ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE

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2 ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE Baron Sandrine 1, Le Bouquin Sophie 2, Tocqueville Aurélien 3, Jouy Eric 1, Levadoux Marine 4, Gaumé Matthieu 3, Larvor Emeline 1,3, Sanders Pascal 5, David Julie 6, Chauvin Claire 6, Kempf Isabelle 1 ANSES, Ploufragan - 1 Unité Mycoplasmologie Bactériologie ; 2 Unité Épidémiologie et bien-être en aviculture et cuniculture; 6 Unité Épidémiologie et bien-être porcin 3 ITAVI, Service Technique Aquaculture 4 CIPA, Paris 5 ANSES, Fougères - Laboratoire

3 600 PISCICULTURES T/an 3 grandes régions productrices Aquitaine Bretagne Nord/Picardie Une production majoritaire Truite arc-en-ciel

4 ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UN ARSENAL THÉRAPEUTIQUE RESTREINT 5 molécules avec AMM : Oxytétracycline, Florfénicol, Association triméthoprime/sulfamide, Fluméquine, Acide oxolinique Recours à la cascade

5 ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UNE FILIÈRE PARTICULIÈRE Elevage en lien direct avec l environnement Dépendant de la qualité de l eau en amont Contrainte de débit Dissémination de l antibiorésistance en milieu aquatique plus rapide qu en milieu terrestre Peu de données disponibles au niveau national sur la présence de bactéries résistantes Bactéries résistantes absentes Des paramètres de qualité des eaux, Pas de plan de surveillance systématique.

6 ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE : PROJETS EN COURS ET FUTURS Suivi des pratiques et usage des antibiotiques ANPI ( ) Dissémination de l antibiorésistance en milieu aquatique AQUARES ( ) Présence de bactéries résistantes dans la flore commensale & pathogène du poisson ( ) Effort & Flor-Co Antibio-Fish

7 ANPI : ETUDE QUANTITATIVE ET QUALITATIVE DE L UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES EN PISCICULTURE Service Technique Aquaculture PARTENAIRES GDS FINANCEMENT Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l antibiorésistance Mesure 35 : Mettre en place des enquêtes régulières sur des échantillons représentatifs de vétérinaires et d éleveurs et étendre les enquêtes de pharmaco-épidémiologie à toutes les filières

8 ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE Travaux sur l usage dans les autres filières (porcine, avicole, cunicole, vitellière ) En pisciculture : quelques données au niveau national, des estimations par l ANMV Données ANMV (suivi des ventes) Recensement en salmoniculture 1997 & 2007

9 SUIVI DES VENTES DE MEDICAMENTS (ANMV) Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de matière active et en quantité de matière active par kilogramme animal Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de poids vif traité (ACDkg) et en indicateur du niveau d exposition ALEA et en quantité de matière active par kilogramme animal

10 RECENSEMENT 2007 VS 1997 EN SALMONICULTURE

11 Une filière peu exposée ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE Une filière peu consommatrice d ATB critiques pour la santé humaine : C3G & C4G : non utilisées Fluoroquinolones & macrolides : peu utilisés Mais peu de données disponibles et pas d éléments sur la variabilité et les facteurs associés étude ponctuelle réalisée en élevage

12 OBJECTIFS ANPI Estimer les quantités utilisées Par famille, molécule Par voie d administration Variabilité des quantités entre élevages Analyse des usages Motifs d utilisation Facteurs associés Analyse de la variabilité des usages en relation avec les pratiques d élevage et le niveau sanitaire

13 SCHÉMA D ÉTUDE Population cible : salmoniculture continentale (75% des piscicultures) Un échantillon représentatif d élevages 100 élevages tirés au sort dans la base de données nationale effectif proportionnel au nb d élevages/région Production > 2T/an 13

14 LA PROCÉDURE D ENQUÊTE Tirage au sort des élevages Prise de contact ( courrier d info + téléphone) Enquête en élevage : questionnaire complété par interrogation de l éleveur, consultation de documents et relevés d informations (inspiré d Aquares) Recueil d éléments complémentaires auprès des structures (si accord de l éleveur et des structures) année 2013 Un traitement anonyme des données 14

15 AQUARES : Etude pilote sur la présence de bactéries résistantes en amont et en aval des piscicultures dans l hydro-écorégion Normandie/Bretagne Service Technique Aquaculture PARTENAIRES GDS FINANCEMENT Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l antibiorésistance Mesure 37 : Examiner l impact de l utilisation des antibiotiques dans l environnement des élevages

16 OBJECTIFS 1. Obtenir une sélection pertinente d indicateurs de la dissémination de l antibiorésistance, 2. Définir une méthodologie analytique et d échantillonnage, 3. Mettre au point des outils épidémio (questionnaire en élevage, modalités de collecte des données d usage ) ANPI BOITE À OUTILS

17 Volontariat CHOIX DE 20 PISCICULTURES de TRUITES ARC EN CIEL Localisation : Bretagne et Normandie Type de production, Position sur le bassin-versant, Présence d autres activités en amont (Station d Epuration, Elevages terrestres ) 17

18 2 visites par élevage ECHANTILLONNAGE hiver : février/mars & Eté : juin/juillet 2014 Questionnaires + Prélèvements EAU / SEDIMENT BIOFILM EAU/SEDIMENT AMONT PISCICULTURE AVAL 18

19 RECUEIL DE DONNEES / ANALYSES Questionnaires épidémiologiques (Anpi) Paramètres de terrain : ph, Température, Salinité, Débit, Oxygène dissous Caractérisation du Bassin Versant Analyses microbiologiques % de bactéries résistantes Détection et origine de la contamination fécale Détection/quantification des gènes de résistances Caractérisation de la sensibilité aux ATB des isolats collectés

20 CHOIX DES «ESPECES» BACTERIENNES & DES ATB Aeromonas Enterococcus B H E. coli Cyclines Tétracycline Tétracycline Tétracycline Macrolides Quinolones Acide Oxolinique Erythromycine Acide Oxolinique Phénicolés Florfénicol Florfénicol Β-lactamines Céfotaxime Amoxicilline Céfotaxime Aminosides Glycopeptides Triméthoprime Sulfamides Gentamicine Triméthoprime Sulfaméthoxazole (SXT) Vancomycine SXT

21 DETERMINATION DU % de BACTERIES RESISTANTES Ensemencement de milieux sans ATB et avec ATB GSP : Aeromonas spp TSA Bact. Hétérotrophes ECB E. coli Slanetz Enterococcus spp Conservation d isolats bactériens Constitution d un souchier

22 METHODES MOLECULAIRES Gènes de résistance : Détection Quantification svt-biologie-premiere.bacdefrancais.net Contamination fécale : présence/absence origine : humaine, élevage terrestre (porc )

23 ETAT D AVANCEMENT Les deux campagnes de prélèvements sont achevées (collecte des paramètres de terrain) Questionnaires épidémiologiques complétés Constitution d une collection d isolats Aeromonas (1500 isolats) Enterococcus (1200 isolats) E. coli (250 isolats) Ratio R/S en amont/aval pour l ensemble des piscicultures échantillonnées Caractérisation des isolats en cours

24 Remerciements aux Eleveurs qui ont accepté de participer à ces études Vétérinaires aquacoles & ssssssss GDS aquacoles MERCI DE VOTRE ATTENTION