155 Chaptre 5. Menu de SUPPORT Ce que vous apprendrez dans ce chaptre Ce chaptre vous présentera des routnes supplémentares susceptbles de vous ader dans les analyses de données présentées dans le chaptre précédent. Smulaton d échantllons de fréquence de talle La routne applque la technque de Monte Carlo pour smuler la dynamque d'un stock de possons et la procédure d'un échantllonnage aléatore, prenant en consdératon pluseurs éléments stochastques du système bologque quand l s'agt de générer des échantllons de fréquences de longueurs. Le fcher(s) produt par cette routne de smulaton peut être utlsée dans pluseurs cas tel que pour évaluer l'applcablté d'un modèle sur des données avec des caractérstques connues ou en estmant des paramètres de populaton en les changeant de manère tératve jusqu'à ce que les fréquences de longueur qu sont produtes devennent très proches de celles observées. Cette routne nclut deux optons: (1) fréquences de longueur générées à travers un échantllonnage aléatore dans un "habtat fermé" et (2) fréquences de longueur générées prenant en compte des mgratons.
156 Fcher exgé Paramètres d entrée Fonctons Aucun A l'excepton d'un élément, la route de mgraton pour des stocks mgratores, les données d'entrées exgées sont les mêmes pour les deux optons. Ces données d'entrées sont présentées en résumé dans les Tableaux 5.1 à 5.3. La séquence des fonctons de probablté utlsée est résumé dans le Tableau 5.4. Elles sont utlsées pour smuler la ve (crossance, mgraton) d'un posson ndvduel, à un certan moment, d'une pérode d'échantllonnage à la suvante, jusqu'à la mort due à M ou F. Tableau 5.1. Champ exgé des données d'entrée pour smuler les données de fréquence de longueur. om du champ Type Lmtes Remarques ombre de zones 1 à 5 Le no. de régons hypothétques au sen desquelles mgre le stock (pour les stocks mgratores seulement). Type d échantllon Ch - Tros types d échantllons sont dsponbles; (1) représentant la populaton, (2) représentant la capture, et (3) échantllonnage double, représentant la populaton et la capture. ombre de possons échantllonnés ombre de groupes d âge 1 à10 6 ombre total de spécmens dans un échantllon smulé. 1 à 10 ombre de groupes d'âge supposé se retrouver dans l'échantllon. ombre de groupes de talle 2 à 100 ombre de groupes de talle dans un échantllon smulé.
157 Tableau 5.1. (fn) Champ exgé des données d'entrée pour smuler les données de fréquence de longueur. om du champ Type Lmtes Remarques L 1 à 10 5 Longueur asymptotque. CV de L 0 à 99 Une mesure de la varablté supposée de L, sot CV = (L ) 100/L. K 0.1 à 20 Paramètre de la courbure de la foncton VBGF. CV of K 0 à 99 Une mesure de la varablté supposée de K, sot (K) 100/K. C 0 à 1 Ampltude des oscllatons sasonnères de la courbe de crossance. Une donnée d'entrée zéro mettra automatquement le Pont hvernal (WP) à zéro. CV de C 0 à 99 Une mesure de la varablté supposée de C, sot (K) 100/C. WP 0 à 1 Pérode de l'année durant laquelle la crossance est plus lente. CV de WP 0 à 99 Une mesure de la varablté supposée de WP, sot (WP) 100/WP. L50* 0 à 10 6 50% de longueur de rétenton (sélectvté man gauche et/ou recrutement). L75* 0 à 10 6 75% de longueur de rétenton (sélectvté man gauche et/ou recrutement). R50* 0 à 10 6 50% de longueur de rétenton (sélectvté man drote ou de-recrutement). R75* 0 à 10 6 75% de longueur de rétenton (sélectvté man drote ou de-recrutement). F maxmum* 0 à 99 La mortalté par pêche maxmum qu sera applquée sur les groupes d'âge du stock. * Dans les stocks mgrateurs ces champs sont des régons-spécfques, c.-à-d. que les valeurs sont défnes pour chaque régon où le posson émgre.
158 Tableau 5.2. Autres données d'entrée pour exécuter une routne de smulaton (Optons 1 et 2). om du champ Type Lmtes Remarques Sére de valeurs 0 à 100 Utlser la même sére de valeurs pour pour obtenr exactement les mêmes valeurs l échantllon- comme dans le cas de l exécuton nage aléatore précédente. o. o. 0 à 50 50 Cela Cela fat fat référence référence au au nombre nombre de de mos mos d échantllons d échantllons d'échantllonnage d'échantllonnage pour pour smuler. smuler. oter oter que que comme comme pluseurs pluseurs smulatons smulatons sont sont nécessares, nécessares, le le temps temps de de calcul calcul augmente augmente exponentellement. exponentellement. o. de mos 11 ombre de mos séparant les échantllons o. de mos 1 à 11 ombre de mos séparant les échantllons entre les smulés. entre les smulés. échantllons échantllons Identfcateur char. Cec sera enregstré au moment du storage Identfcateur d exécuton C 9 char. dans Cec un sera dosser enregstré FISAT au dans moment OTHER du storage FILE d exécuton IDETIFIERS. dans un dosser Fournr FSAT des dans entrées OTHER dans ce FILE champ IDETIFIERS. qu dentferont Fournr clarement des entrées la smulaton dans ce champ d exécuton qu dentferont clarement la smulaton d exécuton Force de 0 à 100 Les données d'entrées pour ce tableau sont Force recrutement de 0 à 100 en Les termes données relatfs, d'entrées c.-à-d., pour ce la tableau force sont du recrutement recrutement en termes relatfs, dans un c.-à-d., mos donné la force vs-à-vs du des recrutement autres mos. dans un FSAT mos ajustera donné vs-à-vs proportonnellement des autres mos. toutes FSAT les valeurs ajustera de proportonnellement sorte la plus forte toutes donnée les d'entrée valeurs sera de égale sorte que à que l'unté. la plus forte donnée d'entrée sera égale Force relatve Force relatve 0 à 100 Force à l'unté. relatve de chaque groupe d'âges; 0 à 100 comme Force relatve avec de les chaque données groupe d'entrée d'âges; du tableau comme avec précédent,, les données FSAT d'entrée ajustera du proportonnellement tableau précédent,, toutes FSAT les valeurs ajustera de sorte proportonnellement que la plus forte toutes donnée les d'entrée valeurs sera de égale sorte que à l'unté. la plus forte donnée d'entrée sera Mortalté 0.01 à 20 La égale mortalté à l'unté. naturelle qu affecte chaque Mortalté naturelle naturelle 0.01 à 20 La groupe mortalté d'âge. naturelle qu affecte chaque groupe d'âge.
159 Tableau 5.3. Données d'entrées addtonnelles pour exécuter une routne de smulaton qu ncorpore des mgratons. om du champ Type Lmtes Remarques L50 de mgraton 0 à 10 6 50% de longueur de rétenton (sélectvté man gauche) à partr de laquelle débute la mgraton hors de la zone de culture (Zone 1). L75 de mgraton 0 à 10 6 75% de longueur de rétenton (sélectvté man gauche) à partr de laquelle débute la mgraton hors de la zone de culture (Zone 1). Destnaton à partr de la Zone 1 2 à 5 Destnaton (zone 1+) à partr de laquelle débute la mgraton hors de la Zone 1. Durée de séjour dans la zone 1+ 1 à10 5 Durée de séjour dans la zone 1+ (en mos). Par sute des données sases, FSAT nctera l'utlsateur à dentfer les régons subséquentes de mgraton (2 à 5) et les durées de séjour dans la régon spécfée (1 à 10 5 ). Tableau 5.4. Résumé et séquence de procédures qu défnssent la technque de smulaton de Monte Carlo pour générer des échantllons de fréquence de longueur. Dstrbuton Paramètres Probablté de Résultats de probablté d entrée présence Recrutement no. de de groupes d âge Cy / Cy / Cy le le groupe d âge (t (t n )) et et force de de la la classe dans dans lequel les les de de l année (Cy (Cy ); ); s s la la possons force de de la la classe de de l année devraent se se n'est pas pas spécfée, stuer elle elle est est supposée égale pour pour toutes les les classes de de l'année
160 Dstrbuton Paramètres Probablté de Résultats de probablté d entrée présence Mos de recrutement mensuel MR / MR le jour nassance relatf (MR ) est supposé être le 15 du mos et date de nassance et (tz) est défn Paramètres paramètres de 1/(x+2 (x)) défnt la courbe de crossance crossance et leurs de crossance écarts-type d un posson (x) Mgraton les âges auxquels (n.a.) vérfer s les possons restent les possons dans la zone de ont qutté pêche ou arrvent dans la zone de pêche Mortalté mortalté naturelle (M t ) e -Z, où vérfer s et données de sélectvté les possons SEL t par âge t, et la Z= ((F max P t ) survvent mortalté par pêche +M t ) à cet âge ou maxmum dont meurent en l échantllon rason de la est exposé durant pêche ou de sa ve (F max ) la mortalté naturelle Sélectvté Probablté de capture P t vérfer s engn (.e., sélectvté et les possons courbe de recrutement) par sont pêchés longueur ou groupe d âge par l engn ou (P t ) non Résultats Les deux optons de cette routne peuvent produre des séres chronologques de fréquences de longueur qu sont sauvées automatquement.
161 Interface utlsateur L'nterface de l'utlsateur de ces routnes content une sére d'étquettes (Fg. 5.1) pour sasr les paramètres. Les valeurs par défaut sont fournes par FSAT II qu peut être modfé. Les résultant fréquences de la longueur résultantes sont automatquement enregstrées pour usage dans pluseurs routnes de FSAT II Remarques Le temps exgé pour exécuter cette routne de smulaton dépend des données d'entrées fournes, et peut durer quelques mnutes à pluseurs jours. Cependant, l est possble d'nterrompre toute smulaton en appuyant sur n'mporte quelle touche (attenton: les résultats ntermédares ne sont pas sauvés, et la smulaton dot être recommencée en cas d'nterrupton mpromptue). Fg. 5.1. L'nterface de l'utlsateur quand l s'agt d'exécuter la routne de smulaton pour produre des fréquences de longueur.
162 Estmaton du pods de l échantllon Cette routne permet aux utlsateurs d'estmer des pods de l'échantllon comme étant nécessare pour estmer des facteurs d'extrapolaton, ou pour d'autres buts. Fcher exgé Paramètres d entrée Foncton Fréquence de talle avec une classe de talle constante. a et b coeffcents de la relaton talle pods. Le pods moyen de l échantllon (WS) est calculé à partr de Ws = w / où est le nombre fréquence, et w est le pods moyen des possons dans la classe calculé à partr de w = L + 1 1 L a b + 1 b+ 1 b+ 1 ( L+ 1 L où a et b coeffcents de la relaton talle pods et L et L +1 sont respectvement les lmtes nféreures et supéreures de la classe de talle. ( Résultats Un tableau des pods calculés pour chaque classe de longueur et le pods de l'échantllon. Interface utlsateur L'nterface de l'utlsateur content deux étquettes (Fg. 5.2 et Fg. 5.3). L'étquette "Général" (Fg. 5.2) dentfe le fcher et fournt les champs pour rentrer les données des coeffcents de la relaton talle-pods 'a' et 'b'.
163 Fg. 5.2. Interface de l'utlsateur pour sasr les données d'entrée pour la routne de l'estmaton du pods de l'échantllon. La deuxème étquette (Fg. 5.3) est pour les résultats de l'analyse. A noter la présence du bouton de commande "Compute". Après l'dentfcaton du fcher et la sase des coeffcents exgés, clquer ce bouton permettra de commencer les calculs. Auss, à noter la présence du bouton de commande "Update Samples". Clquer ce bouton de commande mettra à jour le sousen-tête du fcher de fréquence de longueur, remplaçant la valeur enregstrée. Cette foncton dot, par conséquent, être utlsée avec prudence.
164 164 Fg. 5.3. Résultats de la routne de l'estmaton du pods de l'échantllon. A noter que le sous-en-tête de l'échantllon peut être ms à jour automatquement en utlsant le calcul des pods de l'échantllon. Remarques L'unté pour les pods calculés est détermnée par le coeffcent a, fourn comme donnée d'entrée à la routne. [L'équaton préctée fournt des estmatons non basées de w ; l estmaton de w de par son pods correspondant à L, base de résultat]. Bblographe Beyer (1987)