Génome : structure et expression Enseignement dirigé

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1 UE1 /PACES Année Génome : structure et expression Enseignement dirigé Séance ED 6 (Sélectionner les propositions exactes) QCM 1 Concernant les codons et le code génétique A Le code génétique est spécifique à chaque individu. B Un codon est un groupe de trois acides aminés. C Il existe autant d ARNt que de codons différents. D Un codon peut coder plusieurs acides aminés. E La séquence 5 -AGU-3 est l anticodon du codon sérine 5 -UCA-3. QCM 2 Concernant la traduction A L initiation de la traduction se fait par positionnement d un ARNt associé à un acide aminé sur le premier codon immédiatement en aval de la coiffe 5 de l ARNm. B Chaque ARNm est lu une seule fois. C La fixation de l ARNt initiateur associé à la petite sous-unité ribosomique entraîne la fixation de la grosse sous-unité ribosomique pour former un complexe de traduction fonctionnel. D En fin de traduction, toutes les protéines ont le même acide aminé N-terminal. E Il existe un système de contrôle de qualité qui corrige de façon co-traductionnelle les erreurs faites pendant la traduction. QCM 3 Concernant la synthèse des protéines A L initiation de la traduction peut être contrôlée par des protéines inhibitrices qui se fixent au niveau de l AUG initiateur et empêchent la fixation de la petite sous-unité ribosomique. B L initiation de la traduction peut être contrôlée par des petits ADN qui empêchent la fixation de la petite sous-unité ribosomique. C Le facteur d initiation de la traduction eif2 est une petite protéine G monomérique dont l activité peut être inhibée par phosphorylation. D Les protéines mal repliées au cours de leur maturation post-traductionnelle sont incluses dans des vésicules de sécrétion et éliminées par exocytose hors de la cellule. E Une fois maturées, toutes les protéines ont le même acide aminé N-terminal. 1

2 QCM 4 à 6 Exemple d expression d un gène. La transcription d un gène constitué de 4 exons peut générer 3 transcrits matures distincts (T1, T2, T3). Ces transcrits sont eux-mêmes traduits en 2 protéines de tailles différentes (protéine 1 pour les transcrits T1 et T3, protéine 2 pour T2) mais de même extrémité N-terminale. L exon 3 a une taille de 300 nucléotides. ADN 5 Exon 1 Exon 2 Exon 3 Exon 4 3 T1 5 AAAAA 3 protéine 1 : 354 AA Exon 2 T2 5 AAAAA 3 protéine 2 48 AA Exon 1 Exon 4 Exon 2 Exon 3 Exon 4 T3 5 AAAAA 3 protéine 1 : 354 AA Exon 1 Exon 2 Exon 4 QCM 4 Concernant la transcription de ce gène A Les 3 transcrits sont produits à partir de 3 gènes distincts. B Les 3 transcrits sont issus du même transcrit primaire (pré-arnm). C Le gène décrit possède 5 introns. D Les transcrits T2 et T3 partagent le même site d initiation de la transcription. E Les transcrits T1 et T2 partagent le même signal de polyadénylation. QCM 5 Concernant la régulation de la transcription de ce gène A Les transcrits T1 et T2 sont issus de l activation du même promoteur B T1 et T2 diffèrent par un épissage alternatif de l exon 3 C Dans les transcrits T1 et T3 le site donneur d épissage de l intron 3 n a pas été utilisé D Les transcrits T1 et T3 ont le même site accepteur d épissage fonctionnel en aval de l intron 2 E Les transcrits T1 et T2 sont issus d un épissage alternatif dans la région 5 du transcrit primaire QCM 6 Concernant la traduction des transcrits A Les 3 transcrits partagent le même site d initiation de la traduction B L AUG initiateur de la traduction se trouve dans l exon 2 C Il y a un codon STOP dans l exon 4 D Il y a un codon STOP dans l exon 3 E La présence de l exon 3 induit un décalage du cadre de lecture entraînant l apparition d un codon STOP dans l exon 4 différent de celui utilisé pour les transcrits T1 2

3 QCM 7 A propos des mutations : A Dans l ADN, le changement de l adénine par la guanine est une transversion. B Si le codon initial est transformé en un codon synonyme, on parle de mutation isosémantique. C Si le codon initial est transformé en un codon signifiant un autre aminoacide, on parle de mutation non-sens. D La délétion d une ou deux base(s) conduit à un décalage du cadre de lecture. E Les mutations somatiques sont héritables QCM 8 Mutations et conséquences phénotypiques Soit le gène X, la mutation c.145c>a a été trouvée dans la séquence de triplets suivante : GGT CTT TTG A Selon le code génétique (ci-joint), la séquence sauvage permet la synthèse de l enchaînement Gly Leu Leu B Dans la séquence sauvage, les deux derniers triplets sont dits synonymes. C Dans la séquence mutée de la protéine, l une des deux leucines sera éliminée par l apparition d un codon stop. D La protéine mutée peut avoir la même activité biologique que la protéine sauvage. E La régulation de l activité biologique de la protéine mutée peut être perdue. QCM 9 Concernant les mécanismes de réparation : A - Les protéines MutS et MutL forment un tétramère [2MutS/2MutL] capable de reconnaître des mutations de la double hélice d ADN. B Les protéines MutS et MutL reconnaissent le mésappariement entre 2 bases ou la présence de petite boucle simple brin. C - La fixation du tétramère (cité dans l item A de ce QCM) permet le recrutement de l endonucléase MutH qui fait une coupure simple brin sur le brin néosynthétisé au 3

4 voisinage de la distorsion. D Une endonucléase autre que MutH, une ADN polymérase et une ligase interviennent après l action de MutH pour obtenir une copie du brin parental et le comblement de la brèche. E - Le système MutHLS conserve le brin parental et corrige celui qui contient l information erronée. QCM 10 Concernant la réparation : A Le système BER est le principal mécanisme de réparation des dommages de l ADN causés par alkylation ou oxydation. B Dans le système BER, l excision de la base anormale fait intervenir une ADN glycosylase non spécifique du type de base à éliminer. C A la suite de l excision de cette base, le ribose est éliminé par une endonucléase. D L ADN polymérase bêta est la principale ADN polymérase du système BER. E Des mutations du gène codant l ADN polymérase bêta sont présentes dans certains cancers gastriques. QCM 11 Mutations et réparation : A Le changement d une base purique par une autre base purique peut provoquer une mutation non-sens. B La désamination d une cytosine en uracile se traduit par une mutation ou un polymorphisme génétique. C Dans le cas de désamination d une cytosine en uracile, un des deux systèmes de réparation BER ou NER peut intervenir indifféremment. D Dans le système BER, l AP endonucléase (APE) est capable de reconnaître un site apurique ou apurinique : elle clive alors la liaison entre un groupement 3 OH et un groupement 5 phosphate d un nucléotide sans base. E Une diminution de l activité d APE se traduit par une élévation de la susceptibilité des cellules au stress oxydant (formation de radicaux oxygénés). QCM 12 Concernant la réparation : A Les rayons ultraviolets (UV) provoquent la formation de dimères de thymine intracaténaires responsables d une distorsion de la double hélice d ADN. B Les dimères de thymine sont reconnus par les systèmes de réparation BER et NER. C Dans le système de réparation NER, le complexe XPC-HR23 a besoin de protéines partenaires pour se fixer sur les lésions induites par l action des UV. D Le Xeroderma Pigmentosum est une maladie en relation avec un défaut du système d excision / réparation NER. E Les défauts du système d excision / réparation peuvent être responsables de la survenue de cancers précoces et multiples. 4

5 QCM 13 Le laboratoire de cytogénétique a effectué le caryotype ci-dessous chez un patient de sexe masculin, en utilisant la technique des bandes R. normal anormal A- Le caryotype présente une anomalie de structure déséquilibrée. B- L un des deux chromosomes 5 a perdu un segment chromosomique sur son bras long. C- La région perdue sur le chromosome 5 semble une région riche en gènes. D- La morphologie du chromosome 5 anormal est métacentrique. E- La technique d hybridation in situ en fluorescence permettra d analyser plus finement la région perdue. QCM 14 Un exemple de pathologie constitutionnelle : caryotype 1 caryotype 2 A- Le caryotype 1, correspond à un individu qui présente de graves troubles cliniques. B- Le chromosome 14, du caryotype 1, est impliqué dans une translocation robertsonienne (trob). C- Les ségrégations méiotiques qui se déroulent au cours de la gamétogenèse du sujet porteur du caryotype 1, peuvent aboutir à la formation de gamètes anormaux. D- Le sujet qui présente le caryotype 1 peut être la mère du sujet qui présente le caryotype 2 (le caryotype du père est normal). E- L inactivation du chromosome 21 supplémentaire, permet que seuls deux chromosomes 21 soient actifs. 5

6 QCM 15 Un exemple de pathologie acquise: Chromosomes normaux ABL BCR Image 1 Hybridation in situ en fluorescence sur noyau interphasique Image 2 Chromosomes transloqués Flèche 1 gène BCR sur le chromosome 22 Flèche 2 gène ABL sur le chromosome 9 BCR Chromosome ABL de Philadelphie 22 Image A- L image 1 permet d affirmer que les chromosomes 9 et 22 transloqués sont la conséquence d un mécanisme de translocation réciproque (trcp). B- Le chromosome de Philadelphie (image1) résulte de la perte d un fragment 22q et du gain d un fragment 9q contenant le gène ABL. C- L image 2 montre un noyau au contenu cytogénétique normal. D- Les flèches 3 des images 2 et 3 indiquent le chromosome de Philadelphie. E- La flèche 4 de l image 3 pointe le chromosome 9 normal. QCM 16 Concernant les maladies rares d origine génétique : A - leur prévalence dans la population est inférieure à 1/200. B - leur prévalence dans la population est inférieure à 1/2000. C - leur prévalence dans la population est inférieure à 1/ D - le nombre de personnes atteintes en France est de l ordre de E - le nombre de personnes atteintes en France est de l ordre de QCM 17. L hérédité autosomique récessive : A - s exprime à l état hétérozygote. B - s exprime à l état homozygote. C - est plus fréquente dans les populations consanguines. D - se transmet sur un mode vertical. E - se transmet sur un mode horizontal. QCM 18. Parmi les caractéristiques d une maladie autosomique dominante : A Il n y a pas de transmission père fils. B - Les hétérozygotes n expriment pas la maladie. C - Des sujets atteints sont observés sur plusieurs générations successives d une famille. D - Un saut de génération peut être observé. E - Les mutations de novo n existent pas. 6