Bioscope Corse-Méditerranée

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1 Bioscope Corse-Méditerranée " L Observatoire du vivant en Méditerranée " A. Falchi-Thibault, C. Arena, F. Casabianca, T. Blanchon, L. Varesi J.P. Amoros. INSERM Unité Université de Corse - INRA " Épidémiologie, Systèmes d Information, Modélisation "

2 BIOSCOPE Corse-Méditerranée Programme financé par l Agence Nationale de la Recherche et un Contrat Plan Etat Région Programmes développés entre le réseau Sentinelles de l UMR 707 et l Université de Corse 13/06/2011 2

3 Historique * : Étude Anthropologique «Provinces françaises», Inserm (marqueurs HLA). Thalassémies. * : Réseau en recherche Clinique Inserm: Étude Epidémiogénétique de la population insulaire corse; Prédispositions aux pathologies. Génétique population saine, Polyarthrite rhumatoïde, DID I, Thalassémies. * 2001: Comité de Coordination de la Recherche médicale et en santé de Corse : Inserm, Université de Corse, Hôpitaux. * 2003: Programme adopté par le Comité 2003: Génétique-Santé publique-environnement en milieu insulaire méditerranéen. * Juillet 2005: Convention: CTC-UdC-Inserm + Contrat état Région et financement Projet BioScope Corse-Méditerranée: santé humaine et interactions avec le monde animal et le domaine végétal. A. FLAHAULT, J.P. AMOROS * Janvier 06: Projet déposé puis validé et financé par l Agence nationale pour la Recherche. * Décembre 2006: INVS participe au financement du réseau insulaire.

4 Bioscope Corse-Méditerranée " L Observatoire du vivant en Méditerranée " L observation du vivant : Le réseau sentinelles * Constituer un observatoire utile à la veille sanitaire et l alerte épidémiologique précoce. * Développer un lien structurel entre l approche sentinelle dans le domaine médical et le domaine vétérinaire. Maladies liées à l environnement * Pathologies d origine infectieuse ou parasitaire : Maladies infectieuses classiques et/ou saisonnières Maladies émergentes ou ré-émergentes * Pathologies multifactorielles : Maladies liées à HLA, Maladies cardiovasculaires.

5 La corse terrain idéal pour ces travaux: Le contexte géographique insulaire corse: Population plus stable et plus homogène, Population médicale restreinte, Environnement animal et végétal, plus homogène et mieux circonscrit, Position unique en Méditerranée, zone de pénétration des vecteurs infectieux du sud vers le nord, Zones humides,

6 Le réseau Sentinelles Une plateforme de recherche en médecine générale UMR S 707 Inserm / Université Pierre et Marie Curie

7 Présentation Le réseau Sentinelles (RS) a été créé en 1984 par le Pr. Alain- Jacques Valleron. Intégré dans l unité mixte de recherche en santé Inserm / UPMC 707, équipe Epidémiologie des Maladies Infectieuses et Modélisation. Directeur d unité et de l équipe RS : Pr Guy Thomas. Responsables du RS : Pr Thomas Hanslik et Dr Thierry Blanchon. Permet aux médecins généralistes libéraux (MGL) de s impliquer dans la recherche épidémiologique. ~1300 MGL inscrits au RS (~2% des MGL français).

8 Répartition géographique des médecins Sentinelles

9 Les axes de travail Le RS développe 4 axes de travail: 1) La surveillance continue. 2) Détection, prévision, modélisation. 3) Système d information. 4) Etudes ponctuelles.

10 La surveillance continue ~400 médecins Sentinelles (MS) participant à la surveillance chaque année. Transmission via internet des données issues des consultations.

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12 La surveillance continue (2) 400 médecins Sentinelles (MS) participant à la surveillance en Transmission via internet des données issues des consultations. 10 indicateurs surveillés : syndromes grippaux, diarrhée aiguë, varicelle, oreillons, zona, urétrite masculine, maladie de Lyme, hospitalisation, tentative de suicide et crise d asthme. Retours d information : Page d accueil du site internet public et bulletin hebdomadaire ; Bilan annuel ; Base de données en ligne et libre d accès.

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14 La surveillance continue (3) 400 médecins Sentinelles (MS) participant à la surveillance en Transmission via internet des données issues des consultations. 10 indicateurs surveillés : grippe clinique, diarrhée aiguë, varicelle, oreillons, zona, urétrite masculine, maladie de Lyme, hospitalisation, tentative de suicide et crise d asthme. Retours d information : Page d accueil du site internet public et bulletin hebdomadaire ; Bilan annuel ; Base de données en ligne et libre d accès. Retours personnalisés pour les médecins avec possibilité de comparaison avec les données régionales et nationales. Publications scientifiques : Méthode de surveillance. Données issues de la surveillance.

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16 Détection, prévisions, modélisation Détection des épidémies de grippe et de gastroentérite, à partir de la surveillance des 2 indicateurs cliniques : les SG et la DA Calcul de taux d incidence nationaux et régionaux. Calcul d un seuil épidémique (modèle de régression périodique appliqué aux données historiques).

17 Détection, prévisions, modélisation (2) Prévisions à 3 semaines pour la grippe et la gastroentérite: Méthode des analogies appliquée aux données historiques. Prévision de la grippe à partir des ventes de médicaments (données IMS-Health France).

18 Détection, prévisions, modélisation (3) Estimation de l efficacité du vaccin anti-grippal à partir de la méthode administrative (screening method) qui nécessite : Un échantillon de cas (déclaration des MS). Un échantillon issu de la population générale (ex: sondage TNS/SOFRES).

19 Détection, prévisions, modélisation (4) Travaux récents : Estimation de la part attribuable aux virus grippaux parmi les cas de SG. Développement d un site internet mettant à disposition librement un outil d analyse permettant de détecter des épidémies dans des séries d observations. Surveillance de la grippe, la diarrhée et la varicelle à partir des requêtes sur le moteur de recherche google. Prévisions de la diarrhée aiguë à partir des ventes de médicaments (données IMS-Health).

20 Détection, prévisions, modélisation (5) Travaux en cours: Seuils épidémiques régionaux. Impact des choix des paramètres du modèle permettant de déterminer les seuils épidémiques. Caractérisation des épidémies saisonnières et de la pandémie 2009.

21 Etudes ponctuelles 4-5 études par an, observationnelles et expérimentales. Exemples d études réalisées : Déterminants de la prescription des psychotropes. Evaluation en Ile-de-France de l incidence de la coqueluche. Prise en charge de la syphilis. Virus respiratoires chez les patients présentant un SG. Facteurs de risque des DA virales chez les adultes (DAVIA). Exemples d essais cliniques : Flurec : récurrence des infections grippales. Gripmask : masque et prévention de la transmission de la grippe. Bivir : bi-thérapie antivirale et traitement de la grippe. Retour d information : Rapports d étude, mis en ligne sur le site internet du RS. Communications dans des congrès internationaux. Publications dans des revues scientifiques à comité de lecture. Thèses de médecine et de sciences.

22 Système d information Le système d information permet : Le recueil et la validation des données transmises par les MS. Le traitement et la redistribution en temps réel des données. La gestion du réseau et des sites internet. Développé afin de le rendre modulable, évolutif et exportable. Travaux en cours : Développement d un outil de recueil s intégrant à la pratique quotidienne des médecins. Intégration d un système qualité (norme ISO 9001 et bonnes pratiques de développement informatique).

23 Les antennes inter-régionales du RS Depuis 2005, 4 antennes ont été mises en place : Franche-Comté. Auvergne/Rhône-Alpes. Centre. Languedoc-Roussillon/Paca/Corse : antenne «Méditerranée». Objectifs des antennes : Augmenter la précision des données régionales et départementales (renforcement du maillage des MS). Développement de programmes de recherche et de veille régionaux. Surveillance et mode de recueil identiques qu au niveau national.

24 Antenne Méditerranée Responsable : Pr-Ass Amoros Jean-Pierre (Centre hospitalier d Ajaccio, Université de Corse). Animateur : Arena Christophe (Inserm-UPMC). Laboratoire de virologie : Pr Varesi laurent (Université de Corse) et Dr Falchi Alessandra (Inserm-UPMC). Antenne régionale Corse dès fin 2005 : Développée dans le cadre du projet «BioSCOPE : observatoire du vivant centré sur la Corse, avec une vocation méditerranéenne». Contexte géographique et académique favorable. Appui sur les structures locales (Urml, Urcam, Cire, Ors, DSS). Extension aux régions Paca et Languedoc-Roussillon en juin 2008.

25 Efficacité des antennes Renforcement de la surveillance continue : 3 MS en Corse en 2005, 45 en 2011 (15% des MGL Corses VS 2% national). Programmes régionaux de recherche et veille : Surveillance virologique des virus de la grippe en Corse. Etudes ponctuelles menées en Corse uniquement : Prévalence du «Burn-out» en médecine générale (2006). Santé bucco-dentaire des enfants scolarisés en Corse (2006). Diffusion spatiale de la varicelle (2007/2008). Réelle dynamique académique : A. Falchi : Post-doc 2009/2010 et 2011/2012 (financement ADEC). C. Arena : Doctorat 2010/2012 (financement ADEC).

26 Laboratoire de Virologie Opérationnel depuis 2006 Laboratoire de l Université de Corse - P2 Partenaire privilégié: réseau Sentinelles Inserm UMR S -707 Dir. Pr Guy THOMAS Alessandra FALCHI-THIBAULT: Ingénieur de recherche réseau Sentinelles Inserm falchi@u707.jussieu.fr

27 Virus Influenzae Programme de recherche Analyse moléculaire des virus influenzae A et B isolés chez : des patients présentant des syndromes grippaux prélèvements nasopharyngés effectués par les MG du réseau Sentinelles pendant les périodes épidémiques des réservoirs animaux (porcs et sangliers) prélèvements nasopharyngés effectués par l INRA de Corte

28 Virus Influenzae - Bilan des projets (1) Etude des virus influenzae circulant en Corse chez l Homme En collaboration avec l unité de Virologie Médicale de Reims (Pr. Laurent Andreoletti) et le CNR virus influenzae région sud (Pr. Bruno Lina) Falchi et al., 2008 J Clin Vir Etude des co-infections grippales chez un même individu En collaboration avec l unité de Virologie Médicale de Reims (Pr. Laurent Andreoletti) Falchi et al., 2009 J Clin Vir

29 Virus Influenzae - Bilan des projets (2) Virus responsables des syndromes grippaux en période hivernale : détection de 18 virus respiratoires (Sentivir) En partenariat avec l InVS Falchi et al., 2011 J Med Virology Circulation du virus influenzae pandémique A(H1N1)2009 Avec l aide de la CTC Falchi et al., 2011 PLoS ONE

30 Virus Entériques Etude DAVIA: Facteurs de risques de survenue des diarrhées aigues virales (calicivirus humains, rotavirus, astrovirus ou adenovirus) chez les sujets adultes non institutionnalisés et vus en médecine générale En collaboration avec l InVS le Centre National de Référence des Virus Entériques (Dr Katia Balay)

31 Perspectives Virus respiratoires dynamiques spatio-temporelles des épidémies dues à plusieurs virus respiratoires (Influenzae virus; Métapneumovirus; VRS) Virus entériques et respiratoires co-infections virus Influenzae et virus entériques chez des patients présentant un syndrome grippal et/ou une diarrhée aigue