TUTORAT UE Génome Séance n 10 Semaine du 29/11/2010

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1 FACULTE de PHARMACIE TUTORAT UE Génome Séance n 10 Semaine du 29/11/2010 Structure dynamique et diversité du génome Lésions et remaniement du génome - Epigénétique E. Badia, S. Lumbroso, S. Galas Séance préparée par Oli Rakotonirina, Benoît Trinh Van Dam, Sofiène Hadidane (TNM) QCM n 1 : Concernant les différents types de recombinaisons, quelle(s) est (sont) la (les) a) La recombinaison méiotique se réalise entre deux chromatides sœurs b) La recombinaison méiotique est initiée par la présence de dimère de thymine c) Dans le mecanisme de la recombinaisonn homologue, le site du second point de cassure (sur la structure de Hollyday) détermine le caractère recombinant ou non de l ADN. d) Lorsque la seconde cassure se fait sur les mêmes brins que la première, l ADN est non recombinant e) Les segments de gènes «D» participent à la formation des chaînes légères des anticorps. QCM n 2 : Concernant les différents types de recombinaisons, quelle(s) est (sont) la (les) a) Les crossing-over participent à la diversité des anticorps. b) L inversion est la plus fréquente des macrolésions. c) La fusion de gène est une microlésion peu fréquente. d) Deux brins d ADN d une même chromatide, issus de parents différents forment un ADN recombinant. e) La recombinaison somatique s effectue dans toutes les cellules de l organisme. QCM n 3: Les microlésions : quelle(s) est (sont) la (les) a) Le duplex d ADN 2 présente une mutation par transition par rapport au duplex 1. Duplex 1 Duplex 2 5 TCGGTTCGAAC 5 TCGGGTCGAAC 3 AGCCAAGCTTG 3 AGCCCAGCTTG b) Une mutation faux-sens a toujours un effet important sur la protéine. c) Une mutation silencieuse conduit à un changement d acide aminé sur la protéine. d) Une hyperméthylation d un gène suppresseur de tumeur entraine une hyperexpression de ce dernier. e) Les mutations faux-sens et non-sens sont les plus fréquentes au niveau des régions codantes Tutorat UE1 Séance n 10 Génome 1 / 5

2 QCM n 4 : Soit une molécule d'adn Y codant pour la protéine X ci-dessous. La molécule d'adn Y fait l'objet d'une mutation non-sens. Après transcription et traduction à quoi peut correspondre la protéine néoformé? Protéine X : N-term C-term a) b) c) d) e) f) Aucune des protéines proposées. QCM n 5 : Les microlésions : quelle(s) est (sont) la (ou les) a) Une mutation faux-sens à l origine d un remplacement de tryptophane par de l arginine peut conduire à une protéine mutée non fonctionnelle. b) La délétion d un nucléotide peut conduire à l apparition prématurée d un codon stop. c) Une mutation de régions régulatrices de 3 NC peut altérer la traduction. d) Une mutation en 5 NC peut conduire à une inhibition de la trancription. e) L augmentation du nombre de triplets CAG répétés dans la région codante d un gène peut être à l origine de la chorée de Hungtington. QCM n 6: Le génome mitochondrial : quelle(s) est (sont) la (les) a) La mitochondrie est un lieu de synthèse d ATP. b) Le mécanisme d endosymbiose pour la mitochondrie résulte de l intégration d une cellule eucaryote dans une cellule procaryote. c) De nombreux gènes appartenant au génome nucléaire ont été transférés à la mitochondrie. d) Dans la mitochondrie, il n existe qu une seule copie de l ADN comme c est le cas pour le génome nucléaire. e) Le taux de mutation de l ADNmt est 2 fois moins élevé que celui du génome nucléaire. QCM n 7: Organisation du génome mitochondrial. quelle(s) est (sont) la (les) a) L ADN mitochondrial circulaire possède un brin lourd (H) riche en bases puriques ainsi qu un brin léger (L) riche en bases pyrimidiques. b) Avant maturation, la transcription du brin lourd génère 2 ARN et celle du brin léger génère un seul ARN. c) Le cytochrome b ou l ATPase font partie des polypeptides codés par le génome mitochondrial. d) Les ARNm mitochondriaux sont généralement monocistroniques. e) La présence de protéines histones rend le génome mitochondrial très compact Tutorat UE1 Séance n 10 Génome 2 / 5

3 QCM n 8 : Le génome nucléaire : quelle(s) est (sont) la (les) a) Le génome nucléaire possède un jeu diploïde de 6 milliards de paires de bases. b) Il existe 24 chromosomes : 22 chromosomes non sexuels nommés gonosomes et 2 chromosomes sexuels nommés autosomes. c) Les centromères contiennent des séquences alpha satellites. d) Le génome nucléaire possède généralement un jeu diploïde (2n) de chromosomes formé de 2 exemplaires de chaque autosome et de 2 chromosomes sexuels. e) Historiquement, les autosomes nucléaires ont été classés par leur taille apparente. QCM n 9 : A propos de la structure du génome humain, quelle(s) est (sont) la (les) a) L ADN codant représente 1,5 % du génome. b) L ADN codant peut être extragénique c) L ADN génique représente 30% du génome et comprend entre autres les introns et les séquences régulatrices d) Au cours du temps, les copies surnuméraires d un gène accumulent moins rapidement des mutations que la copie fonctionnelle. e) Les pseudogènes sont des copies fonctionnelles et homologues d un gène connu f) Toutes les réponses précédentes sont fausses. QCM n 10 : L ADN répétitif en tandem, quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) a) Il est généralement dérivé d éléments transposables du génome b) Le nombre de copies peut varier au cours de certains évènements méiotiques. c) Les séquences microsatellites sont des répétitions de 1 à 13 bases localisées au niveau des télomères d) Les séquences alpha-satellite des centromères jouent un rôle dans la ségrégation des chromosomes e) Les minisatellites hypervariables sont des séquences de 13 à 65pb répétées en tandem QCM n 11: Les éléments transposables du génome, quelle(s) est (sont) la (les) a) L ADN répétitif dérivé d éléments transposables représente environ 45% du génome b) Les éléments transposables de classe II nécessitent l intervention d une rétrotranscriptase c) Les éléments HERV possèdent des séquences LTR et représentent 8% des éléments transposables d) La séquence Alu se transposerait grâce à la rétrotranscriptase codée par LINE-1 e) La structure des HERV implique parfois des gènes de type gag, pol ou env. QCM n 12 : Allèles et polymorphismes, quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) a) Un polymorphisme est une mutation pathogène d un gène, de fréquence dans la population supérieure à 1% b) Un polymorphisme de répétition est obligatoirement biallélique c) Un SNP peut donner lieu à un RFLP d) La méthode de la génétique inverse se sert des recombinaisons mitotiques pour trouver un gène lié à une maladie en partant de son symptôme e) C est le gène CFTR du locus morbide qui est en cause dans la mucoviscidose Tutorat UE1 Séance n 10 Génome 3 / 5

4 QCM n 13 : A propos des modifications épigénétiques, quelle(s) est (sont) la (les) a) Une modification épigénétique est transmissible selon les lois de Mendel. b) Les étiquettes épigénétiques permettent de moduler l expression des gènes. c) L épigénome permet la différenciation de toutes les cellules d un organisme. d) Le syndrôme de Beckwith-Wiedemann est associé à une anomalie du profil épigénétique d un gène soumis à empreinte. e) Le profil épigénétique ne peut pas renseigner sur le pronostic ou l évolution d un cancer. QCM n 14 : A propos des modifications épigénétiques, quelle(s) est (sont) la (les) a) Les îlots CpG sont des séquences d ADN enrichies en CpG de taille supérieure à 1000 bases. b) Près de la moitié des gènes possèdent des îlots CpG localisés majoritairement en 3. c) La méthylation de l ADN est non-enzymatique. d) La DNMT1 est une enzyme responsable du maintient des profils de méthylation après chaque divisions. e) La méthylation des îlots CpG au niveau du promoteur d un gène favorise sa transcription. QCM n 15: A propos des modifications épigénétiques, quelle(s) est (sont) la (les) a) Une modification épigénétique peut modifier une séquence d ADN. b) Les protéines MeCP inhibent la traduction grâce à leur affinité pour l ADN méthylé. c) Certaines DNMT peuvent méthyler de novo une séquence satellite. d) Dans une cellule-fille, une mutation de novo est une mutation héritée de la cellule-mère. e) La chromatine est composée uniquement de nucléotides. QCM n 16 : A propos des modifications épigénétiques, quelle(s) est (sont) la (les) a) Les étiquettes épigénétiques s appliquent sur les extrémités C-ter des histones. b) L acétylation des Lysines inhibe l expression des gènes. c) La phosphorylation des histones joue un rôle dans la ségrégation de la chromatine durant la mitose. d) Un même résidu d une histone ne peut subir qu un seul type de modification. e) Un résidu basique d une histone peut être méthylé plusieurs fois. QCM n 17 : A propos des modifications épigénétiques, quelle(s) est (sont) la (les) a) La protéine HP1 a une haute affinité pour les histones acétylées. b) La méthylation de l ADN peut entraîner une désacétylation des histones par l intermédiaire du complexe MeCP-HDAC. c) La citrulline est un intermédiaire retrouvé dans la désacétylation des histones. d) Le nucléosome est composé d ADN et de protéines (2xH2A, 2xH2B, 2xH3, 2xH4). e) La disposition en «hélice alpha» des extrémités N-ter des histones permet leur compaction. f) Toutes les réponses précédentes sont fausses Tutorat UE1 Séance n 10 Génome 4 / 5

5 QCM n 18 : Soit la mutation c T>A, quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) a) Cette mutation est une insertion b) Cette mutation n'aura aucune répercussion sur la protéine codée c) Ce type de mutation est rare d) Cette mutation entraînera un décalage du cadre de lecture (frameshift) e) Il s agit d une substitution dans un intron d un nucléotide T par un nucléotide A QCM n 19: A propos des mutations génétiques, quelle(s) est (sont) la (les) proposition(s) a) Une mutation en mosaïque, somatique et précoce entre en jeu dans la maladie de McCune Albright. b) Une mutation dite germinale ou constitutionnelle est retrouvée dans toutes les cellules de l'organisme. c) Les mutations faux sens et non sens sont les plus fréquentes. d) Une seule mutation du gène CFTR est responsable de la mucoviscidose. e) Un seul gène peut être responsable de plusieurs maladies Tutorat UE1 Séance n 10 Génome 5 / 5