Stratégie et perspectives en conservation ex situ en France méditerranéenne continentale

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1 Stratégie et perspectives en conservation ex situ en France méditerranéenne continentale Conservatoire botanique national méditerranéen de Lara DIXON Sylvia LOCHON-MENSEAU Colloque OPTIMA 8 juin 2016

2 Les missions du CBNMed C.Torellii Connaissance de la flore Gestion de données C.Torellii B. Huynh-Tan B. Huynh-Tan Information Porté à connaissance avec SILENE J.Molina S.Lochon-Menseau M.Virevaire R.Rolland Expertises. Conservation in situ et ex situ

3 Territoire d agrément

4 Objectifs : La conservation Conservatoire botanique national méditerranéen Permettre la conservation des espèces menacées Eviter les disparitions Aider au déploiement des politiques environnementales Conservation in situ et Conservation ex situ Conservation ex situ L.DIXON

5 La conservation ex situ Conservation en dehors des stations naturelles Objectifs Ultime sauvegarde en cas de disparition à l état sauvage Disposer d un stock pour mesure d urgence Disposer d un matériel pour expérimentation Méthodes Banque de semences Collections vivantes L.DIXON Problèmes Viabilité des semences dans le temps Diversité génétique stockée Potentiel évolutif Coût humain et matériel

6 Stratégie de récolte au CBNMed

7 Critères de sélection des espèces Espèces patrimoniales : Protection nationale Protection régionale Livre rouge de la Flore menacée de France (Tome 1 et 2) Liste rouge de la flore vasculaire de PACA Espèces endémiques Priorité livre rouge national - liste rouges régionales Cotation UICN CR (en danger critique), EN (en danger) et VU (vulnérable)

8 Avant la récolte Protocole de récolte Espèces protégées Réservée au personnel du CBN Visite préliminaire de terrain Plante en fleur F.ANDRIEU

9 Protocole de récolte Sachet en papier Fiche de récolte Nom scientifique Lieu et/ou pointage GPS Date de récolte Nom du récolteur Nombre de pieds récoltés État d avancement phénologique etc Les graines doivent être récoltées mûres de préférence encore fixées sur la plante Récolte 20 % des graines présentes

10 La Conservation des Graines

11 Après la récolte De la récolte au laboratoire Acheminement rapide Tri, nettoyage Dessiccation Conditionnement Stockage B. HUYNH-TAN L. DIXON L. DIXON

12 La Banque de graines Le stockage Chambre froide Congélation Lyophilisation L.DIXON

13 La Banque de graines Chambre froide 28m 3 5 C 3 grands compacteurs coulissants Hygrométrie non contrôlée Conditionnement : Flacons en verre Tubes en plastique accessions G. LASMER

14 La Banque de graines Congélation Arrêt en 2008 Lots précieux Éco-responsable Congélateur ménager ~ 300 lots -23 C L. DIXON B. HUYNH-TAN

15 La Banque de graines Lyophilisation Ultra-dessiccation pendant 24 h Fermeture sous vide Absence d O 2 L.DIXON lots

16 La Banque de graines Pas tout nos œufs dans le même panier.. Subdivision des récoltes en sous-lots Chambre froide Lyophilisation

17 ~1 992 taxons Bilan de la Banque de graines Répartis en accessions Base de données pour la gestion Récoltes effectuées depuis Années Nombre d'accessions Nombre d'espèces Taxons inédits

18 Les Tests de Germination

19 Les tests de germination B. Huynh Tan Données de germination acquises depuis L. DIXON 4071 données de germinations depuis 2008

20 Les tests de germination Boîte de Pétri + coton + papier filtre 7 modalités de germination dans des étuves : Alternance 12h à 10 C/O 12h à 20 C/Obscurité Alternance 12h à 10 C/O 12h à 20 C/Lumière 5 C/O 10 C/O 15 C/O 20 C/O 25 C/O B. Huynh Tan Durée de 1 jour à plus d un an selon les espèces Espèces sauvages Espèces cultivées L. DIXON

21 Culture en jardin conservatoire Adapté à certaines espèces - multiplication végétative L.DIXON

22 Base de données ex situ «Banques de graines Alpes Méditerranée»

23 Contexte Différents territoires travaillent sur la conservation ex situ des plantes rares et menacées Nécessité de mutualiser les informations Partenariat multi-structures CBNA & CBNMed ( ) Vision régionale CBNA & CBNMed & CBV (2014) CBNA & CBNMed & GBH (2015) Vision transfrontalière

24 Contexte Vision biogéographique ne se limitant pas qu aux limites administratives Zone transfrontalière Programme national FEDER Germination Programmes Interrégionaux Alcotra SeminAlp puis ADM Progres Partenariat CBNA & CBNMed & CBV & GBH

25 Base de données «Banques de graines Alpes-Méditerranée» Adéquation avec la zone biogéographique concernée Accessible en ligne Gestion des banques de graines Récoltes Stockage Germination Etc

26 Base de données Base disponible en 2 langues Texte introductif Logos des partenaires et financeurs

27 Base de données Une interface disponible pour les partenaires Chacun est administrateur de sa banque & consultation possible des autres banques Une interface accessible au public Données limitées

28 Base de données Accès à 6 modules CBNMed Base commune «Alpes-Méditerranée»

29 Module «Récoltes» Liste des récoltes CBNMed Code de récolte Nom Taxref V.7 Lieu Cotation UICN Statut de protection

30 Module «Banque de graines» Liste des lots stockés CBNMed Code Nom Localisation Statuts Type de stockage

31 Module «Tests de germination» Détails d un TG : Taxon (nom, récolte ) Prétraitements Traitements Régime thermo-photopériodique Date de début et de fin Délai germinatif % de germination

32 Module «Semis» Détails d un semis : Historique de la banque de graines Nombre de semences Substrat Type d arrosage Mode de semis Localisation

33 Module «Culture» Détails d une culture : Taxon (nom, récolte ) Origine Type de multiplication Substrat Arrosage.

34 Photothèque Albums en fonction des structures Plusieurs sous-albums Identification possible

35 Photothèque Possibilité de faire de nombreux sous-albums Exemple de la photothèque du CBNMed 4 sous-albums

36 Photothèque Album «Loupe trinoculaire» Loupe trinoculaire + caméra reliée à un ordinateur

37 Photothèque Album «Plantules»

38 Photothèque Album «Scans de graines» Papier millimétré Bandes colorimétriques Vue d ensemble de 10 graines Zoom sur 1 graine

39 Perspectives Base évolutive Au départ 2 banques de graines, puis 3 et maintenant 4! Possibilités de rajouter de nouveaux partenaires Projets pour l avenir Faire une interface nationale pour intégrer les données des CBN demandeurs (CBN de Bailleul et CBN Sud-Atlantique)

40 Merci de votre attention Conservatoire botanique national méditerranéen de Lara DIXON Sylvia LOCHON-MENSEAU Colloque OPTIMA 8 juin 2016

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