Contrat d accompagnement de projet

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1 Page : 1 /8 Intitulé du Projet: Acronyme: Coordonnées des intervenants Pour le Laboratoire de recherche Intitulé: Adresse: Responsable d'équipe : Tel : + Responsable Projet : Tel : + Pour la Plate forme Bioinformatique ARTbio de l Institut de Biologie Paris Seine CNRS & UPMC IBPS, 9 quai Saint Bernard Bat B, 7ème étage Paris Responsable Projet : Tel : + I Les missions de la plate forme Les missions de la plate forme ARTbio sont : 1. d'accompagner les biologistes dans leur projet d'analyse bioinformatique en utilisant l interface d un serveur Galaxy. 2. de fournir l infrastructure de calcul, les outils bioinformatiques et les fichiers de référence nécessaires aux équipes de recherches publiques ou privées, afin qu ils puissent réaliser des analyses reproductibles et transparentes. Prestation de service ou Collaboration II Type de projet (se reporter à la section XI et effacer la rubrique inutile)

2 Page : 2 /8 III Résumé du projet de Recherche Le cas échéant, préciser aussi l'environnement du projet et l'intitulé du programme Environnement : Régional, National, Européen, International, Autre (effacer les rubriques inutiles et précisez) Durée du projet de Recherche :

3 Page : 3 /8 IV Résumé de la demande bioinformatique Résumé à écrire en concertation avec la plate forme, après discussion et évaluation des besoins et analyses à effectuer.

4 Page : 4 /8 V Estimation des coûts Que cela soit dans le cadre d une prestation de service ou d une collaboration, les coûts sont calculés sur la base du temps consacré par la plate forme au projet selon la grille tarifaire en vigueur: Pour les personnels de l IPBS et de l UPMC: 1 mois d analyse par un membre de ARTbio: 1000 HT Pour les personnels externes (académiques): 1 mois d analyse par un membre de ARTbio: 2000 HT Pour les personnels externes (non académiques): 1 mois d analyse par un membre de ARTbio: 3000 HT Ces tarifs couvrent la participation au frais de stockage et de calcul. Tout projet nécessitant l'achat d'un logiciel ou de banques de données payantes ou l accès à des ressources Cloud payantes devra intégrer ce coût supplémentaire au coût de la prestation déterminée selon la grille tarifaire ci dessus. Prix HT (Nombre de mois X Tarif applicable): Coût supplémentaire éventuel HT: TVA : 20 % Prix TTC : Détail des coûts supplémentaires : participation au coût de stockage : participation au coût de calcul : participation au coût d accès à un Cloud: N.B. : La tarification d un service ponctuel sera réduite au prorata du nombre de jours de travail occasionnés par la prestation. Après concertation entre les parties, il pourra être décidé de la gratuité d un service ponctuel.

5 Page : 5 /8 VI Ressources humaines L étude se fera en étroite collaboration entre le laboratoire de recherche et la plate forme bioinformatique. Il est demandé au laboratoire de recherche de prendre connaissance du manifeste Agile ( ) auquel la plate forme ARTbio se conforme, dans la mesure du possible. Les personnes directement impliquées sont au nombre de. Pour le laboratoire Prénom(s) Nom(s) xxx Rôle xxxxx Pour la plate forme bio informatique Prénom(s) Nom(s) Rôle yyy yyyyy VII Ressources matérielles, logicielles, banques de données Pour ce projet, il est nécessaire d accéder à des ressources supplémentaires : Disque X GO de disque Logiciels logiciel 1 logiciel 2... Banques banque 1 Cloud computing Cloud: Instance (spécifier le nombre de vcpu et la mémoire allouée) Temps de calcul (estimé ou provisionné):

6 Page : 6 /8 VIII Sauvegarde des données Les données fournies par l'utilisateur et produites au cours du projet seront sauvegardées sur la plate forme bio informatique durant toute la durée du projet. IX Planification de la réalisation de la demande détaillée au paragraphe IV Sous réserve d impondérables indépendants de notre volonté : du DATE au DATE (mettre ici les dates de début et fin de contrat). Si nécessaire, un avenant (gratuit ou payant) sera établi en concertation avec l'équipe de recherche. Date prévisible de la réception des livrables : DATE (mettre ici la date prévisible de rendu des résultats, voir section X) Après la livraison du livrable, le support est assuré jusqu'à la fin du contrat. A la date de fin de contrat, la collaboration ou la prestation de service sera réputée terminée.

7 Page : 7 /8 X Déroulement du projet et rendu des résultats La plate forme ARTbio adhère aux principes du manifeste AGILE (voir ) dont elle s inspire pour ses interactions avec les chercheurs. Tout projet fait l'objet d un suivi assuré grâce: au gestionnaire de projet Redmine à des interactions aussi fréquentes que possibles des réunions et face à face réguliers. Si la qualité des données s avère insuffisante pour le traitement initialement prévu, la plate forme s'engage à prévenir le laboratoire de recherche dés que possible et à décider en concertation de la suite à donner au projet. Sous réserve d une qualité suffisante des données à traiter, les résultats à l'issue du projet se présenteront sous la forme : de données brutes validées en début de projet des analyses effectuées en concertation avec le labo de recherche et conservées sous la forme des histories Galaxy. de workflows Galaxy exportables, et contenant toutes les informations pour rejouer l analyse dans un autre environnement. de Pages Galaxy permettant l'accès aux données, à l intégralité de l analyse, et aux conclusions & figures générées, sous réserve que le laboratoire de recherche le souhaite et apporte une contribution effective à la composition des Pages Galaxy. d un accès au projet dans le gestionnaire de projet Redmine d une enquête satisfaction. En raison des aléas liés aux projets de recherche, la plate forme est soumise à une obligation de moyens et non de résultats.

8 Page : 8 /8 XI Propriété des résultats et valorisation Dans le cas d une prestation de service comme d une collaboration : Les résultats sont la propriété exclusive du laboratoire de recherche. Le laboratoire de recherche a la maîtrise de la valorisation des résultats. Le laboratoire s engage à mentionner la plate forme bioinformatique ARTbio dans la section methods et/ou Acknowledgments des publications issues du projet d analyse. Il s engage également à informer la plate forme de la parution de ces publications. Les procédés et méthodes élaborés par les membres de la plate forme à l occasion d un projet et avérées indépendantes des données afférentes au projet sont la propriété exclusive de la plate forme qui conserve la maîtrise de leur valorisation. Dans le cas d'une collaboration : Le laboratoire de recherche a la maîtrise de la valorisation des résultats. Il s'engage à associer les personnes de la Plate forme Bioinformatique ayant travaillé au projet (cf paragraphe VI) en tant que coauteurs des publications/communications utilisant les résultats générés. XII Commentaires éventuels Fait le à Responsable Equipe pour le laboratoire de recherche Fait le à Responsable Projet pour la Plate forme Bioinformatique Lu et approuvé Lu et approuvé

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