ACHEMINEMENT DES PRELEVEMENTS DE VIROLOGIE

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Brian Éthier
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ACHEMINEMENT DES PRELEVEMENTS DE VIROLOGIE MILIEU DE TRANSPORT A utiliser pour tout prélèvement destiné à la CULTURE. Il est disponible à la Réception Centrale des Analyses (Laboratoires).

1 ACHEMINEMENT DES PRELEVEMENTS DE VIROLOGIE MILIEU DE TRANSPORT A utiliser pour tout prélèvement destiné à la CULTURE. Il est disponible à la Réception Centrale des Analyses (Laboratoires). Dans les services cliniques, il doit être conservé congelé, et décongelé au moment de son utilisation. Durée de péremption : 1 an Deux présentations existent : En tube En pot Pour : - écouvillons (peau, gorge...) - sécrétions naso-pharyngées - biopsies Pour : - urines - Lavages Broncho- Alvéolaires - Liquides amniotiques TRANSPORT Tout prélèvement doit être acheminé immédiatement au laboratoire +++ En cas d'envoi différé, conserver le prélèvement le moins longtemps possible, selon les indications suivantes : NATURE LCR (PCR) TOUT PRELEVEMENT POUR CULTURE : écouvillons, sécrétions, liquides, urines, biopsies, selles SANG HEPARINE (virémie) SANG TUBE SEC (sérologie) SANG EDTA (PCR) TEMPERATURE Congélation si possible Sinon : 4 Congélation si possible Sinon : 4 Conservation impossible t ambiante t ambiante

PRELEVEMENTS CUTANES FAIRE IMPERATIVEMENT : - un prélèvement pour EXAMEN DIRECT (Microtrak ) - un prélèvement pour ISOLEMENT VIRAL (culture) LESION VESICULEUSE Aspirer le liquide vésiculaire à la

2 PRELEVEMENTS CUTANES FAIRE IMPERATIVEMENT : - un prélèvement pour EXAMEN DIRECT (Microtrak ) - un prélèvement pour ISOLEMENT VIRAL (culture) LESION VESICULEUSE Aspirer le liquide vésiculaire à la seringue ou le prélever à l'écouvillon (virus libre +++) Le décharger dans un milieu de transport en tube culture de virus Etaler le prélèvement sur les 2 puits. Laisser sécher et fixer à l'acétone immunofluorescence LESION CROUTEUSE Enlever la croûte à l aiguille Ecouvillonner vigoureusement le plancher de la vésicule (cellules infectées) Etaler le prélèvement sur les 2 puits Laisser sécher et fixer à l'acétone immunofluorescence Répéter l'opération avec un deuxième écouvillon Décharger le prélèvement dans un milieu de transport en tube culture de virus

PRELEVEMENTS RESPIRATOIRES PRELEVEMENT DE GORGE Milieu de transport Ecouvillonner énergiquement Décharger l écouvillon en tube le pharynx et la région dans le milieu de transport amygdalienne

3 PRELEVEMENTS RESPIRATOIRES PRELEVEMENT DE GORGE Milieu de transport Ecouvillonner énergiquement Décharger l écouvillon en tube le pharynx et la région dans le milieu de transport amygdalienne transport Jeter l écouvillon Envoyer le milieu de SECRETIONS NASO-PHARYNGEES Aspirer les sécrétions du rhinopharynx (min 0.5 ml) à l aide d un mucus extractor ou d une sonde gastrique n 8 montée sur seringue Décharger les sécrétions dans un milieu de transport Envoyer le milieu de transport LAVAGES BRONCHO-ALVEOLAIRES Recueillir le produit du lavage dans un pot stérile Transférer une partie du liquide dans un pot de milieu de transport (volume à volume ) Envoyer le milieu de transport

4 BIOPSIES PAR CULTURE Déposer un fragment dans un tube de milieu de transport PAR PCR Déposer le fragment biopsique dans un tube sec Humidifier avec une goutte de sérum physiologique Ne pas diluer le prélèvement dans un grand volume de liquide +++

5 SELLES En cas d impossibilité d obtenir des selles, pratiquer un écouvillonnage rectal (en culture, rendement inférieur à celui de la selle). SELLES Mettre l équivalent d une noix de selle (5 à 10 g), à sec, dans un pot stérile. ECOUVILLONNAGE RECTAL Milieu de transport Introduire l écouvillon dans l anus Décharger l écouvillon en tube jusqu à l ampoule rectale et le tourner dans le mileu de transport sur son axe Jeter l écouvillon Envoyer le milieu de transport

6 RECHERCHE D'UNE VIREMIE PAR CULTURE Concerne essentiellement la recherche de Cytomégalovirus (CMV). Le virus est détecté par culture sur cellules et par immunocytochimie. La culture nécessite un tube bien rempli de sang sur HEPARINE (bouchon vert). Agiter immédiatement le tube par retournement (4 ou 5) pour éviter la formation de microcaillots Le sang doit parvenir avant la fin de la matinée au laboratoire, pour permettre la séparation des leucocytes. Les tubes non parvenus dans les délais seront non utilisés +++. PAR PCR Le prélèvement doit être fait sur EDTA (bouchon mauve). Les impératifs de délai de transmission au laboratoire sont les mêmes que pour le tube hépariné.

7 RECHERCHE DE VIRUS DANS LE LIQUIDE CEPHALO-RACHIDIEN (LCR) Les recherches virales dans le LCR se font par biologie moléculaire. Le LCR doit être recueilli dans un tube sec et stérile. Si possible, prescrire les recherches virologiques en même temps que la cytologie et la bactériologie +++ En cas de prescription retardée, prévenir au plus tôt le laboratoire de Virologie qui ne conserve les LCR adressés en Bactériologie que pendant une semaine.

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