L aventure génétique, Le cas du lapin

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Damien Charpentier
il y a 8 ans
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1 Histoire de lapins... Le lapin européen (Oryctolagus Cuniculus) De la Renaissance au XIXème siècle : Des élevages de production apparaissent (Olivier de Serres), les lapins sont élevés en clapier et les races se multiplient avec des croisements raisonnés A partir du XVème siècle : Les grands navigateurs diffusent le lapin dans le monde Moyen Age : Début de la domestication. Les «connins» ou «counils» vivent en garenne close Il fait partie de l ordre des lagomorphes, littéralement «ceux qui ressemblent aux lièvres» Cet ordre se distingue de celui des rongeurs en particulier par l existence d une deuxième paire d incisives à la mâchoire supérieure Il possède : 2 x 22 chromosomes soit 44 chromosomes A la fin du Vème siècle : Le lapin est présent sur tout le territoire de l Empire Romain Originaire d Andalousie, Les fossiles les plus anciens datent de 6M d années XIème siècle avant J.C. : Les Phéniciens découvrent le lapin et nomment l Espagne I-SEPHAN-IM «le pays des lapins» qui deviendra plus tard HISPANIA

multiplient avec des croisements raisonnés A partir du XVème siècle : Les grands navigateurs diffusent le lapin dans le monde Moyen Age : Début de la domestication.

2 Rôle de l INRA dans le schéma national d amélioration génétique 1961 : Début des recherches sur la génétique et la sélection du lapin à l INRA : Création du schéma national d amélioration génétique du lapin Création du progrès génétique Multiplication des reproducteurs améliorés Sélectionneurs (races pures) v Multiplicateurs (Animaux croisés) v Producteurs (lapin de chair) Firmes privées et INRA Firmes, groupements d éleveurs, centre d insémination artificielle Groupements d éleveurs 1970 : Création de la Station d Amélioration Génétique des Animaux et de la Station Expérimentale Lapins à Toulouse v 1972 : Sélection et diffusion des lignées INRA Bâtiment SAGA (INRA Auzeville) Souche A1077 Souche A : Création du pôle expérimental cunicole de Toulouse, arrêt de la diffusion des lignées INRA vers les professionnels, appui scientifique et logistique aux professionnels renforcé Pôle expérimental cunicole INRA Firmes de sélection privées : Grimaud frères, Eurolap, Hycole

croisés) v Producteurs (lapin de chair) Firmes privées et INRA Firmes, groupements d éleveurs, centre d insémination artificielle Groupements d éleveurs 1970 : Création de la Station d Amélioration

3 La sélection c est quoi? Accouplement des reproducteurs Choix des reproducteurs Génération n Génération n+1 Choisir des reproducteurs dans une population à partir d une valeur d index La supériorité des reproducteurs choisis est transmise aux descendants Le progrès génétique se cumule au long des générations Calcul de la valeur d index des candidats A partir des performances des animaux En connaissant les facteurs de milieu d élevage En connaissant le degré de parenté (de ressemblance) des animaux Poids 2,7 2,6 2,3 La performance résulte des effets génétiques et des effets milieux Milieu 1? Gènes 1 Milieu 2? Gènes 2 Animal 1 Animal 2 Classement des individus selon leur index génétique Index Gènes 1 Index Gènes 2

reproducteurs choisis est transmise aux descendants Le progrès génétique se cumule au long des générations Calcul de la valeur d index des candidats A partir des performances des

4 La génomique : Les outils de sélection du futur L aventure génétique, Photothèque INRA Le séquençage complet du génome du lapin a été réalisé en 2009 grâce à une collaboration entre l INRA et le Broad institute (USA) - Le génome est une succession de 4 bases (GCAT) qui constitue le code génétique de chaque individu - La séquence est l ordre d enchaînement de ces bases Les marqueurs génétiques : - Un marqueur est une portion du génome qui est variable selon les individus - La connaissance de la séquence complète permet d identifier des marqueurs Le SNP* est un marqueur qui varie pour une seule base : - Marqueur Animal 1 : TGCTATAGACGTACTGAT - Marqueur Animal 2 : TGCTATAGTCGTACTGAT Plusieurs millions de marqueurs SNP sont présents sur le génome * SNP : Single Nucleotide Polymorphism Génotypage et sélection génomique : - Le génotypage permet de connaître la forme(séquence) du marqueur - La relation entre la forme du marqueur et les performances des animaux est calculée - On sélectionne les animaux qui ont les formes de marqueurs les plus favorables pour les caractères intéressants

génétiques : - Un marqueur est une portion du génome qui est variable selon les individus - La connaissance de la séquence complète permet d identifier des marqueurs Le SNP* est un marqueur qui varie

5 Choix des critères de sélection : L aventure génétique, Une volonté permanente de répondre aux attentes professionnelles et sociétales Les critères de sélection sont les caractères pour lesquels on souhaite une amélioration de la valeur génétique des animaux Les critères sont choisis pour répondre au triple enjeu du développement durable : Rentabilité économique - Augmentation de la productivité - Diminution des coûts de production Respect de l environnement - Diminution des intrants (aliment, énergie, médicaments) - Diminution des rejets (médicaments, effluents) Demande sociale - Qualité des produits - Santé des animaux - Bien être animal - Facilité d élevage Environnement Social Qualité du produit Qualités maternelles Longévité de la femelle Fertilité Résistance aux maladies Prolificité Efficacité alimentaire Critères de sélection pour l amélioration de la valeur génétique Economique Vitesse de croissance

productivité - Diminution des coûts de production Respect de l environnement - Diminution des intrants (aliment, énergie, médicaments) - Diminution des rejets (médicaments, effluents) Demande sociale

6 L aventure génétique, Une grande diversité à préserver 60 races patrimoniales en France, parfois en voie de disparition Papillon anglais 2 à 3,5kg Bélier français 5 à 8 kg Lapin nain 0,6 à 2 kg Fauve de Bourgogne 3 à 5 kg Angora français Face aux souches commerciales, ces races sont un véritable réservoir de gènes aujourd hui inconnus ou non valorisés mais peutêtre précieux pour demain (par exemple résistance naturelle aux maladies ) Pendant 4 ans, les chercheurs ont étudié différentes races domestiques européennes dans un but d inventorier leur diversité génétique, de la caractériser et de la conserver, en collaboration avec les associations d éleveurs, notamment la FFC (Fédération Française de Cuniculiculture). Un nouveau programme international va permettre de poursuivre l étude de la biodiversité du lapin à l aide des outils les plus récents de la génétique moléculaire (marqueurs SNP). Conservation : - Populations vivantes (conservation in situ) : éleveurs sélectionneurs de la FFC - Populations dormantes (conservation ex situ) : cryobanque nationale - 55 populations stockées embryons issus de 1300 lapines Alimentation Agriculture Environnement

exemple résistance naturelle aux maladies ) Pendant 4 ans, les chercheurs ont étudié différentes races domestiques européennes dans un but d inventorier leur diversité génétique, de la caractériser

7 Partenariat scientifique et professionnel : Un schéma cohérent pour la production et le transfert des connaissances Ministère de l Alimentation, de l Agriculture et de la Pêche Ministère de l Enseignement supérieur et de la Recherche Institut Technique de l Aviculture Laboratoires étrangers Italie, Espagne, USA, Australie SYSELAF Sélectionneurs privés FENALAP Fédération des Eleveurs de lapins de chairs Fabricants d aliments Groupements d éleveurs CLIPP Interprofession Lapin de France Tutelles (Ministères) Partenariat scientifique Partenariat professionnel INRA Station d Amélioration Génétique des Animaux TANDEM Nutrition, écosystème digestif Pôle Expérimental LAPINS Physiologie de la Reproduction et du Comportement Laboratoire de Génétique Cellulaire Infectiologie des Animaux et Santé Publique

lapins de chairs Fabricants d aliments Groupements d éleveurs CLIPP Interprofession Lapin de France Tutelles (Ministères) Partenariat scientifique Partenariat professionnel INRA Station d

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