La banque de dorank de l'htitut - -de-



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< r La banque de dorank de l'httut de botanque de Strasbourg 27 HENRY BUSSE (), GLLES GRANDJOUAN (Z),%CHELHOFF et PATRCK de RY (1) (3), (1) nsttut de botanqu 28, rue Goethe = 67083 Strasbourg Céda (2) Laboratore de palynologe, USTL Place Eugène Batallon 34060 Montpeller (3) nsttut de botanque, ORSTOM 28, rue Goethe 67083 Strmbowg Céda _ La baque de données que nous avons consttuée 3!'nsttut de botanque de Strasbourg pourrat s'nttuler "BOTANQUE et ECOLOGE",, ~ ~ _ ~Z',> _ ~ : L Elle concerne sx dscplnes, plus ou mons relées entre elles, et pouvant être regroupés en deux ensembles : d'une part, celles qu concernent la Systématque botanque et d'autre part, celles qu concernent la Géographe botanque LA SYSTEMATQUE! BOTANQm Sous ce terme nous avons regroupé la nomenclature botanque, tout au mons sous son aspect de lstes des noms de plantes contenues dans les flores, la geston des herbers (connassance des stocks, entrées et sortes des Cchantllons de prêt, etc ) et enfn, la taxonome numérque qu vse B décrre, comparer et classfer les plantes La nomenclature botanque La banque de données se propose de rassembler tous les nom des plantes, tant des végétaux vasfulares (Dcotylédones, Monocotylédones, Gymnospermes et Cryptogames Vasculares), que des végétaux "nféreurs" (Characées, Bryophytes, Lchens, Algues et Champgnons) Elle recense non! ORSTOM ' Fonds Documentare

2s seulement les noms de référence, mas auss les synonymes, auxquels elle attrbue des numéros dfférents Elle recense également les noms de tous& rangs taxonomques (23 rangs, dont les 7 plus usuels) Les recensements ont concerné en premer leu l'échelle natonale, pus actuellement l'échelle européenne et, dans certans cas, l'échelle mondale La banque a fat l'objet de nombreuses publcatons : une dzane de formulares florstques (4,5,9,10,17,18,20,21,X,28) et deux publcatons méthodologques (1 et 8) Son prncpal attrat, outre son exhaustvté, est de fournr à l'utlsateur, botanste ou documentalsterun numéro unque, smple et non ambgu pour coder le nom des plantes Elle permertra surtout, par le codage de Flora Europaea, qu est en cours, de partcper à l'échange entre banques de données à l'échelle de l'europe ~ La geston des herbers La geston nformatsée des herbers a été envsagée Ces 1975 (6) et a été reprse depus dans le cadre de l'orstom qu a, avec le,muséum L natonal d'hstore naturelle, de gros besons dans ce domane Une publcaton a été fate sous 'égde de 1'ORSTOM (27), d'autres sont en cours _ Descrpton morphologque, comparason et classfcaton des phtes Une chaîne complète de geston et une autre de calculs ont été réalsées depus 1978 Elles permettent, en premer leu, de consttuer les formulares de descrpton (3, 19), l'édton en clar des descrptons facltant leur contrôle, pus la préparaton des données pour les calculs (détermnaton des classes des descrpteurs quanttatfs) En second leu, les calculs vsent à comparer les descrptons Les descrpteurs sont auss ben qualtatfs que quanttatfs ( codés ou mesurés, constants ou fluctuants) Les calculs tennent compte, en outre, des données non observées et des données non défnes ( par pondératon ) Les résultats aboutssent à des clés de détermnaton rédgées en clar, basées sur les caractères les plus dscrmnants séparant les groupes de plantes obtenus par classfcaton 1 y a publcatons de formulares de descrpton, obtenton de résultats nformatques, mas pas de publcaton de ces résultats r t _ 5 LA GEOGRAPHE BOTANQUE Sous ce terme, on regroupe tros dscplnes de la botanque, de plus en plus explcatves sur le plan Ccologque En premer leu, la chorologe ou étude de la répartton des plantes, ensute la phytosocologe, qu étude prncpalement les groupements végétaux, et enfn, l'écologe végétale qu explque, par les vgables ndcamces, la répartton des plantes _ La chorologe Cette étude a été pratquée, par nous, jusqu'à présent, sot àpartr de données phytoécologques, sot à partr de données phytosocologques, mas non encore à partr de données recuelles spécalement pour cela Dans ce but, on pourrat recuellr des lstes florstques d'herborsaton, ou des nventares effectués par quadrat, ou encore des données d'herber Lesrésultats analytques obtenus sont des cartes de répartton d'espèces (envron 3000) : ces résultats ontdonné leu à une publcaton (32) Devant la multplcté de ces cartes on peut souhater une méthode numérque permettant de regrouper les espèces ayant une répartton smlare Une telle synthèse aboutrat à la consttuton d'élémen ts florstques ou groupes de plantes 1 serat auss possble de détermner des terrtores florstques Ce sujet a fat l'objet dune publcaton (13) La phytosocologe Cette dscplne prolonge le rôle explcatf de la phytoécologe En effet, elle apporte nfnment plus d'nformatons, grâce au réseau d'nterrelatons des plantes, chaque plante étant caractérsée par rapport à toutes les plantes de la banque, Ces explcatons, qu sont effectuées par l'ntermédare des plantes dscrmnantes, restent toutefos mplctes 7 Les données recuelles provennent essentellement des publcatons, mas auss de données non publées fournes par les phytosocologues; dans certan cas, elles ont été drectement obtenues sous forme nformatque Le but de la collecte de ce type de données n'est pas d'être exhaustf (nous estmons à plus de 200000 le nombre de lstes publées), mas d'établr un réseau d'nterrelatons des plantes suffsamment stable pour permettre de décrre et d'explquer les groupements végétaux B l'échelle de la France Actuellement, nous avons réalsé une chaîne complète de geston et de calculs pour les données phytosocologques, depus leur recuel jusqu'8 L 29

/ 30 la consttuton des groupements végétaux, leur explcaton par les plantes dscrmnantes, les tableaux phytosocologques, la cartographe des groupements obtenus, etc, tous résultats habtuellement souhatés par les botanstes et fourns prêts pour la publcaton (2, 16,25,26) La phytoécologe C'est cette dscplne qu apporte les explcatons CcoloFques de la répartton des plantes, et c'est autour de cette dscplne qu'a éte réalsé _ la banque de données rapdement présentée Un exemple complet a été traté : l s'agssat de mettre en évdence des relatons entre plantes et clmats, à l'échelle delafrance Pour cela, 450 plantes ont été étalonnées à l'égard des précptatons et des températures mnmales et maxmales mensuelles (7, 11, 12, 15, 29, 30) Ensute, leurs comportements ont été comparés par une méthode de classfcaton et résumés Pour chaque plante et pour chaque groupe de plantes on comat non seulement la gamme de varaton de la varable en présence de la plante (sa poston clmatque), mas auss son degré d'ndcaton (sa valeur ndcatrce) L'étalonnage réalsé servra à explquer les groupes phytosocologques ou phytogéographques, de leux ou de plantes, tels qu'ls seront établs? pa& de données plus complbtesque les données écologques qu restent relatyement raes? CONCLUSON Le but de la banque consttuée à l'nsttut de botanque de Strasbourg n'a pas la prétenton de rassembler toutes les données sur tous les sujets de la botanque La Banque s'est prncpalement donné comme but d'nformatser les démarches ntellectuelles des botanstes de façon à &Crer dans les programmes toutes les hypothèses qu'ls ont formulées d'une manere plus ou mons explcte (14, 23, 24, 31) Actuellement, nous pouvons dre que nous avons nformatsé la plupart des tratements courants souhatés par les botanstes, à partr d' exemples réels; même s'l reste beaucoup à fare SUT le plan de la convvalté de ces programmes REFERENCES BBLOGRAPHQUES BADRE (F), BRSSE (H), DENELLE (P), FLORENCE (J), GRANDJoUAv (G), HOFF (M) et de RUFFRAY (P), 1985 Proposton pour un code florstque Prncpes, consttuton et utlsaton à partr d'un exemple : les Ptérdophytes d'europe DT, ORSTOM, PARS, 77 p BRSSE (H), 1982 Un exemple d'utlsaton d'une banque de données phytoscologques Coll Méthodes math appl géogr, Oct 1982, Besançon, Unversté de FranceComté, 40 p BRSE (H) et BRUNEL (JF), 1980 Formulare de descrpton pour une taxnome numérque des Phyllantheae et affnes nsttut de botanque de Strasbowg,6 p, Offset BRSSE (H) et BRUNEL (JF), 1982 ndex des Phyllantheae et affnes nsttut de Botanque, 12 p, lste d'ordnateur BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1971 Formulareflorstque des végétaux vasculares de la France Montpeller, CBRS CEPE Lous Emberger, 18p BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1975 Un procédé de geston mécanographque des observatons florstques Bull soc bot f, 122, pp 35 50 BRSSE et GRANDJoum (G), 1977 Etalonnage et classfcaton clmatque de 450 plantes en France Coll de 'Assoc nternat de phytosocologe Rnteln (RFA), éd Cramer, pp 535 607 BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1979 Utlsaton de l'ordnateur pour la consttuton d'un code florstque (exemple de Bryophytes de la France): Actes du 7ème colloque de 1'Assoc nterna "nformatque et Bosphère'a pp 71 85 BRSSE(H) et GRANDJOUAN (G), 1979 Formulare florstque des Bryophytes de la France, d'après la Flore de J AUGER (1966) nsttut de botanque de Strasbourg, 10 p offset, * _ BRSSE (H) et GRAND JOUA^ (G), 1979 Formulare florstque des végétaux vasculares de l'algére, d'après a Flore de Quéze et Santa (1962) nsttut ' de botanque de Strasbourg, 20 p offset

_ " BRSSE (H) et GRANDOUAN (G), 1980 Plantes ndcatrces du cí'lmat Méthode de caractérsaton clmatque des plantes a dfférents nveaux"'* d'abondance Bull soc botfr, 127, leme bot 1980 (3), pp 263 273 BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1980 Plantes ndcatrces du clmat Quelques exemples B dfférents nveaux d'abondance Bull soc bot fr, 127, Lettres bot 1980,471 482 BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1981 DéteLnaton statstque des "éléments" et des terrtores dans tros branches de la géographe botanque Mém socde bogéogr, 3bme sére, : pp 113 137 BRSSE (H) et GRANDOUAN (G), 1982 Comparason des ponts de vue statstques de la bologe et de la géograpse en écologe végétale Coll de math appl à la géogr, Oct 1981, Besançon, Unversté de Francecomté, 49 p BUSSE (H), GRANDJOUAN (G) et de REFRAY (P), 1982 Ls types de clmat annuel, un mode d'expresson des gradents clmatques ntégrant les varatons nterannuelles But et prncpes de la classfcaton des clmats annuels Les cnq prncpaux types de clmat annuel en France depus 50 ans Les gradents de fréquence des types de clmat annuel? l'échelle régonalela Météorologe, VE" sére, No 31, Décembre 1982, pp 3981 BRSSE (H),OSANDJOUAN (G), HOFF (M) et de RUFFRAY (P), 984 Utlsaton d'un crtère statstque de 'écologe en phytosocologe Exemple des forêts alluvales en Alsace n "La végétaton des for& alluvales", 9ème colloque de 'Assocaton Amcale nternatonale de Phytosocologe, Strasbourg 1980, éd Cramers, pp 543 590 BRSSE (H) et GRANDJOUAN (G), 1983 Formulare florstque pour le codage des mauvases herbes nsttut de Botanque, Strasbourg, 6 p offset BRSSE (H) et MESCH (R), 1982 Formulare florstque des algues nsttut de Botanque de Strasbourg, 6 p lste d'ordnateur BRSSE (H) et RSCH (F), 1982 Formulare de descrpton des plantes lgneuses en France pour uen étude morphoécologque nsttut de botanque de Strasbourg, 6 p photocope BRSSE (H) et WTTEBOLLE ( G), 1979 Formulare florstque des végétaw vasculares du Sénégal, d'après la flore de J BERHAUT 1967 nsttut de botanque de Strasbourg, 16 p offset ; CREMERS (G), FEWET (C), de GRANVLLE (JJ), HOFF (M) et BRSSE (H), 1985 Mse en place d'une base de données en botanque tropcale 4 Formulare florstque des Ptérdophytes de Guyane DT, ORSTOM, Pans, (en cours de publcaton) FLORENCE (J), HOFF (M) et BRSSE (H), 1985 Mse en place d'une base de données en botanque tropcale Formulare florstque des végétaux au Gabon DT, ORSTOM,Pars, (en cours de publcaton) GRANDJOUAN (G), 1982 Un tratement statstque assocant des fchers phytosocologques et phytoécologques Coll méthmath appl à la géogr, Oct 1982, Besançon, Unversté de Francecomté, 26 p GRANDJOUAN (G), 1982 Une méthode de comparason statstque entre les réparttons des plantes et des clmats Thèse d'éfat, ULP Strasbourg, 316 p HOFF (M) et BRSSE (H), 1985 Proposton pour un schéma synthétque des végétatons secondares ntertropcales n "La végétatqn ntrophle et anthropque", 12ème colloque de l'assocaton Amcale nternatonal de Phytosocologe, éd, Cramers Colloque de Balleul, oct 1983 HOFF (M), BRSSE (G) et GRANDOUAN (J), 1985 Les groupements végétaux rudéraux et anthmpques de a NouvelleCalédone et des?es Loyauté n "La yégétatc"troph1e et anthropque"; 2E"e colloque de l'assocaton ' _ Amcale nternatonale de Phytosocologe, éd Cramers, Colloque de Balleul, oct 1983 HOFF (M) et BRSSE (H), 1985 Mse en place d'une base de données en botanque tropcale 1 nformatsaton des échantllons d'herber DT, ORSTOM, Pars, (en cours de publcaton) HOFF (M) et BRSSE (H), 1985 Mse en place d'une base de donnéesen botanque tropcale Formulare florstque des végétaux vasculares et des Bryophytes de Walls et Futuna DT, ORSTOM, Pars, (en cours de publcaton) De RUFFRAY (P) et BRSSE (H) et GRANDOUAN (G), 1981 Un procédé d'estmaton des données manquantes fondé sur des corrélatons clmatques entre posts vosns La Métorologe, Vème sére, 24, (mars 1981), pp 47 59, fg, 4 tabl, 7 réf bblogr De fuffray (P), 1978 Etalormage clmatque des plantes en Alsace et dans *es régons lmtrophes Thèse de spécalté, Strasbourg, 185 p ' 33 _

9 s e De RUFFRAY (Ex 1981 Caractérsaton clmatque de deux espèces spontanées 21 petts fruts : le Framboser (Rubus daeus L) et la Myrtlle (Vaccnum murfllus L) Coll de L'NRA, Productons spontanées Colmar, 17 20jun 1980, pp 59 69 De RUFFRAY (P), BRSSE (H), HOFF (M), et GRANDJOUAN (G), 1985 La banque de données phytosocologques de l'nsttut de botanque de Strasbourg Descrpton Premers blans Secrétarat de la Faune et de la FZore, MNHN, Pars, 143 p f