«Flore digestive le bien et le mal»

Transcription

1 «Flore digestive le bien et le mal» Frédérique Beuhorry-Sassus Céline Cabrérizo 18 ème JIP Romans sur Isère 19 juin 2014

2 Précision réglementaire : Nous n avons aucun conflit d intérêt 2

3 Appareil digestif humain Système ouvert et donc colonisé par les bactéries 3

4 Composition de la flore digestive Flore digestive = microbiote intestinal Milieu complexe - Composition : Bactéries Champignons Bactériophages Archae 4

5 Microbiote varie le long du tube digestif en quantité et en qualité bactéries 10 fois plus que les cellules humaines > 1000 espèces Dans le colon, 99.9% des bactéries sont des anaérobies 5

6 Bonnes bactéries et bonne santé G.Corthier,

7 Microbiote intestinal, bactéries Le colon est la seule zone colonisée de façon permanente par une flore résidente La flore dominante 10 9 à /g ; germes anaérobies : Bacteroides, Bifidobacterium, Peptostreptococcus La flore sous-dominante 10 6 à 10 8 /g ; bactéries aéro-anaérobies facultatives : Entérobactéries surtout E.coli, streptocoques, lactobacilles La flore de passage < 10 6 /g ; ne s implante pas sauf circonstances pathologiques Polymorphe (bactéries : entérobactéries, Pseudomonas, levures) 7

8 Divisions majoritaires = Phyla en biologie moléculaire Les bactéries dominantes du microbiote sont réparties en 3 phyla majeurs Phylum Firmicute : 60-75% Bactéries gram+, Phylum Bacteroidetes : 30-40% Bactéries Gram-, Phylum Actinobacteria : 1-5% Bifidobactéries 8

9 Microbiote varie dans le temps Le tube digestif est stérile in utero Il est rapidement colonisé après la naissance avec une flore simple à partir des flores de sa mère et de son environnement proche Ordre d implantation défini : 1 bactéries aérobies 2 bactéries anaérobies 9

10 Microbiote varie dans l espace La composition du microbiote est très dépendante des facteurs environnementaux (alimentation, hygiène ) 10

11 Un microbiote personnalisé La plus grande partie des espèces dominantes dans le microbiote fécal d un individu lui sont propres. Empreinte fécale spécifique de l individu Cependant, un petit nombre d espèces (quelques dizaines) pourraient constituer un ensemble partagé par la plupart des individus Noyau central «Nous sommes tous assez semblables mais loin d être identiques» 11

12 Un 19 juin Tube Digestif et Microbiote se sont unis pour le meilleur

13 Microbiote intestinal et Métabolisme 13

14 Microbiote nourricier Rôle dans la digestion : Production de vitamines Dégradation de substrats en métabolites assimilables Régénération des cellules intestinales Régulation du poids

15 Microbiote intestinal et Système immunitaire 15

16 Microbiote protecteur Intestin : réserve de chasse gardée Occupation du territoire Puise toutes les ressources énergétiques Effet barrière

17 Microbiote justicier Système de renseignement : Stimule, collabore et fait évoluer le système immunitaire => acquisition de tolérance Système d alarme : Alliance entre bactéries contre l envahisseur

18 Microbiote intestinal et autres implications 18

19 Microbiote docteur «Antidépresseur» : Implication dans le comportement (humeur, capacité d intégration ) «Antalgique» : Rôle dans la perception de la douleur Anti-allergène

20 Un équilibre à préserver

21 et pour le pire

22 Le microbiote intestinal est un réservoir de gènes de résistance aux antibiotiques 22

23 Bactéries MultiRésistantes : BMR E.coli sauvage E.coli BMR / BLSE 23

24 Transmission des gènes Verticale : de mère en filles Horizontale : entre bactéries d espèces différentes 24

25 Effet des antibiotiques sur le microbiote intestinal Inspiré du diaporama de D.Lepelletier CHU Nantes : Gestion des excreta

26 Le microbiote intestinal peut être le réservoir de bactéries hautement résistantes 26

27 K.pneumoniae sauvage K.pneumoniae BLSE = BMR K.pneumoniae EPC = BHRe 27

28 Bactéries hautement résistantes émergentes : BHRe Entérobactéries productrices de carbapénémases EPC Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli Entérocoques résistants aux glycopeptides - ERG Enterococcus faecium Impasse thérapeutique prévisible à court ou moyen terme Bactéries de la flore intestinale de l homme 28

29 Le microbiote intestinal peut héberger Clostridium difficile 29

30 Clostridium difficile : CD Bacille gram positif anaérobie strict Bactérie sporulée Spores résistantes à de nombreux désinfectants Persistent plusieurs semaines dans l environnement Eau, sol, intestin de l homme et de l animal Principale cause des diarrhées nosocomiales chez l adulte dans les pays industrialisés Souches toxinogènes 30

31 Clostridium difficile : CD (2) 3 facteurs nécessaires pour obtenir une infection digestive liée à CD Présence de CD Sécrétion de toxines par CD Diminution de la flore protectrice (effet barrière) Par antibiotiques, anticancéreux 31

32 FIN Merci de votre attention 32