Rapid testing to target the most successful antibiotics
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- Amaury Blanchard
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1 FESASS International Conference Farmers and veterinarians together to tackle antimicrobial resistances Rapid testing to target the most successful antibiotics Marc Saulmont ARSIA asbl Brussels, 23 Octobrer 2015
2 Identification des bactéries pathogènes Déterminer leur profil de résistances aux antibactériens Répondre aux exigences du client Résultats fiables Résultats rapides Coûts peu élevé Microbiologie vétérinaire Les principales missions du laboratoire de microbiologie en médecine vétérinaire Absence de développement technologique spécifique (sauf PCR) Automatisation très limitée Absence de réseaux structurés En Belgique, nombre très limité d intervenants de taille significative
3 Microbiologie vétérinaire Avant: tests phénotypiques classiques Colorations, galeries biochimiques Peu ou pas d automatisation, pas d automates réellement adaptés à la bactériologie vétérinaire
4 Depuis peu: Microbiologie vétérinaire Apparition de la spectrométrie de masse appliquée à la microbiologie MALDI TOF (Matrix Assay Laser Desorption Ionisation, Time of Flight)
5 Identification des bactéries pathogènes Ensemencement des différents milieux de culture 24H à 48H Avant Tests phénotypiques (colorations, oxydases, catalases, galeries ) 48H Maintenant Maldi Tof 5 minutes Identification
6 Délais d'obtention d'un résultat bactériologique 100% 90% 92% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 45% 30% 42% 63% <3j 3-5j 6-10j >10j 20% 10% 0%
7 Délais d'obtention d'un résultat bactériologique 100% 90% 92% 80% 70% 60% 50% 40% 30% 45% 30% 42% 63% <3j 3-5j 6-10j >10j 20% 10% 0% >10j 28% 1er trimestre 2013 <3j 20% 6-10j 5% >10j 4% 4e trimestre j 30% 6-10j 15% 3-5j 37% <3j 61%
8 Mais aussi Résultats plus précis et plus fiables Bibliothèque Bruker riche de plus de 4200 spectres de référence Exemple: SCN, Mycoplasma spp. Mises à jour régulières des bibliothèques Création de réseaux d utilisateur A faible coût Exception faite de l amortissement et la maintenance
9 2 mission du laboratoire de microbiologie Déterminer le profil de résistances aux antibactériens Technique de diffusion en milieu gélosé Sous accréditation pour les entérobactéries et Staphylococcus aureus
10 Belac ISO QC
11 Système Sirscan lecture semi automatisée aide à l interprétation des résultats bruts stockage des données et traitement épidémiologique
12 Un objectif immédiat et urgent Des objectifs indirects
13 Détermination de la sensibilité aux antibiotiques Un objectif direct Apporter aux praticiens, une information précise en matière de résistance aux antibactériens d intérêt vétérinaire Interpréter le résultat et le replacer dans le contexte pathologique
14 Un objectif indirect Épidémiologique Même s il existe plusieurs biais de prélèvement Recours fréquent au laboratoire en cas d échec thérapeutique Bactéries soumises à une pression de sélection préalable Pas de maîtrise du prélèvement Permet néanmoins De montrer, s il y a ou non évolution de l antibiorésistance dans le cadre de notre pratique bovine Exploiter et vulgariser des données Provenant des utilisateurs directs et donc des prescripteurs Articles, présentations diverses pour vétérinaires Rapport d activité antibiogramme (4 éditions depuis 2005)
15 Société Belge Francophone de Buiatrie
16 Evolution de l'antibiorésistance pour les E. coli CS31a et F17 chez les veaux 100,00% 90,00% 80,00% 70,00% 60,00% 50,00% 40,00% 30,00% 20,00% 10,00% 0,00% TRIMETHOP+SULFA 2 AMOXICILLINE 2 AMOX-CLAV 2 COLISTINE 2 GENTAMICINE 2 FLUOROQUINOLONE C3G et C4G KANAMYCINE FLORFENICOL TETRACYCLINE % Rb % Rb % Ra
17 Evolution de l'antibiorésistance pour les E. coli CS31a et F17 chez les veaux entre et ,00% 90,00% 80,00% 70,00% 60,00% 50,00% 40,00% 30,00% 20,00% 10,00% 0,00% TRIMETHOP+SULFA 2 AMOXICILLINE 2 AMOX-CLAV 2 COLISTINE 2 GENTAMICINE 2 FLUOROQUINOLONE C3G et C4G KANAMYCINE FLORFENICOL TETRACYCLINE % Rb % Rb Evolution de l'antibiorésistance pour les E. coli CS31a et F17 chez les veaux entre et ,00% 90,00% 80,00% 70,00% 60,00% 50,00% 40,00% 30,00% 20,00% 10,00% 0,00% TRIMETHOP+SULFA 2 AMOXICILLINE 2 AMOX-CLAV 2 COLISTINE 2 GENTAMICINE 2 FLUOROQUINOLONE C3G et C4G KANAMYCINE FLORFENICOL TETRACYCLINE % Rb % Ra
18 Evolution de l'antibiorésistance pour les E. coli CS31a et F17 chez les veaux entre et ,00% 90,00% 80,00% 70,00% 60,00% 50,00% 40,00% 30,00% 20,00% 10,00% 0,00% TRIMETHOP+SULFA 2 AMOXICILLINE 2 AMOX-CLAV 2 COLISTINE 2 GENTAMICINE 2 FLUOROQUINOLONE C3G et C4G KANAMYCINE FLORFENICOL TETRACYCLINE % Rb % Ra E. coli résistants à la colistine (CMI > 2mg/L) (en %) 5,00% 4,50% 4,00% 3,50% 3,00% 2,50% 2,00% 1,50% 1,00% 0,50% 0,00% 4,32% 1,28% 0,89% 0,00% 0,09%
19 Intégration des données ARSIA dans le système de contrôle et de gestion des médicaments belges Intégration de première ligne ARSIA Anamnèse Infos traitements infos animaux traités Eleveurs /vétérinaires Autopsies Résultats Bactério Antibiogrammes AMCRA Antimicrobial Consumption and Resistance in Animals) Recommandations Vademecum médicaments Interprétation Recommendations Conseils en collaboration avec vété traitant Vété conseil ARSIA
20 Intégration des données ARSIA dans le système de contrôle et de gestion des médicaments belges DESIR = Data Mining LIMS ARSIA données labo ELEVEURS Traitements Motifs de traitement Indicateurs sanitaires données identifications Vétérinaires Traitements Motifs de traitement Indicateurs s/ usage des médicaments BIGAME: gestion informatique des médicaments à la ferme données antibiotiques Benchmarking s/ usage des médicaments Sanitel-MED DB médicament officielle AMCRA Antimicrobial Consumption and Resistance in Animals)
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