proposées pour parvenir à identifier les gènes encore inconnus, en l absence de familles atteintes de taille suffisante pour permettre une analyse de liaison génétique, sont tout à fait pertinentes. Ces projets s inscrivent dans la continuité de ceux menés jusque là avec un renouvellement des approches technologiques et scientifiques. Ainsi, le projet du laboratoire a-t-il pour objectif dans le futur d étudier tout d abord les bases moléculaires des fonctions normales affectées dans les diverses maladies considérées, fondées sur les données obtenues, de tester l implication des cibles géniques potentielles ainsi définies. Les résultats du laboratoire font l objet de publications dans des journaux internationaux généralistes de très bonne qualité, Proc Natl Acad Sci USA, J Clin Invest, Plos Genetics, et dans les meilleurs journaux de la spécialité, Am J Human Genet, J Clin Endocrinol & Metab. Plus encore, c est la dynamique de publication qui a attiré l attention du Comité, une qualité de publications en nette croissance au cours des trois dernières années. Le laboratoire a obtenu de nombreuses subventions sur contrats (ANR, contrat européen, ). Le responsable ainsi que d autres membres du laboratoire assurent des tâches d enseignement au sein des cursus des études médicales. Parmi ses autres atouts, cette équipe, parce qu elle est particulièrement soudée, peut à tout moment être réactive à une difficulté, une question ou une compétition inattendue. 5

7 4 Analyse de la vie de l'unité En complément des informations sus-mentionnées, le Directeur a développé une vision stratégique de son activité biomédicale au sein du site Trousseau. Il démontre une aptitude à valoriser au mieux les compétences de ses collaborateurs dans la réalisation des projets de l unité (voir ci-dessous les points forts). 5 Conclusions Points forts : Excellente cohérence des thématiques avec le site d implantation du laboratoire. Cohérence aussi de formation des membres de l équipe, à dominante médicale ou apparentée. Excellente maîtrise de la génétique humaine. Ténacité et approfondissement de l analyse quel que soit le domaine sur lequel elle porte. Très bonne dynamique de publication. Bonne visibilité et reconnaissance internationale. Equipe soudée et bien dirigée. L avis du comité d évaluation est très favorable. Points à améliorer : Aucun Recommandations : Compte tenu des compétences de l unité, dès à présent, elle est l objet de nombreuses sollicitations en provenance de divers services hospitaliers du site. Le Comité recommande au laboratoire de veiller à ne pas céder à la tentation de la dispersion de ses activités de recherche. Prenant conscience de la petite taille du site scientifique de Trousseau, le Comité invite par avance le laboratoire à être particulièrement vigilant à l effort supplémentaire que seront amenés à faire ses membres pour suivre au mieux les avancées scientifiques, y compris hors de leur propre champ thématique. En conséquence, il recommande à l attention des responsables du site de Trousseau qu un effort tout particulier soit fait en ce qui concerne l établissement et l entretien du réseau informatique. Il juge souhaitable d envisager rapidement l implantation d une autre équipe de recherche sur le site de Trousseau. 6