UE2 Biologie Cellulaire

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1 UE2 Biologie Cellulaire

2 La biocée au concours : Ce sont 22 questions, dont - 10 sur les schémas du poly de la fac (souvent 2) - 12 sur les ED (en général 3) dont le sujet est en rapport avec celui de l un des ED vus en cours Comment résoudre les QCM? L essentiel reste de : - connaître ses schémas sur le bout des doigts, surtout les motifs revenant très souvent (le protéasome, les protéines G ) - gagner du temps et des points sur les ED en saisissant le raisonnement (après ça file tout seul)

3 I) La cellule: introduction et méthodes d étude (cours 1 et 2) La cellule: c est l unité fondamentale du vivant; elle peut vivre et se reproduire toute seule! Plusieurs cellules constituent un tissu, et plusieurs tissus = un organe

4 Dans la cellule, il y a quoi? Tout d abord, il y a le cytosol: appartient au cytosol tout ce qui ne possède pas de membrane propre : centrioles, cytosquelette, ribosome libre et inclusions lipidiques centrioles Inclusion lipidique cytosquelette ribosomes libres

5 Le système endomembranaire: à l inverse, c est tout ce qui est dans le cytosol mais qui possède une membrane propre (RE, Golgi, enveloppe nucléaire ) Le noyau (qui aura son propre cours) Les organites (que vous verrez largement plus tard)

6 L immunocytochimie: La technique consiste simplement à utiliser un anticorps (Ac) qui reconnaît un antigène (Ag) particulier, pour savoir par exemple si vous êtes encore à jour de votre vaccin contre l hépatite. Si vous êtes à jour -> vos Ac se fixent à l Ag ; sinon -> les Ac ne reconnaissent pas leur cible (l épitope = Ag) Pour savoir si vos Ac se sont fixés sur l Ag, on utilise une deuxième Ac qu on a marqué et on peut lire le résultat (par comparaison au test témoin)

7 Selon l endroit où l antigène (ou épitope) est situé (sur la membrane ou à l intérieur de la cellule), on aura logiquement besoin ou non de perméabiliser la cellule : Epitope situé à l intérieur de la cellule Epitope situé sur la membrane cellulaire, côté interne Perméabilisation Perméabilisation Epitope situé sur la membrane cellulaire, côté externe Pas de perméabilisation

8 Le Western Blot (important à comprendre pour les ED) On récupère des protéines dans une ou plusieurs cellules Après amplification, on les fait passer sur le WB: selon sa «lourdeur» la protéine migre plus ou moins On lit le WB : on connaît le poids moléculaire des molécules d intérêt; il ne reste qu à vérifier si elles sont présentes ou non Attention : le Western Blot ne renseigne pas sur la localisation intra ou extracellulaire de la molécule

9 L hybridation in situ : Sonde complémentaire à la séquence l intérêt Marquage Séquence d intérêt

10 II) Membrane plasmique (MP) A repérer sur les schémas: le milieu extracellulaire : - Oxydant - Contient des ponts disulfure - Glycosylations - Côté Nter des molécules transmembranaires Le milieu intracellulaire : - Réducteur - Jamais de ponts S-S - Phosphorylations

11 Caractéristiques de la MP : Bicouche lipidique Asymétrique (du fait des différences entre milieu oxydant/réducteur) Hétérogène Interagit avec le système endomembranaire Des glycoprotéines y sont insérées Est majoritairement constituée de lipides et de protéines (+10% de sucres toujours extracellulaires) Lipides Protéines Flip flop Pas de flip flop

12 Les rôles de la MP : - Mobilité cellulaire (association avec le cytosquelette) - Communication intercellulaire (transduction mécano chimique) - Adhérence (SAM et CAM) - Transports (avec ou sans mouvements)

13 CAM Ig Cadhérines Sélectines Intégrines Adhésion Ca++ INdépendante Ca++ dépendante Ca++ dépendante Ca++ dépendante Expression à la membrane Aspect OK OK Disponible par exocytose A activer

14 Les jonctions à espaces intercellulaires «étroit»:

15 Les jonctions à espaces intercellulaires «larges»:

16 III) Le compartiment cytosolique Son contenu : - Eau (85%) - Ribosomes libres - Cytosquelette - Stocks de sucres et lipides - Protéasome - Ribonucléoprotéines

17 Fonctions du cytosol : 1. Métabolisme des lipides Les inclusions lipidiques proviennent du RE (formation entre les deux feuillets) Elles sont entourées d une MONOcouche de lipides et de protéines (comme la cavéoline)

18 2. Synthèse et modification des protéines Les ribosomes libres synthétisent des protéines à partir des ARNm Les protéines sont ensuite adressées à leur lieu de fonction (sans adressage elles restent dans le cytosol) Les modifications post traductionnelles : Phospho/déphosphorylation (kinases / phosphatases) Acétylation O glycolylation Acylation (ajout d acides gras)

19 3. Site de dégradation des protéines La protéase la plus importante (à connaître sur le bout des doigts) est le protéasome. ph neutre (7,4) Superfamille des AAA Utilise ATP Il dégrade les protéines - Pour leur renouvellement - En cas de protéine anormale Une protéine est adressée au protéasome avec des ubiquitines (Ub)

20 Il est impliqué dans la réponse immunitaire : les peptides antigéniques qu il produit sont adressés au CMH 1

21 Les acteurs principaux du cytosol: Chaperons moléculaires : accompagnent les protéines déformées (ex: les Hsp) -> ont une activité ATPasique (fixent ATP/ADP) Ubiquitines : orientent vers la protéolyse Protéines G : transduction du signal -> utilisent GTP/GDP Etape G trimériques G monomériques Échange GDP/GTP Hydrolyse GTP RCPG (récepteur couplé à protéine G) RGS (regulator of G signaling) GEF (G exchange factor) GAP (G activating protein) Calcium : stocké dans le système endomembranaire et la mitochondrie