1- LES BACTERIES PRODUCTRICES DE CARBAPENEMASE : GENERALITES
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- Anaïs Marceau
- il y a 10 ans
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1 RAPPEL DES CONSIGNES DE PRISE EN CHARGE DE PATIENTS TRANSFERES D UN HOPITAL SITUE DANS UN PAYS A HAUTE ENDEMICITE DE BACTERIES PRODUCTRICES DE CARBAPENEMASES Escherichia coli multi-résistant, producteur d une carbapénémase de type New Delhi Métallo-Beta-Lactamase (NDM-1): un premier cas importé dans un hôpital aigu en Belgique. Rédacteurs: Y.Glupczynski, Denis Piérard, Boudewijn Catry, Michèle Gérard, Anne Simon, Béatrice Jans. En juin 2010, un patient transféré d un hôpital du Pakistan, admis dans un service de soins intensifs d un hôpital de la Région Bruxelloise a été identifié comme infecté par un Escherichia coli multirésistant (c.a.d. résistant vis-à-vis de toutes les classes d antibiotiques à l exception de la colimycine et parfois de la tigecycline) producteur d une carbapénémase plasmidique de classe B de type New Delhi Métallo--Lactamase (NDM-1) au sein d une flore mixte comprenant entre autres un MRSA. La souche et le type de carbapénémase ont été confirmés par le Prof. Y. Glupczynski, UCL- Mont Godinne. Le germe en question a été isolé au niveau d une plaie infectée au pied, suite à un traumatisme chez un patient diabétique. Des précautions ont rapidement été prises pour éviter la transmission nosocomiale incluant le renforcement des précautions générales, la mise en chambre individuelle du patient et les précautions additionnelles de type «contact» (l utilisation de blouses et de gants, la désinfection de l environnement) et une surveillance renforcée par un dépistage auprès des patients du service de soins intensifs démontrant l absence de transmission secondaire. Le patient a développé une neurotoxicité secondaire à un traitement à la colistine et est rapidement décédé dans un état septique non contrôlé malgré un traitement par la tigécycline, des débridements larges et une amputation du membre atteint. CE CAS CONFIRME LA NECESSITE D UNE VIGILANCE ACCRUE FACE A : - un patient transféré - après un séjour hospitalier en service de soins intensifs - dans un pays à haute endémicité de bacilles gram négatifs multi-résistants = R à tous les antibiotiques ou à > de 3 classes différentes, incluant les carbapénèmes ex : Pakistan, Inde, Grèce, Italie, Turquie, Israël, Etats-Unis,. Une information générale concernant les bactéries productrices de carbapénémases et plus particulièrement le type New Delhi MBL est reprise ci-dessous. Notons que l approche et la prise en charge de patients colonisés ou infectés par une bactérie productrice de carbapénémase est identique quel qu en soit le type. 1- LES BACTERIES PRODUCTRICES DE CARBAPENEMASE : GENERALITES Problème lié à la résistance aux carbapénèmes Les carbapénèmes constituent souvent les seules armes contre bon nombre de bactéries Gram négatives multi-résistantes, en particulier les productrices de Beta-Lactamase à Spectre Etendu (BLSE). Cependant, la production de carbapénémases par les bactéries, contre-indique un traitement aux carbapénèmes. L émergence et la diversité des souches productrices de carbapénémases sont donc particulièrement préoccupantes. Type de bactéries pouvant produire des carbapénémases De façon générale, la production de carbapénémases peut être associée à diverses espèces appartenant à la famille des entérobactéries : K. pneumoniae, Escherichia coli (plus rarement Citrobacter freundii, Enterobacter cloacae et Morganella morganii) mais également à d autres familles (Pseudomonas aeruginosa et Acinetobacter baumannii). Les carbapénémases, ainsi que les autres résistances souvent associées à celles-ci, ont un haut potentiel de dissémination par transfert plasmidique horizontal au sein de différentes espèces d entérobactéries.
2 Classification des enzymes inactivant les carbapénèmes On distingue à ce jour trois classes d enzymes inactivant les carbapénèmes. Dans certains pays, l endémicité de certains types de carbapénémases est particulièrement élevée (voir tableau ci-dessous). Classification Enzyme Bactéries les plus souvent incriminées CLASSE A KPC, K. pneumoniae SME, IMI, NMC, Entérobactéries GES Pseudomonas aeruginosa CLASSE D Oxacillinases CLASSE B Métallo-β-Lactamases OXA-23, -58, -40 OXA-48 VIM, IMP, GIM SPM, SIM, AIM, NDM A. baumannii K. pneumoniae Pseudomonas aeruginosa Entérobactéries, Acinetobacter spp Principaux pays concernés Etats-Unis, Israël, Turquie Grèce, Italie Chine, Inde, Royaume-Uni et pays Nordiques Turquie, Afrique du Nord, Espagne, Brésil, Colombie Turquie, Chine, Inde et le Royaume- Uni Grèce, Turquie, Italie, France, Brésil Etats-Unis, Japon, Corée, Chine Figure 1: Klebsiella pneumoniae, productrice de carbapénémases (P. Nordmann, Lancet Inf. Dis, 2009) Figure 2: Proportion de souches de Klebsiella pneumoniae résistant aux carbapénèmes, EARSS, 2008 Chypre (10%), Grèce (37%), Israël (19%)
3 Les souches d entérobactéries productrices de carbapénémases détectées en Belgique depuis 2008 sont quasiment toujours retrouvées chez Klebsiella pneumoniae (exceptionnellement chez Enterobacter cloacae et jamais à ce jour chez Enterobacter aerogenes) et sont majoritairement de type «VIM» (VIM-1) (Métallo--Lactamase de classe B) ou plus rarement de type «KPC» (KPC-2, KPC- 3) (carbapénémase de classe A). La grande majorité des souches de Klebsiella pneumoniae productrices de carbapénémases VIM-1 ou KPC-2/-3 ont été détectées par des prélèvements de dépistage chez des patients qui avaient préalablement été hospitalisés en Grèce (Grèce continentale, Crête, Rhodes, Chypre) ou en Italie (Sicile). Détection et profil des résistances des bactéries productrices de carbapénémases Les souches productrices de carbapénémases, quel que soit leur type, présentent toujours un haut niveau de résistance à tous les antibiotiques classiques 1, incluant : - les bêta-lactamines: pénicillines avec ou sans inhibiteurs, céphalosporines NB : la résistance à l aztreonam est variable selon le type de carbapénémase, les Métallo--Lactamases de classe B n étant pas actives sur l aztreonam ; une résistance à cet antibiotique peut cependant être observée en cas de présence d un autre type de -Lactamase, p.ex.: une BLSE - les aminoglycosides - les quinolones - les sulfamidés (cotrimoxazole). Les valeurs des CMIs aux carbapénèmes sont souvent augmentées, mais peuvent encore être catégorisées comme sensibles selon la technique utilisée. Cette particularité peut rendre leur détection difficile. Les tests phénotypiques pour détecter la présence d'une carbapénémase ne sont que peu fiables (car non standardisés) et la présence d'un résultat négatif ne permet certainement pas d'exclure la présence d'une carbapénémase. Généralement les polymyxines (polymyxine B, colistine) sont encore actives in vitro, mais pas vis-àvis de M. morganii et d autres espèces intrinsèquement résistantes, et leur efficacité clinique est encore peu documentée en particulier dans le cadre d infections sévères. La tigecycline est souvent active (sensible ou intermédiaire) in vitro, mais présente des taux sériques faibles. De plus, elle n est enregistrée que pour les infections de tissus mous ou digestives et de façon plus générale, son efficacité n est pas prouvée dans le cas d infections sévères. Groupes de patients à risque d importation/transmission Patients transférés après un séjour aux soins intensifs dans un hôpital d un pays à haute endémicité de bactéries Gram-négatifs multi-résistants. Transmission La transmission des clones épidémiques est essentiellement manuportée et concerne essentiellement les soins intensifs. Les facteurs de risque incluent la présence d une pathologie lourde telle que transplantation d organe, les antibiothérapies prolongées, notamment (mais pas exclusivement) par carbapénèmes et la durée de séjour en service de soins intensifs (USI). 2 - LES ENTEROBACTERIES PRODUCTRICES DE CARBAPENEMASE NEW DELHI METALLO-BETA-LACTAMASE DE TYPE-1 Classe d enzyme de la carbapénémase NDM-1 Cette carbapénémase appartient à la classe B (Métallo-beta-Lactamases). Origine et dissémination des bactéries productrices de carbapénémases du type NDM-1 Pays à haute endémicité pour NDM-1: Pakistan, Inde A Mumbai 2 et New Delhi (Inde), mais également à Karachi (Pakistan) le nombre d isolats résistants aux carbapénèmes a fortement augmenté depuis Dans le sous-continent Indien, les carbapénèmes sont largement disponibles et fréquemment utilisés pour le traitement d infections causées par des entérobactéries résistantes aux céphalosporines de 3 eme génération tant chez l adulte que chez l enfant. En effet, en Inde en 2008, 60-90% des souches de E. coli, et K. pneumoniae isolées à partir d hémocultures produisaient une BLSE.
4 Il est très vraisemblable que l utilisation croissante des carbapénèmes a sans doute exercé une pression de sélection et favorisé l émergence de cette nouvelle carbapénémase dont l origine reste à ce jour inconnue. Les données épidémiologiques relatives à la fréquence d isolement des souches de type NDM+ sont encore limitées. De telles souches ont été isolées dans plusieurs villes d Inde depuis NDM-1 en Europe - Le tout premier cas Européen décrit en 2008, concerne un patient diabétique suédois originaire d Inde qui au cours d un voyage à New Delhi (Inde) avait été hospitalisé pour un abcès fessier. Lors de son transfert vers un hôpital Suédois, une Klebsiella pneumoniae résistante aux carbapénèmes NDM-1 positive 3 avait été isolée à partir d une culture d urine. Au niveau des plaies et dans un liquide prélevé dans le cadre d une otite externe, un E. coli BLSE+ et un Acinetobacter sensible aux carbapénèmes avaient été trouvés. - Entre 2008 et 2009 ce nouveau type de carbapénémase de type NDM-1 a émergé rapidement dans plusieurs hôpitaux du Royaume-Uni. Il s agissait le plus souvent de K. pneumoniae mais Escherichia coli, Citrobacter freundii, Enterobacter cloacae et Morganella morganii étaient également concernés. La majorité de patients colonisés/infectés par ce type de germe avaient eu une hospitalisation récente en Inde ou au Pakistan pour un traitement oncologique, des traitements de chirurgie esthétique, une transplantation rénale ou hépatique ou des dialyses 4. Un tourisme médical important entre le Royaume-Uni et le sous-continent indien explique l importation de ces isolats qui circulent maintenant dans les hôpitaux britanniques puisqu aujourd hui le lien avec une hospitalisation «outremer» n est plus présent pour tous les cas. Les travaux préliminaires réalisés par les laboratoires de références au Royaume-Uni et en Ecosse suggèrent que la Métallo--Lactamase NDM-1 (et les autres résistances associées) a un haut potentiel de dissémination par transfert horizontal de plasmides au sein de différentes espèces d entérobactéries. L impact clinique de ces souches en termes de morbidité et de mortalité est encore peu connu compte tenu du nombre encore limité de cas rapportés, mais des cas d infections sévères avec hémocultures positives ont été signalés. Détection et profil des résistances des bactéries productrices de carbapénémases du type NDM-1 Une entérobactérie productrice de carbapénémase (quelque soit son type) doit être suspectée par le caractère multirésistant de la souche, c.a.d. résistant aux: - bêta-lactamines, - aminoglycosides - quinolones - sulfamidés (cotrimoxazole). - carbapénèmes: imipénème, méropénème, doripéneme Ces souches ne sont habituellement sensibles qu aux polymyxines (polymixyne B, colistine) et de façon inconstante à la tigecycline. Les souches productrices de carbapénémase NDM-1 peuvent éventuellement être sensibles à l aztreonam pour autant qu un autre mécanisme de résistance associé ne soit pas présent (BLSE et/ou céphalosporinase AmpC). Cependant, des mécanismes de résistance associée sont souvent présents. En l occurrence, le premier cas Belge transféré du Pakistan présentait en plus de la carbapénémase NDM-1, une pénicillinase à spectre étroit de type TEM-1, une BLSE de type CTX-M-15 et deux céphalosporinases plasmidiques AmpC différentes de type CMY dont le séquençage est en cours. De plus une résistance de haut niveau aux aminoglycosides liée à la présence du gène RmtB codant pour une méthylase de l ARN 16S était également présente. Notons que pour leur détection, les carbapénémases MBL de type NMD-1 sont inhibées par l EDTA et une synergie peut être observée entre l imipenème et l EDTA par la méthode des disques combinés ou par l E-test. Les souches d entérobactéries multi-résistantes et présentant une résistance aux carbapénèmes, en particulier E. coli et K. pneumoniae doivent être référées dans un laboratoire de référence pour confirmation du mécanisme de résistance.
5 CONDUITE A TENIR FACE A UN CAS SUSPECT DE BACTERIE MULTI RESISTANTE PRODUCTRICE DE CARBAPENEMASE TOUT TYPE CONFONDU CAS POTENTIEL/A HAUT RISQUE D INFECTION/COLONISATION AVEC UNE BACTÉRIE PRODUCTRICE DE CARBAPÉNÉMASE notion de: - transfert après un - séjour aux SI - dans un pays à endémicité élevée Continent Indien Inde, Pakistan Europe du sud Grèce, Turquie (OXA-48), Italie, Espagne Asie mineure, Moyen & extrême Orient, Afrique Maroc, Tunisie, Lybie, Egypte, Palestine, Israël Etats-Unis et Amérique du Sud Etat de New York, Etats de la côte est (KPC), Brésil, Colombie Dépistage actif systématiquement à l admission (<48h.) : selles ou frottis rectal Quels milieux? Culture sur milieux sélectifs ou différentiels (p.ex. milieu McConkey avec ajout d un disque de ceftazidime et d imipénème ou de méropénème) Plusieurs milieux chromogènes sélectifs pour la recherche de BLSE disponibles dans le commerce peuvent convenir à cet effet. Signaler au laboratoire le pays de transfert du patient CAS SUSPECT D INFECTION/COLONISATION AVEC BACTÉRIE PRODUCTRICE DE CARBAPÉNÉMASE notion de: - transfert après - séjour aux SI - dans un pays à endémicité élevée et et bactérie Gram négative multi résistante = Résistant à tous les antibiotiques ou à > 3 classes, y compris aux carbapénèmes : imipénème, méropénème, doripénème présence de synergie visualisée entre l imipénème et l EDTA par la méthode des disques et MBL E-test SANS ATTENDRE LA CONFIRMATION : PREVENIR L EQUIPE D HYGIENE de votre établissement pour la mise en place sans délai de mesures de contrôle adaptées. RENFORCEMENT DES PRECAUTIONS GENERALES VIS-A-VIS DE TOUS LES PATIENTS : hygiène des mains par friction à l aide d une solution hydro-alcoolique, en cas de risque de contact avec des liquides biologiques : port de l équipement de protection individuelle (gants, sur-blouse à manches longues, masque) adapté à l évaluation du risque, désinfection des surfaces fréquemment touchées dans l environnement du patient AFIN D EVITER LA TRANSMISSION DE GERMES RE- SISTANTS, IL FAUT : Envoyer la souche pour confirmation phénotypique et génotypique du mécanisme de résistance, accompagnée du formulaire de signalement à l attention du : Prof. Y. Glupczynski, Laboratoire de Microbiologie, Cliniques Universitaires Mont-Godinne - UCL (Formulaire de signalement en annexe 1 ) CAS CONFIRMÉ PAR LE LABORATOIRE DE RÉFÉRENCE Mettre le patient en isolement/chambre individuelle ou cohortage (si même germe) Si plusieurs cas/service : limiter les admissions Précautions «de contact» Blouse à manches longues et gants pour tout contact avec le patient et son environnement Respecter la continuité des précautions «de contact» lors des soins au patient en isolement (p.ex. éviter de devoir sortir pendant les soins pour répondre au téléphone, aller chercher du matériel, etc ). Favoriser les soins intégrés ; Réaliser un dépistage (routine) des patients et contacts proches en cours d hospitalisation : - 1 site : selles ou frottis rectal (portage intestinal) - frottis inguinal/périnéal n est pas une alternative - préciser sur la demande : nature des sites prélevés, type de bactéries recherchées, zone à risque de transfert du patient.
6 COMMUNICATION LORS D UN CAS CONFIRME DE BACTERIE MULTI RESISTANTE PRODUCTRICE DE CARBAPENEMASE Communication interne à l hôpital L équipe d hygiène hospitalière : dès que le transfert est annoncé/connu. L équipe du service d accueil, y compris le personnel d entretien ménager, le personnel intérimaire/stagiaires, les paramédicaux. Le laboratoire lors du dépistage à l admission : indiquer sur le formulaire de demande : zone à risque d où le patient a été transféré, bactérie recherchée, site du prélèvement. Le personnel des services médico-techniques si le patient doit être déplacé vers ce service pour un examen, un acte technique ou diagnostique. Limiter au strict minimum ce genre de déplacements. Communication externe avec le laboratoire de référence et l Institut Scientifique de Santé Publique Laboratoire de référence (envoi de souche pour confirmation + document accompagnant la souche): Il faut communiquer au laboratoire de référence qu il s agit d un patient transféré à partir d'un hôpital dans un pays/zone à risque. Cette information est essentielle à obtenir et à communiquer lors de l envoi de la souche au laboratoire de référence. Professeur Y. Glupczynski, Laboratoire de Microbiologie, Cliniques Universitaires de Mont Godinne (UCL) 1, avenue Dr. G. Therasse 5530 Yvoir Tel : 081/ Fax : 081/ Mail : [email protected] L Institut Scientifique de Santé Publique (centralisation des données des cas confirmés) Béatrice Jans, Département Santé Publique et Surveillance 14, rue Juliette Wytsman 1050 Bruxelles Tel : 02/ Fax : 02/ Mail : [email protected] Communication lors du transfert du patient vers un autre établissement de soins (hôpital, maison de repos,..) Le portage doit être mentionné clairement dans les comptes rendus d hospitalisation et dans la lettre de transfert. Un contact téléphonique, avant le transfert, permet de prévenir le service d accueil avant l arrivée du patient, afin de mieux organiser les mesures à prendre. Cette communication est fondamentale afin que, en cas d antibiothérapie empirique, le traitement soit adapté et que les précautions «contacts» soient instaurées. Communication lors d un retour à domicile, signaler le caractère «porteur» du patient aux personnes susceptibles de réaliser des soins à domicile (médecin traitant, infirmier, kinésithérapeute, ). Le document de transfert ou de sortie mentionnera au minimum les renseignements suivants : o type de bactérie o le/les site(s) colonisé(s) et/ou infecté(s) o les dates de derniers prélèvements positifs o l état du patient lors du transfert ou à la sortie o les précautions à prendre Information du patient L équipe d hygiène hospitalière informe le patient qu il est porteur d une bactérie multi-résistante et des mesures qui doivent être prises.
7 RÉFÉRENCES 1 David Livermore, Neil Woodford. New carbapenemase, NDM-1, linked to India and Pakistan. ARMRL news, Health Protection Agency, Summer, Issue 23, Payal Deshpande, Camilla Rodrigues, Anjali Shetty, Farhad Kapadia, Ashit Hedge,Rajeev Soman. New Delhi Metallo-b lactamase (NDM-1) in Enterobacteriaceae: Treatment options with Carbapenems Compromised. JAPI, March 2010, VOL. 58. Pp Yong D, Toleman MA, Giske CG, Cho HS, Sundman K, Lee K, Walsh TR. Characterization of a new metallo-beta-lactamase gene, bla(ndm-1), and a novel erythromycin esterase gene carried on a unique genetic structure in Klebsiella pneumoniae sequence type 14 from India. Antimicrob Agents Chemother Dec; 53(12): Epub 2009 Sep A Muir, MJ Weinbren. New Dehli Metallo-beta-lactamase: a cautionary tale. JHI, 75(2010):
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