Epidémiologie des staphylocoques multirésistants aux antibiotiques chez les chats, les chiens et les personnes

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1 Epidémiologie des staphylocoques multirésistants aux antibiotiques chez les chats, les chiens et les personnes - Revue de littérature et étude Suisse Paola Decristophoris Istituto cantonale di microbiologia, Bellinzona & Universität Basel CHUV, Forum hygiène, février 2009

2 Sommaire Staphylocoques et résistance aux antibiotiques (AB) Revue de la littérature Étude menée en Suisse Buts Importance de l étude Design de l étude Méthodes Résultats préliminaires Collaborations

3 Portage de bactéries multirésistants aux AB Portage de bactéries non résistants aux AB Pression antibiotique dans l environnement Utilisation d AB dans cliniques, hôpitaux et EMS Portage de bactéries multirésistants aux AB chez animaux Contact, échange de souches et échange de gènes de résistance aux AB Portage de bactéries multirésistants aux AB chez personnes Diminution de l immunité Problèmes de sainté Mort Traitement avec AB

4 Staphylococcus spp.: Coques Gram + + Catalase 41 espèces et 24 sous-espèces (Mellmann et al. 2006) Coagulase-positives: S. aureus, S. intermedius, S. pseudointermedius, S. delphinii, S. schleiferi subsp. coagulans, S. hyicus Coagulase-negatives: ex. S. hominis, S. epidermidis, S. capitis, S. felis, S. warneri,

5 S. aureus: 25-30% des personnes porteuses saines (Grundmann et al. 2006) SARM: S. aureus résistant à méthicilline (MRSA), grâce au gène meca présent dans la casette chromosomique SCCmec des staphylocoques (types I- VI) Même cassette peut porter plusieurs gènes de résistance souches résistantes à un grande nombre d antibiotiques transfert horizontale SCCmec entre staphylocoques (Wielders et al. 2001; Hanssen et al. 2004) Noto et al. 2008

6 HA MRSA (Hospital aquired) et CA-MRSA (Community aquired) HA-MRSA: SCCmec type II et III multirésistance aux antibiotiques (AB), 3 antibiotiques CA-MRSA: SCCmec type IV et V résistants seulement aux β-lactames et macrolides Panton-Valentine leukocidine (PVL) (Naimi et al. 2003; Berglund et al. 2005)

7 Staphylocoques coagulase-positive (SCP), autres que S. aureus S. intermedius S. pseudointermedius S. delphinii Staphylococcus intermedius Group (SIG) S. schleiferi subsp. coagulans S. hyicus Résistance à la méthicilline est documentée (Morris et al. 2006, Jill et al. 2007)

8 Staphylocoques coagulase-négative (SCN) 60% à 80% des souches nosocomiales sont résistantes à la méthicilline (von Eiff et al. 2001) 30% à 40% des souches de porteurs sains sont résistantes à la méthicilline (Piette and Verschraegen 2009) Progrès dans la médecine moderne (ex. implantations de prothèses et cathéters) infections nosocomiales SCN (Piette and Verschraegen, 2009)

9 peuvent agir comme réservoir de gènes de résistance

10 Résistance aux AB chez les staphylocoques d origine: Humaine (surtout S. aureus et SCN) Animale (surtout S. pseudointermedius) Transmission bidirectionnelle de souches a été documentée

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12 Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus: An Emerging Pathogen in Small Animals. (Weese et al. 2005) Methicillin-resistant Staphylococcus aureus in dogs and cats: an emerging problem? (Duquette and Nuttall, 2004)

13 Typage de SARM par PFGE (1 hôpital vétérinaire et 14 cliniques privées): 25 animaux (14 chiens, 1 chat, 8 chevaux, 1 lapin et 1 phoque) 10 personnes porteurs sains dans équipes vétérinaires 2 groupes de SARM: Équines: origine à définir Non-équines: même profil PFGE de ceux dans hôpitaux en Irlande

14 Total de 300 écouvillons aux nez et bouche de: 78 personnes équipe vétérinaire 45 chiens 12 chats 30 surfaces dans l hôpital vétérinaire SARM: 14 personnes (17.9%) 4 chiens (9%) 0 chats 3 surfaces dans l hôpital vétérinaire(10%) Portage dans les muqueuses d une souche épidémique dominante dans hôpitaux de UK

15 6 cas de SARM identifié chez animaux dans clinique vétérinaire et dans communauté (amputation membre, rhinite chronique, infection post-opératoire, opération péri-oculaire, infection tractus urinaire) Investigation de la relation entre colonisation chez animaux (4 chiens et 3 chats) et colonisation chez personnes en contact par typage PFGE Suspicion de transmission animal-homme et homme-animal Souches communautaires prédominantes au Canada

16 Clinical Infectious Disease, 2003; 36: e26-28 Infection recourrante à SARM chez patient diabétique avec insuffisance rénale et sa femme Éradication de SARM chez chien Écouvillon au nez du chien de famille: SARM résistant à mupirocine arrêt des infections recourrantes chez les propriétaires

17 SARM cultivé depuis écouvillon au nez d un chien sain Propriétaire colonisée par SARM travaillait dans EMS Animaux domestiques en étroit contact avec personnes porteuses de SARM peuvent être colonisés Manque de détection ou traitement des animaux peut amener à colonisation ou infections recourrantes chez homme

18 Chien de pet therapy, border collie de 11 ans, porteur asymptomatique de SARM après visite de EMS en UK Nécessité d investiguer la prévalence de SARM chez chiens de pet therapy et le potentiel risque de transmission à l homme

19 Écouvillons au nez et bouche: 13 chiens avec pyodermite profonde (+ lésion) 13 propriétaires des chiens 13 personnes sans contact journalier avec animaux domestiques Présence de S.intermedius plus importante chez propriétaires que chez contrôles (Fisher s exact test, p = 0.03) Risque de transfert de gènes depuis S.intermedius des chiens aux staphylocoques pathogènes humains

20 Homme 60 ans Cardiopathie ischémique et tachycardie ventriculaire avec implanted cardioverter-defibrillator (ICD) Hypertension artérielle, hypercholestérolémie et carcinome à la prostate

21 Pet therapy: partie importante du traitement multidisciplinaire dans EMS

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23 Epidémiologie des staphylocoques multirésistants aux antibiotiques chez les chats, les chiens et les personnes en Suisse Personnes en contact avec animaux domestiques: risque majeur de portage de staphylocoques multirésistants aux AB vis-à-vis de personnes sans animaux? Résultats de l étude: dans le contexte du rôle psychologique primaire des animaux

24 Déterminer la prévalence de staphylocoques chez les chats, les chiens et les personnes dans différentes régions de Suisse Établir la résistance aux antibiotiques chez les staphylocoques isolés Buts de l étude Décrire les relations épidémiologiques entre les isolats des animaux et ceux des personnes Analyse de potentiels facteurs de risque pour le portage de staphylocoques multirésistants aux AB chez les animaux et les personnes

25 Importance de l étude Relation entre animaux domestiques et personnes plus étroite Peu d information quant à colonisation des animaux, dans communauté, par staphylocoques et leur transmission aux personnes Pas de données indiquant proportion porteurs sains de SARM dans communauté en Suisse Probablement souhaitable préparer des recommandations d hygiène pour EMS, cliniques vétérinaires et propriétaires de chiens

26 Causal web Portage bactéries multirésistants aux AB Portage staphylocoques non résistants aux AB Pression antibiotique dans l environnement Utilisation d AB dans cliniques, hôpitaux et EMS Portage staphylocoques multirésistants aux AB chez animaux Contact, échange de souches et échange de gènes de résistance aux AB Portage staphylocoques multirésistants aux AB chez personnes Diminution de l immunité Problèmes de sainté Mort Traitement avec AB

27 cantons n = 4 EMS n = 84 Communauté avec animaux n = 42 sans animaux n = 42 personnes avec animaux personnes sans animaux animaux n = 126 personnes n = 252 personnes n = 252 animaux n = 360 personnes n = 360 personnes n = 180

28 Canton Vaud EMS avec animaux = 10 (x 6 personnes et 3 animaux) sans animaux = 10 (x 6 personnes) Total: 120 personnes et 30 animaux Communauté avec animaux = 90 personnes et 90 animaux sans animaux = 45 personnes Total: 135 personnes et 90 animaux

29 Méthode d échantillonage Consentement écrit des sujets Questionnaire (démographie et facteurs de risque) Personnes: Un écouvillon à une narine Animaux: Un écouvillon à une narine et une oreille

30 Culture sur SAID Enrichement bouillon SARM Isolement cultures pures sur milieu Chapman Recolte échantillon Questionnaire Contrôle qualité Informations relevantes MALDI-TOF Extraction ADN Résistance génotypique Diffusion de disque Kirby-Bauer séquençage rpob MLST, ETST, PFGE Antibiogramme selon CLSI Identification espèces et sous-espèces Typage souches Résistance aux antibiotiques

31 Antibiotiques testés Clindamycine Linezolide Tetracycline Doxycycline Acide fusidique Rifampicine Mupirocine Ciprofloxacine Erythromycine Imipenem Vancomycine Chloramphenicol Quinopristine-dalphopristine Trimethoprim-sulfamethoxazole Pénicilline Ampicilline Oxacilline Amoxicilline + Acide clavulanique Gentamicine Kanamycine Tobramycin Cephazoline Ceftazidim Cefoxitin

32 Résultats étude pilote Canton TI et BE animaux EMS Chiens (n = 21) Chats (n = 22) Total (n = 43) n % n % n % Traitement antibiotique dans les derniers 3 mois Traitement immunosuppressif dans les derniers 3 mois Portage de une ou plusieurs souches de staphylocoques Portage de une ou plusieurs souches de staphylocoques résistants à 3 AB ou plus Portage de une ou plusieurs souches de staphylocoques résistants à 4 AB ou plus

33 I0022-rpoB ok S. hominis subs.novobiosepticus DQ I0035-rpoB ok I0043-rpoB ok I0042-rpoB ok and I0044-rpoB F 65 I0078-rpoB F I0016-rpoB ok 60 I0077-rpoB F 99 S. haemolyticus NC rev c. S. capitis subsp. urealyticus DQ I0055-rpoB F 99 I0061-rpoB F S. lugdunensis AF S. saccharolyticus AF rev c. S. pasteuri DQ I0080-rpoB F 99 S. warneri EF I0069-rpoB F 68 S. equorum subsp. linens DQ S. succinus subsp. succinus DQ S. succinus subsp. casei DQ S. saprophyticus subsp. bovis DQ I0028-rpoB ok 91 S. saprophyticus subsp. NC rev.c 83 S. nepalensis DQ S. cohnii subsp. urealyticus DQ I0030-rpoB ok and I0031-rpoB F Staphylococci (n = 34) ATCC43300-rpoB F S. aureus subsp. aureus NC I0053-rpoB F and I0054-rpoB F S. aureus X64172 rpob S. aureus subsp. aureus str. AP I0081-rpoB F I0001-rpoB ok I0024-rpoB F I0038-rpoB F I0015-rpoB ok S. epidermidis NC rpob I0045-rpoB F S. auricularis EF I0029-rpoB ok I0027-rpoB ok S. pettenkoferi DQ S. condimenti DQ S. carnosus subsp. utilis DQ S. piscifermentans DQ I0051-rpoB F I0032-rpoB ok S. lutrae DQ S. schleiferi subsp. schleiferi EF S. schleiferi subsp. coagulans DQ S. intermedius AF S. delphini DQ I0073-rpoB F and I0074-rpoB F I0065-rpoB F and I0066-rpoB F I0057-rpoB F and I0056-rpoB F I0008-rpoB F I0049-rpoB F I0005-rpoB F I0006-rpoB Animaux Chat 1 Chat 2 Chien 1 Chien 2 Chien 3 Résistance aux antibiotiques P; AM; OX; TE; E; SXT; AMC; CAZ; NN; FA; FOX P; AM; E; FA P; AM; OX; CAZ; FA; FOX P; AM; TE; E; CC; SXT; K P; AM; E; CC; C; K Présence du gène meca OUI NON OUI NON NON I0010-rpoB F I0075-rpoB F I0006-rpoB ok I0007-rpoB F I0006-rpoB I0048-rpoB F Chien 4 P; AM; OX; FA NON S. vitulinus DQ S. fleurettii DQ S. sciuri subsp. rodentium DQ S. sciuri subsp. carnaticus DQ I0067-rpoB F I0072-rpoB F I0068-rpoB F I0070-rpoB F K. rhizophila NC Arbre UPGMA sur le fragment de 372 pb du gène rpob (Nucleotide Maximum Composite Likelihood; les valeur de bootstrap pour réplications sont reportés sur les noeuds).

34 Récolte et analyses sont en cours 6% des personnes dans EMS du Canton Tessin sont porteurs de MRSA ICM données pas publiées 35/116 (30.2%) des personnes dans EMS du Canton Tessin sont porteur de un ou plusieurs staphylocoques qui présentent gène meca

35 Collaborations Canton Vaud Istituto cantonale di microbiologia, Ticino Dr. med. C. Petignat et M. Attinger (Service de médecine préventive hospitalière, (PD Dr. O. Petrini) CHUV) Swiss Tropical Institute, Basel Canton Tessin (PD Dr. J. Zinsstag) Dr. med. A. De Benedetti (Capo vigilanza, Ufficio del medico cantonale) Canton Bern OFV, Bern J. Guillaume (Office des personnes âgées et handicapées OPAH, Direction de la santé publique (Dr. et med. de la prévoyance vet. G. Schuepbach-Regula) sociale ) Canton Zürich Dr. med. C. Meier et V. Schaufelberger (Gesundheitsdirektion, Kantonsärztlicher Dienst)