Stratégie des examens complémentaires en Parasitologie-Mycologie. Pr P. Vincendeau. UMR 177 INTERTRYP IRD CIRAD Université de Bordeaux

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1 Stratégie des examens complémentaires en Parasitologie-Mycologie Pr P. Vincendeau UMR 177 INTERTRYP IRD CIRAD Université de Bordeaux

2 I Introduction

3 Causes de mortalité et de morbidité Cardio-vasculaires Infections Cancers Dégénératives Systémiques Traumatiques Métaboliques Génétiques

4 Agents Infectieux Bactéries 538 Agents non conventionnels Agents infectieux 1415 Virus 217 Parasites (Protozoaires 66, Helminthes 287) Arthropodes?? Champignons 307 EUCARYOTES 61% zoonotiques Taylor et al., 2001

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6 Toxocara

7 Levures Candida Cryptococcus Malassezia Pneumocystis jiroveci Champignons Dimorphiques Histoplasma Microsporidies Filamenteux Aspergillus Microsporum Trichophyton

8 Arthropodes

9 Mise en évidence d un agent pathogène Examen direct macroscopie MICROSCOPIE Culture (champignons) Inoculation à un animal Détection acides nucléiques (PCR, PCR temps réel) Détection de molécules (antigène circulant) Spectrométrie de masse Retentissement sur l hôte anémie, thrombopénie, éosinophilie, enzymes musculaires Sérologie IDR

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12 Identification correcte Phase pré-analytique Prélèvement Qualité Localisation Examen des selles trophozoïtes, œufs, kystes, larves, champignons Orientation Importance des renseignements cliniques Diarrhée chez un immunodéprimé (VIH+) Colorations particulières (cryptosporidies, microsporidies) Suspicion d anguillulose (Larves Baermann) Répéter 3 fois ( corticothérapie)

13 Cryptosporidium Ziehl microsporidies Weber

14 Diagnostic anguillulose Séjour zone d endémie Hyperéosinophilie 3 examens de selles par la technique de Baermann Sérologie peu intéressante

15 II Diagnostic d un paludisme

16 Endémie parasitaire majeure, due au parasitisme des hématies par espèces du genre Plasmodium Vecteurs: Anopheles (moustiques) Homme réservoir de parasites Prévalence 2 Milliards, mortalité annuelle <1 million/an. Maladie fébrile, hémolysante, risque majeur accès pernicieux ou neuro-paludisme (encéphalite aiguë Plasmodium falciparum) mortel en l absence de traitement (antipaludéen et réanimation). Toute fièvre en zone d endémie et à son retour doit être suspecte de paludisme. Diagnostic d urgence Résistance aux antipaludéens Plasmodium knowlesi

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19 Anémie Thrombopénie +++, leucopénie, Hémoglobinémie (Hémolyse) Recherche d hématozoaires de Plasmodium (Trophozoïtes ; éventuellement schizontes, rosaces) Prioritairement par microscopie sanguine : frottis mince +++ avec parasitémie et/ou goutte épaisse+++, Autre méthode rapide : Détection de l antigène HRP2 (histidine rich protein), (NB : Polymerase Chain Reaction (PCR) possible mais pas en routine dans tous les hôpitaux, dans le futur plateformes de diagnostic moléculaire?)

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21 Recherche de l antigène HRP2

22 Formes cliniques Formes symptomatiques forme pseudo-typhique Formes étiologiques Paludisme transfusionnel parasites résistent à 4 C sélection des donneurs de sang (SEROLOGIE) toxicomanes Paludisme des aéroports Formes associées salmonellose une agression peut réveiller un paludisme latent association parasitaire P. falciparum - P. vivax

23 Formes selon le terrain enfant nourrisson convulsions anémie grave, neuropaludisme femme enceinte, grossesse favorise survenue accès palustre, majoration de l'anémie

24 SUIVI

25 III Diagnostic d une infection fongique invasive

26 Circonstances d apparition Patients - Immunodéprimés TERRAIN (oncohématologie, greffes, neutropénie, réanimation, ) - Non immunodéprimés Champignons incriminés - Candida spp - Cryptococcus neoformans - Aspergillus spp - Autres moisissures: Fusarium, Scedosporium spp,

27 Diagnostic Examen direct (Prélèvement, Biopsie) Hémoculture (faible sensibilité) Culture Identification (galerie) (éventuellement antifongigramme) Antigène circulant (galactomannane, mannane, b glucane) Anticorps Détection acides nucléiques (PCR en temps réel) Spectrométrie de masse

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30 Aspergillose invasive A. fumigatus: 84% A. flavus: 4% A. nidulans: 4% A. terreus: 2% autres: 7%

31 Madame L.D., 45 ans, leucémie aiguë myéloïde, allogreffe de moëlle 20/02/13 22/03/13, un syndrome de GVH entraîne mise en route corticothérapie. 25/04/13 elle présente un tableau clinique associant fièvre, toux, dyspnée, qui fait prescrire un traitement antibiotique et pratiquer en plus du bilan standard les examens complémentaires suivants : -TDM thoracique -Recherche de l antigène galactomannane dans le sérum. L antigène galactomannane vérifié est à 0,92. examen microscopique de la culture Le scanner thoracique du LBA pratiqué le 28/04/13

32 Détection Ag galactomannane Faux positif du galactomannane

33 IV Hyperéosinophilie et parasitoses

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35 Obstruction voies biliaires Pancréatite appendicite Occlusion étranglement perforation Maturation des adultes dans l intestin Passage des larves à travers les alvéoles, migration vers la trachée et passage dans l oesophage Œufs non embryonnés dans les selles (2 mois) Ascaris lumbricoides Ingestion des oeufs Eclosion des larves et transport vers le foie Migration vers le cœur, les poumons Syndrome de Loeffler

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37 Parasitoses «autochtones»

38 Parasitoses «tropicales»

39 Bilharziose

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41 mai 2014 Une bilharziose pas si tropicale que cela CAVU CORSE

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43 Devenir des œufs -Excrétés cycle -Dans paroi organe -Emportés vers foie (S. mansoni, S. ja., S. me)

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45 Bilharziose

46 V Prélèvements cutanés

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48 SCABIOSE *Transmission interhumaine principalement vénérienne, enfant à enfant, literie, vêtement *Forme typique : Prurit, surtout au coucher Localisation : Sillon en zigzag 1-2 cm, vésicule perlée antérieure. Lésions grattage, surinfection Prurit «familial» ou «collectif» Recherche parasite vaccinostyle

49 sillons de gale

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51 Nodules scabieux

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53 *Gale hyperkeratosique, croûteuse, norvégienne Sujets âgés, Immunodéprimés très contagieuse (maison de retraite) hyperkératose, Examen squames, présence grand nombre parasites, Surinfections

54 Hyperkératose Sarcoptes ++++ Epaississement de l épiderme Infiltrats de cellules

55 V Conclusion Liaison clinicien-biologiste, renseignements Plusieurs techniques Technique de dépistage Technique de confirmation Étude critique des résultats Laboratoire de référence Optimisation des techniques Nouvelles techniques