L élevage de précision aujourd hui et demain

Transcription

1 L élevage de précision aujourd hui et demain Santé et Bien-être des animaux Exemple de travaux de recherche Raphaël Guatteo 1, Marie-Madeleine Richard 2 1 UMR Oniris-INRA BioEpAR 2 UMR Vetagrosup-INRA Herbivores

2 Des outils développés initialement pour le pilotage du troupeau Alimentation & Reproduction Robot de traite et DAC/DAL : se dispenser de la traite et tâches d alimentation Puis monitoring de la reproduction : sécuriser mise à la reproduction et vêlage Pilotage «Bâtiment»

3 Des outils désormais avec des objectifs annoncés «Santé» La santé comme co-produit ou en soi Utilisation de données initialement prévues pour un autre objectif Activité : Détection Chaleurs Détection boiteries Développement d outils 100% Santé Mesure ph / Température Rumen

4 D après Allain, 2014 De multiples possibilités Seules ou en combinaison Position de la queue Reproduction (Accéléromètre, gyromètre) T vaginale Reproduction (Thermomètre) Contractions abdominales Reproduction (Capteur de pression) NEC Reproduction, santé, alimentation (Caméra 3D, IR) Id électronique pilotage général (Puce RFID) Quantité d aliments Alimentation (Peson) Quantité et composition du lait Santé, alimentation, (Compteurs à lait, analyseurs optiques) Comportement alimentaire - Santé, alimentation (Microphone, accéléromètre) Analyses du lait (hormone, enzyme) Reproduction, santé (Analyses chimiques en ligne) T et ph ruminal Santé, alimentation (Thermo et ph mètre) Posture Santé (boiteries) (Capteur de pression) Poids vif Santé, alimentation (Peson) Activité physique et position Reproduction, santé (Podomètre, accéléromètre)

5 Et aujourd hui. Monitoring de la reproduction surtout

6 Une absence de cadre règlementaire Pas d obligation de résultats Spécialité pharmaceutique : AMM Tests diagnostiques : EIL, Normes (LNR) Outils de monitoring : aucun cadre Disponibilité des algorithmes commerciaux? Exception pour Robot Traite et détection MMT : ISO/FDS/20966 : Se > 80%, Sp > 99%. En pratique rarement atteint Mais un marché

7 Antibioresistance Atteinte BEA Atteinte BEA Besoin d outils performants pour la Santé Mais pas trop.. Trop d alarmes sur VL saines Vaches malades non détectées Alarme Action Excès traitements Alarme Action Risque de ne pas traiter VL malade Sous-traitement ou retard au traitement Etude Récente Plus de 95% des alertes générées par le robot de traite non analysées par l éleveur

8 Des verrous pour l évaluation des outils Pas de guideline pour leur évaluation Notion de Gold Standard? Pour vêlage : aisé Pour Chaleurs : Eleveur < Dosage? Examen Eleveur < Vétérinaire Méthode de référence Etat + Etat - Outil Monitoring Alerte + Alerte - VP FN FP VN Définition Résultat + Seuil, durée, nature de la référence (bovin lui-même, norme?) Bruits parasites

9 Les motivations pour s équiper Du confort plus que la technique Impact de l équipement de détection des chaleurs sur le confort de travail (21 enquêtes, Courties 2014) Organisation Charge mentale Temps Répartition du travail Flexibilité des horaires Gestion des absences Travail du week end Stress au moment de l'ia Relation homme-animal Relations avec les collaborateurs Temps de travail Impact positif Pas d'impact Impact négatif

10 Une rentabilité en question Mais le confort n a pas de prix (exemple détection automatisée chaleurs) Effet non linéaire Effet non uniforme Disenhaus & Bareille, 2016

11 Un nécessaire compromis à trouver Exemple de la mesure activité et rumination Réglage 1 Réglage 2 Réglage 3 Mesure Rum Act Rum ou Act Rum ou Act Rum ou Act Sp (%) Se (%)(n=404) TFP (detections/j pour 100 vaches) Notamment du fait d une faible fréquence de maladies Inutilisable tel quel Perspective : adapter les seuils de détection mais algorithmes commerciaux

12 Un même outil à l utilisation différente selon le contexte Exemple du monitoring de la température Jeunes Bovins Forte prévalence de troubles respiratoires Concentrés dans le temps (mise en lot) Un critère fiable et précoce Différent en VL Timsit et al., 2011

13 Pourcentage du total Mais des détections souvent plus précoces Exemple du monitoring de la rumination Mammites (n=41) Première détection CUSUM /détection éleveurs (jours)

14 Des outils pour l éleveur ouvrant de nouvelles perspectives Comportement et activité de l animal : révélateur précoce d une situation de mal-être ou maladie Difficile à mesurer en continu dans un élevage Antennes logettes couloir auges tag Localisation en temps réel et utilisation de l espace

15 Des outils pour l éleveur ouvrant de nouvelles perspectives Perturbation du rythme circadien 2 jours avant une maladie (Veissier et al, 1989) Possible de calculer un rythme circadien à partir des données de l outil CowView : cela élargit les pistes de recherches S intéresser à de nouvelles activités : utilisation des brosses, de la pierre à sel, comportement social logettes couloir Auges inactif mange marche repos Veissier et al, 2017

16 Des outils pour l éleveur ouvrant de nouvelles perspectives De premiers résultats prometteurs sur vaches laitières A partir de données expérimentales : 14 vaches en acidose & 14 vaches ration témoin En situation d acidose (mesure ph via bolus) Niveau d activité (unité pendant arbitraire) l acidose en P2 15 Temps léchage pierre à sel (min/j) nuit nuit 10 0:00 12:00 24:00 heures 5 0 Acidose P2 1 6 jours Silberberg et al les vaches sont moins actives et passent plus de temps à lécher la pierre à sel

17 Perspectives Combiner et Mutualiser De nouveaux outils disponibles permettant du phénotypage à haut débit Exemple NEC Propriété / Disponibilité des données Besoin de sécuriser l utilisation Combinaison des outils, alertes Source : INRA (P. Faverdin) Evaluation multicritères

18 CONCLUSION Un marché à encadrer/aider/surveiller Des outils plus ou moins performants car plus ou moins conçus pour santé/bea Reproduction : valeur informative ++, intérêt s équiper +/- mais confort Santé : hétérogène et dépendant du contexte Pouvoir conseiller l éleveur sur la bonne utilisation Des perspectives immédiates et long terme Données à intégrer au raisonnement clinique (et à l enseignement) Besoin d aller vers un standard d évaluation Phénotypage à haut débit Pas en substitution de l éleveur/vétérinaire mais en complément

19 Merci pour votre attention