-Protection de l acide nucléique (physique, chimique (UV), enzymatique (nucleases) Les capsides virales sont composées de nombreuses sous-unités

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1 Virus Parasites obligatoires (dépendent d un hôte pour leur réplication) Phase extracellulaire inerte Acide nucléique (ARN ou ADN) encapsidé par protéines structurales (morphologies variables) Génomes compactés ( gènes) Mode de transmission variés Souvent pathogènes Leur taille est variable: 20 à 400 nanomètres (1 nm = 0, mm) Leur taille est en général inférieure à la taille d'une cellule (100 à 1000 fois inférieure)

2 Particule virale -Protection de l acide nucléique (physique, chimique (UV), enzymatique (nucleases) Les capsides virales sont composées de nombreuses sous-unités L extérieur de la particule est responsable de l interaction avec la cellule infectée (récepteurs) et de l initiation de l infection Les particules virales ont des formes géométriques 3 grand types de particules: hélicoidales icosaédriques enveloppées Construction modulaire en sous-unités Code génétique: un triplet (3 nucleotides) ont un PM d environ 1000 et code pour un acide aminé de PM env 150 ->15% de son PM ->il faut donc de multiples protéines pour emballer l acide nucléique qui les code Certains virus sont relativement fragiles (enveloppés), mais d autres sont extrêmement stables ex: mosaïque du tabac > années (retrouvé infectieux dans des herbiers)

3 Le Virus de la mosaïque du Tabac (Tobacco Mosaic Virus TMV), prototype des virus à symétrie hélicoïdale hélices= structures simples (diamétre et pas) 17nm 300 nm 16,3 prots/tour 1957: Fraenkel-Conrat & Williams montrent que lorsqu on mélange de l ARN purifié de TMV et une préparation de protéine capside, des particules se forment -> énergie libre minimale, structure la + stable interactions electrostatiques et hydrophobes, pas de liaisons covalentes, entre protéines, entre protéines et acides nucléiques, entre prot et lipides (pas TMV)

4 Emballage (packaging) du génome du TMV OAS: origine d assemblage progression dans les deux directions

5 Particules icosaédriques 20 faces -Emballage optimal de l acide nucléique, particule quasi sphérique, (pas possible avec un tetraédre par ex) -Versions les plus simples: chaque face est formée de 3 sous unités protéiques identiques (jusqu à 60, microvirus bactériens) -Nombreux virus de familles différentes ont 3 sousunités différentes /face: Picornavirus (poliovirus, virus de la fiévre aphteuse, virus du rhume), comovirus végétaux

6 Virus hélicoïdaux fréquents chez plantes( nm) et bactéries (ex:phage M13) Pas de virus nu à symétrie hélicoidale chez les animaux -> toujours enveloppés ex:rhabdovirus (virus de la rage), enveloppes et protéines associées viennent de la cellule hôte, particules bacilliformes nucleocapside=acidenucléique complexé avec une protéine basique (N)

7

8 Protéines d enveloppe glycoprotéines externes-> récepteurs protéine de transport: modification de l interieur de la particule durant l infection

9 Particules enveloppées les particules «nues» sont formées lorsque le virus lyse la cellule d autres virus ont développé des stratégies pour sortir de la cellule sans la détruire toutes les cellules sont bordées par une enveloppe lipidique, les virus sortent par extrusion, la particule est recouverte par une partie de cette enveloppe et les protéines qui y sont associées. Des protéines virales se regroupent sur la membrane pour être intégrées dans la particule. la structure de base peut être hélicoidale ou icosahédrique toutes le membranes cellulaires peuvent servir a l assemblage viral (vacuoles, endomembranes)

10 Virus complexes - poxvirus: nm pas de symétrie simple souvent grand génome 100 gènes, >100kb poxvirus (variole), herpesvirus virus hélicoidaux et icoséadriques: 3-15 gènes, 3-15 kb

11 Virus complexes Bactériophages T (Caudovirus)

12 Mimivirus (amibes) Taille 400nm, DNA 1200kb (1,2 Mb) plus grand que certaines bactéries commensales (mycoplasma genitalium) Le génome code pour des protéines impliquées dans sa propre traduction (facteur d elongation etc..mais pas d ARN ni de protéines ribosomales => Frontiére entre virus et cellule: systémes de génération d energie autonome (ATP) et fabrication des ribosomes? autres grand virus Phycodnavirus 560 kb(algues unicellulaires) Bacteriophage D670kb(bacillus megaterium)

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