MICROORGANISMES RESPONSABLES D'INFECTIONS NOSOCOMIALES

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1 MICROORGANISMES RESPONSABLES D'INFECTIONS 2.08 Objectif Un grand nombre d agents infectieux (parasites, levures, bactéries, virus, prions) peuvent être responsables d infections nosocomiales (IN). Néanmoins, certains d entre eux sont plus fréquemment impliqués ; il est indispensable de les identifier et de connaître leur habitat préférentiel, leur(s) mode(s) de transmission nosocomiale, leur(s) porte(s) d entrée dans l organisme et les principales pathologies dont ils sont à l origine, afin d organiser plus efficacement la prévention et la prise en charge de ces dernières. Techniques et méthodes PRESENTATION DES PRINCIPAUX AGENTS INFECTIEUX RESPONSABLES D IN Les tableaux ci-après répertorient par grands types d agents infectieux ceux qui sont le plus souvent rendus responsables d IN, aussi bien chez les patients que chez les soignants. Leur reconnaissance repose, à partir d échantillons judicieusement prélevés, sur les techniques microbiologiques et parasitologiques couramment développées dans les laboratoires concernés. En cas de suspicion d épidémie nosocomiale (voir fiche 1.07), il est nécessaire, pour affirmer ce caractère épidémique, d identifier précisément l agent infectieux en cause et, s il s agit d un germe relativement banal, de recourir à des méthodes de typage phénotypiques (biotypage, profil de résistance aux antibiotiques, sérotypage ) ou génotypiques (ribotypage, électrophorèse en champ pulsé, profils de restriction des acides nucléiques viraux ) pour établir la parenté entre les souches isolées chez les patients, les soignants et/ou l environnement hospitalier. Dans le contexte de l'isolement septique, ces informations sont complémentaires des recommandations pour l'isolement septique du CTIN (voir aussi chapitre 9). Responsables Le responsable du laboratoire de microbiologie est responsable de la vigilance par rapport à l'apparition de nouveaux pathogènes, de nouvelles résistances et de cas groupés. Le CLIN et l'équipe opérationnelle sont responsables de la mise en œuvre des procédés de surveillance et de prévention adaptés. Le responsable de service doit être vigilant pour identifier des situations inhabituelles dans les résultats microbiologiques dans son service. Pour en savoir plus Références AVRIL JL, CARLET J et al. Les infections nosocomiales et leur prévention. Ellipses, paris, 1998, 687 pages. BANET JC, BERTHELOT P, LUCHT F et al. Isolement vôtre. CD ROM, didacticiel multimédia de formation à l'isolement à l'hôpital, 1998, CHU de Saint-Etienne. B. POZZETTO coordonnateur. Infections nosocomiales virales et à agents transmissibles non conventionnels coordonnateur. John Libbey Eurotext, Montrouge., 2001, 554 pages. Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 1 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

2 Guides et recommandations COMITE TECHNIQUE NATIONAL DES INFECTIONS (CTIN). Isolement septique Recommandations pour les établissements de soins. Ministère de l'emploi et de la Solidarité, 1998, 51pages. SOCIETE FRANÇAISE DE MICROBIOLOGIE. Le REMIC. Référentiel en Microbiologie Médicale (bactériologie et mycologie). 2M2, Paris, 1998, 147 pages. SOCIETE FRANÇAISE DE MICROBIOLOGIE. Le REVIR. Référentiel en Virologie Médicale. Société Française de Microbiologie. 2M2, Paris, 2000, 159 pages. Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 2 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

3 PARASITES Cryptosporidium sp Pediculus capitis (pou de tête) Pediculus corporis (pou de corps) Pediculus pubis (pou de pubis ou morpion) (TD*) (eau) (zones pileuses) (vêtements, literie, matériel de toilette ) Sarcoptes scabei hominis Toxoplasma gondii Animal (chat) (eau, aliments) LEVURES Aspergillus sp (A. flavus, niger, ) Candida sp (C. albicans, glabrata, krusei ) Cryptococcus neoformans (végétaux, sol, poussières) Animal Animal (pigeons) Poils, cheveux Cutanéo-muqueux Pneumocystis carinii hominis BACILLES A GRAM POSITIF Clostridium difficile Listeria monocytogenes (spores) (végétaux, sol, poussières, aliments) Diarrhées chez l immunodéprimé (SIDA) Pédiculose Gale Toxoplasmose cérébrale chez l immunodéprimé (SIDA) Aéroporté Aspergillose invasive chez l immunodéprimé (SIDA, transplantés) Candidose cutanéo-muqueuse Candidose cutanéo-muqueuse chez l immunodéprimé Aéroporté Méningo-encéphalite Septicémie chez l immunodéprimé Pneumocystose invasive chez l immunodéprimé (rare) Diarrhée post-antibiothérapie Colite pseudo-membraneuse Listériose chez l immunodéprimé (méningite, méningoencéphalite, septicémie ) Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 3 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

4 COCCI A GRAM POSITIF Enterococcus sp (E. faecalis, faecium) (entérocoques) Staphylococcus aureus (staphylocoque doré) Staphylocoques à coagulase negative (S. hominis, S. epidermidis, S. capitis ) Streptococcus agalactiae (streptocoque B) Streptococcus pneumoniae (pneumocoque) Streptococcus pyogenes (streptocoque A) (eaux, aliments) (peau, rhinopharynx, vagin) (poussières, aliments) (peau, muqueuses) Animal (peau, muqueuses) (TD, vagin) et animal (voies aériennes supérieures) (voies aériennes supérieures) Percutanée Percutanée Materno-foetale Staphylococcie : Infection de la peau et des parties molles (plaie, brûlure),septicémie Infection osteo-articulaire Infection sur cathéter et sur prothèse Toxi-infection alimentaire Staphylococcie Infections sur cathéter et sur prothèse Méningite, endocardite Péritonite Pneumonie Infection cutanéomuqueuse Pneumonie Bronchite Infections ORL Méningite Arthrite Scarlatine Angine Infections de la peau et des parties molles (fascite nécrosante) Erysipèle choc toxique Rhumatisme articulaire aiguë Erythème noueux Glomérulonéphrite Infections génitales gravissimes post accouchement ou chirurgie gynécologique Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 4 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

5 BACILLES A GRAM NEGATIF ENTEROBACTERIES Enterobacter sp (E. aerogenes, cloacae ) Escherichia coli Klebsiella sp (K. pneumoniae, oxytoca) Proteus sp (P. mirabilis, vulgaris) Salmonella enterica - typhi, paratyphi - salmonelles mineures Serratia sp (S. marcescens, liquefaciens) Yersinia enterocolitica (sol, eau, végétaux) (sol, eau, végétaux) (sol, eau) (eau, sol, végétaux) (eau, sol, aliments) Diarrhée Infections urinaire et génitale Méningite Toxi-infection alimentaire Fièvres typhoïde et paratyphoïdes Toxi-infections alimentaires Diarrhée Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 5 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

6 AUTRES BACILLES A GRAM NEGATIF Acinetobacter baumanii Bordetella pertussis (bacille de Bordet-Gengou) Burkholderia cepacia Haemophilus influenzae Legionella sp (L. pneumophila, ) Pseudomonas aeruginosa (bacille pyocyanique) Stenotrophomonas maltophilia (peau et muqueuses) (eau, sol) (voies aériennes supérieures) (eau, sol) (muqueuses) Animal (muqueuses) (eaux tièdes, climatiseurs) (eau, sol, végétaux) (sol, végétaux) Coqueluche Bronchite Infections ORL Méningite Epiglottite Légionellose : Fièvre de Pontiac Infection de la peau et des parties molles (plaie, brûlure) Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 6 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

7 AUTRES BACTERIES Mycobactéries - tuberculeuses (Mycobacterium tuberculosis, bovis, africanum) - atypiques (M. aviumintracellulare, marinum, xenopi ) Mycoplasma pneumoniae VIRUS A ADN Adénovirus (ADV) Cytomégalovirus (CMV) (également bovin pour M. bovis) Animal (voies aériennes supérieures) (formations lymphoïdes, TD) (cellules mononucléées, cellules épithéliales salivaires, rénales, cellules endothéliales) Aéroporté Tuberculose pulmonaire Tuberculose extra-pulmonaire Méningite tuberculeuse Infection respiratoire basse Infection cutanée Infection ganglionnaire Infection disséminée chez l immunodéprimé atypique Infection ORL Bronchite, bronchiolite Formes neurologiques Virus de l hépatite B (HBV) (foie) Virus herpès simplex (HSV) Virus varicelle-zona (VZV) (ganglions nerveux sensitifs) (ganglions nerveux sensitifs) Aéroporté Gouttelette Percutanée Infection respiratoire haute et basse Bronchite, bronchiolite Kérato-conjonctivite Gastro-entérite Fièvre prolongée Syndrome mononucléosique Infection chronique chez l immunodéprimé (rétinite, pneumopathie, colite ) Hépatite aiguë Hépatite chronique Association au cancer primitif du foie Infection cutanéo-muqueuse Kérato-conjonctivite Méningo-encéphalite Infection chronique chez l immunodéprimé Varicelle Zona Méningo-encéphalite Infection chronique ou grave (pneumopathie) chez l immunodéprimé Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 7 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

8 VIRUS A ARN Entérovirus (coxsackievirus, echovirus) Myxovirus influenzae (virus de la grippe) Rhinovirus Rotavirus Virus de l hépatite A (HAV) (eau) (arbre respiratoire) (arbre respiratoire) Virus de l hépatite C (HCV) (foie) Percutanée Virus de l immunodéficience humaine Percutanée (HIV) (lymphocytes T) Virus parainfluenza (PIV) (arbre respiratoire) Virus respiratoire syncytial (RSV) (arbre respiratoire) Méningite poliomyélite Infection respiratoire Bronchite- angine herpangine Infection cutanée Infection oculaire Péricardite Grippe commune Grippe maligne Bronchite, bronchiolite Rhume banal Infection ORL Bronchite, bronchiolite Gastro-entérite Déshydratation Hépatite chronique Immunodéficience SIDA Infection respiratoire haute et basse Infection respiratoire haute et basse (en particulier bronchiolite) Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 8 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08

9 AGENTS TRANSMISSIBLES NON CONVENTIONNELS OU PRIONS PrP res PrP res nouveau variant (système nerveux, oeil) (système nerveux central, œil, amygdales, formations lymphoïdes associées au tube digestif) Animal (bovins) Peropératoire Percutanée (hormones de croissance ) Peropératoire possibles non confirmées Encéphalopathies spongiformes Encéphalopathies spongiformes * TD : tube digestif Guide Technique d'hygiène Hospitalière 2004 Page 9 / 9 C.CLIN Sud-Est Fiche n 2.08