Entrepôt de données Biomédical - CHU de Bordeaux

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1 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données Entrepôt de données Biomédical - CHU de Bordeaux Service d information médicale, Pôle de santé Publique, CHU de Bordeaux Vianney Jouhet, Frantz Thiessard, Moufid Hajjar, Véronique Gilleron, Florence Saillour-Glenisson, Rachid Salmi, Geneviève Chêne 07/10/2013

2 Utilisation secondaire des données biomédicales Enjeu important reconnu Nombreux travaux Recherche clinique et Epidémiologie (EHR4CR EURECA Linked2Safety) Vigilances (ALADIN-DTH SALUS) Usage éthique et légal 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 2

3 Besoins identifiés au CHU de Bordeaux Repérage des patients Phénotypage Détection d évènements indésirables Suivie de cohorte Pre-screening et aide à l inclusion pour la recherche clinique EPP et Qualité de prise en charge 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 3

4 Interrogation transversale du système d information Infection du site opératoire (ISO) Acte chirurgical Bactériologie positive dans les 30 jours ou diagnostic clinique de l infection Phénotypage Polyarthrites rhumatoïdes avec nodules rhumatoïdes Nouveaux cas de cancer pris en charge au CHU 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 4

5 Usage actuel des données Infocentre / Outil décisionnel (BO) Direction du Système d Information Pilotage Analyse de Données Difficultés liées au dossier patient informatisé (DPI) Optimisé pour la saisie Temps de réponse Structure en silo Risque de ne pas retrouver certaines informations Structure complexe Où rechercher l information? Hétérogénéité sémantique 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 5

6 Hétérogénéité sémantique M06.4 Ce patient présente depuis 5 ans une polyarthrite rhumatoïde. On note la présence de nodules rhumatoïdes. Il n y a pas de syndrome sec associé 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 6

7 Algorithmes complexes Nombre de nouveaux cas de cancer au CHU Détection d évènements indésirables Nombreuses sources Non exhaustives Données bruitées Mise en œuvre très délicate avec les outils actuels 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 7

8 Enjeux : Qualité des données Production Représentation Accessibilité Représentation Description des données du SIH Intégration sémantique Terminologies de référence Hiérarchisation de l information 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 8

9 Enjeux : Qualité des données Production Représentation Accessibilité Accessibilité Utilisateurs cliniciens / chercheurs Traitements automatisés Consolidation Agrégation Détection 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 9

10 Projet - Entrepôt de données SIH CHU de bordeaux Transform Extract ETL Load Entrepôt Interfaces Algorithmes Extractions 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 10

11 Entrepôt de données Intégration Sémantique Terminologies de référence Structuration de la représentation 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 11

12 Finalité Valorisation des données du CHU Pre-screening / Faisabilité d études Aide à l inclusion Recherche clinique Cohortes Algorithmes complexes de détection Vigilances / Coordination des prélèvements / Autres : 3C, Qualité (EPP, analyse de prise en charge, ) Autonomie des cliniciens / chercheurs Ergonomie des outils (orientés métiers) Sécurité 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 12

13 Avancement Objectif ajouté au Contrat du Pôle de Santé Publique Etat des lieux (DSI PAD) Partage d expérience Environnement actuel Présentation de l infocentre Présentation Ravel / Entrepôt de données (SIM - ERIAS) Anonymisation Extraction des données Echange avec le CHU de Rennes Connecteurs et scripts d extractions Réplication de base de données Intégration sémantique (Pôle de biologie) Analyse des terminologies d interface de biologie Alignement vers un référentiel sémantique (LOINC) 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 13

14 Conclusion Qualité des données Représentation et accessibilité Processus de consolidation et d agrégation Partage d information Plateforme territorial de partage Standardisation de l information Sémantique Lien avec les CRB Bio-banques, tumorothèques, données omiques Utilisation conjointe avec les données clinique issues du DPI Recherche translationnelle Masse critique pour les maladies rares 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé Entrepôt de données 14