Equilibres microbiens dans les Elevages

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1 Equilibres microbiens dans les Elevages Tech&Bio Juin 2012 Gilles GROSMOND - Vétérinaire HIPPOLAB

2 La vie sur la terre Apparition de l UNIVERS 13,7 Ga Apparition de la TERRE 5 Ga Apparition de la VIE Autoduplication de molécules complexes 3,5 Ga

3 Les microbes de notre planète Virus Bactéries êtres unicellulaires autonomes adaptées à tous les milieux mutations fréquentes total % des microbes parasites intracellulaires obligatoires mutations possibles bactériophages 15% des microbes Champignons unicellulaires autonomes dépendants des substrats 5% des microbes

4 Caractéristiques d une bactérie Paroi classification + sensibilité aux antibiotiques Organites intracellulaires Autonomie Adhésion aux supports Toxines métabolisme de l eau cytotoxicité Multiplication : 1 génération toutes les 20 minutes Plasmides échanges + intégration des informations mutations

5 Relation d une bactérie à son environnement Bactériophages lutte indispensable Autres bactéries : concurrences symbiose Flores - Biofilms Substrat adaptation développement Environnement : Cycles des constituants du vivant : C.H.O.N. Animaux d élevage Notion de flores

6 Places des bactéries dans les élevages Animaux flores intestinales flores cutanées flores pulmonaires Qualité des aliments distribués déjection s Equilibre des litières Compostage Qualité et évolution des productions animales

7 Flore intestinale des animaux Implantation de la flore intestinale naissance animal stérile rôle déterminant de l environnement durée d implantation quelques heures Evolutions de la flore intestinale selon l évolution de l alimentation transitions alimentaires rôle du lest rôle des antibiotiques Déséquilibres des flores intestinales erreurs alimentation pratiques d élevage densité de population mélanges d animaux stress qualité eau d abreuvement

8 Principe généraux des kéfirs Lactobacilles brevis, acidophilus, casei, bulgaris, plantarum, cellobiosus, Streptocoques lactiques lacticus, diacétylactes, cremoris, Leuconostocs Levures Saccharomyces Kluyveromyces Candida Sucre saccharose Lait lactose Maïs amidon

9 Préparation du kéfir de lait 3 jours 2 litres de lait Production 12 litres 3 jours Veau ¼ litre 3 litres / repas colostrum lait à cellules 20 C 5g poudre de Kéfir Pied de cuve 4 litres 3 jours Pied de cuve Fermenteur Litière 500 g de lait kéfiré + 5 litres d eau tiède 200 m 2, 2 à 3 fois / semaine

10 Kéfir et flore intestinale du veau Kéfir flore complexe et équilibre de germes aéro-anaérobies construction sur du lait stabilité même si variations des substrats sécurité d emploi Modalités de distribution au veau utilisation précoce utilisation continue possible importance : 100 ml à 3 litres /repas Usages complémentaires anoblissement des laits à cellules contrôle des flores de litières stabilisation des ensilages

11 Flore intestinale de la génisse laitière Phase lactée pure implantation précoce et entretien flore intestinale techniques de distribution du lait quantité de lait distribuée Transition gouttière œsophagienne fermentations ruminales couverture des besoins de croissance enzymes de digestion du lait Phase polygastrique favoriser la flore cellulolytique couverture des besoins de croissance

12 Equilibre flore du rumen Composition flore du rumen bactéries /ml de jus de rumen bactéries dominantes bactéries cellulolytiques flores complémentaires champignons et protozoaires Conditions d équilibre ph 6,5 faible développement de bactéries amilolytiques et de streptocoques lactiques Précautions fibres efficaces bonne gestion des aliments à risques: ordre de distribution, fréquence de distribution respect des rythmes de digestion progressivité des transitions

13 Equilibre flore de la mamelle Nature et rôle flore cutanée: occupation de la surface cutanée + dégradation du sébum flore intra-mammaire : lactocoques et lactobacilles flores de contamination : butyriques, salmonelles, colibacilles, strepto et staphylocoques Raisons des déséquilibres de flore qualité du couchage nature des produits appliqués sur la mamelle au cours de la traite usage des antibiotiques au tarissement ambiance bâtiment : ventilation, fréquence des raclages équilibres alimentaires

14 Kéfir et flore intestinale des volailles Bilan flore intestinale du poussin désinfections des œufs dans les couveuses contact après naissance : manipulations variées emballages véhicules de transport Kéfir de maïs kéfir sur sucre 80g sucre + 2 litres d eau + 5 g poudre kéfir kéfir de maïs maïs concassé + milieu liquide contenant les germes revivifiés de kéfir Distribution maïs kéfiré jus de fermentation boisson de J1 quelques grains fermentés /poussin /jour idem porcelet au sevrage

15 Equilibre microbien des litières Paille Litière brillante terne saine contaminée Lactobacilles 10 3 /g Lactobacilles 10 2 /g entérobactéries 10 4 /g entérobactéries 10 6 /g moisissures 10 2 /g X 5 X 50 X 100 Lactobacilles 10 6 /g Lactobacilles 10 4 /g

16 Saga colibacillaire en élevage porcin Colibacillose néonatale F5/F41/F6 Diarrhée colibacillaire de sevrage F4 Gastro-entérite hémorragique F4 Maladie de l œdème F18/ Prévention élevage hors-sol vaccins truies désinfection place des chauffages poids de sevrage confort thermique antibiotiques vaccins antibiotiques transition alimentaire formule aliment quantité aliments antibiotiques Prévention élevage bio, pleinair qualité pailles kéfirs chauffage kéfirs transition alimentaire kéfirs fibres kéfirs fibres

17 Choix d Elevage Approche conventionnelle description des déséquilibres pathologiques désinfection outil systématique de gestion des locaux d élevage Approche alternative comprendre les conditions d équilibre et de stabilité des flores prendre en compte les interdépendances des divers espaces de l élevage : sol, plante, bâtiments, aliments, eau, animaux et productions animales rechercher systématiquement la constitution et l entretien de flores complexes et équilibrées

18 Gilles Grosmond