Epidémiologie du pneumocoque en France

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David Falardeau
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1 Epidémiologie du pneumocoque en France Jacques Croizé MCU-PH Unités de microbiovigilance et de bactériologie Département des Agents Infectieux DU Thérapeutiques anti-infectieuses 1 er mars 2007 Définition et facteurs de virulence du Streptococcus pneumoniae 1

2 Définition Cocci à Gram positif d aspect lancéolés, en diplo ou en courtes chaînettes. Capsulé dans les prélèvements pathologiques, les cocci apparaissent entourés d un halo blanc autour d eux à l examen direct et les colonies peuvent avoir un aspect muqueux. Catalase négative, ils préfèrent l anaérobiose mais sont aéro-anaérobie. Exigence en facteurs de croissance retrouvés dans une gélose au sang; ils apparaissent alpha hémolytique après 24 h de culture Différents aspects 2

3 3

4 Exemple de souche muqueuse le type 3 Facteurs de virulence 4

5 Identification Différentes méthodes d identification Phénotypique : aspect des colonies, sensibilité à l optochine, lyse par les sels biliaires Tests de biologie moléculaire pour les souches atypiques (TO -) : par PCR recherche de deux gènes : autolysine et pneumolysine En cas de doute, absence d un des deux gènes, séquençage du gène de la superoxyde dismutase soda- comparé à une banque génomique ou séquençage d un panel de 7 gènes conservés ou MLST (Multi Locus Sequence Typing) 5

6 Identification par test à l optochine Génome 6

7 Génome de S. pneumoniae : paires de base (2001) Antibiogramme 7

8 Application des références du Ca-SFM 2006 CASFM 2006 Antibiotiques à tester : listes standard et complémentaire 8

9 CASFM Pneumocoque CA-SFM 2006 règles d interprétation pour les B lactamines 9

10 CASFM 2006 Autres antibiotiques CASFM 2006 Interprétation aminosides 10

11 CASFM 2006 Interprétation autres antibiotiques dont les fluoroquinolones Résistance aux Fluoroquinolones 11

12 12

13 Antibiogramme automatisé Exemple : Carte Vitek 2 AST P533 Carte d antibiogramme pour S. pneumoniae Carte Vitek 2 AST

14 Carte Vitek 2 AST-P533 CMI E test 14

15 CMI E test quatre B lactamines CMI agar 15

16 CMI dilution milieu solide Exemple céfotaxime: témoin, 0,125 et 2 Sérotypage 16

17 Sérotypage - Sérogroupage Il existe 90 sérotypes connus Un sérogroupe peut regrouper plusieurs sérotypes (lettre différenciant les sérotypes) Ex 19F dans le vaccin et 19A non vaccinal; 23 F et A et B.. Technique d agglutinations sur lame à l aide de latex sensibilisés Existence de sérum poolé portant des lettres A à I et P à T comportant un mélange de 7 à 11 anticorps L ORP permet de sérogrouper et la souche est envoyé au CNRP pour confirmation et sérotypage Epidémiologie Suivi au niveau de la résistance : questions : Y-a-t-il des retombées positives de la diminution de consommation des antibiotiques dans les angines et notamment de l utilisation du TDR? Les souches deviennent-elles plus sensibles? Quel est le pourcentage de résistance selon les antibiotiques? Quel antibiotique peut-on utiliser en première intention en attendant l antibiogramme? Antibiogramme est-il toujours utile? Dans les méningites à Pneumocoque, traitement Vanco et Céfotaxime ou ceftriaxone : intérêt de la CMI

18 Epidémiologie Suivi au niveau des sérotypes : Efficacité de la vaccination chez les enfants et les adultes : diminution des infections? Diminution des sérotypes «résistants» présents dans le vaccin? Apparition de nouveaux sérotypes Modification des prochains vaccins en termes de valences Couverture vaccinale Acteurs de la surveillance épidémiologique CNRP ( Dr Emmanuelle Varon et Pr Laurent Gutmann) ORP regroupant 22 observatoires et 403 laboratoires surveillant les souches isolées de LCR, hémocultures et OMA Différentes surveillances ponctuelles ou ciblées : Activ, méningites pédiatriques 18

19 Données épidémiologiques régionales ORP Arc Alpin 2005 Poster RICAI

20 Participants Arc Alpin Treize centres : 12 hospitaliers et un LAM Annecy, Annemasse, Briançon, Chambéry, Gap, Grenoble, Meylan, Montélimar, Romans, Sallanches, Thonon, Valence, Voiron Souches étudiées des différents centres participants à l ORP - Arc Alpin 70 Graphe 1 : Nombre de souches par centre Annecy Annemasse Briançon Chambéry Gap Grenoble Meylan Montélimar Romans Sallanches Valence Voiron Thonon 20

21 ORP Arc Alpin 2005 ORP Arc Alpin

22 ORP Arc Alpin ORP Arc Alpin

23 ORP Arc Alpin 2005 ORP Arc Alpin

24 Données épidémiologiques nationales CNRP-ORP 2005 CNRP ORP

25 CNRP ORP PSDP Hémocultures 25

26 CNRP ORP 2005 Hémocultures CNRP ORP 2005 Hémocultures et pénicilline 26

27 Méningites CNRP ORP 2005 Méningites évolution 27

28 CNRP ORP 2005 Méningites CNRP ORP 2005 Activité des antibiotiques 28

29 CNRP ORP 2005 Sérotypes et résistance à la pénicilline Sérotypes 29

30 CNRP ORP 2005 Sérotypes et méningites CNRP ORP 2005 Protection vaccinale 30

31 CNRP ORP 2005 CNRP ORP

32 Comparaison entre régions 32

33 Epidémiologie Europe EARSS

34 34

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