Resaolab. PhC Christophe Peyrefitte, PharmD, PhD Unité de virologie, Institut de recherche biomédicale des armées
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- Marc-Antoine Larochelle
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1 Resaolab Le virus Ebola PhC Christophe Peyrefitte, PharmD, PhD Unité de virologie, Institut de recherche biomédicale des armées Emprunts Pr Pialoux,Pr Leloup, Pr Lassel, Pr Tatevin, CDC, MSF, Pr Rapp Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 1
2 Objectifs Connaître la structure du virus Ebola Connaître la Pathogenèse Reconnaître un cas suspect et possible Connaître les différents prélèvements Connaître le diagnostic de certitude Connaître l acheminement en triple emballage Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 2
3 Filoviridae ou Filovirus Beaucoup d inconnues pour le virus Ebola Pathogenèse peu connue Réservoir encore hypothétique Distribution mondiale Endémicité en Afrique Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 3
4 Classification des Filovirus Ordre : Mononegavirales :Filoviridae, Paramyxoviridae,, Rhabdoviridae et Bornaviridae virus enveloppé, ARN non segmenté de polarité négative Famille : Filoviridae : Virus filiforme Genre Cuevavirus (Lloviu virus) Genre Marburgvirus (Marburg et Ravn virus) Genre Ebolavirus Espèces : Zaïre-ebolavirus Soudan-ebolavirus Taï Forest-ebolavirus Bundibugyo Reston-ebolavirus (maladies chez le primate non humain) Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 4
5 STRUCTURE VIRALE DES FILOVIRUS ssarn- (antisens) 19 kda Filaments L : nm D : 80 nm Enveloppe lipidique spicules glycoprotéine (GP) EBO 3 NP GP L 5 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 5
6 Organisation et structure du virus Ebola EBO-Z 3 NP VP35 VP40 GP VP30 VP24 L 18,959nt 5 Leader sgp Trailer : Nucleoproteine : Polymerase L : VP30 : VP35 Protéines de nucléocapside : Glycoprotéine de surface 8A editing : VP40 : VP24 Protéines de matrice sgp : protéine non structurale 7A pas d editing Organisation structurale du virion Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 6 O Reynard
7 Cycle cellulaire Septembre 2014 Christophe Peyrefitte Asuka Nanbo, N 7 et al Scientific reportt, 2013
8 Pathogenèse du virus Ebola DCs MPs Médiateurs solubles proinflammatoires Echec du déclenchement 1 d une réponse immune efficace Réorganisation du cytosquelette d actine Modifications de la perméabilité vasculaire Saignements Pression sanguine faible Défaillance multi-organies Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 8 8
9 Pathogenèse du virus Ebola Apoptose Ly NK 3 4 Virémie Nécrose hépatique DCs MPs Médiateurs solubles proinflammatoires Echec du déclenchement 1 d une réponse immune TF 2 efficace Réorganisation du cytosquelette d actine Troubles de la coagulation CIVD Modifications de la perméabilité vasculaire Saignements Pression sanguine faible Défaillance multi-organies Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 9 9
10 Anomalies biologiques Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 10
11 Cas suspect = Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 11
12 Cas possible = Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 12
13 Que faut-il faire? Isoler le patient dans une pièce seule Lui mettre un masque chirurgical Fermer la porte Mettre une affiche sur la porte S équiper EPI Gants, masques, lunettes, FPP2, blouse et surblouses Liste de tous les contacts Préparer son matériel de prélèvement Identifier les tubes Compléter la fiche de prélèvement Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 13
14 Type d échantillons Sang Diagnostic des VFH Total, plasma ou sérum Urine Sli Salive (E Swab) Biopsie peau, rein, foie, poumons paraformaldéhyde à 10% Transport à +4 C,ou ambiante (Pas de congélation) dans les boîtes de transport UN 3373 ou UN 2814 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 14
15 Prélèvements Triple emballage aux normes de la classe 6. 2 de l ONU ou 3373 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 15 15
16 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte 16 N 16
17 Adresse de l expéditeur et du destinataire Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 17
18 Pictogramme de danger biologique Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 18
19 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 19
20 Diagnostic de certitude des VFH Identification directe du virus Amplification génique (RT PCR, qrt PCR, LamPCR) ½ jour Antigène capture 1 jour Pas utilisé au laboratoire Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 20
21 Diagnostic de certitude des VFH Séquençage 3 jours Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 21
22 Diagnostic de certitude des VFH Isolement en culture cellulaire nécessite un P4 10 jours Immunofluorescence indirecte (IFI) oupcr Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 22
23 Diagnostic de certitude des VFH Identification indirecte Sérologie IgM, IgG 1 jour N est jamais une confirmation Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 23
24 Envoi des prélèvements suspicion de FHV - avant tout prélèvement et toute expédition téléphoner au Laboratoire de Donka ou EMLab Adresse Pr Magasse, Laboratoire de virologie, Hôpital de Donka tel : - prévenir du cas suspect et de l envoi d échantillons - organiser le transport - ti triple emballage, transporteurt agréé, - fiche de renseignement clinique Septembre 2014 Christophe Peyrefitte 24 N 24
25 MERCI Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 25
26 Anticiper, se préparer Locaux adaptés 15/41, personnels formés 24/41, protocoles 35/41. Rédaction de protocoles. Veille et cellule l de crise (communication). Formation et entraînement des équipes adaptés au niveau de prise en charge Training health care workers to face highly infectious diseases B. Bannister, A. Prygodzicz, G. Ippolito For the ETIDE Working Group, CMI Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 26
27 Intérêt des centres référents Moyens - spécialistes en maladies infectieuses - circuit dédiée, chambres individuelles avec sas - Equipe soignante dédiée - laboratoire LSB3 minimum (équipements de sécurité), USIC, - stock médicaments dont ribavirine -protocoles écrits, équipes entrainées. Mise en oeuvre - accueil de rapatriement sanitaire - conseil aux hôpitaux régionaux si nécessaire - mise en œuvre graduelle des mesures d isolement en fonction du niveau de risque de transmissibilité (probabilité diagnostique et tableau clinique) Andriamanantena D, Rapp C. Parcours de soins des FHV africaines importées. Med Mal infect 2011 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte 27 N 27
28 Réseau de laboratoires COPIL : DGSSA et DGS Conseil scientique du réseau ( DGS+ SSA) Un réseau de réseaux de laboratoires pluridisciplinarité / fonctionnalités complémentaires compétences biomédicales environnementales vétérinaires Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 28
29 Réseau de laboratoires Niveau 1 = les laboratoires sentinelles Capacité de gérer et acheminer les prélèvements suspects vers les laboratoires de niveau 2 Niveau 2 = lb laboratoires ti de zone et laboratoires lb ti experts associés Le dispositif opérationnel de réponse précoce à une alerte Laboratoire P3 référent santé humaine :CHU zone de défense et de sécurité Laboratoire référent environnement et chimique toxique :laboratoire du réseau eau Laboratoire HIA et Institut de Recherche Biomédicale des Armées Laboratoire ANSES Laboratoire associés = réseau des laboratoires PN et IRCGN Niveau 3 = lb laboratoires ti de référence, de confirmation Centres nationaux de référence Laboratoires de l Institut Pasteur Laboratoires Institut de Recherche Biomédicale des Armées Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 29
30 Réseau de laboratoires Prélèvement (EPI, Laboratoire de niveau 1) Emballage échantillons : triple Transport +4 C Laboratoire P3 de niveau 2 Centre National Référence Laboratoire de niveau 3 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 30
31 Une vision plus large Intérêt d une procédure standardisée de prise en charge des patients suspects d infection à risque épidémique et biologique par les services d urgence et les SMUR. Intérêt d un réseau de prise en charge globale, d une coordination des urgences infectieuses et du risque épidémique et biologique : Ex : réseau CO REB en Ile de France Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N Leport C et al. Presse Med 2011
32 Septembre 2014 Christophe Peyrefitte N 32 Procédure COREB
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