Classification des bactéries d intérêt médical Origine écologique et pouvoir pathogène. Roland Quentin

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1 Classification des bactéries d intérêt médical Origine écologique et pouvoir pathogène Roland Quentin

2 4 Groupes principaux Morphologie Cocci Gram Bacilles Gram Cocci Cocci Bacilles Bacilles Gram (+) Gram (-) Gram (+) Gram (-)

3 Premier Groupe Les cocci à Gram positifs Croissance Aéro-anaérobie Anaérobie Catalase (-) Catalase (+) Streptocoques Pneumocoques Entérocoques Staphylocoques Peptostreptococcus

4 Streptocoques

5 Streptococcus sp.

6 streptocoques α- et β-hémolytiques

7 streptocoques α-hémolytiques Commensaux de la bouche ---> ENDOCARDITES

8 streptocoques β-hémolytiques du groupe A Streptococcus pyogenes

9 Angine à S. pyogenes

10 Toxines érythrogènes A, B et C (ou exotoxines pyrogènes streptococciques SpeA, SpeB ou SpeC) Scarlatine

11 INFECTIONS CUTANEES Erysipèle bulleux Erysipèle Impétigo Suppuration de plaie

12 Fasciite nécrosante : streptocoque du groupe A producteur de toxines

13 Fièvre puerpérale Ignaz Philipp Semmelweis ( ) Assistant professor on the maternity ward of the Vienna General Hospital

14 Les complications post-streptococciques Rhumatisme articulaire aigu Glomérulonéphrite aiguë Chorée Erythème noueux

15 Streptococcus agalactiae

16 S. agalactiae et Obstétrique Origine écologique Flore intestinale Vagin : - 5 à 25% - 13 à 45% femme enceinte

17 S. agalactiae : conséquences à l accouchement pour la femme chorioamniotite (2,9%) : S. agalactiae dans 39% à 50 %des cas endométrite du post-partum (2%) : S. agalactiae 20 à 30%

18 S. agalactiae et Obstétrique Conséquences néonatales A l ouverture de l œuf Transmission : 50 à 75% Infection néonatale dans 10% des cas (Pmsi 1999) 1999 : 3800 nouveau-nés avec problèmes majeurs Méningites septicémies infections pulmonaires

19 Streptococcus pneumoniae

20 Otites Commensal Rhinopharynx Septicémie Pneumonie Méningites

21 Enterococcus Commensal de l intestin

22 Infections urinaires Endocardites

23 Premier Groupe Les cocci à Gram positifs Croissance Aéro-anaérobie Anaérobie Catalase (-) Catalase (+) Streptocoques Pneumocoques Entérocoques Staphylocoques Peptostreptococcus

24 Staphylocoques

25 Staphylocoques

26 Commensal du nez Commensal de la peau Plaies Impétigo Furoncles et panaris

27 Chirurgie et Prothèses Septicémie Plaies chirurgicales et Cathéters Ostéomyélite Staphylococcie pleuropulmonaire

28 Les toxines Entérotoxine Toxine TSST-1 Exfoliatine

29 Premier Groupe Les cocci à Gram positifs Croissance Aéro-anaérobie Anaérobie Catalase (-) Catalase (+) Streptocoques Pneumocoques Entérocoques Staphylocoques Peptostreptococcus

30 Les cocci à Gram négatifs Anaérobies : Peptostreptococcus Infections et Chirurgie abdominale Abcés du cerveau Flore intestinale et vaginale Infections et Chirurgie gynécologique et obstétrique

31 Deuxième Groupe : les bacilles à Gram positifs

32 Les bacilles à Gram positifs Croissance Aéro- anaérobie Listeria monocytognenes - listériose Corynébactéries : -Corynebacterium diphteriae -Autres : septicémie chez le malade assisté Bacillus -Bacillus anthracis : Charbon -Bacillus cereus: intoxications alimentaire Lactobacilles : Doderlein Anaérobie Clostridium : -Clostridium perfringens : gangrène gazeuse -Clostridium botulinum : botulisme -Clostridium tetanis : tétanos

33 Listeria monocytogenes Listériose

34 Corynebacterium sp. culture

35 diphtérie

36 Bacillus sp.

37 Bacillus anthracis culture anthrax cutané

38 Flore de Doderlein

39 4 Groupes principaux Morphologie Cocci Gram Bacilles Gram Cocci Cocci Bacilles Bacilles Gram (+) Gram (-) Gram (+) Gram (-)

40 Les cocci à Gram négatifs Aérobie : Oxydase (+) Neisseria -Neisseria commensales -N. gonorrhoeae -N. meningitidis Anaérobies Veillonella Branhamella - B. catarrhalis

41 Les cocci à Gram négatifs Aérobie strict : Les Neisseria et les Branhamella Anaérobies : les Veillonella

42 Les cocci à Gram négatifs : Neisseria commensales et Branhamella catarrhalis Commensales du rhinopharynx OTITES chez l enfant

43 Neisseria meningitidis Méningococcémie : septicémie + purpura Méningite cérébrospinale LCR PL

44 Neisseria gonorrhoeae Endocervicite Urétrite Coloration de Gram Salpingite Conjonctivite Orchi-épididymite Prostatite

45 Les cocci à Gram négatifs Anaérobies : les Veillonella Infections et Chirurgie abdominale Abcés du cerveau Flore intestinale Infections et Chirurgie gynécologique et obstétrique

46 4 Groupes principaux Morphologie Cocci Gram Bacilles Gram Cocci Cocci Bacilles Bacilles Gram (+) Gram (-) Gram (+) Gram (-)

47 Les bacilles à Gram négatifs

48 Les Bacilles à Gram négatifs Aéro-anaérobies Oxydase (-): -Entérobactéries Vibrio cholerea Aérobies stricts Oxydase (+) : -Pseudomonas (pyocyanique) -Stenotrophomonas -Burkolderia -Moraxella Oxydase (-) -Acinetobacter De croissance Difficile (CO2, Facteurs) -Haemophilus +++ -Agents des zoonoses et maladies spécifiques: -Brucella -Franscisella -Pasteurella -Legionella -Helicobacter Anaérobies - Bacteroïdes - Prevotella - Fusobacterium

49 Les entérobactéries Pathologies spécifiques intestinales : -les fièvres typhoïdes -Diarrhées Intestin Pathologies Extra-intestinales : -Infections urinaires et biliaires -Infections maternofoetales et néonatales -infections compliquent la chirurgie abdominale et gynécologiques

50 Entérobactéries et Pathologies spécifiques intestinales les fièvres typhoïdes : -Salmonella typhi -Salmonella paratyphi A, B, C Diarrhées : -Shigella -Autres Salmonella -Escherichia coli entéropathogénes et entéro-invasifs

51 Entérobactéries et Pathologies Extra-intestinales : -Infections urinaires Pyélonéphrite Cystites -Escherichia coli +++ -Klebsiella, Enterobacter, Serratia -Proteus, Providencia, Morganella

52 Entérobactéries et Pathologies Extra-intestinales : -Infections maternofoetales et néonatales Nouveau-nés : septicémies et méningites néonatales Chorioamniotite Accouchée : Endométrite du post-partum et septicémies Escherichia coli

53 Vibrio cholerae selles

54 Les Bacilles à Gram négatifs Aéro-anaérobies Oxydase (-): -Entérobactéries Aérobies stricts Oxydase (+) : -Pseudomonas (pyocyanique) -Stenotrophomonas -Burkolderia -Moraxella Oxydase (-) -Acinetobacter De croissance Difficile (CO2, Facteurs) -Haemophilus +++ -Agents des zoonoses et maladies spécifiques: -Brucella -Franscisella -Pasteurella -Legionella -Helicobacter Anaérobies -Bacteroïdes - Prevotella -Fusobacterium

55 Pseudomonas aeruginosa Mucoviscidose et bronchite chronique Surinfection Des malades assistés (respirateurs, KT, Perfusions, sondages urinaires)

56 Les Bacilles à Gram négatifs Aéro-anaérobies Oxydase (-): -Entérobactéries Aérobies stricts Oxydase (+) : -Pseudomonas (pyocyanique) -Stenotrophomonas -Burkolderia -Moraxella Oxydase (-) -Acinetobacter De croissance Difficile (CO2, Facteurs) -Haemophilus +++ -Agents des zoonoses et maladies spécifiques: -Brucella -Franscisella -Pasteurella -Legionella -Helicobacter Anaérobies -Bacteroïdes - Prevotella -Fusobacterium

57 Haemophilus influenzae Otites Commensal Rhinopharynx Septicémie Pneumonie Méningites de 3 mois à 3 ans

58 Entérobactéries et Pathologies Extra-intestinales : -Infections maternofoetales et néonatales Nouveau-nés : septicémies néonatales Chorioamniotite Accouchée : Endométrite du post-partum et septicémies Haemophilus influenzae

59 Les Bacilles à Gram négatifs Aéro-anaérobies Oxydase (-): -Entérobactéries Aérobies stricts Oxydase (+) : -Pseudomonas (pyocyanique) -Stenotrophomonas -Burkolderia -Moraxella Oxydase (-) -Acinetobacter De croissance Difficile (CO2, Facteurs) -Haemophilus +++ -Agents des zoonoses et maladies spécifiques: -Brucellea -Franscisella -Pasteurella -Legionella -Helicobacter Anaérobies -Bacteroïdes - Prevotella -Fusobacterium

60 Legionella pneumophila : La légionellose Bactérie de l eau Inhalation Pneumonie Helicobacter pylori Gastrite Cancer de l estomac

61 Les Bacilles à Gram négatifs Aéro-anaérobies Oxydase (-): -Entérobactéries Aérobies stricts Oxydase (+) : -Pseudomonas (pyocyanique) -Stenotrophomonas -Burkolderia -Moraxella Oxydase (-) -Acinetobacter De croissance Difficile (CO2, Facteurs) -Haemophilus +++ -Agents des zoonoses et maladies spécifiques: -Brucellea -Franscisella -Pasteurella -Legionella -Helicobacter Anaérobies -Bacteroïdes - Prevotella -Fusobacterium

62 Les bacilles à Gram négatifs anaérobies - Bacteroïdes - Prevotella - Fusobacterium septicémie Infections et Chirurgie abdominale Flore intestinale Abcés du cerveau septicémie Infections et Chirurgie gynéco-obstétrique

63 Les bactéries non colorables par le Gram

64 1- Les Mycobactéries : Mycobacterium tuberculosis (tuberculose) 2- Les Mycoplasmes : pas de paroi a) Génitaux : Mycoplasma homini s Mycoplasma genitalium Ureaplasma urealyticum! commensaux du vagin : endocervicites, endométrites, salpingites, urétrite, infections materno-fœtales. b) Respiratoires : Mycoplasma pneumoniae - trachéobronchites trainantes - pneumophathies atypiques 3- Les Chlamydiae a) C. trachomatis : - lymphogranulomatose vénérienne - infections urétrales et utéro-annexielles b) C. pneumoniae : - trachéobronchites pneumopathies atypiques 4 - Treponema pallidum : la Syphilis 5 - Bartonella (angiomatose bacillaire, maladie des griffes du chat) 6 Tropheryma whipplei (Maladie de Whipple) 7 Richettsiae (typhus, fièvres pourprées et boutonneuses) 8 Borrelia buradorferi (Maladie de Lyme)