IMPORTATION DE FICHIERS
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- Roger Bouffard
- il y a 5 ans
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1 IMPORTATION DE FICHIERS SURVEILLANCE DES INTERVENTIONS PRIORITAIRES Il s agit ici de détailler l importation de données externes, issues du PMSI ou autre système d information, au sein de l application. Cette manipulation ne concerne pas les établissements ayant saisi leurs données en ligne. Trame du fichier.csv à importer dans la base de données WEBISO RAISIN Les pages 3 et 4 détaillent le fichier de 43 colonnes à créer pour chaque service. - en respectant impérativement l ordre des champs/variables ; - en respectant impérativement le format de chaque variable. Si votre fichier initial est un fichier Excel, vérifiez bien que les colonnes attendues au format numérique sont effectivement au format numérique et non pas stockées en format texte. Le petit triangle vert qui apparaît à droite d une cellule signifie valeur stocké au format Texte. S il apparaît, sélectionnez l ensemble des cellules concernées (pas la colonne), cliquez sur le point d'exclamation et ensuite sélectionnez au sein de la liste déroulante proposée "Convertir en nombre". N omettez pas de renseigner les variables Type de surveillance et Existence d une procédure de suivi à J30 (valeur unique=invariante à répéter) Si vous n avez pas les renseignements concernant une variable, créez tout de même la colonne avec son libellé. Données manquantes, veuillez compléter : - avec le codage correspondant à «Inconnu» si existant, - si vous n avez pas de date de dernier contact : - en l absence d infection, entrez la date de sortie - avec ISO, entrez la date de l infection survenue post sortie Les variables mentionnées «Générée par l application» seront calculées automatiquement dans WEBISO RAISIN dont le score NNIS (variable NNISS), à ne pas compléter donc. Vérifiez que les codes RAISIN et les codes CCAM sont bien inclus au sein de la méthodologie Vérifiez le format Date : le format attendu est JJ/MM/YYYY Effectuez des contrôles sur validité (période de surveillance) ET sur la cohérence entre les différentes dates Si votre fichier initial est au format Excel, enregistrez ce dernier au format attendu.csv. en ayant préalablement sélectionnées les données.
2 Importation du fichier.csv dans la base de données WEBISO RAISIN Cette manipulation est également détaillée au sein du guide d utilisation de l application. Connectez-vous à l application WEB ISO RAISIN, Sélectionnez l année de la surveillance, Sélectionnez votre établissement dans la liste des établissements proposés, Cliquez sur le lien «Importation de fichiers» Sélectionnez votre fichier à envoyer en format.csv Puis cliquez sur «Importation des fichiers» La personne en charge de la surveillance est alors informée de votre manipulation par mail automatisé. Elle doit alors procéder à des vérifications de la structure du fichier et de son contenu. Si des erreurs/données manquantes sont listées, le référent en est informé par mail. Le premier fichier importé est supprimé dans l attente d une autre importation qui fera de même l objet de contrôles, et si besoin de demandes de corrections/compléments Seulement à réception d un fichier propre vos données sont injectées au sein de l application WEB, le référent en est informé par mail. Après un certain délai, vos données sont accessibles via l application pour consultation, ajouts, modifications, exploitation et validation. Les données ainsi injectées doivent être validées par vous-mêmes au plus tard le 01/11/2016 mais attention = en période de vacances scolaires donc de congés potentiellement. L injection au sein de la base de données WEB demandant en amont des manipulations/traitements de la part du CCLIN, ne procédez pas à l importation à la date butoir. L expérience antérieure a en effet montré que des compléments/remaniements de fichiers sont souvent nécessaires. Le référent doit veiller à consulter ses mails et à être réactif dans la période postimportation.
3 Colonne du fichier csv En tête de colonne : nom de variable Structure du fichier à importer dans l application Web ISO Structure modifiée depuis 2015 : 54 variables dont variable IMPLANT obligatoire (colonne 30) A B cclin 5 = CCLIN Sud Ouest (à réécrire sur chaque fiche) 1 region codetab 2 = Guadeloupe, 3 = Aquitaine, 4 = Limousin, 5 = Midi-Pyrénées, 6 = Poitou- Charentes (à réécrire sur chaque fiche) Code anonymat de l établissement / numérique sur 3 caractères (à réécrire sur chaque fiche) D statut Texte : PUB (pour public) - PRI (pour privé) - PSP (pour PSPH) 4 E typetab Texte 3 caractères (cf. thésaurus) 5 F typesurv Coddage= 2 (surveillance des interventions prioritaires) 6 G H codserv specserv! chiffre ou nombre défini par le CCLIN! stocké au format Texte! (à réécrire sur chaque fiche) Texte 3 caractères (ex : pour l'urologie mettre URO, pour l'orthopédie mettre ORT, etc.) (à réécrire sur chaque fiche) I fiche Numérique 1 à N sans doublon 9 J dnais Date Format JJ/MM/AAAA 10 K dadmiss Date Format JJ/MM/AAAA 11 L dsortie Date Format JJ/MM/AAAA 12 M etatsort Numérique 13 N sexe Numérique 14 O age Numérique Générée par l application 15 P dms Numérique Générée par l application 16 Q dcontact Date Format JJ/MM/AAAA 17 R delcont Numérique Générée par l application 18 S dinter Date Format JJ/MM/AAAA 19 T delai Numérique Générée par l application 20 U ccam OBLIGATOIRE - Format alpha numérique (texte ou numérique) 21 V codeinter Format texte (cf. thésaurus code RAISIN) 22 W classecont Numérique 23 X asa Numérique 24 Y dureeinter Numérique 25 Z urgence Numérique 26 AA chircarc Numérique 27 AB coeliochir Numérique 28 AC nniss Numérique Générée par l application 29 AD implant Numérique 30 AE infection Numérique 31 AF valchir Numérique 32 AG dinf Date Format JJ/MM/AAAA 33 AH delinf Numérique Générée par l application 34 AI siteinf Numérique 35 AJ ncas Numérique 36 AK reprise Numérique 37 AL proc_suivi Suivi après la sortie à J 30 Numérique (1 oui, 2 non, 9 inconnu) 38 AM germe1 Format texte (cf. thésaurus)
4 Structure du fichier à importer dans l application Web ISO AN sens1 Numérique (cf.thésaurus) 40 AO germe2 Format texte (cf. thésaurus) 41 AP sens2 Numérique (cf.thésaurus) 42 AQ germe3 Format texte (cf. thésaurus) 43 AR sens3 Numérique (cf.thésaurus) 44 AS hincis Numérique 2 caractères (vide si dureeinter renseignée) 45 AT mincis Numérique 2 caractères (vide si dureeinter renseignée) 46 AU hferm Numérique 2 caractères (vide si dureeinter renseignée) 47 AV mferm Numérique 2 caractères (vide si dureeinter renseignée) 48 AW Modfri Numérique (1 oui, 2 non) 49 AX Poids Numérique 3 caractères (sans virgule ni point car en kilos) 50 AY Taille Numériques 3 caractères (sans virgule ni point car en centimètres) 51 AZ Tabac 1 (<10 cigarettes/jour), 2 ( 10/jour), 3 (Non), 9 (Inconnu) 52 BA Diab 1 (DID), 2 (DNID), 3 (Non), 9 (Inconnu) 53 BB HTA 1 (Oui), 2 (Non), 9 (Inconnu) 54
5 Eléments d aide à la structuration du fichier à importer dans l application Web ISO Fichier CSV* Trame fiche de recueil Nom Variable (N DE COLONNES*) Format et/ou (Codage) et (codage Inconnu) Cclin cclin (1) Numérique valeur unique (5) Region region (2) (2) Guadeloupe, (3) Aquitaine, (4) Limousin, (5) Midi-Pyrénées, (6) Poitou-Charentes Numéro de fiche fiche (9) Numérique 1 à N sans doublon Code établissement codetab (3) Numérique 3 caractères (attribué par le CCLIN) Code Service codserv (7) Numérique 1 à 2 caractères (attribué par le CCLIN) Spécialité du service specserv (8) Texte sur 3 caractères (ex : pour urologie mettre URO, pour orthopédie mettre ORT, etc.) Date de naissance dnais (10) Date au format JJ/MM/AAAA Sexe sexe (14) Numérique : (1) Masculin (2) Féminin Date d'hospitalisation dadmiss (11) Date au format JJ/MM/AAAA Date de sortie dsortie (12) Date au format JJ/MM/AAAA Etat à la sortie etatsort (13) Numérique : (1) Vivant (2) Décédé Date d'intervention dinter (19) Date au format JJ/MM/AAAA Code de l intervention principale codeinter (22) Texte sur 4 caractères (cf. thésaurus*) Code CCAM ccam (21) Alphanumérique /4 lettres + 3 chiffres/ (cf. thésaurus*) Classe de contamination classecont (23) Numérique : (1) (2) (3) (4) (9) Score ASA asa (24) Numérique : (1) (2) (3) (4) (5) (9) Durée d'intervention dureeinter (25) Numérique /en minutes/ (999 si > 1 000Mn) Heure d incision hincis (44) Numérique (vide si dureeinter renseignée) Minutes d incision mincis (45) Numérique (vide si dureeinter renseignée) Heure de fermeture hferm (46) Numérique (vide si dureeinter renseignée) Minutes de fermeture mferm (47) Numérique (vide si dureeinter renseignée) Urgence urgence (26) Numérique : (1), (2), (9) Chirurgie carcinologique chircarc (27) Numérique : (1), (2), (9) Endoscopie chirurgicale coeliochir (28) Numérique : (1), (2), (9) Pose d implant et de prothèse Implant (30) Numérique : (1), (2), (9) Présence d'une infection infection (31) Numérique : (1), (2) Date de l'infection dinf (33) Date au format JJ/MM/AAAA Degré de profondeur de l'infection siteinf (35) Numérique : (1), (2), (3), (9) Validation de l ISO par chirurgien valchir (32) Numérique : (1), (2), (9) Circonstances de diagnostic ncas (36) Numérique : (1) (2) (3) (4) (9) Micro-organisme 1 identifié germe1 (39) Texte sur 6 caractères (cf. thésaurus*) Sensibilité Micro-org. 1 sens1 (40) Numérique (cf. thésaurus*) (9) Micro-organisme 2 identifié germe2 (41) Texte sur 6 caractères (cf. thésaurus*) Sensibilité Micro-org. 2 sens2 (42) Numérique (cf. thésaurus*) (9) Micro-organisme 3 identifié germe3 (43) Texte sur 6 caractères (cf. thésaurus*) Sensibilité Micro-org. 3 sens3 (44) Numérique (cf. thésaurus*) (9) Reprise chirurgicale pour cette ISO reprise (37) Numérique : (1) (2) (9) Suivi après la sortie jusqu à J30 proc_suivi (38) Numérique : (1) (2) Date du dernier contact dcontact (17) Date au format JJ/MM/AAAA (date de sortie) Module Facteurs de risque modfri (49) Numérique : (1) (2) Poids poids (50) Numérique (3 caractères maximim) Taille taille (51) Numérique (3 caractères maximim) Tabac tabac (52) Numérique : (1), (2), (3), (9) Diabète diab (53) Numérique : (1), (2), (9) HTA hta (54) Numérique : (1), (2), (9)
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