Plateforme IMPACT PROTOCOLE D'ACCÈS

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1 PROTOCOLE D'ACCÈS 1. Gestion du matériel Le matériel de la plate-forme est utilisable par ou sous contrôle de l ingénieur responsable. Les équipements sont situés dans les locaux de la plate-forme Site de l UFR Sciences et techniques Laboratoire de Biotechnologie au sein de l UMR CNRS 6204 «Biotechnologie, Biocatalyse et Biorégulation», Faculté des Sciences et Techniques, 2 rue de la Houssinière, Nantes CEDEX 3 Responsable : Pierre WEIGEL Tél Pierre.weigel@univ-nantes.fr Responsable Technique : Cathy CHARLIER, Ingénieur d études Tél Fax : cathy.charlier@univ-nantes.fr Equipement Spotteur GMS 417 (Aviso) Spotteur SciFlexArrayer S3 (Scienion) Scanner ScanArrayGx (PerkinElmer) Scanner : Odyssey (Li-Cor) Protein Array Workstation (PerkinElmer) Bioanalyseur 2100 (Agilent Technolgies) Biorobot 3000 (Qiagen) TissueLyser (Qiagen) Spectropolarimètre 810 (Jasco) Spectrofluorimètre FP 6500 (Jasco) Spectrophotomètre UV/Vis V-530 (Jasco) Photomètre de polarisation de fluorescence FP-715 (Jasco) Microcalorimètre ITC200 (MicroCal) Site du Centre de Recherche en Cancérologie (CRCNA) INSERM UMR892, Institut de biologie 9, Quai Moncousu NANTES Responsable : Yannick JACQUES Directeur de recherche, INSERM UMR892 Tél Fax : yjacques@nantes.inserm.fr Responsables techniques Mike MAILLASSON, Ingénieur d études Tél Fax : mike.maillasson@univ-nantes.frnantes.fr Fabien GAUTIER, Ingénieur de recherche, Tél Fax : fabien.gautier@univ-nantes.frnantes.fr Equipement BIACore 2000 (GE healthcare) BIAcore 3000 (GE healthcare) MiThras LB940 (BERHOLD) avec chaîne automatisée Synthétiseur de peptides (INTAVIS) PAGE 1 sur 7

2 a. Matériel et équipement accessible en «libre service» après formation : Utilisation du scanner Odyssey Application des avantages de la détection dans l IR lointain (grande sensibilité, bruit de fond très faible ) à des analyses courantes (Western blot, Gel shift ) Réalisation de puces Agilent Utilisation du TissueLyser Marquage de biomolécules (protéines, AC, ligand ) Approches biophysiques pour l étude des interactions biomoléculaires: Utilisation du spectropolarimètre J810 (Dichroïsme Circulaire et linéaire, Jasco), du spectrofluorimètre, FP 6500 (Jasco), du spectrophotomètre UV/Vis V-530 (Jasco), du photomètre de polarisation de fluorescence FP 715 (Jasco) b. Matériel utilisable uniquement par les ingénieurs responsables : Spotteur GMS 417 (Aviso) Scanner ScanArrayGx (PerkinElmer) Protein Array Workstation (PerkinElmer) Bioanalyseur 2100 (Agilent Technolgies) Biorobot 3000 (Qiagen) BIAcore 2000 (GE healthcare) BIAcore 3000 (GE healthcare) MiThras LB940 (BERHOLD) avec chaîne automatisée Synthétiseur de peptides (INTAVIS) Microcalorimètre ITC200 (MicroCal) PAGE 2 sur 7

3 2. Réglementation de l accès Rendez-vous de faisabilité Définition avec l équipe demandeuse de la stratégie, des objectifs du projet et du type de prestation Accès à la plateforme Les équipes extérieures accèdent à la plateforme dans la limite de 50 % de son activité annuelle (réservation en ligne ou par téléphone) La gestion financière de la plate forme est assurée par la société CAPACITÉS, filiale de l'université de Nantes (facturation, devis ). Type de Prestations : 1. Activités R&D Projet collaboratif Rendez-vous de faisabilité Phase préliminaire et Phase de conception, de préparation et de réalisation des puces à protéines, des expérimentations BRET/HTRF ou des développements ents BIAcore Analyse des paramètres d interactions des partenaires identifiés, 2. Activités d expertise Conseils, formation et/ou réalisation partielle* ou totale* des différentes étapes de la technologie «puces à protéines» Approches biophysique* pour l étude des interactions biomoléculaires 3. Prestations «libre service» Accès ponctuel à certains équipements 4. Développement technologique a. Conditions d accès Les technologies sont accessibles à toutes équipes de recherche membres du réseau Biogenouest et plus largement à toutes équipes de recherche (secteur publique ou privé) désireuse d une prestation technologique. b. Modalités d accès Pour accéder aux services de la plate-forme, il est nécessaire de contacter les responsables de la plate-forme afin de mettre au point la stratégie expérimentale et de réserver un créneau de manipulation (possibilité de réservation de créneau en ligne pour le matériel «libre service» et pour les personnes formées). 3. Aspects organisationnels a. Utilisation des appareils PAGE 3 sur 7

4 Les ingénieurs de la plate-formfonctionnement dépend de leur responsabilité. étant les uniques utilisateurs des appareils, le bon b. Conditions pour les utilisateurs Trois possibilités sont offertes pour accéder à la plate-forme «Interactome et puces à protéines» 1. Les consommables courants et spécifiques peuvent être fournis aux utilisateurs à la demande et leur sont alors facturés par la plate-forme. Dans ce cas, les tarifs incluent la quote-part "contrats d'entretien & fonctionnement courant" Consommables types : lames «support» puces à protéines ou puces Biacore, fluorophores, anticorps, protéines, kit d extractions ou de fractionnement, tampons, (tarifs fournis à la demande). 2. Les utilisateurs sont libres d'apporter leurs propres consommables. 3. Dans le cadre d un service pour les utilisateurs, les deux possibilités cités ci-dessus sont conservées en plus d une tarification au prorata du temps machine utilisé et d une tarification de la prestation effectuée par l ingénieur de la plate-forme (tarifs fournis à la demande). Aucune prestation ne sera réalisable sans l'acceptation du protocole d accès (original signé) et sans un bon de commande engagé. Les frais d entretien et de fonctionnement courant du dispositif sont assurés par la plate-forme (contrats d entretien, mises à jour logicielles, fluides, impressions, photocopies ). Ils sont ensuite mutualisés auprès des utilisateurs et facturés au prorata du temps d utilisation des équipements et de l espace de travail et correspondent à la quote-part «contrats d'entretien & fonctionnement courant» c. Définition de la prestation Cocher la prestation retenue Prestations R&D «puces à protéines» Cocher le type d échantillon retenu : Echantillon(s) brut(s) fournis par l équipe demandeuse Echantillon(s) purifié(s) fournis par l équipe demandeuse Le ou les anti-corps fournis par La plate-forme (tarifs sur demande) La ou les lames supports Lames support commerciales ou non (entourer le support retenu) Lames à anticorps commerciales ou non (entourer le support retenu) Fournies par l équipe demandeuse Fournies par la plate-forme (tarifs sur demande) PAGE 4 sur 7

5 Pour tout t projet collaboratif le type de prestations et leur coût sera précisé (devis original signé) Prestations projet collaboratif «puces à protéines»: cocher la (les) prestation(s) retenue(s) Conception (C), Spottage (S), Incubation (I), Lavage (L), Détection (D) Analyse (A) Chaque étape CSILDA correspond un montant forfaitaire (tarifs sur demande). Cocher le type d échantillon retenu : Echantillon(s) brut(s) fournis par l équipe demandeuse Echantillon(s) purifié(s) fournis par l équipe demandeuse Le marquage de l échantillon Réalisé par l équipe demandeuse Réalisé par la plate-forme (tarifs sur demande) Le ou les anti-corps fournis par La plate-forme (tarifs sur demande) Le ou les tampons fournis par La plate-forme (tarifs sur demande) La ou les lames supports Lames support commerciales ou non (entourer le support retenu) Lames à anticorps commerciales ou non (entourer le support retenu) Fournies par l équipe demandeuse Fournies par la plate-forme (tarifs sur demande) Prestations projet collaboratif «approches biophysiques pour l étude des interactions biomoléculaires»:: cocher la (les) prestation(s) retenue(s) Spectropolarimètre J810 (Jasco) (tarifs sur demande) Spectrofluorimètre, FP 6500 (Jasco) (tarifs sur demande) Spectrophotomètre UV/Vis Jasco V-530 (Jasco) (tarifs sur demande) Photomètre de polarisation de fluorescence FP-715 (Jasco) (tarifs sur demande) TissueLyser (Qiagen) (tarifs sur demande) Microcalorimètre ITC200DC (MicroCal) (tarifs sur demande) BIACore 2000 (GE healthcare) (tarifs sur demande) BIAcore 3000 (GE healthcare) (tarifs sur demande) MiThras LB940 (BERHOLD) (tarifs sur demande) Synthétiseur de peptides (INTAVIS) Microcalorimètre ITC200 (MicroCal) PAGE 5 sur 7

6 Cocher le type d échantillon retenu : Echantillon(s) brut(s) fournis par l équipe demandeuse Echantillon(s) purifié(s) fournis par l équipe demandeuse La ou les biomolécules sont fournies par : type de bio molécule : La plate-forme (tarifs sur demande) type de bio molécule : Le marquage de la biomolécule Réalisé par l équipe demandeuse Réalisé par la plate-forme (tarifs sur demande) Le ou les tampons sont fournis par La plate-forme (tarifs sur demande) Prestations «Libre service» Les tarifs sont calculés en fonction du temps «personnel» et du temps machine engagés (tarifs horaires sur demande) Utilisation du scanner Odyssey (tarifs sur demande) Application des avantages de la détection dans l IR lointain (grande sensibilité, bruit de fond très faible ) à des analyses courantes (Western blot, Gel shift ) Réalisation de puces Agilent (tarifs sur demande) Utilisation du TissueLyser (tarifs sur demande) Marquage de biomolécules (protéines, AC, ligand ) (tarifs sur demande) L ingénieur de la plate-forme étant l unique utilisateur des appareils, le bon fonctionnement dépend de sa responsabilité (tarifs sur demande) Prestations offertes en fonction du temps «personnel» et du temps machine disponible d. Gestions de résultats Dans le cadre des prestations collaboratives (R&D et prestations de services) et dans un souci de valorisation de Biogenouest et des organismes ayant participé au financement de la plate- forme (équipement, infrastructure, personnel et fonctionnement courant), il est convenu que sera mentionné dans toute publication, communication écrite ou orale, utilisant les données obtenues: PAGE 6 sur 7

7 Plate-forme IMPACT - Biogenouest, Laboratoire de Biotechnologie, UMR CNRS 6204 Université de Nantes. Ou INSERM UMR892 - Site du Centre de Recherche en Cancérologie (CRCNA) Institut de biologie Dans le cas où des travaux ont nécessité l'implication technique et intellectuelle d'un ou plusieurs personnels de la plate-forme (autre que pour des conseils), ces derniers et le responsable sur site de la plate-forme devront apparaître au nombre des auteurs des publications, communications écrites ou orales utilisant les données obtenues, et ceci à hauteur de l'implication des ce(s) personnel(s). En cas de litige, le responsable sur site de la plate-forme est le seul habilité à décider du degré d'implication effective des personnels sous sa responsabilité dans des travaux de recherche. La plateforme offre l ensemble de ses technologies et de ses compétences aux équipes académiques ou privées* accueillies. 4. Hygiène et sécurité Les consignes usuelles de laboratoire doivent être respectées. Il est de plus souhaitable que l utilisateur se renseigne auprès du responsable technique pour les consignes particulières. Je reconnais avoir pris connaissance des conditions d utilisation de la plate-forme Interactome et Puces à Protéines et déclare accepter les termes de la présente convention. Nom/prénom : Qualité : Laboratoire : Fait à, le. PAGE 7 sur 7