Programme AKER : L innovation compétitive

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1 Programme AKER : L innovation compétitive Présentation AKER en bref Décembre 2015 Financé par Titre présentation Date - confidentiel

2 Le programme AKER en bref AKER vise à améliorer la compétitivité de la betterave à l horizon 2020 en doublant le rythme de croissance annuelle de son rendement en sucre/hectare (4 % vs 2 %) AKER s inscrit dans le Programme d Investissements d Avenir ; il est porté par 11 partenaires publics et privés représentant l ensemble de la filière betterave française AKER est un programme original et innovant qui concerne à la fois la recherche, le développement et la formation ; il confirme la betterave comme plante et filière de référence

3 Pour aller plus loin dans AKER AKER a mis en évidence la totalité de la diversité génétique de la betterave sur la base de 15 plantes sélectionnées AKER développe une nouvelle approche de la sélection qui place le génotypage (analyse de la composition génétique) avant le phénotypage (évaluation des caractères) AKER utilise une nouvelle méthode de sélection (génomique) qui s appuie sur l ADN des plantes et de nouvelles techniques de sélection (marquage, lecture du génome) AKER gère un grand nombre de données (bio-informatique) pour faire de la prédiction AKER utilise des technologies (imagerie, robotique) en provenance d autres secteurs (physique, médecine) AKER ne s intéresse pas uniquement au rendement de le betterave, mais à toutes ses composantes, dans le respect de l environnement AKER est à la fois un programme de recherche, de développement et d enseignement. Il contribue à assurer le renouvellement des chercheurs

4 Un consortium associant 11 organismes publics et privés INRA, Direction Scientifique «Agriculture» INRA, LIPM (Interactions Plantes Microorganismes), Toulouse INRA, URGI (Génomique et bio-informatique), Versailles INRA, Physiologie Moléculaire des Semences, Angers Université d Angers, LARIS IRSTEA, Montpellier GEVES, Angers Agrocampus Ouest, Rennes Université de Lille 1 Institut Technique de la Betterave Florimond Desprez 80 chercheurs durant 8 ans

5 Schéma général du programme AKER Matériel élite X Banques de Gènes (10.000) Ressources triées (3.000) Collections de Référence (15) (15) Populations sources 200 individus Nouveau Matériel Commercial

6 Elargir la variabilité génétique de la betterave Carte des accessions disponibles Environ accessions existantes/ sélectionnées/15 retenues

7 Le génotypage (analyse de la composition génétique) Le génotypage permet : d analyser les différences de composition génétique entre les individus d une même espèce d associer pour un gène donné l ensemble des différentes versions possibles (allèles) de cartographier les gènes grâce à ces différentes versions par des marqueurs génétiques de comparer les espèces entre elles et la conservation ou l évolution des gènes et de leur fonction

8 Le phénotypage (évaluation des caractères) Le phénotypage consiste en l étude des caractères ou phénotypes Le phénotype est le résultat de l interaction du génotype avec l environnement Grâce au phénotypage, on évalue les individus dans un environnement donné Le phénotypage haut débit permet d analyser un grand nombre d individus dans un environnement donné, mais aussi indirectement dans différentes conditions environnementales

9 Un défi : le traitement de l information Génotypage et phénotypage conduisent à augmenter le nombre de données produites qu il faut stocker et analyser Connecter les informations sur les génotypes et les phénotypes Intégrer la prise en compte des interactions génotype x environnement dans le traitement des données

10 Un programme en 7 modules WP1: Gouvernance du projet WP3: Séquençage et développement de marqueurs pour le génotypage WP2: Caractérisation WP2: et exploitation de la diversité naturelle WP5: Intégration de nouvelles stratégies de sélection WP4: WP4: Evaluation Field and des génotypes controlled au conditions champ et en evaluation conditions of contrôlées genotype WP6: Bioinformatics WP6: Bioinformatique data integration WP7: WP7: Dissémination Results dissemination des résultats

11 Un programme long terme sur 8 ans et au-delà Collection de ressources génétiques (10 000) Obtention de la collection de référence (15) X Introgression de la variabilité de la collection de référence dans du matériel élite Obtention et multiplication des populations sources (15 x 200) Analyse des populations sources Sélection de nouvelles variétés post AKER

12 Une organisation structurée Comité de Projet Stratégique Comité Interprofessionnel Comité Pédagogique Bureau Comité de Coordination Comité Scientifique International WP 1 WP 2 WP 3 WP 4 WP 5 WP 6 WP 7

13 Un budget conséquent de 18,5 M 26 % Florimond Desprez Institut technique Recherche publique 16 % 58 % Total : 18,5 M dont 5 M d aides de l Etat

14 Pour améliorer la compétitivité de la betterave vs la canne

15 2013 l année de la sélection des plantes de référence Karine Henry, leader du WP2 : «Les 15 accessions couvrent 100 % de la variabilité» Récolte de accessions en provenance de 46 banques de gènes Sélection de 15 accessions à partir de l analyse de la diversité Croisements en cours avec le matériel élite

16 2014 l année du phénotypage des semences et des plantules Carolyne Dürr, coordinatrice des travaux d AKER sur les semences : «Tout commence avec la semence, concentré de technologies, véhicule du progrès» Des outils d imagerie pour traiter l information issue du phénotypage En vue de caractériser, en 2018 et 2019, les génotypes étudiés Pour créer de nouvelles variétés

17 2015 l année de l information génomique «Générer, stocker, valoriser les données du programme AKER» Séquençage et marquage moléculaire Traitement de l information génomique Mise en place du système d information 17

18 Merci pour votre intérêt Financé par Soutenu par Partenaires 18