NOMENCLATURE ET CLASSIFICATIONS

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François-Xavier Baril
il y a 7 ans
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1 I DÉFINITIONS NOMENCLATURE ET CLASSIFICATIONS la systématique = la taxinomie a pour objet la description et le groupement d êtres en systèmes à partir de divers critères, aboutissant, grâce à une nomenclature aux règles universelles et fixes, à une classification = système hiérarchisé de taxons taxon = classe d êtres rapprochés par des traits communs 3 volets : description, identification une nomenclature une classification Solanum tuberosum ce taxinomiste fait de la taxinomie et aboutit la taxinomie des Solanacées ce systématicien fait de la systématique et aboutit à la systématique des Solanacées

2 II NOMENCLATURE art de nommer des êtres classés 1 Codes Internationaux de Nomenclature CINZ = Code International de Nomenclature Zoologique CINB = Code International de Nomenclature Botanique (CINPC = Code International pour la Nomenclature des Plantes Cultivées) ICNB = Code International de Nomenclature des Bactéries (CINCV = Code International de la Nomenclature et de la Classification des Virus

3 2 Type nomenclatural type : spécimen échantillon secs échantillon dans l alcool préparation microscopique planche d herbier herbier : collection de spécimens herbier : établissement gastéropodes Bordeaux 1 ostéothèque de Pessac serpents Bordeaux Segalen au CCCM diatomées JB Bordeaux Herbier Lyon 1 (4,5 M de planches)

4 3 Nomenclature binominale ou binaire systématisée par Linné en 1753 chez plantes systématisée par Linné en 1758 chez animaux non suivie pour les virus le Chat sauvage : Felis silvestris Schreber, 1775 nom générique : nom spécifique : nom(s) d auteur(s) : Felis silvestris Schreber année de publication 1775 Felis silvestris le Cocaïer : Erythroxylum coca Lam. nom générique : Erythroxylum nom spécifique : coca nom(s) d auteur(s) abrégé : Lam. pour Lamarck Erythroxylum coca

5 III TAXONS 1 Espèce compréhension intuitive critères morphologiques : taille, forme peuvent dépendre de l environnement dimorphisme sexuel polymorphisme : fourmis reines le Faisan de Colchide, Phasianus colchicus castes d ouvrières la Grande Marguerite

6 III TAXONS 1 Espèce critères morphologiques : taille, forme convergences morphologie insuffisante Cactacée Euphorbiacée Apocynacée interfécondité non vérifiable sur fossiles, sur e rares e asexuées hybridation interspécifique chez certaines plantes critères écologiques niches écologiques peuvent se recouvrir autres critères : physiologiques, anatomiques, cytologiques, biochimiques, etc.

7 plusieurs sens au mot espèce! définitions dépendent des connaissances du monde vivant au XVIIIe, Linné est : créationniste : l univers a été créé par Dieu fixiste : fixité des espèces vivantes Linné ( ) une définition possible : ensemble de populations d individus entre lesquels les différences sont faibles et où l interfécondité est possible

8 2 Taxons supraspécifiques rang supérieur à l espèce le genre : e proches entre elles Poa annua L. Pâturin annuel Poa pratensis L. Pâturin des prés la famille : genres proches le genre Felis appartient aux Félidés (m. pl.) le genre Poa appartient aux Poacées (f. pl.) Poa trivialis L. Pâturin commun un ordre : familles proches Les Félidés appartiennent aux Carnivores Les Poacées appartiennent aux Poales

9 Poacées : importante source d énergie Zea mays L., le Maïs Triticum aestivum L., le Blé Oryza sativa L., le Riz Saccharum officinarum L. la Canne à sucre Miscanthus X giganteus le Roseau de Chine

10 3 Taxons infraspécifiques rang inférieur à l espèce sous-espèces : individus isolés subsp. [subspecies] Zea mays L. subsp. mays le Maïs cultivé et 3 autres sous-espèces variétés : individus non isolés var. pour varietas cv. pour variétés cultivées lignées hybrides F1 races : animaux domestiques le Chat domestique : Felis silvestris Schreber, 1775 subsp. catus Linné, 1758 Birman Chartreux Écaille de tortue Persan Siamois

11 IV CLASSIFICATIONS 1 Classifications artificielles choix d un ou plusieurs critères Grecs repris par Romains : plantes, animaux, dieux animaux : sang rouge ou non plantes : arbres, arbustes, sous-arbrisseaux, herbacées Dioscoride : propriétés médicinales Théophraste Renaissance : ordre alphabétique Dioscoride

12 système sexuel de Linné (1764)

13 2 Classifications naturelles 2.1 Avec subordination des caractères famille de Jussieu subordonne, hiérarchise les caractères Antoine Laurent de Jussieu Cuvier

14 2.2 Sans subordination Adanson 2.3 Classifications généalogiques transformisme de Lamarck évolution Adanson Lamarck Wallace, Darwin sélection naturelle sauts évolutifs polyploïdie mutations évènements géologiques catastrophes écologiques Wallace Darwin

15 2.4 Classification phylogénétiques Hennig fonde en 1950 la cladistique glossaire technique complexe généalogie : qui est ancêtre de qui phylogénie : qui est le plus proche parent de qui Hennig

16 importance de la symbiose = association durable de deux organismes vivants chacun des êtres associés est un symbiote ou symbionte ectosymbiose Ex : lichens mésosymbiose Ex : microorganismes du tube digestif chez l Homme, bactéries assurent synthèse de vitamines (B1, B2, B6, K2) endosymbiose : un des symbiotes vit inclus en partie ou totalement dans la cellule de l autre ; on l appelle endosymbiote ou endosymbionte - en partie : pas de perforation de la membrane plasmique = le plasmalemme Ex : endomycorrhizes - totalement : endosymbiose intracellulaire = endocytobiose Margulis en 1960 : origine endosymbiotique des mitochondries des chloroplastes symbiose : un des principaux moteurs de l évolution Margulis

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